research centers


Search results: Found 8

Listing 1 - 8 of 8
Sort by

Article
A NEW HOST RECORD FOR TOMATO LEAF MINER TUTA ABSOLUTA (MEYRICK, 1917) IN BAGHDAD PROVINCE, IRAQ
تسجيل جديد لمضيف حافرة الطماطم Tuta absoluta (Meyrick, 1917) في محافظة بغداد، العراق

Author: Mohammad. S. Abdul-Rassoul محمد صالح عبد الرسول
Journal: Bulletin of the Iraq Natural History Museum مجلة متحف التاريخ الطبيعي العراقي ISSN: Print ISSN: 10178678, Online ISSN: 23119799 Year: 2014 Volume: 13 Issue: 1 Pages: 15-18
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

In 2010, the tomato leaf miner Tuta absoluta (Meyrick, 1917) was reported for the first time in Iraq. The larvae can feed on all parts of tomato plants and can damage all the growth stages. The main host plant is tomato, Lycopersicon esculentum, but it can also attack other plants in Solanaceae family. In this study it was found attacking alfalfa plants, Medicago sativa in Baghdad Province. This finding reveals that alfalfa also serves as a host plant for T. absoluta in Iraq.

سجل حفار اوراق الطماطة Tuta absoluta (Meyrick, 1917) لاول مرة في العراق عام 2010.لوحظ ان الدور اليرقي له القابلية على ان يتغذى على جميع اجزاء نبات الطماطة مسبباً التلف في جميع مراحل النمو، كما لوحظ ان للحشرة القابلية على مهاجمة مجموعات متعددة من النباتات العائدة لعائلة Solanaceae بالاضافة الى تطفله على المضيف الرئيسي له و المتمثل بنبات الطماطة Lycopersicon esculentum. لوحظ في هذه الدراسة ان لهذا الطفيلي القابلية على التغذي على نبات الجتMedicago sativa من خلال ملاحظته على التبات المذكور في محافظة بغداد.تشير نتائج هذه الدراسة الى ان الجت يمكن ان يعد واحد من مضائف النوع T. absoluta في العراق.


Article
Effect of foliar application of two amino acids "arginine and cysteine" and potassium nitrate on the growth and yield of the tomato plants grown in plastic houses

Authors: Awatif N. Jerry --- Talib M. M. AL-Jarah
Journal: Kufa Journal for Agricultural Sciences مجلة الكوفة للعلوم الزراعية ISSN: 20727798 23128186 Year: 2015 Volume: 7 Issue: 2 Pages: 16-35
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

An experiment was conducted during the winter growing season of 2013/2014 inunheated plastic house conditions belonging to tomato development project in Khor Al-Zubair / Agriculture Directorate of Basrah. The aim was to study the effect of foliarspraying of the aim was to study the effect of foliar spraying of two amino acids (arginineand cysteine) and potassium nitrate (KNO3) on s growth and yield of tomatoLycopersicon esculentum Mill. cultivar" Wogdan". The study included fifteen treatmentswhich were the combinations of five treatments [i.e. Amino acids arginine and cysteineat (75 and 150) mg. l-1 of each of them in addition to the control treatment (used wateronly)] and KNO3, at three concentrations (0 ,1.0 and 1.5) g. l-1 applied by spraying fourtimes at 15-day intervals started three weeks after transplanting.Results showed that spraying with arginine at both concentrations and cysteine at75 mg. l-1 significantly increased leaf area per plant as compared with control treatment.Spraying with arginine at 150 mg. l-1 gave the highest values for nitrogen, potassiumconcentrations, whereas spraying with arginine at 75 mg. l-1 gave the highest value forphosphorus concentration in the leaves. Spraying with arginine at both concentrations andcysteine at 75 mg. l-1 significantly increased total soluble carbohydrate in the leavesspraying with arginine and cysteine at 75 mg .l-1 of each of them increased fruit settingpercentage as compared with control treatment. Spraying with arginine and cysteine at 75mg .l-1 of each of them increased early yield per plant as much as 11.12 and 10.31%, andtotal yield per plant as much as 13.12 and 11.87 % as compared with the controltreatment, respectively.Spraying with KNO3 at 1 and 1.5 g. l-1 significantly increased all parameter studies ascompared with control. The most effective treatment was 1.5 g. l-1 KNO3.


