research centers


Search results: Found 4

Listing 1 - 4 of 4
Sort by

Article
Detection of Extended Spectrum β-lactamases Producing by Klebsiella pneumonia Isolated from Urinary tract Infection Patients by Using mPCR Technique
الكشف عن طيف اللاكتاميز الممتد المنتجة بواسطة الالتهاب الرئوي كليبسيلا المعزول من مرضى التهاب المسالك البولية باستخدام تقنية mPCR

Author: Wafaa Abdelwahed Jaheel Al-Kaaby وفاء عبد الواحد جليل
Journal: Al-Qadisiyah Medical Journal مجلة القادسية الطبية ISSN: 18170153 Year: 2016 Volume: 12 Issue: 22 Pages: 59-64
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Objective: In this study Klebsiella pneumonia where isolated from urine samples and detection of extended spectrum β-Lactamases by using mPCR technique.Method: This isolated subjected to the antimicrobial susceptibility test (Disc diffusion) for some antibiotics following by multiplex PCR techniques for detection extended spectrum β-Lactamase genes (bla TEM, bla SHV, bla CTX-M and bla AMPC).Results: The extended spectrum β-Lactamase genes by PCR techniques were given bla CTX-M (30/93.75%), bla SHV (25/78.12%), bla TEM (18/56.25%) and bla AMPC (22/68.15%), respectively.Conclusion: K. pneumonia isolates of urinary tract infection patients highly associated with the emergence of bla CTX-M β-Lactamase that provides useful good treatment.

الهدف: في هذه الدراسة عزلت جرثومة Klebsiella pneumonia من عينات البول وحُدِّدَ الطيف الواسع لإنزيمات البيتالاكتام بإستخدام تقنية mPCR.طريقة العمل: أُخضِعت العزلات قيد الدراسة لإختبار الحساسية (بطريقة إنتشار الأقراص) تجاه بعض المضادات الجرثومية وبإتباع تقنية multiplex PCR تم تحديد الطيف الواسع للمورثات المسؤولة عن فعالية إنزيمات البيتالاكتام (bla TEM, bla SHV, bla CTX-M and bla AMPC).النتائج: الطيف الواسع لمورثات إنزيمات البيتالاكتام بإستخدام تقنية تفاعل سلسلة إنزيم البلمرة أعطى النسب المئوية للمورثات bla CTX-M (30/93.75%) و bla SHV (25/78.12%) و bla TEM (18/56.25%) و bla AMPC (22/68.15%), على التوالي.الإستنتاج: عزلات K. pneumonia من أخماج مرضى المجاري البولية إرتبطت بقوة مع ظهور مورثة bla CTX-M β-Lactamase التي أثبتت فائدتها العلاجية الجيدة


Article
Detection of CTX-M-1 gene Among Klebsiella pneumonia Isolates in An Najaf Province
الكشف عن جين CTX-M-1في عزلات Klebsiella pneumonia في محافظة النجف

Author: Raed Ali Hussein Shabaa
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2014 Volume: 13 Issue: 2-2 Pages: 128-133
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Resistance of Klebsiella pneumoniaes trains to the broad-spectrum antibiotics may be caused by extended-spectrum β-lacta+mases (ESBLs). This study was aimed to determine the antimicrobial resistance patterns and prevalence of extended spectrum beta lactamase gene (CTX-M-1) among isolates of K. pneumoniae.A total of 62 K. pneumoniae isolates were collected from two hospitals in An Najaf -Iraq, during 6-month study (2013-2014). The antimicrobial susceptibility of isolates was determined by disc diffusion method and interpreted according to the clinical and laboratory standards institute (CLSI) recommendations. Production of ESBL was determined by the presence of CTX-M-1gene using PCR technique. Most of the isolates showed high level of resistance: 37 isolates were simultaneously resistant to Amoxicillin-Clavulanic acid, Cefotaxime, Ceftriaxone, Aztreonam, and Ceftazidime (37/62, 59.6%). All were susceptible to Imipenem and Ciprofloxacin. The results of PCR study revealed that 60.1% of the isolates were ESBL positive. This study highlighted the need to establish antimicrobial resistance surveillance networks for K. pneumoniae to determine the appropriate empirical treatment regimens

