research centers


Search results: Found 7

Listing 1 - 7 of 7
Sort by

Article
Study of transferrin polymorphism in a population of Carp (Cyprinus carpio)

Author: T.A. Jaayidand N.M. Aziz
Journal: Marsh Bulletin مجلة الاهوار ISSN: 18169848 Year: 2009 Volume: 4 Issue: 2 Pages: 162-168
Publisher: Basrah University جامعة البصرة

Loading...
Loading...
Abstract

This study was carried out at the college of agriculture, Basrah university. Fifty blood samples taken from carp (Cyprinus carpio) analyzed by Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) under alkaline conditions at pH 9.8. The present study is aimed to provide the first insight into the genetic constitution of carp based upon analysis of Transferrin. Five genetic types of transferrin were revealed (Tf1Tf1, Tf2Tf2, Tf5Tf5, Tf3Tf2 and Tf1Tf5) in Carp controlled by four allelic genes of that locus (Tf1, Tf2, Tf3 and Tf5). These fractions are controlled by co dominant autosomal genes according to the Mendelian laws of inheritance. Differences in gene frequencies between alleles were observed. The gene frequencies of Tf1, Tf2, Tf3 and Tf5 were 0.15, 0.51, 0.29 and 0.05, respectively. The predominant genotype was Tf2Tf2 (44%) then Tf3Tf3 (22%). Transferrin was identified as highly polymorphic protein markers which is a result of importance for future genetic characterization of the carp .


Article
Analysis of Glutathione S-Transferase M1 and T1 Polymorphism in Samples of Iraqi Children with Autism

Authors: Nada Abed AL-Majeed AL-Ansari --- Esraa Mahmood Majeed Ahmed --- Haider Abdulmuhsin AL-Maliky
Journal: Mustansiriya Medical Journal مجلة المستنصرية الطبية ISSN: 20701128 22274081 Year: 2017 Volume: 16 Issue: 3 Pages: 28-38
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية

Loading...
Loading...
Abstract

Aims: Is to find relationship between autism and absence of Glutathione-Stransferase (GSTs) genes GSTT1 and GSTM1, which are responsible for detoxification from the body. Methods: The present study includes the collection of (sixty) Iraqi children with a psychiatrist autism, the range of their age was 2-10 years. All blood samples were subjected to multiplex polymerase chain reaction (PCR) technique in laboratories of college of science (for Woman) Baghdad University for detection of the presence or absence of the gene encode for glutathione protein, and determination of the level of mercuryand lead in blood samples. Results: The results of the study showed that the male: female ratio in autistic children is (5.7:1). The percentage of children who have (GSTM1-null) genotype was 55.9% higher than the children 44.0% with (GSTM1-positive) genotype while the frequency of (GSTT1-null) genotype (11.8%) was lower than that of (GSTT1-positive) genotype (88.1%) in the tested cohort.The numbers of parents who have a positive GSTM1 genotype are lower than other groups while the number of parents who have a positive GSTT1 is higher than in other groups. The present study reveals that the presence of high concentrations of mercury in the blood samples for all children with autism compared with their families and with the normal value. Conclusions: It is concluded from the present study that the deletion or absence of GSTM1 genotype in autistic children is higher than presence. This indicates that GSTM1- null genotype is related to the ASD but not as a risk factor for autism. The highfrequency of GSTT1 positive genotype in autistic children and their parents is an indicator for a relationship between them. Further studies with large size of samples is needed to detect the activity of oxidative stress effect of enzymes encoded by alleles of GSTT1 genes.


Article
Genetic polymorphisms of GSTM1 and GSTT1 Genes and Endometrial Cancer in Basrah, south of Iraq
التعدد الوراثي للجينين GSTM1 و GSTT1 وعلاقتهما بخطورة الاصابة بسرطان بطانة الرحم في البصرة جنوب العراق

Author: Adnan Issa Al-Badran عدنان عيسى البدران
Journal: Journal of Basrah Researches (Sciences) مجلة ابحاث البصرة ( العلميات) ISSN: 18172695 Year: 2011 Volume: 37 Issue: 5A Pages: 54-59
Publisher: Basrah University جامعة البصرة

Loading...
Loading...
Abstract

The genes glutathione S- transferase M1 (GSTM1) and GSTT1 involved in phase II metabolism catalyse glutathione – mediated reduction of exogenous and endogenous electrophiles. A case control study was designed to identify the association between polymorphisms at GSTM1 and GSTT1 genes and endometrial cancer risk. While there was a lack of association between GSTM1 null genotype with the risk of endometrial cancer, the null genotype of GSTT1 had a 5.7 fold increased risk toward endometrial cancer (OR=5.76; 95% CI = 2.07-15.97). Both GSTM1, GSTT1 null genotype increased risk to about 3 fold. When stratified according to different grades of endometrial cancer the GSTM1 was more representative in grade III (OR=2.6), the association becomes stronger when the GSTT1 gene was also null (OR= 4.6).