Article
THE ROLE OF SPRAYING NITROGEN ON GROWTH AND NUTRITIONAL VALUE OF FRUITS IN DIFFERENT TOMATO GENOTYPES
دور الرش بالنتروجين في النمو والقيمة الغذائية لثمار تراكيب وراثية مختلفة من الطماطة

Authors: I. J. Abdul Rasool ايمان جابر عبد الرسول --- Sh. T. Habeeb شيماء ذياب عبد حبيب
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2016 Volume: 47 Issue: 7 - special issue Pages: 82-90
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

An experiment was conducted at the field of the Department of Horticulture and Landscape Gardening, College of Agriculture, University of Baghdad during the spring season of 2012 to evaluate Nitrogen (Urea) foliar application at four concentrations 0 , 1.5 , 3 , and 4.5 g/L-1 and six tomato genotypes ,OLKA , JINAN, SUN, GS12, BAHGAT (Lycopersicon esculentum Mill) and wild type (Lycopersicon pimpinillifolium). The experiment was carried out according to the split–plot experimental design with three replications in order to determine the best concentration of urea along with the best genotype(s) respond to the treatments. Results showed Spraying with 4.5 g. L-1 (Urea) gave significant response in terms of number of main branches (4.98 branch. Plant -1), leaf area (229.11 decm2.Plant-1), total chlorophyll (261.86 mg. 100g-1 fresh weight), early flowering (27.83 day), acidity, T.S.S. and nitrogen in fruits (0.23, 4.01 and 2.26%, respectively). The Interaction of the same concentration with GS12 gave the best average of total chlorophyll and T.S.S. of (306.22 mg. 100g-1 fresh weight and 4.70% respectively) in addition to early flowering and fruit set of (25.33 and 31.67 day respectively).

اجريت تجربة في الحقل المكشوف التابع لقسم البستنة وهندسة الحدائق – كلية الزراعة جامعة بغداد خلال الموسم الربيعي 2012 لتقييم رش اربعـــــــة تراكيز من اليوريا 0, 1.5 . 3 . 4.5 غم / لتر على نباتات ستــــــــة تراكيب وراثيـــــــــــــــــة من الطماطـــــــــــــــــــــــة هي:,OLKA , JINAN, SUN, GS12, BAHGAT (Lycopersicon esculentum Mill) and wild type (Lycopersicon pimpinillifolium). . نفذت النجربة وفق تصميم الالواح المنشقة وبثلاث مكررات بهدف تحديد افضل تركيز من اليوريا وافضل تركيب وراثي يستجيب لمعاملات الرش. أظهرت نتائج الدراسة تفوق معاملة رش اليوريا بتركيز 4.5 غم . لتر-1 معنوياً في عدد الأفرع الرئيسة (4.98 فرع) و المساحة الورقية (229.11 دسم2.نبات-1) والكلوروفيل الكلي (261.86 ملغم100 غم وزن طري-1) والتبكير بالتزهير (27.83 يومًا) و النسبة المئوية لكل من الحموضة والمواد الصلبة الذائبة الكلية والنتروجين في الثمار(0.23 و 4.01 و 2.26 % على الترتيب). ادى التداخل معاملة الرش باليوريا بالتركيز ذاته التركيب الوراثي جي اس 12 الى اعطاء اعلى قيمة للكلوروفيل الكلي والنسبة المئوية للمواد الصلبة الذائبة (306.22 ملغم.100 غم وزن طازج-1 و 4.70% على الترتيب) بالاضافة الى التبكير بالتزهير والعقد (25.33 و 31.67 يوم على الترتيب).


