research centers


Search results: Found 10

Listing 1 - 10 of 10
Sort by

Article
Detection of ESBLs in Enteropathogenic E. coli (EPEC) Isolates Associated with Infantile Diarrhea in Kut City

Authors: Jinan A. Shamki --- Alaa H. Al-Charrakh --- Jawad K. Al-Khafaji
Journal: Medical Journal of Babylon مجلة بابل الطبية ISSN: 1812156X 23126760 Year: 2012 Volume: 9 Issue: 2 Pages: 403-412
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

A total of 325 fecal specimens were collected from children with diarrhea. 28 E. coli isolates (8.6%) were recovered and serotypically identified as EPEC. Results found that the highest numbers of the EPEC isolates were belonging to polyvalent I, with the following serotypes, O111: k58(B4) (54%), O55:k59(B5) (14%). The antibiotic susceptibility phenotypes of the EPEC isolates were also determined. All isolates (100%) were multi-drug resistants. None of the isolates were found to be resistant to imipenem. All isolates have been found resistant to at least one β-lactam antibiotic and 27 isolates (96.4%) were able to produce extended-spectrum β-lactamases (ESBLs). This study showed that the prevalence of ESBL among EPEC producers is higher than previous studies in Iraq.

تضمنت هذه الدراسة 325 عينة خروج جمعت من اطفال مصابين بالاسهال. تم الحصول على 28 عزلة عائدة للبكتريا المعوية وبنسبة 8.6% من العينات وشخصت مصليا على انها عائدة للبكتريا المعوية الممرضة. أظهرت النتائج أن أعلى نسبة من العزلات كانت عائدة الى المتعدد المصلى І. تم تحديد الانماط المظهرية للحساسية لعدد من المضادات الحياتية ووجد ان جميع العزلات اظهرت نمط المقاومة المتعدد غير انها كانت جميعها حساسة لقار الاميبينيم. وجد ايضا ان جميع العزلات كانت كانت مقاومة على الاقل لاحد المضادات الحياتية التابعة لمجموعة البيتالاكتام وان 27 منها كانت منتجة لانزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف . وقد اظهرت هذه الدراسة ان انتاج انزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف في هذه العزلات كان بنسبة أعلى مما هو مدون في الدراسات السابقة في العراق.


Article
Novel β-Lactamases in the Clinical Isolates of Enterobacter spp. and Klebsiella pneumoniae in Ramadi General Hospital : A Pharmacodynamics Study
أنزيمات البيتالاكتيميز النادرة في العزلات السريرية لبكتريا الانتيروبكتر و الكلبسيلا المأخوذة من مستشفى الرمادي العام: دراسة فارماكودايناميكية

Author: Majid A. K. Lafi مجيد عبدالكريم لافي
Journal: IRAQI JOURNALOF COMMUNITY MEDICINE المجلة العراقية لطب المجتمع ISSN: 16845382 Year: 2012 Volume: 25 Issue: 2 Pages: 124-129
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Enterobacter spp. and Klebsiella pneumoniae are among the most common gram-negative pathogens associated with hospital infections, they have a distinctive ability to develop antimicrobial resistance during therapy due largely to their unusual β-lactamases, AmpC and ESBLs. Aim of Study: To investigate the occurrence of novel β-lactamases (AmpC and ESBLs) in clinical isolates of Enterobacter spp. and K pneumoniae based on Pharmacodynamics approaches.Materials and Methods: A total of 165 samples collected from AL-Ramadi General Hospital represented by 15 burn swabs, 95 wound swabs and 55 urine samples from in and outpatients from October 2003 to April 2004, by API 20 E system and motility test 13 isolates have been identified to be Enterobacter spp. and 33 isolates to be K pneumoniae from a total 150 isolates in addition to four isolates of Enterobacter spp. identified from 10 isolates taken from a previous study on Klebsiella spp. The susceptibility of the isolates to β-lactam antibiotics were determined by the standard disk diffusion method as described in the guidelines of the National Committee for Clinical Laboratory standards (NCCLs). Appropriate tests were performed for detecting AmpC β-lactamase, confirming this detection, inducibility of AmpC β-lactamase, and ESBL production.Results: The interpretive reading of the antibiogram for Enterobacter spp. 1. Classical AmpC inducible enzyme: 2/17(11.8%) 2. ESBLs enzyme: 10/17(58.8%) 2. The number of derepressed or partially derepressed mutants were 7/17 (41.2%) that representing 7/14 (50%) of E. cloacae. While, for K pneumoniae infers the following: Classical low SHV-1 β-lactamase 2/33 (6.1%), All Enterobacter spp. isolates were resistant to cefoxitin but 15/17 were positive in the AmpC β-lactamase inhibition and the 3DM tests. Out of the 33 isolates of K pneumoniae one isolate was resistant to cefoxitin and showed positive result in the AmpC β-lactamase inhibition and the 3DM tests. Seven isolates of Enterobacter spp. showed blunting effect in the zone diameter of used β-lactams by cefoxitin or imipenem. According to the double disk synergy test for detecting the ESBLs enzyme, 8/17 (27.1%) of our Enterobacter isolates and 19/33 (57.6%) of K pneumoniae positive in giving phantom phenomenon. Conclusion: It is concluded that the high occurrence of the novel β-lactamases in the clinical isolates of Enterobacter spp. and K pneumoniae infers a poor control of the use of antibiotics and infection in this hospital. Key words: Enterobacter spp, Klebsiella pneumoniae, AmpC, ESBLs