الجينين GSTM1 و GSTT1 من ضمن جينات الطور الثاني التي تعمل على ايض المواد المسرطنة الداخلية والخارجية.صممت هذه الدراسة للتعرف على العلاقة بين التعدد الوراثي في الجينين GSTM1 و GSTT1 وزيادة الخطورة بالاصابة بسرطان بطانة الرحم في النساء . وجدت الدراسة انه لاتوجد علاقة احصائية واضحة بين فقدان الجين GSTM1 وخطورة الاصابة بسرطان بطانة الرحم بينما ازدادت هذه الخطورة بمقدار اكثر من خمس مرات عند فقدان الجين . GSTT1 وعند توزيع عينات المرضى استنادا الى درجة المرض فقد وجد ان فقدان الجين GSTM1 قد تمثل بشكل كبير في الدرجةالثالثة Grade IIIمن المرض (OR= 2.7) . هذا الارتباط كان اكبر عندما كان الجين GSTT1 مفقودا ايضا(OR= 4.6).


Article
The role of genetic polymorphism of glutathione -S transferase in cancer development and anticancer drug resistance
دورالتغيرات الجينية لانزيم الكلوتاثيون اس تراسفريس في تطور مرض السرطان وفي مقاومة العلاج

Loading...
Loading...
Abstract

Glutathione S-transferse family is an antioxidant enzymes. This family of proteins is characterized by enzymatic and non-enzymatic properties that have rendered them an important factor in many metabolic processes, including internal and external origin detoxification , cell proliferation, apoptosis, and drug resistance. The genetic polymorphisms in glutathione s- transferase affect the biologic activity of this enzyme and thus affect its role in the metabolic pathways that participates in it and make subjects vulnerable to many of the cancerous diseases that have been addressed here. In addition, genetic polymorphism of GST may affect on the response of the patients to anticancer drugs.

يعتبر انزيم الكلوتاثيون اس- ترانسفريز من الانزيمات المضادة للاكسدة . تمتاز هذه العائلة من البروتينات بامتلاكها صفات انزيمية وغير انزيمية جعلت منها عامل مهم في العديد من العمليات الايضية ومن ضمنها ازالة السموم الداخلية والخارجية المصدر وتكاثر الخلية وموت الخلية المبرمج ومقاومة العلاج . ان التغيرات الجينية في انزيمات الكلوتاثيون اس- ترانسفريز بانها تؤثر على الفعالية البايلوجية للانزيم وبالتالي تؤثر على دوره في العلمليات الايضية التي يدخل فيها وتجعله عرضة للعديد من الامراض السرطانية التي تم التطرق لها هنا بالاضافة الى ان التغيرات الجينية للانزيم تؤثر على استجابة المريض للادوية المضادة للسرطان .


Article
Detection of Genetic Polymorphism in Iraqi Barley using SSR-PCR Analysis
الكشف عن تعدد الأشكال الوراثية في الشعير العراقي باستخدام تحليل التكرار التسلسلي البسيط

Author: Zeina S. M. Al-Hadeithi زينه سيف الدين محمد الحديثي
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2016 Volume: 57 Issue: 2B Pages: 1158-1164
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Nine Iraqi varieties of barley (Hordeum vulgare L.) has been differentiated and diagnosed using simple sequence repeat markers to detect their genetic polymorphism. Six SSR primers were used for genetic screening of barley samples (IPA 265, IPA 99, Tuwaitha, Hitra, Rayhan, Shuaa, Bawadi, Samir and Al_khair). These primers generated total PCR product (11) bands divided to 8 polymorphic bands 3 monomorphic bands. the percentage of polymorphism 80% ranged between (50-100%). a mean value of polymorphic band per primer was 1.6 . these primers produced amplification fragment at Molecular weight between 75-900 bp. One unique band was generated at size 200bp, this band can be used as a DNA profiling of all studied genotypes. These results appeared genetic distances ranged between (0.01098-0.99708) among studied varieties. Using the unweighed pair-group method using arithmetic averages (UPGMA) cluster analysis, nine barley landraces were clustered into two main clusters depending on their ancestors and to their spike type (two-row and six-row barley). These results will be useful for barley germplasm management in terms of biodiversity protection and breeder’s rights protection.