Article
Toxic Effects of Purified Microcystins from Soil Blue-Green Alga Oscillatoria pseudogeminata on Tomato Plant Lycopersicon esculentum
التاثيرات السامة للمايكروسستينات المنقاة من طحلب التربة الاخضر المزرق Oscillatoria pseudogeminata على نبات الطماطم Lycopersicon esculentum

Authors: Emad yousif Awad Al-Sultan عماد يوسف عواد سلطان السلطان --- Mustafa Taher Hatem مصطفى طاهر حاتم
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2019 Volume: 16 Issue: 1 Supplement Pages: 169-177
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The current study included the isolation, purification and cultivation of blue-green alga Oscillatoria pseudogeminata G.Schmidle from soil using the BG-11liquid culture medium for 60 days of cultivation. The growth constant (k) and generation time (G) were measured which (K=0.144) and (G=2.09 days).Microcystins were purified and determined qualitatively and quantitatively from this alga by using the technique of enzyme linked immunosorbent assay (Elisa Kits). The alga showed the ability to produce microcystins in concentration reached 1.47 µg/L for each 50 mg DW. Tomato plants (Lycopersicon esculentum) aged two months were irrigated with three concentrations of purified microcystins 0.5 , 3.0 and 6.0 µg/L for 24 days. The results showed that the highest bioaccumulation of these toxins was found in the plant group treated with concentration 6.0 μg/L, with an average of 12.278 µg/L in the entire plant body, with a daily accumulation rate of 0.511 µg/day compared with control group and other treatments (p≤0.05). The highly accumulation of toxin was found in roots followed in descending order by stems and leaves respectively and were directly proportional to the increased concentration of purified microcystins. The study indicated that there were significant changes (p≤0.05) in the plant height, length of roots and surface area of the leaves and the leaves appeared pale green in color, which increased with increasing the concentration of purified toxin. The obtained results also showed a significant decrease in the concentration of carbohydrates and chlorophylls by increasing concentrations of purified toxins.

اشتملت الدراسة الحالية على عزل وتنقية وزراعة الطحلب الاخضر المزرق Oscillatoria pseudogeminata G.Schmidle من التربة باستخدام الوسط الزرعي الغذائي السائلBG-11 ولمدة 60 يومًا. تم قياس ثابت النمو (k) وزمن تكاثر الجيل (G) والذي بلغ (K = 0.144) و (G = 2.09 يوم) .تم تنقية السموم الكبدية Microcystins وتشخيصها نوعا وكما من الطحلب باستخدام تقنية الامتزاز المناعي المرتبط بالإنزيم Enzyme linked immunosorbent assay. أظهرت النتائج قابلية الطحلب على إنتاج السموم الكبدية وبتركيز بلغ 1.47 ميكروغرام / لتر لكل 50 ملغرام من الوزن الجاف للطحلب. عومل نبات الطماطم بعمر شهرين بالسم المنقى وبثلاث تراكيز 0.5 و 3 و 6 ميكروغرام / لتر لمدة 24 يوما. أظهرت النتائج أن أعلى تراكم حيوي لتلك السموم وجد في مجموعة النباتات المعاملة بالتركيز 6 ميكروغرام / لتر بمعدل بلغ 12.278 ميكروغرام / لتر في جسم النبات الكامل مع معدل تراكم يومي قدره 0.511 مايكروغرام/ يوم مقارنةً بمجموعة الكونترول والمعاملات الاخرى (p≤0.05). كما بينت النتائج اعلى مراكمة للسموم الكبدية المنقاة وجدت في الجذور والسيقان والأوراق على الترتيب تنازليا وازدادت بزيادة تركيز السم المنقى. أشارت الدراسة إلى وجود انخفاض معنوي (p≤0.05) في ارتفاع النبات وطول الجذور ومساحة سطح الأوراق وقد بدت الأوراق باللون الأخضر الباهت والتي ازدادت بزيادة تركيز السم المنقى. وأظهرت النتائج أيضا انخفاض معنوي في تركيز الكربوهيدرات والكلوروفيل بزيادة تركيزالسموم الكبدية المنقاة.