الخلاصةالخلفية: من المعروف ان بكتريا الانتيروبكتر والكلبسيلا من اهم عوامل جرام السالبة المرضية المرتبطة بإصبات الخمج المكتسب بالمستشفى, وتمتلك هذه البكتريا إمكانية مميزة لتطوير مقاومة لمضادات المايكروبية خلال فترة العلاج ويرجع ذلك بشكل رئيسي الى إمتلاك أنزيمات غير الاعتيادية مثل أمبلر صنف C (AmpC) وأنزيمات البيتالاكتيميز واسعة الطيف (ESBLs).هدف الدراسة: التحري وملاحظة ضهور الأنزيمات اللغير اعتادية الـ(AmpC) وأنزيمات البيتالاكتيميز واسعة الطيف (ESBLs) في العزلات السريرية لبكتريا الانتيروبكتر والكلبسيلا عن طريق مداخل فارماكودايناميكية.المواد وطرائق العمل: تم جمع 165 عينة تمثلت ب 15 مسحة من مرضى الحروق و95 مسحة من مرضى الجروح الراقدين في مستشفى الرمادي العام ومن 55 عينة إدرار مأخوذة من الأشخاص الراقدين او المراجعين للمستشفى و للمدة من تشرين الأول 2003 ولغاية نيسان 2004، لقد تم استخدام نظام API 20 E واختبار الحركة لغرض تأكيد التشخيص الأولي للعزلات ووجد ان 13 عزلة لجنس الانتيروبكتر, 33 عزلة للكلبسيلا (K pneumoniae) من مجموع 150 عزلة بالاضافة الى اربعة عزلات لجنس الانتيروبكتر تم تشخيصها من 10 عزلات أُخذت من دراسة سابقة لجنس اللكلبسيلا. تم تحديد الحساسية للعزلات لمضادات الحيوية من مجموعة البيتالاكتام بطريقة انشار القرص القياسية كما وردت في دلائل معايير اللجنة الوطنية للمختبر السريري (NCCLs). تم استخدام طرائق مناسبة للكشف عن انتاج أنزيم ال (AmpC) وتأكيد هذا الكشف وأنزيمات البيتالاكتميز الواسعة الطيف واستخدمت طريقة القراءة التفسيرية في قراءة نتائج فحص الحساسية لتسهيل التحري عن وجود آليات المقاومة النادرة.النتائج: بالاعتماد على طريقة القراءة التفسيرية وجد 1. عزلتان من 17 عزلة للانتيروبكتر (11.8%) منتجة لانزيم ال (AmpC) المحفزة التقليدية و 10 (58.8%) 2. عدد العزلات الطافرة المثبطة الكبح كليا او جزئيا 7 من مجموع 17 (41.2%) عزلة لجنس الإنتيروبكتر والذي مثل 7 من 14 (50%) عزلة للنوع E cloacae . اما بالنسبة الى عزلات اللكلبسيلا فقد وجد ان عزلتان من مجموع 33 عزلة (6.1%) منتجة لانزيمات البيتالاكتيميز التقليدية الواطئة (SHV-1). ووجد جميع عزلات الانتيروبكتر مقاومة لسفوكستين ولكن 15/17 (88.2%) أعطت نتيجة موجبة في إختبار تثبيط أنزيمات ال (AmpC) وفي إختبار الثلاثي الأبعاد إما بالنسبة إلى عزلات الكلبسيلا فقد وجدت عزلة واحدة (3%) مقاومة للسفوكسيتين وأعطت نتيجة موجبة في إختبار التثبيط وإختبار الثلاثي الأبعاد, في اختبار تحفيز أنزيمات الـ (AmpC) بواسطة السفوكسيتين و الإميبنم فقد أعطت سبعة من عزلات الانتيربكتر نتجة موجبة للتحفيز, وكما وجد ان 8/17 (27.1%) و 19/33 (57.6%) من عزلات الانتيربكتر والكلبسيلا على التوالي منتجة لأنزيمات البيتالاكتميز الواسعة الطيف بطريقة الأقراص المتآزرة المزدوجة. الاستنتاج: إن وجود أنزيمات البيتالاكتيميز النادرة في العزلات السريرية لبكتريا الانتيروبكتر والكلبسيلا يشير إلى السيطرة الضعيفة في استخدام المضادات الحيوية وضعف السيطرة على العدوى في المستشفى.