تسعة أصناف من الشعير العراقي تم تمييزها وتشخيصها باستخدام مؤشرات التكرار التسلسلي البسيط للكشف عن التباين الوراثي فيما بينها. استخدمت ستة بادئات خاصة في الفحص الجيني لعينات الشعير (اباء 265, اباء 99, تويثة, الحضر, ريحان, شعاع, بوادي, سمير, الخير). أنتجت تلك البادئات 11 حزمة قسمت الى 8 حزم متباينة و 3 منها حزم متماثلة. وبلغ التباين الوراثي 80% و تراوح بين (50-100%). وكان معدل الحزم المتباينة لكل بادئ 1.6. هذه البادئات أنتجت حزم مضخمه بوزن جزيئي بين 75-900 زوج قاعدي. ظهرت حزمة فريدة واحدة بوزن 200 زوج قاعدي, هذه الحزمة يمكن استخدامها كمؤشر وراثي للأصناف المدروسة. أظهرت هذه النتائج نسبة البعد الوراثي بين (0.01098- 0.99708) للأصناف المدروسة. استخدام التحليل العنقودي جمع الأصناف التسع في مجموعتين رئيسيتين اعتمادا على أسلافهم و نوع السنبلة (2 صف و6 صف) وهذه النتائج تفيد في إدارة الأصول الوراثية من حيث حماية التنوع البيولوجي وحماية حقوق المربي.


Article
Estimation of Genetic Distances Among Some Local Okra Cultivars Using Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers
تقدير الإبعاد الوراثية بين بعض أصناف الباميا المحلية باستعمال مؤشرات التضاعف العشوائي المتعدد الأشكال لسلسلة الدنا (RAPD)

Authors: Thamer Khudair Merza ثامر خضير مرزة --- Hayder Sadaq Jaafer حيدر صادق جعفر
Journal: Kufa Journal for Agricultural Sciences مجلة الكوفة للعلوم الزراعية ISSN: 20727798 23128186 Year: 2017 Volume: 9 Issue: 4 Pages: 31-46
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

An experiment was conducted in Molecular Biological laboratory in the Faculty of Science / University of Kufa in 2016 to find out genetic distance of six Local okra cultivars using Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD). Polymorphisms were scored within amplified fragment (their number and molecular sizes) using agarose gel electrophoresis after staining with ethidium bromide. Five primers generated polymorphic patterns and selected among studied cultivars. These primers gave 19 Polymorphic bands from total 41 main bands. The results revealed that, the lowest molecular size to the amplified fragments was generated by UBC-514 reach 276 bp while (1654 bp) was amplified by OPX-18 primer that has the highest molecular size of the amplified fragments. From all of the used primers in the experiment, the primer UBC-210 gave the highest values to the main, amplified and polymorphic band numbers which reached 9, 46 and 14 band compared with the lowest values to these bands which reached 0, 12 and 12 band respectively, produced from primer UBC-620. The highest percentage of polymorphism ratio and the primer efficiency from primer UBC-210 reached %64.3 and %0.2 on sequence while, primer UBC-620 did not reveal give any percenage of the polymorphism ratio and primer efficiency. The results also showed that the highest value of genetic dimes ion (genetic distance) was between the two cultivars: 2 Husinawia Karbala and 5 Husinawia Al-Halle that reached 0.676 comparing with the lowest value to the genetic distance between the two cultivars, 3 Batira Baghdad and 5 Husinawia Al-Halle that reached 0.143. Cluster analysis (phylogenetic tree) revealed two main groups (A and B) with 0.533 distance, Cluster A contained 4 cultivars: Batira Baghdad, Khinyasri Al-Basra, Husinawia Al-Halle and Al-Mawassalia while Cluster B contained 2 cultivars: Husinawia Al-Nasirya and Husinawia Karbala. The results concluded that RAPD parameters were important in revealing polymorphism genetic and its efficiency on the primers number and the genetic distance between the studied cultivars.

