research centers


Search results: Found 15

Listing 1 - 10 of 15 << page
of 2
>>
Sort by

Article
The use of brain lab navigator in the management of small deep seated brain tumors.

Author: Ali K. AL-Shalchy* MBChB FlCMS FlCNS MRCSI د. علي كامل الشالجي
Journal: Journal of the Faculty of Medicine مجلة كلية الطب ISSN: 00419419 Year: 2009 Volume: 51 Issue: 4 Pages: 376-377
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Summary:Background: A comparism study for management of deep seated small brain tumors less than 4 cm in the 3 diameters between cases managed by Brain lab navigator and those without it.Patients and methods: We took 20 patients from the retrospecture data before the use of Navigator in our country compared with the 20 patients managed after the use of navigator in our hospital (specialized surgical hospital) in the neuro-surgical. Unit since 2002 till now. From 1/8/2002 till 31/12/2007 the study included the type of tumor & surgery & the result of surgery & time & complications ((morbidity & mortality)).Results: There was a significant increase of the safety of surgery by using the navigator including morbidity & mortality. But it was a time consuming procedure. Conclusion: The brain lab navigator is very useful safe device in the surgical management of deep-seated small diameter less than 4mm. brain tumors.Keywords: Brain Tumor, Navigator.

Keywords

Brain Tumor --- Navigator


Article
Detection of human cytomegalovirus genome in malignant gliomas by in situ hybridization technique

Authors: Ban A. Abdul majeed** PhD --- Faiza A. Mukhlis* PhD --- Shatha F. Abdullah* FICM
Journal: Journal of the Faculty of Medicine مجلة كلية الطب ISSN: 00419419 Year: 2009 Volume: 51 Issue: 2 Pages: 178-183
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Human Cytomegalovirus ( HCMV ), lies dormant in the glial cells , and can be reactivated under conditions of inflammation and immunosuppression. In vitro, the virus can transform cells and dysregulate many cellular pathways involved in oncogenesis. This study was conducted to detect HCMV matrix-protein mRNA using In Situ Hybridization technique in glial brain tumor tissues compared to normal brain tissues and the presence of cytomegalic inclusion bodies in brain tumor tissues.Patients and Method: Thirty eight of glial tumor specimens were obtained in paraffin blocks compared to eight normal brain autopsy specimens which were age and sex matched with the study group as a control group. ISH was conducted tissue sections using a biotinylated Long DNA Probe for CMV Matrix Protein together with in-situ hybridization (ISH) detection kit.Results: The biotinylated probe specific for mRNA encoded HCMV – Matrix Protein showed hybridization with viral nucleic acids in 34 cases(out of 38)of malignant glial tumor specimens representing (73.9% ) of the total study groups . All cases with high grades astrocytoma revealed a positive hybridization in a percentage of 32.6% from 15 cases with grade III, and 10 ( 21.7% ) cases with grade IV astrocytoma. Nine out of 38 cases with grade III astrocytoma representing (23.7%), 7 (18.4 %) cases with glioblastoma multiforme and 2 oligodendroglioma cases(5.3 %), revealed inclusion bodies on histological examination. Conclusions: HCMV may play a role in the glioma pathogenesis. In Situ Hybridization test proved to be a very sensitive and specific technique for the detection of HCMV mRNA in tissues. Epidemiological, histopathological identification of cytomegalic inclusion bodies , and molecular studies are necessary to confirm the association of HCMV related human cancers in general Iraqi population.


