research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Detection of bovine corona virus in some governorate of Iraq
تشخيص فايروسbovine corona virus في بعض محافظات العراق

Loading...
Loading...
Abstract

In the present study we used Reverse transcription polymer chain reaction (RT-PCR) assay for detecting of bovine corona virus ,We evaluated presence of bovine corona virus ( BCoV) in diarrheic fecal samples in age (1 – 30)day . (152) faecal samples from diarrheic calves were collected from four Iraqi governorates (Al-Qadisyia, Babylon ,Wassit and Najaf) .10 (6.57%) out of 152 were positive to bovine corona virus . This study is the first detection of bovine corona antigen in Iraq .The results suggest that RT-PCR is more sensitive than other method to detect BCoV, especially in subclinical cases and Because these animals shed a low amount of virus in faeces and more animal show clinically normal we need to apply sensitive techniques, such as RT-PCR .

تم في هذه الدراسة استخدام تفاعل سلسلة البلمرة المنعكس للتحري عن وجود فايروسات الكورونا المسببة للاسهال في العجول المولودة حديثا ، حيث تم تقييم وجود فايروسات الكورونا في براز العجول المصابة بالاسهال وفي اعمار تتراوح بين (1 – 30 ) يوم ، تم جمع 152 عينة براز من اربع محافظات عراقية ( القادسية ، بابل ، واسط ، النجف)، كان 10 (6.57) من بين (152). ان هذه الدراسة تمثل الاولى في العراق لتحديد مستضدات فايروسات الكورنا في العجول المولودة حديثا باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة المنعكس. اظهرت النتائج ان تفاعل سلسلة البلمرة اكثر حساسية من الفحوصات الاخرى لتشخيص فايروس الكورونا ، وخصوصا في الحالات التي لا تظهر عليها علامات سريرية وتطرح الفايروس بكميات قليلة لذلك نحتاج الى تقنية عالية الحساسية مثل تفاعل سلسلة البلمرة المنعكس.


Article
Some epidemiological features of BCoVs infection in Al-Qadisiya province by using real time-qPCR technique.
دراسة بعض الصفات الوبائية للفايروس التاجي البقري في محافظة القادسية باستخدام خطوة واحدة في الوقت الحقيقي الكمي للفلورة - تفاعل البلمرة العاكس الناسخ

Loading...
Loading...
Abstract

This study was carried out to evaluate some epidemiological features of Bovine Coronavirus infection by using one-step real-time fluorogenic quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR) assay based on SYBR Green I dye in detection. Coronaviruses detected by the same neocleocapsid (N) gene primers under 98% similarity with HECV-4408 (human enteric Coronavirus) in children according to NCBI with product size 124bp. 285 fecal samples has been examined by routine methods against pathogenic bacteria in the intestines (E.coli, Salmonella Spp.) and Cryptosporidium parvum, the samples positive for the parasite submitted to molecular testing because they may be mixed with coronavirus infections. 100 samples were screened for the presence of BCoVs antigens by using a immunochromatographic rapid test as a field fast test. Where 44% of samples showed positivity to BCoVs, out of 50 samples submitted to quantitative reverse transcription (RT-qPCR) assay. Out of 50 – 31 samples had been positive. We found, that distribution of BCoVs was significantly higher in rural areas 33.3%-87.5% as compare to cities 71.4%-75%, the infection in males reach to75% vas 53.5% in females, high infection rate 62.9% in < 1- 4 months age as compare with > 1 month age 62.9%. The results of infection rate showed high percentage during February 77.7% while the percentage on (January, December, March, and April) was (66.6%, 66.1%, 54.5% and 50%) respectively.

أجريت هذه الدراسة لتقييم بعض السمات الوبائية لعدوى الفايروس التاجي باستخدام خطوة واحدة في الوقت الحقيقي الكمي للفلورة- تفاعل البلمرة العاكس الناسخ Real Time RT-qPCR مقاس على أساس صبغة SYBR الخضراء في الكشف. تم كشف الفيروس من قبل نفس الجين التمهيدي تحت نسبة 98 % وفقا ل NCBI مع حجم المنتج 124 زوج قاعدي . كل العينات البرازية فحصت بالطرق الروتينية ضد البكتيريا الممرضة للأمعاء (الاشريشية القولونية، السالمونيلا) والابواغ الخبيئة, وقد تم استبعاد العينات الموجبة للنمو البكتيري في حين أن العينات إلموجبة للطفيلي قدمت إلى الاختبار الجزيئي لأنها قد تكون مختلطة مع الاصابة بالفايروس التاجي. تم فحص 100 عينة فقط لوجود مستضدات BCoVs باستخدام الاختبار الحقلي المناعي السريع . حيث أظهرت 44% من العينات إيجابية لBCoVs ، قدمت 50 عينة مفحوصة بالاختبار السريع للوقت الحقيقي لتفاعل سلسة البلمرة النسخ العكسي الكمي ( Real Time RT- qPCR). حيث ظهر BCoVs في 31 من أصل 50 عينة برازية سريرية من العجول. وجدنا, أن توزيع BCoVs أعلى بكثير في المناطق الريفية 33.3 -87.5 % بالمقارنة مع المدن 71.4 -75 %، و الإصابة في الذكور تصل 75 % بالمقارنة في الإناث 53.5 %. وزيادة الإصابة مع تقدم العمر < 1-4 62.9% مع انخفاض طفيف في عمر > 1 شهر 62.9 % , أظهرت النتائج أن معدل الإصابة العالية كانت خلال شهر شباط 77.7% في حين كانت النسبة في (يناير، كانون الأول وآذار، وإبريل) (66.6%، 66.1%، 54.5% و 50%) على التوالي.

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

English (2)


Year
From To Submit

2014 (1)

2013 (1)