research centers


Search results: Found 16

Listing 1 - 10 of 16 << page
of 2
>>
Sort by

Article
Association of HLA Class II Alleles (DRB1 and DQB1) in Iraqi Women with Endometriosis

Author: Amna M. Ali1, Mohammed I. Nader2,Batool H. AL-Ghurabi3, Ahmed K. Mohammed4
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2016 Volume: 15 Issue: 2 Pages: 42-50
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Endometriosis is a chronic gynecological disease manifested by the occurrence of ectopic foci of endometrial tissue in the pelvic cavity and/or ovary. Etiopathogenesis of the disease is still poorly understood but there is a growing bulk of evidence that genetic factors and immunological abnormalities play a role in this disease. This study was performed to investigate the association of human leukocyte antigens class II genotypes (HLA-DR and DQ) with the susceptibility to endometriosis. Fifty female patients with endometriosis their age range (19 – 46) years and 30 femalesas control their ages were matched with the patients were enrolled in this study. Blood was collected from patients and controls, DNA was extracted from blood samples, and then HLA-genotyping was performed by polymerase chain reaction-sequence specificoligonucleotide probes (PCR-SSO).The present findings showed that DRB1*0307, DRB1*0701 and DQB1*0301 alleles were found with highly significant frequencies among patients (22 %; 34% and 24 %), in comparison with healthy control (0.0%) for three alleles, (P <0.001). On the other hand, it was observed that HLA-DRB1*0323 in high frequency among healthy individuals (23.3%) rather than in the patients (0.0%); with (P <0.001).This study demonstrates that HLA- DRB1*0307, DRB1*0701 and DQB1*0301 alleles may contribute to the increased susceptibility to endometriosis, whereas HLA-DRB1*0323 allele may confer protective effects against it, suggesting HLA-based different etiopathogenesis.

Keywords

: Endometriosis --- HLA --- Genotyping.


Article
GENOTYPING OF THE ABO BLOOD GROUP SYSTEM IN IRAQ POPULATION USING PCR-RFLP
التنميط الوراثي لمجموعة الدم ABO للمجتمع االعراقي بإستعمال PCR-RFLP

Author: Mohammed I. Nader
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2012 Volume: 11 Issue: 2 Pages: 464-474
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Due to a large number of alleles that could give similar phenotypes but differ in genomic structure. This study study was conducted to determine the ABO genotyping by use PCR-RFLP method. Blood samples withdrawn from 30 unrelated individuals who appear to be healthy. ABO system phenotype grouping was detected by two immunoagglutination tests. Slide and ELISA were done for all samples. Homozygous allele was selected by chosen special family which gives known offspring according to Mendel laws. The DNA was extracted by using two methods, the manual method by using extra gene kit gives relatively high yield concentration (5-10µg/ml) but slightly low purity (0.9-3.3) and the automated BioRobot EZ1 gives slightly lower yield of DNA(4-8 µg/ml) but high purity (1.6–2.2) in comparison with manual method . Two separate segments of ABO gene the glycosyltransferases gene (216pb) in exon 6 and (703pb) in exon 7 were amplified using two sets of specific primers. Restriction digisten of the two amplification PCR productes was used for discrimination of AB and O allells.

