research centers


Search results: Found 3

Listing 1 - 3 of 3
Sort by

Article
Detection of Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) and its strains on Tomato plants and host rang determine by Polymerase Chain Reaction

Authors: Al- Jubouri A.A. --- Al- Fadhal F. A. --- Samaka H. M.
Journal: Kufa Journal for Agricultural Sciences مجلة الكوفة للعلوم الزراعية ISSN: 20727798 23128186 Year: 2014 Volume: 6 Issue: 4 Pages: 99-117
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to identify , determine the host rang, detection ofvirus strains and find out the source of initial infection of Tomato yellow leaf curlvirus (TYLCV) on tomato Solanum lycopersicom L. ,weeds and other economic cropsplanted closed to tomato fields in the desert region of Najaf province by polymerasechain reaction (PCR) technique. Samples of tomato leaves showed curling , rolling,stunting and yellowing symptoms were collected from the hybrids Aula,Aseel,Shreen and Abu- alkaf . PCR results showed that tomato plants have two strains ofTYLCV which were occupied area strain (Palestine ) TYLCV-IS and normal strainTYLCV-mld in Sheen hybrid, by amplifying two DNA bands with sizes of 634bpand 316bp respectively , where the other TYLCV -infected hybrids were given a634bp DNA band , in addition PCR results showed that the economic plants used inthis study Eggplant (Solanum melongen L.) , Melon ( Cucumis melo L.) , Cucumber( Cucumis sativus L.) , Sesame (Sesamum indicum L.) and Cowpea (Vigna sinensisL.) and Weeds plants Small flowered mallow (Malva parviflora L.) , Wall goosefoot(Chenopodium murale L.),and Kinoa (Chenopodium quinoa Willd.) , gave positiveresults with TYLCV-IS strain by amplifying a 634bp – DNA band representing theoccupied area strain. While Common sow thistle (Sonchus oleraceus L.) and Popsaltbush (Atriplex holocarpa F- muell.), gave negative result by PCR test.


Article
The relationship between sesame Phytoplasma (phyllody) and others plant Phytoplasma by using polymerase chain reaction (PCR)
دراسة علاقة القرابة بين فايتوبلازما تورق أزهار السمسم وفايتوبلازما بعض النباتات الاخرى باستخدام تقنية تفاعل البلمرة التسلسلي PCR

Loading...
Loading...
Abstract

This study was aimed to identification of sesame phytoplasma (phyllody) on sesame (Sesame indicumL.) and some other important economic crops behind the weeds of agriculture field like Annual beard grass(Polypogon monspeliensis), Darnel (Lolium temulentum L.), Suaeda1 (Schanginia baccata MQ.T), Melilotus (Melilotus), Purple panic – grass (Echinochloa colonum), Cynanchum (Cynanchum acutum L.), Alkali weed (Cressa cretica L.), Marvel grass (Dichanthiumannulatum (Forks) Stapf), Alfalfa (Medicago sativa), Common read (Phragmites communisT.), Wormwood (Artemisia camperstis L.), Sesbania (Sesbania sesban), Purslane (Portulacaoleracea), Cucumber (Cucumis sativus) and Red bottle brush (Melaleuca viminalis), in Al-Dewania and Al-Najaf Al-Ashraf province field by using polymerase chain reaction (PCR) and find out the relationship between the phytoplasma that infect these plants with sesame phytoplasma. Phytoplasma identification was confirmed by PCR according to amplifying a 558 bp - DNA clearly band representing the samples of sesame(Sesamumindicum L.). All the plants gave positive results by giving 558 bp – DNA according to PCR test with the exception of Darnel (Lolium temulentum L.), Cynanchum (Cynan chumacutum L.) and worm wood weed plant (Artemisia camperstis L.) gave negative results. Sesame seeds collected from control and treatment field experiment gave positive result according to PCR test.