Article
Interaction between Cd & K in Some Growth Parameters and Peroxidase Activity of Tomato (Lycopersicon esculentumL.) Seedlings
التفاعل بين الكادميوم & K في بعض معلمات النمو والبيروكسيد آخر من الطماطم (Lycopersicon esculentumL.) شتلة

Authors: Abdullah I. Shaheed عبد الله ابراهيم شهيد --- Rihab E. Kadhim رحاب عيدان كاظم
Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2014 Volume: 6 Issue: 2 Pages: 108-119
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

Tomato (Lycopersicon esculentum L. var. Al-Wejdan) seedlings at 35 days old supplied with CdCl2 (0, 1, 10, 50, &100 mg/kg soil), KCl (0, 20, 40, &60 mg/kg soil) as well as the combinations between these concentrations. Seedlings at 65 day old showed increasing in stem length and diameter by a combination Cd, 100+K, 60 significantly. Whereas, no significant changes in leaves numbers. Seedlings at 95 day old showed no significant changes in stem length or it diameter whereas, leaves numbers increased by combinations Cd,50+K,20 and Cd,50+K,40. Leaf area was stimulated by K (60mg), Cd (100mg) and by many combinations. There was inhibition in chlorophyll content at Cd (100mg) and at a combination (Cd,1+K,20). Peroxidase activity was inhibited by K at (20 & 60 mg), Cd at 50mg, with all combinations contain K (20mg) except a combination Cd,1+K,20 and increased by Cd at 1mg. There were no significant changes at another combinations comparing with control.

جهزت بادرات نباتات الطماطة (Lycopersicon esculentum L.) صنف الوجدان بعمر 35 يوم بتراكيز مختلفة من كلوريد الكادميوم(0، 1، 10 و50 ملغمكغم تربة) وكلوريد البوتاسيوم (0، 20، 40 و 60 ملغمكغم تربة) مع توليفات من هاتين المادتين وبالتراكيز اعلاه . بينت النتائج زيادة معنوية في طول الساق وقطره في النباتات بعمر 65 يوم بتأثير التوليفة Cd,100+K,60 ملغمكغم تربة، ولم يحصل تغير معنوي في عدد الأوراق. أما في مرحلة النمو الثانية (بعمر 95 يوم) فلم يحصل تغيير معنوي في طول الساق وقطره، بينما ازداد عدد الأوراق بالتوليفتين (Cd, 50+K, 20) و(Cd, 10+K, 40). حفزت المساحة الورقية بالتراكيز العالية لكل من البوتاسيوم والكادميوم ومعظم التوليفات، في حين سبب التركيز العالي للكادميوم (100ملغم) انخفاض معنوي في محتوى الكلوروفيل. ثبطت فعالية إنزيم البيروكسيديز بتأثير البوتاسيوم (20 و60ملغم(والكادميوم بتركيز (50ملغم)، وزادت بتأثير الكادميوم(1 ملغم) فضلا عن انخفاضها بتأثير كل التوليفات الحاوية على البوتاسيوم بتركيز (20 ملغم) عدا التوليفة Cd,1+K,20. ولم تؤثر بقية التوليفات معنويا في فعالية الأنزيم عند المقارنة مع عينة السيطرة.