هدفت الدراسة الى الكشف الجزيئي لمجموعة الدم ABO ومطابقتها مع الكشوف المختبرية المعتمدة على النمط الظاهري وإيجاد أنسب الظروف لعمل الكشف الجزيئي. توجد العديد من السمات التي تتشابة بالنمط الظاهري لكنها تختلف بالتركيب الوراثي ومن أبرز الأمثلة عليها جين مجموعة الدم ABO. جمعت عينات الدم من 30 شخص بدو من الفحص الظاهري أنهم أصحاء, أستعملت طريقتين للتحري عن النمط الظاهري لفصائل الدم لكل النماذج. الطريقة الاولى التلازن المباشر على الشريحة, الطريقة الثانية هي اليلايزا، إذ تطابقت النتائج لطريقتان علماً ان الطريقتان لم تميزا نوع الاليل. تم إنتخاب أفراد من أبوين معلومين لصنف الدمAB) ) حيث يكون نسل هذه العوائل متجانس الزيجة Homozygous وذلك لقلة صفة التجانس الوراثي في المجتمعات مقارنةً بالطرز الهجين . Heterozygous عزلت المادة الوراثية بطريقتين, الطريقة اليدوية بإستعمال عدة العزل وكانت ذات تركيز عالي نسبياً (10 – 5 ميكروغرام) لكنها بنقاوة دون المثالية (3.3 – 0.9). كانت نقاوة الطريقة الميكانكية بإستعمال جهاز عزل المادة الوراثية الالي (EZI )أفضل (2.2- 1.6) لكنها أقل تركيزاً (8 – 4 ميكروغرام) مقارنهً بالطريقة اليدوية. ضبط تركيز المادة الوراثية مع مايلائم طريقة تفاعل التضاعف التسلسلي (PCR)وأستعملت تسلسلات من بادىء البلمرة( Primers ) مخصصة لمضاعفة قطعتان تمثل جينABO بجميع اليلاته. تم مضاعفة قطعتان من جين ABO, القطعة الاولى في المحور 6 تتضمن النيوكليوتيد 261, والقطعة الثانية في المحور7 والمتضمنة النيوكليوتيد 703(جين ABO يتكون من 7 اكسونات و 6 انترونات) نتجَ من مضاعفة القطعة الاولى 200 زوج قاعدة بينما نتج عن القطعة الثانية 128 زوج قاعدة. فصلت نواتج بإستعمال النيوكليوتيدات 261 و 703 لتميز اليلات مجاميع الدم A,B,O بواسطة أنزيمات التقييد.

Keywords

Abo Blood --- PCR-RFLP --- Genotyping


Article
Bioremoval of Chromium by Local Isolates of Pseudomonas aeruginosa in Respect to its Genotype
الازالة الحيوية للكروم بوساطة عزلات محلية من بكتريا Pseudomonas aeruginosa بالأعتماد على النمط الوراثي

Authors: Qusay A. Hameed قصي عامر حميد --- Hind S. Abdulhay هند سهيل عبد الحي
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2016 Volume: 57 Issue: 1B Pages: 367-375
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The current study included bioremoval of chromium metal ions from aqueous solution by using seventeen Pseudomonas aeruginosa species isolated from different environments. The experimental results showed that isolates Pseudomonas aeruginosa have high efficiency in removal of chromium where the P. aeruginosa p.8 was the most efficient (P≥0.001) in bioremoval of chromium with a removal capacity reached 92.5 mg/L and removal index reached (96.5%). While P. aeruginosa p.4 was the least efficient (P≥0.001) in bioremoval of chromium from aqueous solutions reached 74.6 mg/L and removal index reached (79.8%). The REP-PCR detection using BOX-primer, showed genetic relatedness among the isolates of P.aeruginosa. The isolates were grouped according to the REP-PCR to different genotyping, named clusters which included C1, C2, C3 and C4 with relatedness: 2 (88%), 2 (73%), 4 (73%) and 2 (77%), respectively. The REP-PCR analysis showed that the genetic relatedness between isolates regarded to the source of the isolation as well as their efficiency of bioremoval process.