Article
HPLC TECHNIQUE FOR ESTIMATION OF CATECHOLAMINE USING AS BIOCHEMICAL BRAIN TUMOR MARKER
تقديرالكاتيكولامين بتقنية كروماتوغرافيا السائل ذات الاداء العالي وأستخدامه كدالة بايو كيمياوية لسرطان الدماغ

Author: علاء كمال جبار رعد كاظم مصلح
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2011 Volume: 10 Issue: 1 Pages: 55-67
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

ABSTRACT High performance liquid chromatography ٌRP-HPLC technique was used to determine the concentration levels of catecholamine (Noradrenaline (NA), Adrenaline (AD) and Dopamine (DA)) in plasma samples of 25 normal volunteer's and 20 brain tumor patients . A chromatographic reversed-phased method based upon ion-pairing has been developed to measure NA, AD and DA on (ODS-DB) column using 50 mM phosphate buffer mixed with 0.5 mM of 1-octane sulphonic acid : Acetonitrile ( 95 / 5)(V/V) pH = 4.5 and monitored on UV-Visible at 280 nm. A different concentrations of standard catecholamine were prepared to get the chromatographic linearity that appeared to be linear in the range 50--10000 ngml. The results show the concentration levels of NA, AD and DA in normal volunteer’s were(256(33)),(269(41)) and (561(61)) ng/ml respectively whereas (274(31)), (256(38)) and (885(73)) ng/ml respectively in brain tumor patients which reflected the presence of a significant increase dopamine compared with normal volunteers which is use as biochemical brain tumor marker.

الخلاصـة أستخدمت تقنية كروماتوغرافيا السائل ذات الاداء العالي– الطور العكوس لتقدير مستويات تركيز الكاتيكولامين (النورأدرينالين, الادرينالين والدوبامين) في بلازما الدم لـ(25) من المتطوعين الاصحاء و (20) من المرضى المصابين بسرطان الدماغ. أعتمدت الطريقة المثلى لكروماتوغرافيا السائل ذات الاداء العالي- الطور العكوس على المزدوج الايوني المتطور لتقدير مستويات تركيز الكاتيكولامين على عمود (ODS-DB) بأستعمال (50 ملي مول) محلول دارىء من الفوسفات ممزوج مع (0.5 ملي مول) 1-أوكتان حامض السلفونك: أسيتونايتريل (حجم/حجم) (95/5) وبدالة حامضية تساوي(4.5) وبتحسس الاشعة المرئية فوق البنفسجية وبطول موجي 280 نانوميتر. حضرت محاليل قياسية من الكاتيكولامين لحساب خطية المنحنى وظهر بأحسن خط مستقيم ضمن مدى تراكيز (50-10000 نانوغرام/مليلتر). أظهرت النتائج بأن معدلات مستويات تراكيز (النوادرينالين, الادرينالين والدوبامين هي (256(33)), (269(41)) و (561(61)) نانوغرام/ مليلترعلى التوالي في بلازما الدم المتطوعين الاصحاء بينما (274(31)), (256(38)) و (885(73)) نانو غرام/مليلتر على التوالي في مرضى سرطان الدماغ حيث ظهر إرتفاع معنوي بتركيز الدوبامين في مرضى سرطان الدماغ مقارنة بالمتطوعين الاصحاء مما يمكن إستعماله كدالة بايوكيمياوية لسرطان الدماغ.


Article
BIOCHEMICAL STUDY ON SUPEROXIDE DISMUTASE ENZYME IN PATIENTS WITH DIFFERENT BRAIN TUMORS
العلاقة بين مستضدات التطابق النسيجي- الصنف الثاني والفعالية الوظيفية للخلايا اللمفية بعد تحفيزها بمستضدات الحمات المعوية والحمات الغدية في الاطفال المصابين حديثاً بالسكري من النوع الأول

Author: حذامة رزوقي حسن
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2010 Volume: 9 Issue: 2 Pages: 191-201
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of the current study is to in evaluate the role of SOD activity in the previously reported oxidative stress in our laboratory(1), in the patients with different brain tumors. SOD activity was assayed according to riboflavin/NBT method and its specific activity was calculated in patients with benign and malignant brain tumors and control. Moreover the specific activity was compared in these samples according to gender and the occurrence of disease.Non significant elevation (P > 0.05) in SOD specific activity was observed in tissue of malignant tumors in comparison to that of in benign brain tumors. While a highly significant decrease (P < 0.001) of the specific activity was found in sera of malignant patients group in comparison to that of the control group, and it was found lower in female than male in control and malignant groups. An elevation in this specific activity was noticed in patients with secondary brain tumors in comparison to that of primary brain tumors (P<0.05). From the results of the present study we conclude that the observed decrease in SOD activity in sera of patients with different type of brain tumors contribute to the oxidative stress that previously reported in our laboratory to be present in such patients.