Article
تقييم كفاءة الفطر (Dierckx) Penicillium corylophilum كعامل مكافحة أحيائية ضد الفطر Fusarium oxysporum المسبب لمرض الذبول الفيوزارمي على الطماطة

Author: أحمد كاظم عبد الهادي
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2017 Volume: 25 Issue: 4 Pages: 1369-1378
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

The results of the field survey of four cultivars of tomato in Babil province showed the presence of Fusarium wilt disease on tomato caused by Fusarium oxysporum f.sp lycopersici (Sacc) Snyder & Hanse with disease incidence of 46 to 30%. The isolates of Penicillium corylophilum (Dierckx) with the roots of the Tomato plants in the Jablh area in Babil province . P. corylophilum fungus was used as a biocontrol agent. The results of the pathogenicity test of F. oxysporum showed that the radish seeds had a high pathogenicity, with the percentage of germination of radish seeds ranged from 4-2%. P. corylophilum was not shown in radish seeds in the test of pathogenicity, where the percentage of germination was 97% . The results of the biological control agent of P. corylophilum showed a high antagonistic abilty to pathogenic fungi with 93.05% inhibition and antagonism degree was 1. The effect of bioprotective leachate in three concentrations in the inhibition of pathogenic fungi in the PSA medium significantly compared to the control treatment. Bio-control fungus contributed to reducing the severity of pathogenic fungus at low levels compared to the single-pathogenic fungus treatment which was of 85% in the experience under lath house condition . The treatment of the fungus resulted in a significant increase in plant growth parametars compared with the treatment of pathogenic fungi alone

بيّنت نتائج المسح الحقلي لأربع مناطق لزراعة الطماطة في محافظة بابل وجود مرض الذبول الفيوزارمي المتسبب عن الفطر Hanse &Snyder (Sacc) Lycopersici sp Fusarium oxysporum f. وبنسبة أصابة تراوحت مابين 46 -30% .عزل الفطر Penicillium corylophilum (Dierckx) من التربة المحيطة بجذور نباتات الطماطة في ناحية جبله في محافظة بابل , واستعمل في مقاومة الفطر الممرض Fusarium oxysporum كعامل مقاومة أحيائية. أوضحت نتائج اختبار المقدرة الامراضية للفطر الممرض oxysporum F. على بذور الفجل قدرته الامراضية العالية إذ تراوحت النسبة المئوية لإنبات بذور الفجل مابين 4-2% . لم تظهر أمراضية للفطر P. corylophilum في بذور الفجل في اختبار المقدرة الامراضية إذ بلغت النسبة المئوية للانبات %97 . أظهرت نتائج المقدرة التضادية للفطر الإحيائي P. corylophilum مقدرته التضادية العالية للفطر الممرض إذ بلغت نسبة التثبيط 93.05% ودرجة التضاد1 . أثر راشح الفطر الإحيائي بثلاثة تراكيز في تثبيط الفطر الممرض في الوسط الزرعي (PSA) بشكل معنوي مقارنةً بمعاملة المقارنة. أسهم فطر المقاومة الإحيائية في تقليل شدة الاصابة بالفطر الممرض لمستويات منخفضة قياساً بمعاملة الفطر الممرض بمفرده التي بلغت 85% في تجربة الظلة الخشبية . ادت المعاملة بالفطر الإحيائي إلى رفع معنوي لمعايير نمو النبات مقارنة بمعاملة الفطر الممرض بمفرده.


Article
Genetic Diversity of Some Tomato Lycopersicon esculentum Mill Varieties in Iraq Using Simple Sequence Repeat (SSR) Markers
التنوع الوراثي لبعض أصناف الطماطم اسكولينتوم مطحنة في العراق عن طريق بسيط تسلسل كرر (SSR) علامات

Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2015 Volume: 7 Issue: 1 Pages: 64-80
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to evaluate the genetic diversity among 19 tomato varieties (determinate and indeterminate) cultivated in Iraq using polymerase chain reaction based DNA marker (PCR based DNA markers Simple Sequence Repeats (SSRs). To achieve PCR reactions ,total genomic DNA was isolated from fresh leaves (2 weeks old). The average yields of DNA were in the range of 100-295 ng/μl with a purity ranging between 1.8-1.9.A total of 21 alleles were detected among the tested varieties using 5 SSRs loci distributed on 4 chromosomes of tomato. The molecular size of bands obtained from amplification of SSR products ranged from 121 to 247 bp. Alleles ranged from one in (Tom 8-9, Tom 41-42 and Tom 67-68 loci) to twelve in Tom 49-50 locus. The values of heterozygosity for each locus ranged between 0.63 for Tom 31-32 and 0.89 for Tom 49-50 with a mean value of 0.30. The polymorphic information content (PIC) values for the SSR loci ranged from 0.45 in Tom 31-32 to 0.58 in Tom 49-50 loci with an average of 0.21. Each one of (Tom 8-9, Tom 41-42 and Tom 67-68 loci) produce 0.0 value for both heterozygosity and PIC.The study revealed that, The lowest genetic distance was (0.3244) between varieties Kenanh (lane5) and Warda (lane10), while,the highest genetic distance was (0.9177) between varieties Helam (lane3) and Super marimond (lane 16). The genetic similarity values ranging from (0.0823 to 0.6756) depending upon the genetic distance values that ranging from (0.3244 to 0.9177), indicating the largest diversity with percentage of (32 to 91%) among the tested varieties. The analysis of the obtained results from genetic distances and Neighbor-joining dendrogram (unrooted tree) revealed that, the 19 tested tomato varieties can be grouped into two major groups: first cluster include 9 varieties distributed in two subgroups.The second major cluster include 10 varieties which in turn divided into two subgroups.

أجريت الدراسة الحالية لتقدير التنوع الوراثي ل 19 صنف من اصناف الطماطة ( المحدودة وغير المحدودة النمو) المستزرعة في العراق باستخدام مؤشرات الدنا (DNA Markers) المعتمدة على تفاعلات البلمرة المتسلسلة Polymerase Chain Reaction (PCR ) وهي التكرارات المتسلسلة البسيطة Simple Sequence Repeats (SSRs ). لتنفيذ تفاعلات ال PCR تم عزل دنا المجين (Genomic DNA) من أوراق الطماطة الفتية (بعمر أسبوعين) و الحصول على كمية من الدنا تراوحت بين 100-295 نانوغرام/مايكروليتر وبنقاوة تراوحت بين 1.8-1.9.تم الكشف عن 21 من الأليلات بين الأصناف باستعمال 5 من المواقع الوراثية ذات التتابع المتكرر البسيط (SSR) Simple Sequence Repeat والمنتشرة على اربعة من كروموسومات الطماطة. وتراوح الحجم الجزيئي للحزم الناتجة من تضاعف المواقع الوراثية للـ SSR من 121 إلى 247 زوج قاعدي. وتباين عدد الأليلات في المواقع الوراثية من أليل واحد في كل من (Tom 8-9 , Tom 41-42 ,Tom 67-68) إلى اثني عشرأليل في الموقع الوراثي ( (Tom 49-50. ووجد أن قيم التغاير الزايكوتي heterozygosity لكل موقع تراوح من0.63 في (Tom 31-32) إلى0.89 في (Tom 49-50) وبمعدل قدره 0.30. تراوحت قيم محتوى المعلومات متعددة الأشكال (PIC) polymorphic information content لكل موقع وراثي بين 0.45 في الموقع الوراثي (Tom 31-32) إلى 0.58 في الموقع الوراثي ( (Tom 49-50، وبمعدل قدره 0.21. اعطى كل من المواقع الوراثية (Tom 8-9, Tom 41-42, Tom 67-68) قيمة 00. لكل من قيم التغاير الزايكوتي و محتوى المعلومات متعددة الأشكال.توصلت الدراسة من خلال هذا المؤشر الجزيئي إلى أن أقل بعد وراثي هو(0.3244) بين الصنفين Kenanh (رقم 5) والصنف Warda (رقم 10)، بينما كان اعلى بعد وراثي هو (0.9177) بين الصنفين Helam (رقم 3) و Super marimond (رقم 16). وعلى أساس قيم البعد الوراثي تم إيجاد قيم التشابه الوراثي التي تراوحت من 0.0823 الى 0.6756، والتي تشير الى التنوع الكبير الذي نسبته (32 إلى 91%) بين الأصناف المدروسة. اظهر تحليل النتائج التي تم الحصول عليها من البعد الوراثي وشجرة العلاقة الوراثية Neighbor-joining dendrogram إلى أن كل الأصناف المدروسة توزعت إلى مجموعتين رئيسيتين: المجموعة الاولى ضمت 9 أصناف وقسمت هذه بدورها الى مجموعتين فرعيتين اما المجموعة الرئيسية الثانية فتضمنت 10 أصناف قسمت بدورها الي مجموعتين فرعيتين. أظهر التحليل العام للنتائج أن العلاقات الوراثية بين أصناف الطماطة لا علاقة لها بالصفات المظهرية و المنشأ الأصلي