يعود سبب مقاومة سلالات البكتريا Klebsiella pneumoniaeللمضادات واسعة الطيف الى امتلاكها للانزيم extended-spectrum -lactamases (ESBLs). هدفت هذه الدراسة الى تحديد نمط المقاومة الدوائية و وجود الجينCTX-M-1 في عزلات البكتريا. تم جمع 62 عزلة من مستشفيين في محافظة النجف للفترة من تشرين الاول 2013 لغاية نيسان 2014. تم فحص الحساسية الدوائية للعزلات بطريقة الانتشار بالاقراص وقيمت اعتمادا على توجيهات مؤسسة المقاييس المختبرية والسريرية (CLSI) وتم تحديد انتاج انزيم extended-spectrum -lactamases (ESBLs) من خلال الكشف عن وجود الجين CTX-M-1 باستخدام تقنية سلسلة تفاعلات البلمرة (PCR). اظهرت معظم العزلات مستويات عالية من المقاومة: 37 عزلة كانت مقاومة لكل من Amoxicillin- Clavulanic acid ، Cefotaxime، Ceftriaxone، Aztreonam و Ceftazidime (37/62, 59.6%). بينما كانت جميعها حساسة لـ Imipenem و Ciprofloxacin . أظهرت نتائج الـ PCR ان 60.1% من العزلات تمتلك extended-spectrum -lactamases (ESBLs). سلطت هذه الدراسة الضوء على الحاجة الى نظام مراقبة للمقاومة الدوائية لبكتريا Klebsiella pneumoniae و تحديد العلاج الملائم.

Keywords

CTX-M-1 --- K.pneumonia --- PCE Antibiotics --- ESPL.


Article
Bioremediation of Polluted Water with Crude Oil in South Baghdad Power Plant
المعالجة الحيوية للمياه الملوثة بالنفط الخام في محطة جنوب بغداد لإنتاج الطاقة الكهربائية

Authors: Akram R. Yasin أكرم رشيد ياسين --- Shihab Ahmed Salman شهاب أحمد سلمان --- Ithar kamil Al-Mayaly إيثار كامل الميالي
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2014 Volume: 55 Issue: 1 Pages: 113-122
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Pseudomonas aeruginosa and Klebsiella pneumoniae appears good growth when replicate to culture with heavy crude oil. K. pneumoniae was less ability to biodegrade the heavy crude oil (66.22 wt.%) compare with P. aeruginosa 74 wt.%). Also the emulsion percent were about 64.8 % and 62.5 % for K. pneumoniae and P. aeruginosa, respectively. The results showed that the emulsions produced from both the strains decrease the surface tension of the media from 68.43 Mn/m (for control sample) to 44.50 and 43.30 Mn/m for P. aeruginosa and K. pneumoniae, respectively. The optimum temperature and pH for the hydrocarbons biodegradation were 28 ºC and 7, respectively. The incubation period of 28 days of the isolated increased hydrocarbons biodegradation, which were (78 %) for P. aeruginosa, and (83 %) for K. pneumoniae. While, P. aeruginosa recorded heavy oil biodegradation percents were 76.94 and 71.73 % for oil concentrations 1000 and 2000 mg/l, respectively. While the percentage of biodegradation by K. pneumoniae to heavy oil were 74.87 and 69.92 % for 1000 and 2000 mg/l, respectively.

