research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
Incidence of urinary tract infection (UTI) among pregnant women in Al-Muthanna Province
نسبة حدوث خمج المجاري البولية بين النساء الحوامل في محافظة المثنى

Author: Taisir Abdulelah kadhim تيسير عبدالاله كاظم /
Journal: Al-Qadisiyah Journal of pure science مجلة القادسية للعلوم الصرفة ISSN: 19972490 Year: 2013 Volume: 18 Issue: 4 Pages: 25-35
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

This study reported the incidence of urinary tract infections (UTIs) among 64 pregnant women (50 patients and 14 controls) conducted in AL-Samawa Teaching Hospital of Gynecology and Pediatrics, as well as the isolation and identification of the pathogens responsible for the infection. Significant bacteriuria is defined as greater than 1 ͯ 105 of the same bacteria per milliliter of urine. A total of 64 clean voided mid-stream urine samples were collected from pregnant women between the ages of 13-40 years. The results showed that the incidence of UTIs in this study population was 66%, and 33 bacterial isolates (20 single cultures and 13 mixed cultures) were identified based on colonial size, color characteristics, according to HiCrome UTI agar. The most predominant bacterium was Staphylococcus aureus (ATCC 25923) 12 (36.4%). This was followed by Enterococcus faecalis (ATCC29212) 4 (12%), Pseudomonas aeruginosa (ATCC 27853) 2(6), Klebsiella pneumonia (ATCC 13883) 1 (3%), Escherichia coli (ATCC 25922) 1 (3%), and a mixed culture of Enterococcus faecalis (ATCC 29212) and Staphylococcus aureus (ATCC 25923) 8(24.2%), Escherichia coli (ATCC 25922) and Enterococcus faecalis (ATCC 29212) 2(6%), Staphylococcus aureus (ATCC 25923) and Klebsiella pneumonia (ATCC 13883) 2(6%) , Enterococcus faecalis (ATCC 29212) and Klebsiella pneumonia (ATCC 13883) 1(3%) . All bacterial species exhibited 100% susceptibility to Amikacin and Imipenem whereas showed 100% resistance to Ampicillin, Erythromycin, Cephalothin, Cephalexin, Augmentin, Kanamycin, Tobramycin, and Neomycin .

تهدف هذه الدراسة الى بيان نسبة حدوث اخماج المجاري البولية بين 64 امراة حامل (50 مريضة و14 مجاميع سيطرة) ادخلوا الى مستشفى النسائية والاطفال التعليمي في السماوة بالاضافة الى عزل وتشخيص المسببات الجرثومية لاخماج المجاري البولية. معنوية تجرثم البول تعرف على انها عزل اكثر من 1 ͯ 105 من نفس الجرثومة في المليلتر الواحد من البول. تم جمع 64 عينة بول مأخوذة من وسط مجرى البول من النساء الحوامل من اعمار تتراوح بين 13-40 سنة. اوضحت النتائج ان نسبة حدوث اخماج المجاري البولية بين النساء الحوامل كانت 66% .تم عزل 33 جرثومة ( 20 عينة عزلت منها جرثومة منفردة و13 عينة عزلت منها اكثر من جرثومة) حيث تم تشخيص العزلات بالاعتماد على لون وحجم المستعمرات وذلك وفقاً الى وسط اخماج المجاري البولية عالي الصبغة. اكثر الجراثيم التي تم عزلها كانت المكورات العنقودية12 (36.4%) واقل منها البكتريا المعوية 4 (12%) ثم الزوائف الزنجاية2 (6) والكليبسيلة الرئوية (3%)1 .اما العينات التي عزلت منها اكثر من جرثومة فكانت البكتيريا المعوية مع المكورات العنقودية8 ( (24.2% بالاضافة الى الاشريشيا القولونية مع البكتيريا المعوية2 (6%) والمكورات العنقودية مع الكليبسيلة الرئوية2 (6%) واخيراً البكتيريا المعوية مع الكليبسيلة الرئوية1 (3%). كل الجراثيم المعزولة كانت 100 % حساسة للاميكاسين والاميبينيم بينما كانت 100 % مقاومة للامبيسيلين , الاريثرومايسين , سيفالوثين ,سيفالوكسين, اوكمنتين , كانامايسين ,توبرامايسينى ونيو مايسين.