تتضمن الدراسة الحالية الأزالة الحيوية لايونات الكروم من المحاليل المائية بأستخدام 17 عزلة بكتيرية منPseudomonas aeruginosa معزولة من مختلف البيئات. أظهرت النتائج التجريبية أن عزلات P.aeruginosa كانت تمتلك كفائة عالية في أزالة الكروم أذ كانت العزلة 8 لبكتريا P.aeruginosa الأكثر كفاءة (P≥0.001) في الأزالة الحيوية لايونات الكروم من المحاليل المائية مع كفاءة ازالة وصلت الى 92٫5 ملغم/لتر وبنسبة ازالة 96٫5%. بينما كانت العزلة 4 لبكتريا P.aeruginosa الاقل كفاءة (P≥0.001) في الأزالة الحيوية لايونات الكروم بلغت 74,6 ملغم/لتر وبنسبة 79٫8%. أظهرت عملية تنميط تفاعل REP-PCR بأستخدام BOX-primer, وجود قرابة وراثية بين عزلات P.aeruginosa . اذ قسمت العزلات الى مجاميع وفقا لتفاعل البلمرة الى انماط وراثية مختلفة سُميت بالمجموعات وتشمل C1، C2، C3 و C4 مع قرابة او درجة تشابه وصلت: 2(88) %, 2(73) %, 4(73) % و 2(77) % على التتالي. وبين تحليل نتائج سلسلة البوليميريز المتكرر REP-PCR أن هناك قرابة وراثية بين العزلات تبعاً لأماكن العزل فضلاً عن كفاءتها في عملية الأزالة الحيوية.


Article
Genotyping of Candida albicans Isolated from broilers by 25S rDNA Analysis
التصنيف الجيني للمبيضات البيضاء المعزولة من دجاج فروج اللحم باعتماد تحليل 25S rDNA ,

Author: Hiader Tuma Kaab حيدر طعمه الكعبي
Journal: Kufa Journal For Veterinary Medical Sciences مجلة الكوفة للعلوم الطبية البيطرية ISSN: 20779798 Year: 2013 Volume: 4 Issue: 1 Pages: 105-110
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

Abstract: Candida albicans one of the most fungi which isolated from clinical samples that cause many problems to humans, animals and birds. Candidiasis is an opportunistic endogenous mycosis in that perturbance of the microflora or other debilitation of the host. So, this study come to focused on genotyping and antifungal susceptibility profile to Candida albicans isolated from broilers.Ten isolates of Candida albicans were obtained from crop of broilers, samples was collected from poultry diseases lab. in Najaf veterinary hospital of different cases of enteritis broilers. All isolates were identified morphologically and biochemically by Hicandida identification kit and genotyped according to 25s rDNA of transposable intron I region of chromosome R. The results showed that all isolates belonged to the genotype A with amplification product (450 bp). Antifungal sensitivity profile by disc diffusion method showed no resistant to nystatin, ketoconazole and micanazole while three isolates (30%) showed resistant to fluconazole.

الخلاصة: تعتبر المبيضات البيضاء من أكثر الفطريات عزلا من العينات السريرية والتي تسبب الكثير من المشاكل للأنسان والحيوان والطيور على حد سواء . أن داء المبيضات من الأمراض الأنتهازية والتي ترتبط بالمضيف بدرجة كبيرة وقد جاءت هذه الدراسة للتعرف على الأصناف الجينية وحساسيتها للمجموعة من المضادات الفطرية لعزلات معزولة من دجاج اللحم. تم أستحصال عشر عزلات من المبيضات البيضاء من قانصات دجاج اللحم, جمعت العزلات من مختبر أمراض الدواجن في المستشفى البيطري في النجف الأشرف من حالات مختلفة من الفروج المصاب بحالات اسهال. جميع العزلات شخصت على أساس الشكل والتفاعلات الكيمياء الحيوية باستخدام العدد الخاصة ومن ثم صنفت جينيا بالاعتماد على 25S rDNA, PCR . أظهرت النتائج ان جميع العزلات تحت الصنف الجيني حيث حجم المنتج تفاعل البلمرة المتكرر قاعدة نايتروجينية .الحساسية للمضادات الفطرية بطريقة الأنتشار بالأقراص اظهرت عدم وجود مقاومة للنستاتين والكليتوكونازول والميكازول بينما ثلاث عزلات (30 %) كانت مقاومة للفلوكونازول .