Article
Genetic Diversity of Some Tomato Lycopersicon esculentum Mill Varieties in Iraq Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers

Authors: Attyaf jameel thamir --- Ali Hmood Al-Saadi --- Muhssin Chilab Abbass
Journal: Journal of University of Babylon مجلة جامعة بابل ISSN: 19920652 23128135 Year: 2014 Volume: 22 Issue: 9 Pages: 2351-2342
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to evaluate the genetic diversity among 19 tomato varieties (determinate and indeterminate) cultivated in Iraq using polymerase chain reaction based DNA markers (PCR based DNA markers) ; Random Amplified Polymorphic DNA (RAPDs) .To achieve PCR reactions ,total genomic DNA was isolated from fresh leaves (2 weeks old).The average yields of DNA were in the range of 100-295 ng/μl with a purity ranging between 1.8-1.9.RAPDs amplifications were performed for varieties fingerprinting by testing 27 Operon primers. DNA polymorphisms among varieties were scored within detectable amplified fragments (their numbers and molecular weight) after agarose gel electrophoresis and staining by ethidium bromide. These 27 primers produced 442 of main bands,out of which 312 were polymorphic bands (70.5%) and 70 were monomorphic (15.8%) across all tested varieties. Each selected primer produced between 60 bands (OPA-14) to 290 bands (OPD-13). DNA amplification products ranged in their size from 250 bp ( OPA-01, OPU-14, OPX-15,OPX-19,OPT-08( to 2755 bp (OPX-18). The highest number of polymorphic bands (21 bands) was produced by primer OPU-03 while, the lowest number of polymorphic bands (3 band) was produced by both primers OPA-14 and OPB-17. The primers varied in their capacity in producing polymorphic amplified profiles among studied tomato varieties which individually reflected variety specific DNA profiles (fingerprints). The most important primers for this purpose were primers that produced more variety specific DNA profiles, such as OPD-13, OPT-08, OPW-04, OPA-04, OPA-15, OPB-18, OPU-03, OPC-09.The highest value of discrimination among varieties in this study was obtained by primer OPU-03 while the lowest discrimination value was produced by both primers OPA-14 and OPB-17.The primer efficiency ranged from 0.13 in (primer OPC-09) to 0.02 in (primer OPB-17). The lowest genetic distance was (0.2294) between varieties Oula and Shadylady, while, the highest genetic distance was (0.9459) between varieties Fotton and Special pack. Cluster analysis (phylogenetic tree) by unweighted pair-group method of arithmetic means (UPGMA) based dendrogram revealed that they were two main genetic groups (major clusters). The first small major clusters included four (4 varieties) while the second large major cluster included (15 varieties ). The overall analysis of the results show that RAPDs markers are powerful tool in fingerprinting and revealing the genetic relationships among tomato varieties.The relationship among varieties was not concern to their morphological characters and geographical origins