الهدف من هذه الدراسة هو تحديد دور فعالية انزيم SOD في الجهد التأكسدي والذي سبق وان سجل وجوده في أنسجة ومصل الدم من قبل الباحثين في مختبرنا في المرضى المصابين بأورام الدماغ المختلفة. لقد تم تقدير فعالية انزيم SOD بإعتماد طريقة riboflavin/NBT والفعالية النوعية لهذا الانزيم في المرضى المصابين بأورام الدماغ الحميدة والخبيثة والأصحاء، فضلا عن ذلك فقد تمت مقارنة الفعالية النوعية في المجاميع المدروسة إعتماداً على الجنس.أظهرت النتائج ارتفاع غير ملموس في الفعالية النوعية لانزيم SOD في انسجة المصابين بأورام الدماغ الحميدة P>0.05 في حين لوحظ انخفاض ملموس جداً في هذه الفعالية النوعية في مصول المصابين بأورام الدماغ الخبيثة مقارنة مع الاشخاص الأصحاء P<0.001. كما وجد ان الفعالية النوعية لهذا الانزيم منخفضة في النساء مقارنة بالرجال لمجاميع الاصحاء والمصابين بأورم الدماغ الخبيثة، وعند مقارنة الفعالية النوعية لهذا الانزيم في مصول الأشخاص المصابين بأورام الدماغ الخبيثة الابتدائية مع تلك للمصابين باورام الدماغ الخبيثة الثانوية، أظهرت النتائج وجود زيادة فيها في مصول أولئك المصابين بأورام الدماغ الخبيثة الثانوية (سرطان الدماغ) مقارنة مع أولئك المصابين بالأورام الإبتدائية فيها. ممكن الاستنتاج من نتائج الدراسة الحالية ان الانخفاض الملحوظ في فعالية الانزيم SOD في مصول المرضى المصابين بأنواع مختلفة من أورام الدماغ يساهم في الجهد التأكسدي الذي سبق وان سجل عند هؤلاء المرضى في مختبرنا.


Article
The role of Human Cytomegalovirus infection in Iraqi brain tumor patients

Author: Elham Mudallal Amer, Ali. H .M.Ali Alkhfaji, Zuhar N .Hamad
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2017 Volume: 16 Issue: 4 Pages: 15-25
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

A total of (40) astrocytoma patients tissues were enrolled in the present study which include (20) normal surrounding areas from similar tissues used as a control group. The fourty cases represented by formalin fixed paraffin embedded brain tumor tissues blocks and these blocks were collected from the archives of histopathology laboratories at Neurosurgery Teaching Hospital in Baghdad. During the period 2014 to 2015. In our study, the astrocytoma patients were classified into four groups according to their grades (I, II, III, IV). A retrospective study of (40) paraffin embedded samples which were previously diagnosed as brain tumors along with normal unaffected tissues or tissue surrounding the tumors as control were selected from different Histopathology laboratories. All the slides of the paraffin-embedded samples were re-examined and specific sections were selected to be prepared for the techniques (CISH). The Paraffin-embedded samples were sectioned to several sections with (3-4 mm) thickens on charged slides Using Chromogenic insitu hybridization procedure (CISH technique) was used to detect the HCMV on the embedded tissues by light microscope. All grade have positive results for HCMV nucleic acids but the higher percentage (100%) was present in high grades astrocytoma grades (IV).

Keywords

Cytomegalovirus --- Brain tumor --- CISH --- HCMV --- PCR.