أظهرت العزلتان Pseudomonas aeruginosa و Klebsiella pneumoniae نموا" جيدا" بوجود النفط الخام الثقيل عند تكرار زرعها على نفس الوسط وكانت بكتريا K. pneomoniae الاقل في تفكيك النفط الخام الثقيل مقارنة ببكتريا P. aeruginosa والتي سجلت نسبة تفكيك 66.22 % كما سجلت البكتريا K. pneumoniae نسبة استحلاب بلغت 64.8 % بينما كانت النسبة 62.5 % لبكتريا P. aeruginosa . أظهرت النتائج ان المستحلبات المنتجة من قبل العزلتين قامت بتخفيض قيمة الشد السطحي للوسط من (Mn/m 68.43) بالنسبة لعينة الكونترول (من غير لقاح بكتيري) الى (44.50 Mn/m) و (43.30 Mn/m) لكل من P. aeruginosa و K. pneumoniae على التـوالي. وكانت درجة الحرارة المثلى 28º م والرقم الهيدروجيني (pH) الأمثل هو 7 لنمو البكتريا واستهلاك الهيدروكاربونات, و تبين ان فترة الحضن 28 يوم للعزلات البكتيرية قد أعطت زيادة في نسبة استهلاك الهيدروكاربونات حيث سجلت بكتريا P. aeruginosa نسبة استهلاك بلغت 78 % بينما كانت النسبة 83% لبكتريا K. pneumoniae. سجلت بكتريا P. aeruginosa نسبة استهلاك للنفط الخام الثقيل بلغت 76.94 % و71.73 % للتراكيز 1000 mg/l و 2000 mg/l على التوالي. بينما سجلت بكتريا K. pneumoniae نسبة استهلاك بلغت 74.87 % و 69.92 % للتراكيز 1000 mg/l و 2000 mg/l على التوالي.


Article
The relationship between biofilm formation and presence of fimH and mrkD genes among E. coli and K. pneumoniae isolated from patients in Mosul
العلاقة بين تكوين الأغشية الحيوية وتواجد جينات fimH و mrkD بين عزلات بكتريا E. coli و K. pneumoniae المعزولة من المرضى في الموصل

Authors: Mohammed T. Mahmood --- Basima A. Abdullah
Journal: Mosul Journal of Nursing مجلة الموصل للتمريض ISSN: 23118784/26630311 Year: 2015 Volume: 3 Issue: 1 Pages: 34-42
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

Background and objectives: Biofilms have a major medical significance as they decrease susceptibility to antimicrobial agents. The decreased susceptibility to microbial agents within a biofilm arises from multiple factors, including physical impairment of diffusion of antimicrobial agents, reduced bacterial growth rates, and local alterations of the microor-ganisms (M.O) that may impair activity of the antimicrobial agent. The aim of the study was to investigate the biofilm formation among coliforms and study the relationship between biofilm formation and the presence of fimH and mrkD genes among E. coli and K. pneumonia isolates respectively .Materials and method: One hundred and seventy three clinical samples were collected from both gender who visited or admitted to AL- Salam General Teaching Hospital and AL- Wafa‘a center for diabetic patients in Mosul city from April 2013 to February 2014, (110) urine samples from patients suffering from urinary tract infections (UTIs) and (63 ) from patients with diabetic foot infections (DFIs). All samples were cultured on selective media as MacConkey and blood agar aerobically. Coliform isolates are identified to species level depending on biochemical and physiological tests and using Rapid ™ ONE panel kit to be conformed to the diagnosis. The ability of coliforms spp. for biofilm formation was assessed using qualitative and quantitative assay. The Congo red agar (CRA) method was used in the qualitative biofilm assay.Results: Out of (85) bacterial spp. , 44(51.8%) species were biofilm producers. The tissue culture plate (TCP) method was used in the quantitative biofilm formation assay. The results showed that 46(54.1%) spp. produced biofilm strongly. All biofilm producing E. coli and K. pneumoniae spp. which gives strong biofilm formation by CRA method and non-biofilm producer spp. were subjected to PCR for determining the relation between biofilm formation and the presence of fimH gene in E. coli isolates and mrkD gene in K. pneumoniae isolates. The results revealed that all biofilm producing E. coli 15(100%) isolated from UTI samples were positive for fimH gene. While all biofilm producing K. pneumoniae 9(100%) and 5(100%) isolated from UTIs and DFIs respectively were positive for mrkD gene.Key words: Biofilm, fimH and mrkD genes, E. coli, K. pneumonia.