أجريت الدراسة الحالية لتقدير التنوع الوراثي ل 19 صنف من اصناف الطماطة ( المحدودة وغير المحدودة النمو ) المستزرعة في العراق باستخدام مؤشرات الدنا (DNA Markers) المعتمدة على تفاعلات البلمرة المتسلسلة Polymerase Chain Reaction (PCR ) وهي مؤشرات التفاعل التضاعفي العشوائي المتعدد الأشكال لسلسلة الدنا Random Amplified Polymorphic DNA (RAPDs) . لتنفيذ تفاعلات ال PCR تم عزل دنا المجين (Genomic DNA) من أوراق الطماطة الفتية (بعمر أسبوعين) و الحصول على كمية من الدنا تراوحت بين 100-295 نانوغرام/مايكروليتر وبنقاوة تراوحت بين 1.8-1.9.اجريت تفاعلات ال RAPDs للحصول على بصمة للاصناف المدروسة باختبار 27 بادئ والكشف عن التباينات بين القطع المتضاعفة لكل صنف (أعدادها وأحجامها الجزيئية) بعد تصبيغ و ترحيل نواتج التضاعف للعينات على هلام الأكآروز.أعطى 27 بادئ نواتج تضاعف متباينة بين الأصناف المدروسة بلغت 312 حزمة متباينة 70.5%)Polymorphic bands) و70 حزمة وحيدة الشكل bands monomorphic (15.8%) من أصل2 44 حزمة رئيسية main band. تباينت اعداد الحزم المتضاعفة ما بين 60 حزمة (OPA-14) إلى 290 حزمة (OPD-13). وتراوح حجم النواتج المتضاعفة للدنا بين 250 زوج قاعدي , OPA-01, OPU-14, OPX-15) OPX-19,OPT-08) إلى 2755 زوج قاعدي (OPX-18). أكبر عدد من الحزم المتباينة (21 حزمة) نتجت بواسطة البادئ OPU-03 في حين ظهر أن أقل عدد من الحزم المتباينة (3 حزم) كان للبادئين OPB-17 وOPA-14 . وقد اختلفت البادئات في قدرتها على إيجاد أنواع مختلفة من النسق بين الأصناف المدروسة polymorphic RAPD profile أمكن من خلالها إيجاد البصمة الوراثية للأصناف قيد الدراسة من الطماطة والتي تعكس ملامح متنوعة فردية محددة الحمض النووي (البصمات). والبادئات الأكثر أهمية لهذا الغرض هي تلك التي تنتج المزيد من DNA profiles متنوعة محددة، مثل OPD-13، OPT-08، OPW-04،,OPA-04 ,OPA-15 OPB-18 , OPU-03 و .OPC-09 ووجد في هذه الدراسة بأن البادئ OPU-03 كان له أعلى قيمة في القدرة على التمييز ،بينما اظهر كل من البادئين) OPB-17وOPA-14) اقل قيمة كما و تراوحت كفاءة البوادئ بين 0.13 للبادئ (OPC-09) إلى 0.02 في البادئ (17 OPB-).وكان أقل بعد وراثي هو (0.2294) بين صنفي الطماطة Oula و Shadylady ، بينما اعلى بعد وراثي هو (0.9459) بين الصنفين Fotton و Special packوكشف التحليل التجميعي (شجرة النشوء والتطور) من خلال طريقة unweighted pair-group method of arithmetic means (UPGMA ) أي المعتمد على شجرة العلاقات التطورية إلى اثنين من المجموعات الوراثية الرئيسية.الاولى صغيرة ضمت 4 اصناف والثانية كبيرة ضمت 15 صنف .أظهر التحليل العام للنتائج أن كل من المؤشر الوراثي المعروف بال RAPD يعد اداة قوية لتحديد البصمة والكشف عن العلاقات الوراثية بين أصناف الطماطة . لم تظهر العلاقات بين الاصناف المدروسة ارتباطا بالموقع الجغرافي والصفات المظهرية.

Listing 1 - 8 of 8
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (8)


Language

English (6)

Arabic (1)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2019 (1)

2017 (1)

2016 (1)

2015 (2)

2014 (3)