Article
Brain Tumor Detection of Skull Stripped MR Images Utilizing Clustering and Region Growing
الكشف عن أورام الدماغ في صور الرنين المغناطيسي منزوعة الجمجمة بأستخدام طرق العنقدة وانماء المناطق

Authors: S.M. Ali صالح مهدي علي --- Loay K. Abood لؤي كاظم عبود --- Rabab S. Abdoon لؤي كاظم عبود
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2014 Volume: 55 Issue: 3A Pages: 1108-1119
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Brain tissues segmentation is usually concerned with the delineation of three types of brain matters Grey Matter (GM), White Matter (WM) and Cerebrospinal Fluid (CSF). Because most brain structures are anatomically defined by boundaries of these tissue classes, accurate segmentation of brain tissues into one of these categories is an important step in quantitative morphological study of the brain. As well as the abnormalities regions like tumors are needed to be delineated. The extra-cortical voxels in MR brain images are often removed in order to facilitate accurate analysis of cortical structures. Brain extraction is necessary to avoid the misclassifications of surrounding tissues, skull and scalp as WM, GM or tumor when implementing segmentation algorithms. In this work, two techniques have been implemented to extract the brain tissues as elementary step. The next step was utilizing the resultant skull stripped images as input of four segmentation algorithms to extract the tumor region and calculate the area value of it. The resultant skull stripped images for complete set of T2-weighted images and the adaptive K-Means clustering techniques proved the robust performance of these proposed algorithms.

ان عملية تقسيم الانسجة الدماغية تنطوي على تحديد ثلاثة انواع من المادة الدماغية وهي المادة الرمادية والمادة البيضاء والسائل الشوكي . ولكون معظم تراكيب الدماغ تعرف تشريحيا من خلال حدود هذه الانسجة لذا فان التقسيم الدقيق لانسجة الدماغ الى واحدة من هذه الاصناف تعتبر خطوة مهمه في الدراسة الطوبوغرافية النوعية لانسجة الدماغ . كما وان المناطق الغير طبيعية مثل الاورام تحتاج ايضا الى تحديد. ان الفوكسلات العائدة لمناطق خارج المخ في صور الرنين المغناطيسي للدماغ تزال عادة لتسهيل عملية التحليل الدقيق للتراكيب اللحائية. ان عملية استخلاص النسيج الدماغي هي عملية ضرورية لتجنب سوء التصنيف للانسجة المحيطة مثل الجمجمة والفروة على انها مادة بيضاء او مادة رمادية أو ورم عند تطبيق خوارزميات التقسيم. في هذا العمل تم تطبيق تقنيتين لغرض استخلاص النسيج الدماغي كخطوة ابتدائية. والخطوة التالية استخدام الصورة الناتجة المنزوعة الجمجمة كمدخلات لاربعة من خوارزميات التقسيم لاستخلاص منطقة الورم ومن ثم حساب قيمة المساحة له. ان الصور المنزوعة الجمجمة الناتجة لمجموعة كاملة من صور T2 المرجحة وتقنية عنقدة وسائل الـــk المطورة قد اثبتت الاداء المحكم لهذه التقنيات المقترحة.


Article
Automatic Technique to Produce 3D Image for Brain Tumor Of MRI Images

Authors: S.M. Ali --- Loay Kadom Abood --- Rabab Saadoon Abdoon
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2014 Volume: 22 Issue: 7 Pages: 1896-1907
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

In this research, three-dimensional images of brain tumors have been constructed from a series of Magnetic Resonance Images (MRIs) for successive T1-weighted slices, using a simple automatic technology. The MRIs are pre-processed through bilateral filtering to reduce noise and retaining the edges between brain tissues. Spatial enhancement technique is adopted to transform image gray levels by highlighting the band density of the region of interest (tumor) and expanding them into full range. Sobel edge detection is used by morphological operations to extract the tumor area of the image of each slice. The contour of the tumor area in each segmented slice is used to create 3D of the tumor. The relative size of the tumor then measured depending on brain tissue after stripping the skull. The result showed that the adopted technique can efficiently detect and extract the brain tumor from the consecutive slices which can be used to produce 3-D image of the tumor and to identify the tumor's location inside the skull.