Article
Local Study of blaCTX-M genes detection in Proteus spp. by using PCR technique
دراسة محلية للتحري عن جينات blaCTX-M في جنس بكتيريا المتقلبات Proteus spp. بإستخدام تقنية تفاعل الكوثرة

Author: Dimah Nazar Faraj Passat ديمة نزار فرج باصات
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2016 Volume: 57 Issue: 2C Pages: 1371-1376
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

In this study, 25 clinical isolates of Proteus spp. were collected from urine, wounds and burns specimens from different hospitals in Baghdad city, all isolates were identified by using different bacteriological media, biochemical assays and Vitek-2 system. It was found that 15 (60%) isolates were identifies as Proteus mirabilis and 10 (40 %) isolates were Proteus vulgaris. The susceptibility of P. mirabilis and P. vulgaris isolates towards cefotaxime was (66.6 %) and (44.4 %) respectively; while the susceptibility of P. mirabilis and P. vulgaris isolates towards ceftazidime was (20%). Extended spectrum β-lactamses producing Proteus was (30.7 %). DNA of 10 isolates of P. mirabilis and 4 isolates of P. vulgaris were extracted and detection of (blaCTX-M-1, blaCTX-M-2, blaCTX-M-8 and blaCTX-M-9) was done by multiplex polymerase chain reaction (PCR). Results showed the presence of blaCTX-M-2 gene, which is responsible for resistance to cefotaxime in these isolates, while no other types of , blaCTX-M genes were found in them.

في هذه الدراسة تم جمع 25 عزلة سريرية من جنس بكتيريا المتقلبات Proteusمن عينات مختلفة من الادرار، والحروق، والجروح من عدد من مستشفيات مدينة بغداد، تم تشخيص العزلات باستخدام الاوساط البكتيريولوجية والاختبارات البايوكيميائية ونظام Vitek-2، شُخصت 15 عزلة (60 %) لنوع P. mirabilis و 10 عزلات (40 %) لنوع P. vulgaris. كانت نسبة مقاومة عزلات الـ P. mirabilis لمضاد السيفوتاكسيم 66.6 %)) ونسبة مقاومة عزلات الـ P. vulgaris (44.4%) بينما كانت نسبة المقاومة 20%لكلا النوعين لمضاد السيفتازيديم، وكانت نسبة العزلات المنتجة لانزيمات واسعة الطيف 30.7 %. تم استخلاص المادة الوراثية DNA من 10 عزلات من P. mirabilis 4 عزلات من P. vulgaris والتحري عن المورثات المشفرة لـ (blaCTX-M-1, blaCTX-M-2, blaCTX-M-8, blaCTX-M-9) بواسطة تقنية تفاعل الكوثرة، اظهرت النتاىج وجود المورث المشفر للـ blaCTX-M-2 المسؤول عن مقاومة مضاد السيفوتاكسيم في هذه العزلات في حين لم يتم العثور على الانواع الاخرى التابعة للمورثات المشفرة لـ blaCTX-M.


Article
Identification of ESBL CTX-M-15 genes from isolates of urinary tract infections.
الكشف عن جينات الانزيمات المحللة للمضادات الحياتية بيتالاكتام الواسعة الطيف نوع CTX-M-15 من عزلات التهابات المجاري البولية.

Authors: Zahid S.Aziz زاهد سعدون --- Abbas Sh. J. عباس شاكر --- Salman A. Addoos سلمان عزيز
Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2015 Volume: 7 Issue: 1 Pages: 220-236
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

The study aimed to evaluate the distribution of CTX-M genes, which coding for ,Extended Spectrum β- lactamases (ESBLs) which hydrolyzed the extended spectrum β- lactams . Total of 800 urine samples taken from patients suffering from urinary tract infections were collected during the period from February to September from Hospitals in Al-Najaf province. All samples were cultured on MacConkey agar , were the results revealed that 250 isolates were lactose fermentative versus to 50 isolates were lactose non fermentative. The isolates succumbed to conventional tests (IMVC), Indol, Methyl red , Voges- Proskauer and Citrate utilization as well as motility test. Lactose fermentative and non motile isolates were candidate to be confirmed by Vitek2 system. Initial screening tests by Disk Diffusion test and by MacConkey supplemented with 2 mg / liter of Ceftazidime had been conducted, the resultsof disk diffusion test revealed different resistance phenotypes as well as multi drug resistance patterns Ceftriaxone were found to be the most resistant antibiotics in our isolated bacteria with resistance of 100%. The next most resistant antibiotics were Ceftazidime (98.11%), followed by aztreonam (90.57%); and cefotaxime (90.27%). While the result of screening with Ceftazidime reported that 31/53(58.49%) of isolates were initially ESBLs producers. The results of genotyping tests showed that out of 53 isolates which had been screened for the prevalence of bla CTX-M genes, 47(88.6%) were positive. Nucleotide sequence of bla CTX-M of amplicons (19, 20, 22, 23, 24) showed high identity (99%) with CTX-M-15 of NCBI-BLAST. As concerning with protein sequence, the results showed high identity (98%) with reference protein of gene bank. The results of other protein sequences revealed great degree of identity reach to (100%) of identity.