Article
Genotyping of Escherichia Coli Isolated From Clinical and Hospitals Environment

Authors: Rana Abd ALameer --- Bassam Y. Khudaier --- Yahya A. Abbas
Journal: JOURNAL OF THI-QAR SCIENCE مجلة علوم ذي قار ISSN: 19918690 Year: 2015 Volume: 5 Issue: 3 Pages: 3-12
Publisher: Thi-Qar University جامعة ذي قار

Loading...
Loading...
Abstract

Pathogenic Escherichia coli (E. coli) strains are known to cause intestinal and extraintestinal infections in human. A wide variety of infectious diseases could be caused by E. coli strains, including urinary tract infection, septicemia, newborn meningitis, central nervous system and respiratory system infections.Several bacterial agents can cause diarrheal and urinary tract infections, among these E.coli strains are detected as an important cause of morbidity and mortality of diarrhoea and UTI throughout the world.A total of 318 samples were collected during the period from September 2012 to march 2013 .All specimens were screened for the presence of E. coli by cultured on MacConkey agar and Eosin-methylene blue agar then identified by biochemical tests and confirmed by API 20E system which revealed that:90/318(28.33%) gave positive growth for E.coli )15 (16.63%) environmental isolates and 75(83.33%) clinical isolates( as fallowing:1/42(2.38%)was obtained from burns,7/25(28%)from High vaginal swabs ,11/41 (26.82%) from Wounds infections,18/33(54.54%)from Diarrheal infections and38/67(56.71 %)from Urinary tract infections, while 15/110 (13.63%) from environmental isolates, The isolated were subjected to molecular identification as E.coli by used the intergenic spacer region primer(ITS). The confirmed isolates were examined to detect the phylogenetic group based on triplex PCR by using a combination of two genes (chuA and yjaA) and an anonymous DNA fragment.Universal primers (ITS) indicated that all isolates 90(100%) gave positive results.The phylogenetic analysis revealed that 90 E.coli isolates belonged to three phylogenetic groups A &D 36(40%)for each, while B2 18 (20%) and no one isolates belong to B1 phylogenetic types .Out of the 16 of antibiotics used, 87(92.22%) isolates were multidrug resistance.All isolates have been found resistant to at least one β-lactam Antibiotics.

السلالات المرضيه للاشريكية القولونية تسبب للإنسان اصابات داخل وخارج الامعاء. وهي مسوؤلة عن طيف واسع من الامراض المعدية منها اصابات المجاري البولية ,تسمم الدم ,التهاب السحايا لحديثي الولادة وكذلك اصابات الجهاز العصبي المركزي و الجهاز التنفسي . من بين العديد من البكتريا المسببة لإصابات الاسهال والمجاري البولية تعد الاشريكية القولونية واحدة من اهم تلك المسببات جمعت حوالي318 عينة خلال الفترة من ايلول 2012 ولغاية اذار 2013. أظهرت نتائج الزرع الأولي على وسط أكار الماكونكي واكار الايوسين مثيلين الازرق بعد التشخيص بالاعتماد على الصفات الزرعية والكيموحيوية وتوكيد التشخيص بأستعمال العدة E120AP .تبين ان 90 عينة من اصل 318 عينة اعطت نمو موجبا لبكتريا الاشريكيه(15عينة بيئية و75عينة سريرية) وكما يلي : 1/42(2.38%)من الحروق,7/25(28%)من المسحات المهبلية,11/41 (26.82%)من حالات الجروح , 18/33(54.54%)من اصابات الاسهال و 38/67(56.71%)من التهابات المجاري البولية في حين جمعت 15 /110(13.63 % )من بيئة المستشفيات. ابدت جميع العينات(90) نتيجه موجبه تجاه التشخيص الجزيئي بأستعمال البادئة (ITS).ثم فحصت بعد ذلك لكشف عن انماطهاالجينية بأستخدام البوادئ) chuA,yjaA,TSP).اذ توزعت العزلات الى ثلاث مجاميع جزيئية المجموعةAوD (40 %)، 2B (20%)بينما لم تنتمي أي من العينات الى المجموعة B1.أظهرت87 (92.22 %)عزلة مقاومةَ متعددة لمضادات الحيويه بعد استخدام 16 نوع من المضادات.كما و اظهرت جميع العزل مقاومه لنوع واحد على الاقل من مضادات البيتا لاكتام.