في هذا البحث، تم بناء صور ثلاثية الأبعاد لأورام المخ من سلسلة من صور الرنين المغناطيسي لشرائح T1 متعاقبة، وذلك باستخدام تكنولوجيا أوتوماتيكية بسيطة. تم معالجة صور الرنين المغناطيسي بعملية ثنائية للحد من الضوضاء والحفاظ على حواف بين أنسجة الدماغ. اعتمدت التقنية الإطار المكاني لتحويل مستويات الشدة في الصور من خلال تسليط الضوء على الفرق بين مستويات الشدة في منطقة الورم. استخدمت تقنية سوبيل للكشف عن الحافات وبعملية مورفولوجية لعزل منطقة الورم من الصورة لكل شريحة. تم استخدام مخطط الكفاف (المخطط الكونتوري) في منطقة الورم في كل شريحة لإنتاج صور ثلاثية الأبعاد للورم. تم قياس حجم الورم النسبي بعد تجريده من الأنسجة المحيطة و الجمجمة. أظهرت النتائج كفاءة التقنية المعتمدة في تحديد وعزل الورم في الدماغ من الشرائح المتتالية وإمكانية استخدامها لإنتاج صور ثلاثية الأبعاد لأورام المح وتحديد موقع الورم داخل الجمجمة.


Article
Comparison of Some Statistical Measurements Extracted From Benign, Malignant and Normal MRI Brain Images
مقارنة بعض القياسات الإحصائية المستخرجة من صورللدماغ ماخوذه من جهاز الرنين المغناطيسي لاشخاص يحملون امراض حميدة و اخرى خبيثة و صور لغير المرضى

Authors: Raid Adnan Omar رائد عدنان عمر --- Jassim Mohammed Najim جاسم محمد نجم --- Imad H Abood عماد هجول عبود
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2017 Volume: 58 Issue: 4B Pages: 2112-2117
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

People may believe that tissue of normal brain and brain with benign tumor have the same statistical descriptive measurements that are significantly different from the of brain with malignant tumor. Thirty brain tumor images were collected from thirty patients with different complains (10 normal brain images, 10 images with benign brain tumor and 10 images with malignant brain tumor). Pixel intensities are significantly different for all three types of images and the F-test was measured and found equal to 25.55 with p-value less than 0.0001. The means of standard deviations and coefficients of variation showed that pixel intensities from normal and benign tumors images are almost have the same behavior whereas they were significantly different from images of malignant brain tumors with F-tests equal to 23.22 and 6.51 respectively with corresponding p-values of 0.00001 and 0.005 respectively.

قد يعتقد الناس أن نسيج الدماغ للشخص الطبيعي والنسيج للدماغ للشخص المصاب بورم حميد لديهم نفس القياسات الوصفية الإحصائية التي تختلف اختلافا كبيرا عن النسيج للدماغ لشخص مصاب بورم خبيث. جمعت ثلاثين صورة للدماغ من ثلاثين مراجعين مع اعراض مختلفة (10 صورللدماغ الطبيعي، 10 صور مع ورم في الدماغ يعد حميد و 10 صور مع ورم خبيث في الدماغ بحسب تشخيص الاطباء) . اجري اختبار( F ) لنتائج المتوسط الحسابي لجميع الصور و بحسب شدة البيكسل لقد اظهرت اختلافا كبيرا بين الانواع الثلاثة بحسب اختبار (F ) المساوي الى 25.55 مع قيمة p ) ( اقل من 0.0001.واظهرت نتائج الانحراف المعياري والمتوسط الحسابي فروقات بحسب تباين المتوسط الحسابي لشدة البيكسل تبين ان صور الاورام الحميدة و صور الاشخاص الطبيعيين يوجد بينهما تقريبا فرق بسيط اي انها تسلك نفس السلوك تقريبا في حين انها تختلف اختلافا كبيرا عن صور الاورام الخبيثة مع اختبارات (F) مساوية 23.22 و 6.21 على التوالي مع مطابقة قيم ( p ) نجدها 0.0001 و 0.005 على التوالي .


