research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
Comparison between Two Different DNA Extraction Techniques Taken from Buccal Swabs Suitable for Genetic Analyzer

Author: Halah Khalid Ibrahim Al-Sammarraie
Journal: Al-Nahrain Journal of Science مجلة النهرين للعلوم ISSN: (print)26635453,(online)26635461 Year: 2016 Volume: 19 Issue: 3 Pages: 108-113
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

This study aimed to validate two DNA extraction methods collected from buccal cells to gain a genomic DNA and to determine the effect of process time (from collection time to amplification). Total number of 116 buccal swab samples from unrelated healthy volunteers were subjected to DNA extraction by using two methods: modified (phenol chloroform) (Organic) and Prep Filer Forensic DNA Extraction kit. DNA was evaluated according to the: quantity, integrity and suitability for genetic analysis. The DNA yield and purity were measured by Nano drop Spectrophotometer. Organic method was modified from the classical method (addition Dithiothreitol to lysis buffer), The purity average values increased from 1.4 to 1.6 and it had the highest average concentration (73.3ng/µl) while the highest purity was observed in Prep Filer Forensic DNA Extraction kit with average (1.82). Delayed in sample processing effect both quantity and integrity of the extracted DNA. All samples were genetically analyzed at 16 STR with amelogenin (DNA markers) included in the Amp FlSTR® Identifiler™ PCR Amplification Kit panel from Applied Biosystems. Buccal cell swabs were very good source of genomic DNA especially for large population studies.

هدفت هذه الدراسة الى تقييم تقنيتين مختلفتين لاستخلاص الحمض النووي الجينومي من خلايا الظهارية المبطنة للفم ولتحدديد تاثير الوقت (من جمع العينة الى تضخيمها). جمعت 116 عينة ظهارية من بطانة الفم من اشخاص متطوعين لا تربطهم صلة قرابة اذ استخلصت بطريقيتن: العضوية (فينول كلورفورم) المحورة وعدة مختبرية متخصصة وهـــي: Prep Filer Forensic DNA Extraction kit تـم تقييم الحمض النووي وفق الكمية والنوعية وامكانية استخدامه لاغراض التحليلات الوراثية. تم قياس حصيلة ونقاوة الحمض النووي باستخدام جهاز الطيف المرئي ((Nano drop.حورت الطريقة العضوية عن الطريقة التقليدية باضافة مادة Dithiotheritol الى محلول بفر التحليل. زادت معدل النقاوة المستحصلة من 1.4 الى 1.6 ومعدل التركيز 73.3 نانوغرام/ مايكروليتر بينما اعلى قيمة نقاوة كانت باستخدام العدة التجارية وبمعدل 1.82. ان تاخير عملية استخلاص العينة اثر على تركيزها وتكاملها.كل العينات المستخلصة تم تحليلها وراثيا باستعمال عدة تضخيمية لمؤشرات جسمية خاصة لتحديد التتابعات الوراثية الجنائية. اظهرت الدراسة ان عينات الخلايا الظهارية المبطنة للفم تعتبر مصدرا فعالا للحصول على حمض نووي جينومي خاصة للدراسات المجتمعية الكبيرة.

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

English (1)


Year
From To Submit

2016 (1)