Article
3.GENOTYPING OF LISTERIA MONOCYTOGENES IN IRAQI WOMEN WITH SPONTANEOUS ABORTION USING PULSE FIELD GEL ELECTROPHORESIS

Loading...
Loading...
Abstract

Background:Listeria monocytogenes (L. monocytogenes) is a Gram-positive, facultative intracellular bacterial pathogen that can cause a severe invasive disease (listeriosis) mainly in pregnant women. Based on genetic content, L. monocytogenes can be divided into 3 lineages I, II and III. Several molecular methods have been developed to assist in the characterization of L. monocytogenes, macrorestriction analysis by pulse-field gel electrophoresis (PFGE) is one of the most used methods for the genotyping of L. monocytogenes.Objective:To determine the predominant genotype of L. monocytogenes isolated from clinical cases in a group of aborted Iraqi women.Methods: A study was designed and included 15 clinical isolates of L. monocytogenes and one isolate from locally made cheese. The PFGE protocol was performed as described by Graves and Swaminathan. Briefly, bacterial suspensions adjusted to optical density of 1.3 at 610 nm were embedded in 1.2% Sea Kem Gold agarose plugs. The lysed, washed five times and a 2 mm thick piece was cut, equilibrated and digested with 200 μl of AscI enzyme master mix at 37 °C for 2 h. The macrorestriction fragments were separated by electrophoresis on a CHEF-DRIIBIO-RAD. Images were analyzed with the software Bio Numerics Gel Compar II version 6.6.11 (Applied Maths). Results: All L. monocytogenes isolates displayed AscI digestion profiles after incubation with the enzyme, about 6-12 majorfragments of 30 to 675 kb were obtained, sixteen isolates have been used in this study, however, 11 different AscI profiles were encountered, the distribution of the isolates according to the restriction profiles showed that two profiles were the most predominant A, A2 with a percentage of similarity of 100%.Conclusion:L. monocytogenes genotyping showed profiles that can be well used in tracing down infection source and outbreak of this bacterium. PFGE represents a great discrimination and reproducibility method for molecular sub-typing of L. monocytogenes and it is considered the gold standard.Keywords:Listeria monocytogenes, genotyping, placenta, aborted women, pulse field gel electrophoresisCitation: Qassim KW, AL Attraqchi AAF, Khatab YI. Genotyping of Listeria Monocytogenes in Iraqi women with spontaneous abortion using pulse field gel electrophoresis. Iraqi JMS. 2018; Vol. 16(1): 8-13. doi: 10.22578/IJMS.16.1.3


Article
HLA Diversity in Iraqi Population: Molecular Typing
تنوع مستضدات الخلايا البيض البشرية في السكان العراقيين: تنميط جزيئي

Author: Ahmed A.H. Abbas الأستاذ المساعد الدكتور احمد عبدالحسن عباس
Journal: Journal of the Faculty of Medicine مجلة كلية الطب ISSN: 00419419 Year: 2016 Volume: 58 Issue: 2 Pages: 176-179
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

AbstractBackground: Different populations show various human leukocyte antigens (HLA). Data of HLA distribution is important in field of vaccines, therapy, Anthropology and for future studies of disease association with HLA.Objective: To highlight on frequency of HLA alleles in Iraqi population by using molecular technique. Patients and methods: Two hundred individuals were genotyped for HLA class I and II alleles by polymerase chain reaction sequence-specific oligonucleotides (PCR-SSO).Results: This study observed that the alleles with highest frequency were: [A*02(27.75%,A*01(10.75%,A*03(8%),B*51(17.75%),B*35(9%),B*07(6%),C*04(26.75%),C*07(20.25%),C6*0(9.75%),DRB1*02(17.5%,DRB1*07(17%),DRB1*04(14.75%)DQB1*01(25.5%),DQB1*03(21.75%),DQB1*02(19%)].Conclusion: Current study give additional information about HLA distribution in Iraqi Arab society and could be provide standard control for future studies about HLA association with disease in Iraq.Key words:; HLA; Genotyping; PCR.