الدراسة كانت تهدف لتقييم انتشار جينات انزيمات السيفوتاكسيم المقاومة للمضادات الحياتية بيتا لاكتام واسعة الطيف ودراسة تتابع النيوكليوتيدات والبروتين لبعض منها.جمعت 800 عينة ادرار للفترة من شباط الى ايلول من العام 2012 لمرضى مصابين بالتهابات المجاري البولية من عدة مستشفيات في محافظة النجف الاشرف. جميع العينات تمزراعتها على وسط الماكونكي الصلب , 300 منه نمت على وسط الماكونكي و اذ كانت 250 منها مخمرة للاكتوز بينما كانت 50 منها غير مخمرة للاكتوز. العزلات خضعت لفحوصات الاندول و احمر المثيل وفحص فوكس بروسكاور واسهلاك السترات بالاضافه الى فحص الحركة .رشحت العزلات الخمرة للاكتوز وغير المتحركة لفحص الفايتك 2. اجريت فحوصات انتشار الاقراص واستخدام الماكونكي الحاوي على 2 ملغم / لتر من السيفتازيديم . نتائج فحص انتشار الاقراص بين انماط مقاومة مختلفة بالاضافه الى انماط تعدد المقاومة , كانت 100% من العزلات مقاومة للمضاد الحياتي سيفترياكزون , بينما كانت المقاومة 98.11% , 90,57% و 90.27% للسيفتازيديم والازترونام والسيفوتاكسيم على التوالي. بينت نتائج الماكونكي الحاوي على السفتازيدبم 2 ملغم / لتر ان 31 / 53 (58.49%) من العزلات ابتداءاً منتجة لانزيمات المقاومة للبيتا لاكتام الواسعة الطيف.بينت نتائج الفحوصات الوراثية لدراسة انتشار جينات انزيمات المقاومة لمضادات البيتا لاكتام واسعة الطيف ان 47(88.6%) من العزلات كانت موجبة . دراسة تتابع نيوكليونتيدات لخمسه من العزلات ( 19 , 20, 22, 23, 24 ) بينت درجة عالية من التشابه وصلت الى (99%) مع CTX-M-15 للNCBI - BLAST . فيما يتعلق بدراسة تتابع البروتينات فان الدراسة بينت ان التشابه كان ( 98%) مع البروتينات القياسية لبنك الجينات كما ان بعض البروتينات اظهرت (100%) من التشابه مع البروتينات القياسية.


Article
Prevalence of Proteus spp. in some hospitals in Baghdad City
انتشار بكتيريا Proteus spp. في بعض مستشفيات مدينة بغداد

Author: Dalia Azher Ahmed داليا ازهر احمد
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2015 Volume: 56 Issue: 1C Pages: 665-672
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

In this research, 152 clinical samples were collected from different hospitals in Baghdad city, 30 isolates of Proteus spp. were identified from urine, wounds and burns by using different bacteriological and biochemical assays. It was found that 20 (66.6%) samples were identifies as Proteus mirabilis and 10 (33.3%) samples were Proteus vulgaris. Among the 30 isolates of Proteus spp., 18 isolates (60%) were isolated from urine samples; 7 (23.3%) isolates from wounds samples and 5 (16.6%) isolates from burns samples. Out of 20 isolates of P. mirabilis, 13 (65%) isolates were from urine samples, 4 (20%) isolates were isolated from wounds samples and 3 (15%) isolates from burns. According to the gender, out of 30 Proteus spp., 17 (56%) were from female and 13 (43%) from male at different age.

في دراسة شملت عدد من مستشفيات مدينة بغداد، تم جمع 152 عينة سريرية مختلفة تضمنت عينات من الادرار، والحروق، والجروح. تم تشخيص 30 عزلة من جنس بكتيريا Proteus باستخدام الاوساط البكتريولوجية والاختبارات البايوكيميائية، شُخصت 20 عزلة (66.6%) لنوع Proteus mirabilis و 10 عزلات (33.3%) لنوع Proteus vulgaris. كذلك تم عزل جنس الـ Proteus بواقع 18 عزلة (60%( من عينات الادرار، و 7 عزلات (23.3%) من الجروح ، و5 عزلات (16.6%) من الحروق. كانت نسبة عزل بكتيريا P. mirabilis من العينات السريرية قيد الدراسة بواقع 13 عزلة (% 65( تم عزلها من عينات الادرار، و4 عزلات (20%) من عينات الجروح، و3 عزلات (15%) من عينات الحروق. وفقاً لجنس المصاب تم عزل 17 عزلة (56%) من P. mirabilis من اصابات الذكور بينما كانت نسبة عزل البكتيريا من اصابات الاناث (43%) بواقع 13 عزلة.