خلفية البحث والأهداف: للاغشية الحيوية البكتيرية اهمية من الناحية الطبية وذلك لمساهمتها في تقليل حساسية البكتريا تجاة المضادات الحيوية . وهنالك العديد من الاسباب التي تؤدي الى تقليل حساسية البكتريا للمضدات الحيوية داخل الاغشية الحيوية ، منها عوامل فيزيائية تقلل من انتشار المضاد عبر الاغشية ،تقليل معدل النمو البكتيري ، التغيرات الموقعية للجراثيم داخل الغشاء والتي تؤدي الى تقليل تاثير المضاد الحيوي. الهدف من الدراسة هو التحري عن تكوين الاغشية الحيوية ضمن مجموعة جراثيم القولونيات ودراسة العلاقة بين تكوين الاغشية الحيوية وتواجد جينات fimH و mrkD في عزلات بكتريا E. coli و K. pneumonia على التوالي.منيجية البحث :جمعت (173)عينة سريرية ومن كلا الجنسين للفترة من شير نيسان 2013 الى شهر شباط 2014 من مستشفى السلام التعليمي ومركز الوفاء لمرضى السكري ، منها (110) عينة ادرار للذين كانوا يعانون من التهاب المجاري البولية و (63) عينة من الذين كانوا يعانون من قرح القدم السكري شخصت عزلات أشباه القولونيات الى مستوى النوع اعتمادا على الاختبارات الكيموحيوية والايضية وتم تأكيدها باستخدام عدة التشخيص Rapid ™ ONE . استخدمت طرق كمية ونوعية لتحديد قدرة اشباه القولونيات على تكوين الغشاء الحيوي. إذ تم قياس تكوين الغشاء الحيوي نوعيا باستخدام طريقتي الأنبوب ووسط احمر الكونغو الصلب.النتائج : من مجموع(85) عزلة بكتيرية، أظهرت 44 ( 51.8 %) عزلة إمكانية تكوين الغشاء الحيوي بالطريقة الثانية . واستخدمت طريقة (TCP) لقياس تكوين الغشاء الحيوي كميا. وقد أظهرت النتائج أن46 ( 54.1 %) عزلة بكتيرية انتجت بقوة الغشاء الحيوي. اذ كان هناك علاقة معنوية بين تكوين الغشاء الحيوي بطريقة TCP والمقاومة لمضادات الكوينولات. انتخبت جميع عزلات بكتريا E. coli و Klebsiella pneumoniae المنتجة بقوة لمغشاء الحيوي بطريقة وسط احمر الكونغو الصلب وكذلك غير المنتجة لغرض إيجاد العلاقة بين تكوين الغشاء الحيوي وجينات الالتصاق fimH في بكتريا E. coli وجين mrkD فيبكتريا K. pneumoniae بتقنية تفاعل الكوثرة PCR . أظهرت النتائج أن جميع عزلات بكتريا E. coli15 ( 100 %) المكونة للغشاء الحيوي والمعزولة من عينات الإدرار موجبة لجين الالتصاق fimH . بينما كانت جميع عزلات بكتريا K. pneumoniae المكونة للغشاء الحيوي والمعزولة من عينات الإدرار واصابات القدم السكري 9 ( 100 %) و 5 ( 100 %) على التوالي موجبة لجين الالتصاق mrkD .

Listing 1 - 4 of 4
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (4)


Language

English (4)


Year
From To Submit

2016 (1)

2015 (1)

2014 (2)