الملخصالخلفية : الشعوب المختلفة تظهر اختلافا في تكرارية مستضدات الكريات البيض البشرية (HLA). بيانات توزيع هذه المستضدات مهم في مجال اللقاحات والعلاج، وعلم الإنسان وللدراسات المستقبلية لعلاقة الامراض بهذه المستضدات. الهدف من هذه الدراسة لتسليط الضوء على تردد أليلات ال HLA في المجتمع العراقي باستخدام التقنية الجزيئية.تم تنميط اليلات مستضدات الخلايا البيض البشرية الصنف الاول والثاني لمئتي شخص بتقنية تفاعل البلمرة سلسلة تسلسل محدد أل نوكليوتيد] (PCR-SSO).النتائج: هذه الدراسة اظهرت أن الأليلات الأعلى تردد هي: [A*02(27.75%,A*01(10.75%,A*03(8%),B*51(17.75%),B*35(9%),B*07(6%),C*04(26.75%),C*07(20.25%),C6*0(9.75%),DRB1*02(17.5%,DRB1*07(17%),DRB1*04(14.75%)DQB1*01(25.5%),DQB1*03(21.75%),DQB1*02(19%)]الاستنتاج :الدراسة الحالية تعطي معلومات إضافية حول توزيع اليلات ال HLA في المجتمع العربي العراقي، ويمكن أن توفرسيطرة قياسية للدراسات المستقبلية حول علاقة ال HLA مع الامراض في العراق.الكلمات الدلالية: مستضدات الخلايا البيض البشرية, التصنيف الجيني, سلسلة تفاعل البلمرة.


Article
Characterization ,Biotyping and Genotyping of Cronobacter sakazakii isolated from Baghdadian foods

Author: Alyaa Razooqi AL-Lami Sanaa Burhan Abd-Aljalil Biology Department, College of Science,University of Baghdad Abdul Kareem AL-Kazaz
Journal: journal of the college of basic education مجلة كلية التربية الاساسية ISSN: 18157467(print) 27068536(online) Year: 2016 Volume: 22 Issue: 93/علمي Pages: 1-10
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of this study was to characterize,biotyping and genotyping of Cronobacter sakazakii previously isolated from a range of foods .Some virulence factors of 6 Cronobacter sakazakii were tested .All the isolates (6) were capsule formation,capable of producing biofilm,Lipase,gelatinase and protease production.Most of the isolates have hemolytic activity,while none of the isolates have the ability to hydrolyze starch or produce lecithinase.The effect of some physical and biological factors on growth of Cronobacter sakazakii were also studied.Optimum temperature was 40ºC for (3) isolates ,while 37ºC for (2) isolates and 30ºC for (1) isolate.Optimum pH was 5 for (4) isolates ,while (2) isolates gave highest growth at pH 7.An agar well diffusion method was used to assess the antibacterial activity of Lactobacillus fermentum against Cronobacter sakazakii diameter of inhibition zone was ranged between 15-25 mm.Some biochemical tests were performed in order to biotype the isolates .The 6 isolates were distributed in to two biotypes,biotype 1 and biotype 11.BOX-PCR fingerprinting technique was used to genotype Cronobacter sakazakii food isolates.Three isolates (50%) were belong to different genotypes (this may be due to the differences in the source of isolation) ,and the other three isolates (50%) were belong to genotype with closely related patterns of fingerprints (two of strains were isolated from the same type of food sample).