أجريت هذه التجربة في مختبر البايولوجي الجزيئي في كلية العلوم / جامعة الكوفة سنة 2016 م، لمعرفة البعد الوراثي لستة أصناف من الباميا المحلية باستعمال مؤشرات التضاعف العشوائي المتعدد الأشكال لسلسلة الدنا Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD). كشف عن التباينات بين القطع المتضاعفة لكل صنف (إعدادها وأحجامها الجزيئية) بعد ترحيل نواتج التضاعف للعينات على هلام الاكاروز وتصبيغها ببروميد الاثيديوم. اختيرت خمسة بوادئ والتي أظهرت نواتج تضاعف متباينة بين الأصناف قيد الدراسة، إذ أعطت تلك البوادئ 19 حزمة متباينة Polymorphic bands من مجموع 41 حزمة كلية. بينت النتائج أن اقل حجم جزيئي للقطع المتضاعفة كان عند البادئ UBC-514 إذ بلغ 276 زوج قاعدي بينما البادئ OPX-18 امتلك أعلى حجم جزيئي للقطع المتضاعفة وبلغ 1654 زوج قاعدي. وأعطى البادئ UBC-210 أعلى القيم لعدد الحزم الكلية والمتضاعفة والمتباينة بلغت 14 و 46 و 9 حزمة قياسا" بالبادئ UBC-620 الذي أنتج اقل قيما" لتلك الحزم بلغت 2 و 12 و 0 حزمة، على التتابع. أن أعلى نسبة مئوية للتباين الشكلي وكفاءة البادئ بلغت 64.3% و 0.2% على التتابع أعطاها البادئ UBC-210، بينما لم يعط البادئ UBC-620 أي نسبة مئوية للتباين الشكلي ولا كفاءة البادئ. أشارت النتائج إلى أن أعلى قيمة للبعد الوراثي (مسافة وراثية) كانت بين الصنفين حسينـاوية كربلاء 2 وحسيناوية الحلة 5 وبلغت 0.676 مقارنـة باقل قيمة للبعد الوراثـي بين الصنفين بتيرة بغداد 3 وحسيناوية الحلة 5 وبلغت 0.143. فيما كشف التحليل التجميعي (شجرة العلاقة الوراثية) مجموعتين وراثيتين رئيستين (B و A) البعد بينها 0.533، ضمت المجموعة الكبيرة وتدعى A أربعة أصناف هي بتيرة بغداد وخنيصري البصرة وحسيناوية الحلة والموصلية بينما ضمت المجموعة الصغيرة وتدعى B صنفان هما حسيناوية الناصرية وحسيناوية كربلاء. يستنتج من التجربة أن لمؤشرات RAPD أهمية في كشف التغاير الوراثي وتعتمد كفاءتها على عدد البوادئ والتباعد الوراثي بين الأصناف قيد الدراسة.


Article
تطبيق تقنية RAPD-PCR في تحديد التباين الوراثي للابقار المحلية في محافظة بابل

Author: محمد حسن دخيل
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2018 Volume: 26 Issue: 2 Pages: 176-183
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

The present study to find out the genetic distance between two breeds from Babylon cattle (Holstein crossbred with local breed and Restaky local breed). Polymer chain reaction DNA were used after DNA extraction from the blood of cattle, six primers were used in this study. The results of PCR were checked by used gel agaros, where taking the results of PCR and lowed on 0.8% from gel agaros to find out the quality and concentration of DNA. All the primers that used in RAPD-PCR technique for DNA extraction to two breeds were succeeded, (1.25±0.8). The overall average genetic distance was 1.25±0.8 between these two breeds, while the average percentage differences were estimated for all primers to these two breeds (63.3±1.33).

تهدف الدراسة الحالية لايجاد الابعاد الوراثية مابين سلالتين من الابقار العراقية الموجوده في محافظة بابل (سلالة الرستاكي المحلي و الفريزيان المهجن مع المحلي). استخدمت تقنية التضخيم العشوائي لجزيئات الDNA بعد عمل استخلاص لل DNA من دم الابقار المذكورة انفا، وتم استخدام ستة بوادئ في هذه الدراسة. تم فحص نواتج ال PCR والذي استعمل لتضخيم الحامض النووي الرايبوزي منقوص الاوكسجين بواسطة الترحيل الكهربائي على هلام الاكاروز (Agaros gel)، حيث اخذ ناتج ال PCR، وحل على هلام الاكاروز 0.8% وذلك لمعرفة نوعية الحزم وتركيزها. نجحت البوادئ المستخدمة في تقنية الRAPD-PCR في تضخيم اجزاء الDNA للسلالتين السابقة الذكر. مقدار البعد الوراثي مابين السلالتين (1.25±0.8)، في حين قدرت النسبة المئوية للاختلاف بين سلالة الهولشتاين فريزيان المهجن والرستاكي المحلي وباستخدام كل البوادئ فكانت (63.3±1.33).

Listing 1 - 7 of 7
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (7)


Language

English (5)

Arabic (1)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2019 (1)

2018 (1)

2017 (2)

2016 (1)

2011 (1)

More...