Article
الكشف عن انزيمات البيتالاكتاميز واسعة
الطيف ESBLs في بكتريا Pseudomonas

Author: عباس ورنا
Journal: journal of the college of basic education مجلة كلية التربية الاساسية ISSN: 18157467(print) 27068536(online) Year: 2015 Volume: 21 Issue: 90 / علمي Pages: 61-68
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية


Article
Detection of Extended Spectrum β–Lactmase GeneeCTX-M-1 in Escherchia coli and Klebseilla pneumonia Isolated from Urinary Tract Infection of Pregnant Women in Al-Nassyriah City

Authors: Nasser Saleh Lhwak --- Yahya A.Abbas
Journal: JOURNAL OF THI-QAR SCIENCE مجلة علوم ذي قار ISSN: 19918690 Year: 2018 Volume: 6 Issue: 4 Pages: 92-96
Publisher: Thi-Qar University جامعة ذي قار

Loading...
Loading...
Abstract

This study was performed to detect the presence of CTX-M-1 gene in Klebseilla pneumonia and Escherchia coli are that causing urinary tract infections in pregnant women in Al- Nassyriah city , during the period from september (2016) to february (2017).Three hundred and thirty (n= 330) urine samples were collected and cultured on appropriate media for initial isolation. Morphological, conventional biochemical tests and API 20 system were performed to identify the pathological bacteria agents.Ninety samples showed positive culture, the most common isolates were E. coli 57 (63.3%) followed by K. pneumonia 21(23.3%) and 12(13.3%) from other Gram negative bacteria.ESBLs gene CTX-M-1(688 bp) was found in 22 isolates 17/57 (29.8%) in E.coli and 5/21 (23.8 %) in K. pneumonia.

Keywords

ESBLs --- E.coli --- K.pneumoniae --- Pregnant Women --- UTI


Article
Detection of 16S rRNA Methylases and Co-Resistance with β-lactams among Klebsiella pneumoniae Isolates from Iraqi Patients
تشخيص انزيمات مثيلة 16S rRNA و المقاومة المشتركة مع البيتالاكتام في عزلات Klebsiella pneumoniae من المرضى العراقيين

Authors: Mustafa Suhel Mustafa مصطفى سهيل مصطفى --- Rana Mujahid Abdullah رنا مجاهد عبدالله
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2019 Volume: 16 Issue: 3 Pages: 580-587
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Out of 150 clinical samples, 50 isolates of Klebsiella pneumoniae were identified according to morphological and biochemical properties. These isolates were collected from different clinical samples, including 15 (30%) urine, 12 (24%) blood, 9 (18%) sputum, 9 (18%) wound, and 5 (10%) burn. The minimum inhibitory concentrations (MICs) assay revealed that 25 (50%) of isolates were resistant to gentamicin (≥16µg/ml), 22 (44%) of isolates were resistant to amikacin (≥64 µg/ml), 21 (42%) of isolates were resistant to ertapenem (≥8 µg/ml), 18 (36%) of isolates were resistant to imipenem (4- ≥16µg/ml), 43 (86%) of isolates were resistant to ceftriaxone (4- ≥64 µg/ml), 42 (84%) of isolates were resistant to ceftazidime (16-64 µg/ml), and 40 (80%) of isolates were resistant to cefepime (4- ≥16µg/ml). Co-Resistance for both β-lactams and aminoglycosides were detected among 25 (50%) of K. pneumoniae isolates. The extended spectrum beta-lactamases (ESBLs) were detected among 25 (50%) of K. pneumoniae isolates. Screening of 16S rRNA methylases encoding genes revealed that armA was found in 5 (10%) of K. pneumoniae isolates, whereas rmtB was not found among K. pneumoniae isolates. DNA sequencing of armA revealed that the presence of missense mutations in which affected in the translation of protein by substitutions of amino acids, leading to increase the resistance values of MICs for gentamicin and amikacin. These variants were registered in NCBI at the accession number LC373258. The phylogenetic tree of armA variants showed a slight deviation of these variants from K. pneumoniae species.