هدف هذه الدراسة هو لتوصيف , تنميط حيوي وتنميط جيني لCronobacter sakazakii التي عزلت سابقا من مدى من الاغذية . اختبرت بعض عوامل الضراوة لست عزلات من Cronobacter sakazakii . كل العزلات كانت مكونة للكبسولة , ولها القابلية على انتاج الغشاء الحيوي ومنتجة لكل من انزيماتlipase , gelatinase وال protease .معظم العزلات لها فعالية تحلل الدم , بينما لاتمتلك أي عزلة القابلية لتحلل النشأ او لانتاج الLecithinase.درس تاثير بعض العوامل الفيزياوية والحيوية في نمو Cronobacter sakazakii .درجة الحرارة المثلى هي 40˚C لثلاث عزلات , بينما كانت 37˚C لعزلتين و 30˚C لعزلة واحدة. دالة الحموضة pH المثلى هي 5 لاربع عزلات , بينما عزلتين اعطت اعلى نمو عند pH 7 .-استخدمت طريقة الانتشار بحفر الاكار لتقييم الفعالية الضد بكتيرية لبكتريا Lactobacillus fermentum. ضد Cronobacter sakazakii , يتراوح قطر منطقة التثبيط بين 25-15 مليمتر .-لتنميط العزلات حيويا انجزت بعض الاختبارات الكيمياويةالحيوية , وزعت العزلات الستة الى نمطين حيويين هماbiotype1 و biotype 11.-استخدمت تقنية الBOX-PCR لتنميط عزلات الاغذية من Cronobacter sakazakii اظهرت النتائج ان ثلاث عزلات (50%) تعود الى ثلاث انماط جينية مختلفة وهذا قد يعود الى الاختلاف في مصدر العزل , بينما العزلات الثلاثة الاخرى( 50%) تعود الى نمط جيني وباشكال او انماط مترابطة ومتقاربة ))اثنان من العزلات عزلت من نفس نوع العينة الغذائية ((.


Article
Porphyromonas gingivalis fimA genotyping in adult periodontitis population in Kerbala city
التنميط الوراثي لجين الاهلاب fimA genotyping لبكتريا Porphyromonas gingivalis في مجتمع البالغين المصابين بالتهاب اللثة وما حول السن في مدينة كربلاء

Authors: Alnasrawy, A.A --- Alsalihi, A.A. --- Abo Almaali, H.M. --- Al-Khafaji, Y.A.
Journal: karbala journal of pharmaceutical sciences مجلة كربلاء للعلوم الصيدلانية ISSN: 70272221 Year: 2014 Issue: 8 Pages: 11-20
Publisher: Kerbala University جامعة كربلاء

Loading...
Loading...
Abstract

Periodontitis is a chronic bacterial infection affects the gingiva, periodontium connective tissues and alveolar bone, results in alveolar bone resorption ultimately, tooth loss, indeed, it may causes various serious systemic complications like diabetes mellitus, cardiovascular disorders, rheumatoid arthritis, preeclampsia with low birth weight and orodigestive cancer mortality. Numerous bacteria are associated with periodontitis, Porphyromonas gingivalis is considered the main, foremost and strongest periodontal pathogen involved in periodontal diseases. Fimbriae that are encoded by fimA gene have been considered the main and the first virulence factor of this bacterium involved in adhesion, colonization, invasion, establishment and persistence within the host. This study was conducted from September, 2013 to July, 2014 to investigate the prevalence of P. gingivalis throughout monoplex PCR of 16S rRNA and multiplex PCR of fimA genes amplification in adult periodontitis population in kerbala city. Specific virulent clones of P. gingivalis may present in chronic and/or aggressive periodontitis. Some variations are found in the distribution of P. gingivalis fimA genotypes among periodontitis patients and the greater prevalence of fimA genotypes (II, IV) followed by (III, Ib) in adults with chronic periodontitis.

التهاب اللثة وماحول السن هو اصابة بكتيرية مزمنة تستهدف اللثة وماحول السن والانسجة الرابطة والعظم الحويصليمسببة انهياره وبالتالي فقدان السن وكذلك العديد من المضاعفات الجهازية الخطرة مثل داء السكري, الاختلالات القلبيةالوعائية, التهاب المفاصل الروماتزمي, الولادة قبل الاوان مع نقصان وزن المولود والهلاك نتيجة سرطانات الفم والجهازالهظمي. العديد من البكتريا تشترك في التهاب اللثة وماحول السن, وتعد بكتريا Porphyromonas gingivali الرئيسية, الاشهرواقوى الجراثيم المسببة للمرض وتعتبراهلاب fimbriae البكتريا المشفرة بجين FimA gene عامل الضراوة الاساس الاول في التصاق, استعمار, غزو, وتموضع البكتريا المزمن داخل المضيف. اجريت هذهالدراسة للفترة من ايلول 2113 لغاية تموز 2112 لمعرفة مدى انتشار جرثومة P. gingivalis اعتمادا على تقنيةتفاعل سلسلة البلمرة المتعدد لجيني البكتريا P. gingivalis وهما ) (16S rRNA , fimA gene ( في مجتمع البالغين المصابين بالمرض في مدينة كربلاء. ولوحظ تواجد سلالات ضارية من البكتريا متخصصة في التهاب اللثة وماحول السنالمزمن والمدمر, وهناك بعض التباينات في توزيع الانماط الوراثية لجين بكتريا الفم ) ( P. gingivalis( genotypes (fimA بين المرضى وكان اكثرها انتشارا هما النمطان ) , IV II ( يتلوها النمطين ) Ib III , ( بينالمصابين بالمرض.