Article
Diagnosis of brain tumorby using digital image processing technique

Authors: Noor hayder --- Hazeem B. Taher
Journal: Journal of Education for Pure Science مجلة التربية للعلوم الصرفة ISSN: 20736592 Year: 2017 Volume: 7 Issue: 3 Pages: 187-195
Publisher: Thi-Qar University جامعة ذي قار

Loading...
Loading...
Abstract

AbstractIn this paper we propose algorithm for the diagnosis of brain tumor in both cases normal or abnormaltumor, it has been the use of neural network technology after making optimizations, filter andremove the impurities of the brain image. Samples were taken from a group of patients in AL-HusainTeaching Hospitaldisparate ages and both gender, there are 100 images collected 80 of them trainingwhich showed the results of 100% and 20 of these samples were tested results showed 90%.


Article
Automatic Brain MRI Slices Classification Using Hybrid Technique
التصنيف التلقائي للدماغ لصور الرنين المغناطيسي باستخدام تقنية هجينة

Authors: Dr. AhlamFadhil Mahmood د.أحلام فاضل محمود --- Ameen Mohammed Abd-Alsalam أمين محمد عبد السلام
Journal: AL Rafdain Engineering Journal مجلة هندسة الرافدين ISSN: 18130526 Year: 2014 Volume: 22 Issue: 3 Pages: 198-212
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

AbstractThis paper presents an intelligent classification technique to identify normal and abnormal slices of the magnetic resonance human brain images(MRI). The prtoposed hybrid technique consists of four subsequent stages; namely, dimensionality reduction, preprocessing, feature extraction, and classification. In the initial stages, the enhancement and removed unwanted informationare applied to provide a more appropriate image for the subsequent automated stages. In feature extraction stage, the most efficient features like statistical, and Haar wavelet features are extracted from each slice of brain MR images. In the classification stage, initially performs classification process by utilizing Fuzzy Inference System (FIS) and secondly Feed Forward Neural Network (FFNN) is used to classify the braintissue to normal or abnormal.The proposed automated system is tested on a data set of 572 MRI images using T1 horizontal transverse (axial) section of the brain. Hybrid method yields high sensitivity of 100%, specificity of 100% and overallaccuracy of 95.66% over FIS and FFNN. The classification result shows that the proposed hybrid techniques are robust and effective compared with other recently work.Keywords: Brain Tumor Classification; Fuzzy Inference System; Feed Forward Neural Network; MRI .

الملخصتستعرض هذه الورقة تقنية ذكية لتصنيف شرائح صور الدماغ بالرنين المغناطيسي إلى طبيعية أو مرضية. التقنية الهجينة المقترحة تشمل أربعة مراحل : تقليل أبعاد صور الرنين , تجهيزها، واستخراج الميزات ، والتصنيف. في المراحل الأولى، يتم استخدام تقنيات لإزالة المعلومات الغير مفيدة لتوفير صورة أكثر ملائمة لمراحل لاحقة. في مرحلة استخراج الميزات، يتم استخراج الميزات الأكثر كفاءة وهيإحصائية، وميزات المويجات لكل شريحة من صور الرنين المغناطيسي. في مرحلة التصنيف، يتم أولا استخدام نظام الاستدلال الضبابيثم الشبكة العصبية الاصطناعية لتصنيف إلى حالات طبيعية وأخرى مرضية. تم اختبار النظام الأوتوماتيكي المقترح باستخدام البيانات ل572 صورة رنين مغناطيسي لمقطع أفقي محوري لصور الدماغ. الطريقة الهجينة أعطت حساسية عالية مقدارها 100% وكذلك لعامل الخصوصية وبدقة مقدارها 95.66% بدمج المنطق المضبب والشبكة العصبية. نتائج التصنيف أثبتت كفاءة الطريقة المقترحة مقارنة مع أعمال حديثة

Listing 1 - 10 of 15 << page
of 2
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (15)


Language

English (13)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2018 (1)

2017 (4)

2016 (2)

2014 (3)

2011 (1)

More...