تم الحصول على 50 عزلة من بكتريا Klebsiella pneumoniae من 150 عينة سريرية، اذ شخصت حسب الصفات المظهرية و الكيموحيوية. جمعت العزلات من حالات سريرية مختلفة شملت الادرار 15 (30%) و الدم 12 (24%) و القشع 9 (18%) و الجروح 9 (18%) و الحروق 5 (10%). اظهرت نتائج التراكيز المثبطة الدنيا MICs ان25 (50%) عزلة كانت مقاومة لمضاد gentamicin (≤16 مايكروغراممل) و 22 (44%) عزلة مقاومة لمضاد amikacin (≤64 مايكروغراممل) و 21 (42%) عزلة مقاومة لمضاد ertapenem (≤8 مايكروغراممل) و 18 (36%) عزلة مقاومة لمضاد imipenem (4 -≤16 مايكروغراممل) و43 (86%) عزلة مقاومة لمضاد ceftriaxone (4-≤64 مايكروغراممل) و 42 (84%) عزلة مقاومة لمضاد ceftazidime (64-16 مايكروغراممل) و40 (80%) عزلة مقاومة لمضاد cefepime (4-≤16 مايكروغراممل). تم تشخيص المقاومة المشتركة لكل من مضادات البيتالاكتام و الامينوكلايكوسيدات ضمن 25 (50%) من عزلات بكتريا K. pneumoniae . تم تشخيص انزيمات البيتالاكتميز واسعة الطيف ESBLs ضمن 25 (50%) من عزلات بكتريا K. pneumoniae . اظهرت نتائج التحري عن الجينات المشفرة لانزيمات مثيلة 16S rRNA ان الجين armA كان موجودا في 5 (10%) من عزلات بكتريا K. pneumoniae. من جهة اخرى اظهرت النتائج عدم وجود الجينrmtB في عزلات بكتريا K. pneumoniae . اظهر تحليل تتابع الحامض النوويDNA للجين armA وجود طفرات انحشار اثرت في ترجمة البروتين من خلال استبدال الاحماض الامينية بحيث ادى ذلك الى زيادة في قيم التراكيز المثبطة الدنيا MICs لكل من المضادين gentamicin و amikacin . تم تسجيل هذه التغايرات في موقع NCBI تحت الرقم التسلسلي LC373258. ان الشجرة التطورية لتغايرات الجين armA اظهرت ان هناك انحراف طفيف لهذه التغايرات عن النوع K. pneumoniae .


Article
Study the antibiotics sensitivity and beta- lactamase productivity of some Staphylococcus spp. Isolates from different sources of the Al Jamhoree Teaching Hospital in Mosul City
دراسة حساسية المضادات الحيوية وانتاجها لانزيمات بيتا لاكتاميز لبعض انواع Staphylococcus spp. المعزولة من مصادر مختلفة في مستشفى الجمهوري التعليمي في مدينة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

The study includes the isolation of certain types of Gram-positive bacteria Staphylococcus spp..The sample materials (blood, wounds, burns) were collected from both genders of all age groups of inpatients in Al Jamhoree Teaching Hospital in the Mosul during June till end of November 2018.Staphylococcus aureus was the most common among the isolates with 7 isolates(38.9%) followed by Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus scriuri Staphylococcus lentus (Staphylococcus simulans) with 2 isolates each with 11.1% followed by Staphylococcus chromogenase, Staphylococcu scapilis and Staphylococcus xylosus with one isolate for each one 5.5%. The number of isolates was 9 isolates and 50%, followed by wound samples. The isolates were 6 isolated by 33% and the samples of burns were 3 isolates. 17% were isolated and Staphylococcus aureus was the most dominant species.The sensitivity of bacterial isolates was studied for 15 antibiotics for different antibiotic groups. The results showed that a difference in the resistance ratio of the isolates to these antagonists, as they were resistant to the Ceftrixone, Cloxacillin 100%.The Ciprofloxacillin, Gentamycin, Pipracillin, and Amikacin resistance were reduced. The Ciprofloxacillin antagonist was the most affected on the bacterial isolates studied, followed by the Rifampin. The results showed that the beta-lactamase enzyme was not produced by any of the Iodic methods by 4 bacterial strains, while the rest of the species varied in the susceptibility of production to the enzyme. The Iodine tube is one of the best methods to detect the production of these enzymes.The susceptibility of bacterial species to the production of large-spectrum beta-lactase enzymes was also tested using the National Committee for Clinical Laboratory Standards (NCCL) and the double-disc method. Staphylococcus lentus, Staphylococcus capilis, Staphylococcus chromanogenes The first NCCL has shown a single isolation of Staphylococcus capilis ability to produce it.