Article
Isolation, Characterization and Estimation of Ellagic Acid activity against Porphyromonas gingivalis Isolated from adult Periodontitis Patients in Kerbala City.
ن Porphyromonas gingivalis عزل وتوصيف وتقييم فعالية حامض الايللاجيك ضد بكتريا المرضى البالغين المصابين بالتهاب اللثة وما حول الاسنان في مدينة كربلاء

Loading...
Loading...
Abstract

Periodontitis is a chronic bacterial infection affects the gingiva, periodontium connectivetissues and alveolar bone, results in alveolar bone resorption, ultimately, partially orcompletely tooth loss, indeed, it may causes various serious systemic complications likeDiabetes Mellitus, Cardiovascular disorders, Rheumatoid Arthritis, Preeclampsia with lowbirth weight and Orodigestive cancer mortality. Porphyromonas gingivalis is considered themain, foremost and strongest periodontal pathogen. Isolation, characterization and monoplexPCR of 16S rRNA and multiplex PCR of fimA geneotyping are the golden standard assays fordetection of P.gingivalis in adult periodontitis patients. In the present study,Pomegranate peelEthanol extract partially purified ellagic acid has an obvious effectiveness against oralpathogens (P. gingivalis and S. mutans) in both growth inhibition zone on solid medium andPercentage of growth reduction in a liquid medium in various concentrations with commonMIC 16mg/ml.

التهاب اللثة وماحول السن هو اصابة بكتيرية مزمنة تستهدف اللثة والانسجة الرابطة حول السن والعظم الحويصليمسببة انهياره وبالتالي فقدان السن جزئيا اوكليا فضلا عن العديد من المضاعفات الجهازية الخطرة مثل داء السكري،الاختلالات القلبية الوعائية، التهاب المفاصل الروماتزمي، الولادة قبل الاوان مع نقصان وزن المولود والهلاك نتيجةاول واقوى المسببات الرئيسية للمرض. Porphyromonas gingivalis سرطانات الفم والجهاز الهظمي. وتعتبر بكترياوان عزل البكتريا ودراسة خصائصها الكيميائية الحيوية وتشخيصها وراثيا عن طريق التفاعل المتسلسل لانزيم البلمرة16 ) هي الطرق الاساسية المعتمدة في التشخيص الدقيق للبكتريا الممرضة للثة وماحول S rRNA , fimA) لجينيellagic ) الاسنان. ولقد اظهرت نتائج الدراسة الحالية ان مستخلص شحم الرمان بالايثانول والغني بحامض الايللاجيكفي (Streptococcus mutans , P. gingivalis) المنقى جزئيا هو ذات فعالية واضحة في تثبيط نمو بكتريا (acid كل من تقنيتي تثبيط نموالبكتريا على الوسط الصلب وكذلك اختزال نمو البكتريا في الوسط السائل و بمختلفموحد للبكتريا قيد التجربة هو 16 ملغرام لكل ملليلتر . ( MIC) التراكيزللمستخلص، وان اوطا تركيز مثبط

Listing 1 - 10 of 16 << page
of 2
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (16)


Language

English (15)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2018 (3)

2016 (6)

2015 (4)

2014 (1)

2013 (1)

More...