research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Molecular diagnosis of E.coliO157:H7 Which Isolated from Children with Diarrhea by using Multiplex PCR
التشخيص الجزيئي لبكتريا E.coliO157:H7المعزولة من براز أطفال مصابين الإسهال باستخدام Multiplex Polymerase Chain Reaction

Authors: Ayad M.Ali أياد محمد علي فاضل --- Amna N. Jassim آمنة نصيف جاسم --- Shatha T. Ahmed شذى ذنون أحمد
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2010 Volume: 7 Issue: عدد خاص بمؤتمر العلمي النسوي 1 Pages: 207-215
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

A total of 96 stool samples were collected from children with bloody diarrhea from two hospitals in Baghdad. All samples were surveyed and examined for the presence of the Escherichia coli O157:H7 and differentiate it from other Non -Sorbitol Fermenting Escherichia coli (NSF E. coli). The Bacterial isolates were identifed by using morphological diagnostic methods, Samples were cultured on liquid enrichment medium, incubated at 37C for 24 hrs, and then cultured on Cefixime Tellurite -Sorbitol MacConkey Agar (CT- SMAC). 32 non-sorbitol fermenting bacterial isolates were obtained of which 11 were identified as Escherichia coli by using traditional biochemical tests and API20E diagnostic system without differentiation between serotype O157:H7 and other NSF E. coli isolates . Four special biochemical tests were done for serotype O157:H7 differentiation from other NSF bacteria. Only 3 isolates belonging to the serotype O157:H7 were obtained . Latex agglutination test for O157 and H7 showed that the 3 isolates gave positive results with both tests. The Bacterial isolates were identifed by using Multiplex Polymerase Chain Reaction (MPCR) technology for the presence or absence of 4 genes (Stx1, Stx2, hlyA and eaeA) that encode for main virulence factors to diagnose E. coli O157:H7 isolated By using specific primers in MPCR . The result showed that one E. coli O157:H7 isolates contain all 4 genes , other isolates contain 3 genes: Stx2, hlyA & eaeA.

جمعت 96 عينة براز لأطفال مصابين بالإسهال الدموي من مستشفى أطفال العلوية ومستشفى المنصور التخصصي. اجري المسح لجميع العينات للتحري وعزل بكتريا Escherichia coli O157:H7 وتمييزهــا عــن باقـي ســلالات E.coli غيــر المخــمرة للسور بتول Non-Sorbitol Fermenting Escherichia coli ((NSF E.coli. شخصت العزلات البكتيرية بإستخدام طرائق التشخيص المظهري حيث زرعت العينـات على وسـط اغنائي سـائل وحضنت بــدرجة حرارية 37 م لمدة 24 ساعة تبعها الزرع على وســط Cefixime - Tellurite Sorbitol MacConkey Agar (CT-SMAC). تم الحصول على 32 عزلة بكتيرية غيرمخمـرة للســوربتول شـخص منها 11 عزلة E.coli وذلك باستخدام الاختبارات الكيموحيوية التقليدية ونظام التشخيص API20E والتي لم تعطِ نتائج كافية تمكن من تفريق النمط المصلي O157 بشكل نهائي عن باقي عزلات NSF E.coli. أجري أربع اختبارات كيموحيوية خاصة لتشخيصE.coli النمط المصلي O157:H7وتمييزه عن باقي NSF E.coli وأظهرت النتائج أن3 عزلات فقط كانت من النمطO157:H7 ، ثم اجري فحص التلازن بحبيبات اللاتكس المرتبطة بالأجسام المضادة للـمستضدين O157 وH7 وأعطت العزلات الثلاث نتيجة ايجابية مع كلا العدتين. شخصت العزلات باستعمال تقنية التفاعل التضاعفي المتعدد لسلسلة الدنا( Multiplex Polymerase Chain Reaction)( (MPCR للكشف عن وجود أوغياب أربعة أنواع من الجينات هي Stx1 و Stx2 و hlyA و eaeA المشفرة لعوامل ضراوة رئيسية لتشخيص بكتريا E.coliO157:H7 المعزولة وذلك بأستخدام بادئات نوعية تستهدف مواقع متخصصة للجينات الهدف المذكورة انفاً وفي تفاعل واحد ، وأظهرت النتائج وجود تباين في المحتوى الجيني بين عزلات بكتريا E.coliO157:H7 حيث احتوت احدى العزلات على الجينات الأربعة بينما احتوت العزلتان الاخريتان على ثلاثة جينات هي Stx2 و hlyA و eaeA

Keywords

E.coliO157:H7 --- MPCR --- Stx1 --- Stx2


Article
Isolation and identification of E.colio157:H7 bacteria and study the number of total coliform and E.coli in fresh beef meat in Basra city
عزل وتشخيص بكتريا E.coli O157:H7 ودراسة اعدادها وأعداد بكتريا القولون الكلية والبرازية في لحوم البقر الطازجة المفرومة في محافظة البصرة

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to detect the presence of bacteria E.colio157:H7 and prepare coliform and E.coli by using the modern methods (petrifilm 3m), for fresh ground beef on five different areasin Basra city ,which is (Al –jazaaer– Abu alkhaseab – Zubair – Basra al kadema and Karmat Ali )during the period extended (January 2013 to desember 2013). Than obtained 27 positive isolation of bacteria E.colio157:H7 from 540 samples of fresh ground beef .the rate are 5%and we adopted in the diagnosis of morphological examinations and biochemical test using Sorbitol MacConkey Agar ,API20E system and latex test. then we showed lowest spoilage of coliform bacteria in abu alkhaseab in feberuary is (1.53) cfu/g ,while the lowest of log number of E.coli in may (1.53) cfu/g. then shows significant differences between months and different areas on fresh ground beef .the most spoilage is in basra al kadema when compared with other areas in this study .

اجريت هذه الدراسة للكشف عن تواجد بكتريا E.coli O157:H7 وأعداد بكتريا القولون الكلية والايشيريشيا البرازية باستخدام طريقة حديثة ومتطورة petrifilm 3M للحم البقر الطازج المفروم ولخمس مناطق مختلفة من محافظة البصرة وهي (الجزائر، ابي الخصيب، الزبير، البصرة القديمة وكرمة علي خلال المدة الممتدة من شهر كانون الثاني 2013 لغاية شهر كانون الاول 2013 وقد تم الحصول على 27 عزلة موجبة لبكتريا E.coli O157:H7 من اصل 540 عينة لحم بقري طازج مفروم وبنسبة 5% من مجموع العينات طول مدة البحث, وقد اعتمد في التشخيص الفحوصات المظهرية والاختبارات الكيموحيوية على وسط Sorbitol MacConkey Agar وبأستخدام نظام API20E وكت التشخيص اللاتكس اذ بينت النتائج بأن لحم البقر الطازج المفروم لمنطقة ابي الخصيب كان الاقل تلوثاً ببكتريا القولون الكلية اذ بلغ متوسط لوغاريتم اعداد بكتريا القولون الكلية 1.52 cfu/gخلال شهر شباط بينما بلغ ادنى متوسط للوغاريتم أعداد بكتريا E.coli 1.53cfu/g لشهر ايار كما لوحظ وجود ارتفاعاً كبيراً بمعدلات متوسطات لوغاريتم اعداد بكتريا القولون الكلية و E.coliللحوم الطازجة المفرومة لمنطقة البصرة القديمة اذ كانت الاكثر تلوثاً عند مقارنتها مع بقية المناطق الاخرى المشمولة بالدراسة

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

Arabic (2)


Year
From To Submit

2016 (1)

2010 (1)