تضمنت الدراسة عزل بعض انواع الجنس Staphylococcus الموجبة لصبغة كرام من عينات مختلفة شملت (الادرار, مسحات الجروح ,الحروق) من المرضى الراقدين في مستشفى الجمهوري التعليمي في مدينة الموصل لكلا الجنسين وللفترة من حزيران الى تشرين الثاني سنة 2018 وبمختلف الاعمار.أظهرت النتائج عزل انواع بكترياStaphylococcus وبنسبة 13.2% وكانت بكتريا Staphylococcus aureus الاكثر شيوعا من بين العزلات اذ تم الحصول على7 عزلات بنسبة 38.9% تلتها بكتريا Staphylococcus epidermidis و Staphylococcus scriuri Staphylococcus lentus, Staphylococcus simulans بواقع عزلتين لكل منهم وبنسبة 11.1 % ثم تلتها بكتريا Staphylococcus chromogenese , Staphylococcu scapilis, Staphylococcus xylosus بواقع عزلة واحدة لكل منها وبنسبة 5.5 %.تم التحري عن نسبة انتشار هذه البكتيريا حسب مصدر العزل وأظهرت النتائج ان اكثر العزلات تم تشخيصها من عينات الادرار اذ بلغ عدد العزلات 9 عزلات وبنسبة (50 %) تلتها عينات الجروح وكان عدد العزلات 6 عزلات بنسبة 33% ثم عينات الحروق اذ بلغت عدد العزلات 3 عزلة بنسبة17 % وان النوع Staphylococcus aureus كان الاكثر سيادة في الادرار.درست حساسية العزلات البكتيرية لـ 15 مضادا حيويا لمجاميع المضادات الحيوية المختلفة وبينت النتائج تفاوتاً في نسبة مقاومة العزلات لهذه المضادات إذ كانت مقاومة لمضادات الـCeftrixone,Cloxacillin وبنسبة 100% .في حين انخفضت نسبة المقاومة لجميع العزلات تجاه مضادات Rifampin, Ciprofloxacillin, Gentamycin, Pipracillin, Amikacin إذ لوحظ من خلال النتائج أنَ مضاد الـCIP كان الأكثر تاثيراً على العزلات البكتيرية قيد الدراسة تلاه المضاد Rifampin.وتضمنت الدراسة التحري عن إنتاج أنزيمات بيتا لاكتاميز من قبل العزلات قيد الدراسة بالطرائق الأيودية (الأنبوب الأيودية, البقعة الأيودية, الأنبوب الحامضية) وبينت النتائج عدم إنتاج الأنزيم باي طريقة من الطرائق الأيودية من قبل 4 سلالات بكتيرية فيما تباينت بقية الأنواع في قابلية انتاجها للأنزيم وكانت طريقة الأنبوب الأيودية من أفضل الطرائق للكشف عن إنتاج هذه الأنزيمات.كما اختبرت قابلية الأنواع البكتيرية على إنتاج أنزيمات البيتا لاكتاميز واسعة الطيف باستعمال طريقة National Committee Clinical Laboratory Standards الاولي (NCCL) وطريقة القرص المزدوج وقد أظهرت عزلة واحدة من كل من Staphylococcus lentus ,Staphylococcus capilis, Staphylococcus chromanogenes قابليتها على إنتاج الأنزيم بطريقة القرص المزدوج أمَا بطريقة NCCL الأولى فقد أظهرت عزلة واحدة للـ Staphylococcus capilis القدرة على إنتاجه


Article
Molecular characterization of extended spectrum β-lactamase (ESBL) producing Shigella species isolated from patients with bacillary dysentery in Iraq.
الخصائص الجزيئية لانزيمات البيتا لاكتاميز واسعة الطيف الَمُنتَجَة في انواع من جرثومة الشيجيلا المعزولة من مرضى مصابين بالزحار العصوي في العراق

Author: Thanaa R. Abd Al-Rahman ثناء رشيد عبد الرحمن
Journal: Journal of the Faculty of Medicine مجلة كلية الطب ISSN: PISSN: 00419419 / EISSN: 24108057 Year: 2013 Volume: 55 Issue: 3 Pages: 244-249
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Extended-spectrum β-lactamases (ESBLs), including cefotaximases (CTX-M), mediate resistance to extended spectrum cephalosporins and significantly compromise the treatment tools for Shigellosis.Objective: To determine the ESBLs production by Shigella spp. and its role in the resistance to third generation cephalosporins and to determine the occurrence of plasmid- borne blaCTX genes in ESBLS Shigella isolates by Multiplex PCR.Methods: Susceptibility of 59 clinical Shigella isolates was tested by disk diffusion method to six antimicrobial agents. Presence of ESBLs was established by the combination disk method. Minimum inhibitory concentration of β-lactams was determined by agar dilution method for resistant isolates, and then ESBL producers were subjected to plasmid extraction and PCR experiments.Results: Overall isolates had high rate of resistance to Ampicillin (84.7%), Tetracycline (84.7%), Co-trimoxazole(72.9%) and Cefotaxime(69.5%). Moderate to Ceftriaxone (52.5%) and low rate of resistance to Ceftazidime(30.5%). The MIC value of resistant isolates of S. sonnei and S. flexneri for CTX and CRO ranged from (64-512 μg/ml) for both, and (32-256 μg/ml) for CAZ, whereas S. dysenteriae exhibit only high level resistance MIC (256 μg/ml) for CTX, low level resistance (64 μg/ml) for CRO and complete susceptibility to CAZ. 31 of 41 (75.6 %) of Shigella spp. were β-lactamase producers, of these (82.6%) were S. flexneri, (68.8%) S. sonnei, and one S. dysenteriae isolate. The results of PCR amplification of bla CTX gene groups showed that blaCTX-M genes were identified in (74.19%) ESBLs isolates distributed as 14(45.16%) S.flexneri isolates, 9(29.03%) S. sonnei, while no gene was detected in ESBLs S. dysenteriae isolate. The prevalence of bla CTX-M I, bla CTX-M II (TOHO 1) and blaCTX-M III, were ( 54.8%, 16.1% and 3.2% ) respectively. Non of the isolates carried more than one type.Conclusion: The occurrence of plasmid- borne blaCTX genes in ESBLS Shigella isolates are increasing in Iraq with co-resistance to some other classes of antibioticsKey words: Cephalosporines Resistance, Shigella spp., Plasmid; ESBLs, CTX-M.