هدفت الدراسة الى تشخيص فايتوبلازما (Phytoplasma) تورق الازهار (Phyllody) الذي يصيب محصول السمسم Sesame (Sesamum indicum L.) وبعض المحاصيل الاقتصادية المهمة الأخرى وكذلك الادغال المرافقة له في الحقول الزراعية, ومنها ذيل البزون Annual beard grass (Polypogon monspeliensis)، الرويطة Darnel (Lolium temulentum L.)، الطرطيع Suaeda (Schanginia baccata MQ.T)، الحندقوق Melilotus (Melilotus alba)، الدهنان Purple panic-grass (Echinochloa colonum)، المديد Cynanchum (Cynanchum acutum L.)، الشويل Alkali weed (Cressa cretica L.)، زمزوم Marvel grass (Dichanthium annulatum (Forks) Stapf)، البرسيم Alfalfa (Medicago sativa)، القصب Common read (Phragmites communis T.)، الشيح Wormwood (Artemisia camperstis L.) ، السيسبان Sesbania (Sesbania sesban)، البربين Purslane ( Portulaca oleracea)، ومحصول الخيار Cucumber (Cucumis sativus) وشجرة فرشة البطل Red bottle brush (Melaleuca viminalis) في مزارع محافظتي الديوانية والنجف الأشرف باستخدام تفاعل البلمرة التسلسلي Polymerase Chain Reaction (PCR) وايجاد علاقة القرابة بين الفايتوبلازما التي تصيب هذه النباتات وفايتوبلازما محصول السمسم. تم تأكيد تشخيص الفايتوبلازما بواسطة تفاعل البلمرة التسلسلي PCR، حيث اثبتت تجربة الكشف عن الحامض النووي DNA لفايتوبلازما تورق الازهار أن نباتات السمسم موضوع الدراسة تحتوي على الحامض النووي DNA وذلك لظهور الحزم الواضحة بحجم (558 bp) في الترحيل الكهربائي لعينة السمسم. كما أثبتت التجربة إلى أن جميع الأدغال المرافقة لمحصول السمسم كانت تحتوي على الحامض النووي DNA لفايتوبلازما تورق الازهار، ما عدى الرويطة Darnel (Lolium temulentum L.)، المديد Cynanchum (Cynan chumacutum L.) و الشيح Wormwood (Artemisia camperstis L.)، التي اعطت نتائج سالبة. كما إتضح إحتواء بذور السمسم على فايتوبلازما تورق الأزهار والمأخوذة من حاصل حقل التجربة لعام 2015 باستخدام تقنية PCR ولكل من المعاملة والمقارنة.


Article
تشخيص فايروس موزائيك الخيار CMV على الفلفل باستخدام النباتات الكاشفة والأشرطة المناعية وتقنية تفاعل البلمرة التسلسلي العكسي (PCR RT-)
Detection of cucumber mosaic virus on pepper by indicator plant immune strip and RT- polymerase chain reaction

Authors: Ammar Alhares عمار سعدي ناصر الحارس --- Fdhel AL-Fadhel فضل عبد الحسين الفضل
Journal: Kufa Journal for Agricultural Sciences مجلة الكوفة للعلوم الزراعية ISSN: 20727798 23128186 Year: 2017 Volume: 9 Issue: 4 Pages: 73-91
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to identify cucumber mosaic virus (CMV) on pepper plants and determine the host range and the source of primary infection, by using indicator plants, immune strip test and PCR. The infection was done by using the sap. of pepper plants containing CMV upon of some indicator plants like cucumber (Cucumis sativus L),tomato(Lycopersicon esculentum Mill) , zucchini ( Cucurbita pepo L) , Pumpkin (Cucurbita maxima L) , eggplant (Solanum melongena L.) cowpea (Vigna unguiculata ) tobacco (Nicotiana tabacum cv.samsun , Nicotiana rustica )and Wall goosefoot(Chenopodium murale L.)The results showed that all above-mentioned plants were infected with CMV .The symptoms of infection were mosaic , Malformation and stunting in cucumber ,while tomato leaves changed to filiform shape. The symptoms of zucchini , Pumpkin and eggplant were in the form of systemic mosaic and stunting of egg plants , while the symptoms upon cowpea plants were pale local lesion leaves .and in the Wall goosefoot plants the symptoms were unorganized spots. The two varieties of tobacco showed vein clearing. Symptom. The test of immune strip showed the existence of CMV in cucumber, tomato , pepper and cowpea plants by clear precipitation line compare to control plants.The diagnosis of CMV virus was confirmed by reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR). The plant specimens collected from areas under study were gave positive results, the RT-PCR reaction with primer CMV1 and CMV2 for CMV-coat protein gene (CMV-cp Gene) yielded 486-488 base pair DNA bands while the specimens from non- infected plants amplified no bands. These results indicated that the CMV virus detected in present study belong to subgroup I.