Article
Molecular Identification of StaphylococcussppIsolatedfrom Clinical samples
عزل وتشخيص المكورات السريريه باستخدام الاوساط الزرعيه والجزيئيه (دراسه مقارنه)

Author: TaghreedKhudhur Mohammad تغريد خضر محمد
Journal: Jornal of Biotechnology Research Center مجلة مركز بحوث التقنيات الاحيائية ISSN: 18151140 Year: 2018 Volume: 12 Issue: 1 Pages: 14-24
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

The analysis of 16S rRNA gene sequences has been the technique generally used to study and confirm the identification andtaxonomy of staphylococci. However, bacterial species cannot always be distinguished from each other using cultural methods. Thus,clinicalsamples were collected from 190 cases only 31 positive for staphylococcal infections withUrinary Tract Infection, Wounds, Burns, Otitis media, diarrhea infections, were applied for microbiological analysis which include: cultures onManitol salt agar and HiCrome UTI Agar medium all the isolates gave positive golden yellowand identify as Staphylococcusspp. DNA was extracted fromStaphylococcussppand the 16srRNA gene were amplified by using specific primer, then sequencing of nucleic acid of genes was performed by machine is AB13730XL, Applied Biosystem, Macro gen company,the DNA sequencing results of flank sense of 16srRNA gene from 31strains of Staphylococcuswas confirm the identification into species level: Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidisAnd Staphylococcus sciuri.Analysis of the sequences appeared that there two substitution(Transversion, Transition) in the Staphylococcusaureusstrains with Sequence IDLC090540.1 location at Range of nucleotide from 4 to 636, 100% compatibility with NCBI while no substitution appeared in the Staphylococcus haemolyticusstrains which have thesequence IDLN998078.1, 99% compatibility with NCBIalso the sequence ID KR812401.1 which related to the strain Staphylococcussciuri not appeared any substitution after sequencing analysis.Types of substitution detected in partial16srRNA gene inStaphylococcus epidermidisstrains 13 Transversion and 5 transition substitutionlocation at range of nucleotide from 6 to 1026 have the Sequence IDKF575160.1 compared with data obtained from Gene Bank, these finding lead to conclusion,our assay allows rapid and confirm the detection to avoid possibility of misidentification of Staphylococcus species based on cultural analysis, the study aimed to propose the partial sequencing of the gene as an alternative molecular tool for the analysis of Staphylococcus species and for decreasing thepossibility of misidentification. New submission of local Iraqi Staphylococcus clinical isolated during the current study show successfully record of four isolate Staphylococcus sciuri,Staphylococcus epidermidis,Staphylococcus aureus andStaphylococcus haemolyticuswith GenBank accession number: KY938530.1,KY938529.1,,KY938528.1, and GenBank: KY938527.1respectivelly.

استخدم تتابع الجين الرايبوسومي كتقنيه لتأكيد تشخيص وتصنيف المكورات لأن العزلات البكتيريه لانستطيع تمييزها عن بعضها باستخدام الطرق المزرعيه لذلك هدفت الدراسه الحاليه الى تشخيص الأنواع التابعه للمكورات السريريه باستخدام الطرق المزرعيه والجزيئيه ولتحقيق الهدف تم جمع 190 عزله بكتيريه أظهرت النتائج ان 31 فقط منها تابعه لجنس المكورات تم عزلها من أخماج السيل البولي، التهاب الاذن الوسطى، الحروق، الجروح، والاسهال، اخضعت العزلات للتحليل الكيموحيوي المتضمن زرعها على وسط أكار ملح المانيتول و الكروم أكار أظهرت جميع العزلات اللون الأصفر الذهبي ممايعني انها تابعه لأنواع جنس المكورات، عزل الدنا المجيني من المكورات ومضاعفته باستخدام باديء متخصص وعمل تسلسل للحامض النووي للجينات وأظهرت نتائج تسلسل الحامض النووي انه تم تأكيد تشخيص من بين 31 عزله من المكورات هنالك 21 عزله تابعه للمكورات العنقويه الذهبيه و 8 عزلات تابعه للمكورات العنقوديه الحاله للدم و عزله واحده تابعه للمكورات العنقوديه البشرويه وعزله تابعه للمكورات العنقوديه السنجابيه بعد اجراء تحليل تسلسل الحامض النووي تبين ان هنالك 16 موقع استبدال في الجين 16 الرايبوسومي من خلال تحليلنا تبين ان هنالك امكانيه لعمل فحص سريع و أكيد للتعرف على انواع المكورات العنقوديه لتجنب امكانيه الخطأ في التشخيص بالاعتماد على الفحوصات المزرعيه لذلك نقترح باستخدام تحليل الحامض النووي كوسيله جزيئيه لتشخيص المكورات العنقوديه وهذا يقلل امكانية الوقوع في الخطأ أثناء التشخيص.سجلت اربع عزلات محليه للمكورات في المركز العالمي لمعلومات التقنيه الحيويه المعزوله خلال الدراسه للعزلات المكورات العنقودية سسيوري، المكورات العنقودية البشروية، المكورات العنقودية الذهبية والمكورات العنقودية المحلله للدم واللتي تم اعطائها رقم وصول لبنك لجينات العالميه:KY938530.1 ,KY938529.1,,KY938528.1, KY938527.1 بالتتابع.

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

English (2)


Year
From To Submit

2018 (1)

2013 (1)