انزيمات البيتا لاكتاميز واسعة الطيف ومن ضمنها الانزيم المحلل للسيفوتاكسيم (CTX-M ) تكون مسؤولة عن المقاومة للسيفالوسبورينات واسعة الطيف مما يؤدي الى افشال العلاج لمرضى الزحار العصوي بشكل ملحوظ.الهدف:لتحديد الانواع المنتجة من جرثومة الشيجيلا لانزيمات البيتالاكتاميز ودور هذه الانزيمات في المقاومة للجيل الثالث من السيفالوسبورينات واسعة الطيف والمرتبطة بجينات السي تس اكس((CTX-M المحمولة على البلازميدات باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البوليميريزالمتعددة ((Multiplex PCR .طرق العمل :تم اجراء اختبار الحساسية لستة مضادات حياتية على 59 جرثومة شيجيلا باستخدام طريقة انتشارالقرص في الهلام ومن ثم تم الكشف عن الانواع المنتجة لانزيمات البيتا لاكتاميز واسعة الطيف بطريقة الاقراص المركبة. استخدمت طريقة التخفيف الثنائي في الهلام لتحديد التركيز المثبط الأدنى لعزلات الشيجيلا المقاومة لمجموعة من البيتا لاكتام والتي شملت (Cefotaxime Ceftraixone وCeftazidime) ثم تم استخلاص البلازميدات التي استخدمت للكشف عن جينات السي تي اكس بطريقة تفاعل سلسلة البوليميريزالمتعددة.النتائج : اظهرت النتائج مقاومة عالية بنسبة ( 84.7%) لمضادي Ampicillin و Tetracycline ونسبة (%72.9) و (%69.5) لمضادي Co-trimoxazoleو Cefotaxime على التوالي. اما المقاومة للمضادي Ceftazidime, Ceftraixone فتراوحت بين المتوسطة الى المنخفضة وبنسب (52.5%) و( (30.5على التوالي.تراوحت قيمة التركيز المثبط الادنى بين (ml/µg 512-64) لمضادي CTX وCRO وبين (256-32 (ml/µg لمضاد CAZ لجرثومتي الشيجيلا فلكسنيري والشيجيلاسوني . اما نوع الشيجيلا ديزنتري فقط اظهر مقاومة عالية (256 ml/µg) لمضاد Cefotaxime ومستوى مقاومة واطئة(64 ml/µg ) لمضاد Ceftraixone وحساسية كاملة لمضاد .Ceftazidimeتم الكشف عن انتاج انزيم البيتا لاكتاميز في احدى واربعين عزلة مقاومة لواحدة او اكثر من سبورينات الجيل الثالث واظهرت الدراسة ان 31(75.6 %) من العزلات كانت منتجة لهذا الانزيم منها 19(82.6 %) نوع شيجيلا فلكسنيري و11(68.6%) نوع شيجيلا سوني اضافة الى عزلة واحدة من نوع شيجيلا ديزنتري. الكشف الجيني لمحددات المقاومة بتقنية ال PCR المتعددة اظهر وجودالجينات في 23 (74.19%) من العزلات المنتجة للانزيم الواسع الطيف وبنسبة(45.16%) في شيجيلا فلكسنيري و29.03%)) شيجيلا سوني بينما لم يتم الحصول على الجينات في عزلة الشيجيلا ديزنتري . ايضا اظهرت النتائج ان الجينات المتمثلة بالمجموعة الاولى, blaCTX-M I المجموعة الثانية M II ( TOHO1) blaCTX - , المجموعة الثالثة blaCTX-M III وجدت بنسب (54.8% , 16.1% (%3. 2 ,على التوالي, ولم تحمل اي من العزلات اكثر من مجموعة.الاستنتاجات :تزايد المقاومة لمضادات البيتا لاكتمز نتيجة لانزيمات البيتالاكتاميز الواسعة الطيف ذات المحددات الجينية المحمولة على البلازميدات في انواع من جراثيم الشيجيلا في العراق وتزامن وجودها مع المقاومة لاصناف اخرى من المضادات الحياتية .مفتاح الكلمات :مقاومة سيفالوسبورينيس،انواع ا لشيجيلا. ، بلازميد؛ انزيمات البيتا لاكتاميز الواسعة الطيف ، جينات سي تي إكس - إم.

Listing 1 - 10 of 10
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (10)


Language

English (9)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2019 (2)

2018 (1)

2016 (1)

2015 (3)

2013 (1)

More...