اجريت هذه الدراسة بهدف تشخيص فايروس موزائيك الخيار Cucumber Mosaic Virus CMV) ) على الفلفل وتحديد المدى العائلي ومصدر الإصابة الأولية لة باستخدام النباتات الكاشفة Indicator Plants والاشرطة المناعية Immunostrip فضلا عن تقنية تفاعل البلمرة التسلسلي العكسي ((RT-PCR Reverse , Transcriptase - Polymerase Chain Reaction . اجريت العدوى باستخدام عصير نبات فلفل مصاب بفايروس CMV على عدد من النباتات الكاشفة من الادغال وبعض المحاصيل الاقتصادية ومنها الفلفل capsicum) annuum )الخيار (Cucumis sativus L.)، الطماطة (Lycopersicon esculentum Mill.) ، قرع الكوسا (Cucurbita pepo L. ) ، اليقطين( Cucurbita maxima L.) ، الباذنجان (Solanum melongena L.) ، اللوبيا Vigna unguiculata L.) ) ، التبغ (Nicotiana tabacum cv.samsun ، Nicotiana rustica ).) ، الرغيلة (Chenopodium murale L.) .اظهرت النتائج اصابة جميع هذه النباتات بالفايروس CMV اذ كانت الاعراض على نبات الفلفل هي تحزم العروق وتشوه الأوراق مع ظهور أعراض موزائيك وتبرقش وانحناء الأوراق الحديثة للأسفل واختزال في أعناق الأوراق بينما كانت على شكل موزائيك مع تشوه وتقزم في نبات الخيار بينما تحولت اوراق الطماطة الى الشكل الخيطي نتيجة الاصابة . في حين ظهرت الاعراض على نبات قرع الكوسا واليقطين والباذنجان بشكل موزائيك جهازي مع تقزم نباتات الباذنجان، بينما كانت الاعراض بشكل بقع موضعية شاحبة على اوراق نبات اللوبيا وبقع غير منتظمة الشكل على نباتات الرغيلة ،اما التبغ بنوعية فكانت الاعراض على شكل توضح لعروق الاوراق vein clearing .وكان اختبار الاشرطة المناعية Test Immunostrips موجبا للعينات المصابة بفايروسCMV في كل من نباتات الخيار، اللوبياء ، الفلفل ، الطماطة وعلى شكل خط ترسيب واضح مقارنة مع النباتات السليمة . تم تاكيد تشخيص الفايروس بواسطة تفاعل البلمرة العكسي (RT-PCR) اذ ان جميع النباتات المستخدمة في الدراسة كانت موجبة للاختبار المذكور حيث وجد عند تضخيم قطعة مستقيمة لجينات الحامض النووي التي تكون غلاف فايروس CMV مع برايمرCM2,CM1 ظهور حزم DNA واضحة بحجم (bp 486- 488 ) مقارنة مع النباتات السليمة التي لم تعطي اي حزمة للحامض النووي المذكور، مما يؤكد ان الفايروس المستخدم في الدراسة هو فايروس موزائيك الخيار CMV على الفلفل والذي يقع تحت المجموعة ( I ) للفايروس المذكور، وتعدهذه الدراسة الاولى في العراق التي استخدمت التشخيص الجيني لفايروس CMV على الفلفل.

Listing 1 - 3 of 3
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (3)


Language

Arabic and English (3)


Year
From To Submit

2017 (1)

2016 (1)

2014 (1)