research centers


Search results: Found 6

Listing 1 - 6 of 6
Sort by

Article
The incidence of pan-drug resistance in a sample of Acinetobacter baumannii clinical isolates obtained from Al-Ramadi Teaching Hospital
ظهور المقاومة الشاملة في العزلات السريرية لعينة من الاساينيتوباكتر بوماني المأخوذة من مستشفى الرمادي التعليمي

Loading...
Loading...
Abstract

AbstractBackground: Acinetobacter infections have become more difficult to treat owing to the emergence of isolates resistant to all commonly prescribed antimicrobial drugs, particularly pan-drug resistant Acinetobacter baumannii.Aim of Study: to investigate the incidence of pan-drug resistance in a sample of A. baumannii clinical isolates obtained from Al-Ramadi Teaching HospitalMaterials and Methods: Twenty-six A. baumannii were isolated from 130 wound and burn patients obtained from operative theatres and burn centre, in Al-Ramadi Teaching Hospital from October 2012 to May, 2011. Identifications were performed by standard microbiological techniques and by means of a commercial identification gallery (API 20E) and further confirmed by (API 20NE). The susceptibility of the isolates to selected major classes of anti-A. Baumannii agents were determined by the standard disk diffusion method as described in the guidelines of the Clinical Laboratory Standard Institute (CLSI). Appropriate tests were performed for detecting carbapenemase and metallo-β-lactamase production.Result: Out of 26 isolates of A. baumannii, 6/26 (23%) were imipenem-resistant pandrug resistant (IR-PDR) A. baumannii, i.e. resistant to all representative drugs of available anti-A. baumannii in Iraq. One out of 26 (4%) was imipenem-resistant multidrug resistant (IR-MDR). All the (7) imipenem-resistant A. baumannii isolates were obtained from the Burn Centre, six were isolated from patients have taken meropenem in their treatment and only one patient who had not taken meropenem but admitted to the centre at the same time with other two patients suffering from Steven-Johnson syndrome have been given meropenem, all showed positive results in the metallo-β-lactamase production screening tests.Conclusion: It is concluded that the presence of carbapenem, multidrug and pandrug resistance is evident in our sample of A. baumannii isolates and may be associated with the use of meropenem and inadequate infection control measures particularly in burn patients.Key words: Acinetobacter baumannii, Pan-drug resistance, Metallo-β-lactamase, Ramadi

الخلاصةالخلفية: عدوى الاساينيتوباكتر اصبحت صعبة العلاج بسبب ظهور عزلات مقاومة لكل المضادات الحيوية الموصوفة والمتوفرة, خاصة بكتريا الاساينيتوباكتر بوماني ذات المقاومة الشاملة. الاهداف: التحري و ملاحظة ضهور المقاومة الشاملة في عزلات الاساينيتوباكتر بوماني السريرية المأخوذة من مستشفى الرمادي التعليمي.طرائق العمل: 26عزلة لبكتريا الاساينيتوباكتر بوماني عزلت من مجموع 130 مريض مأخوذة من مركز الحروق و صالات العمليات في مستشفى الرمادي التعليمي للفترة من تشرين الأول 2010 لغاية أيار 2011 التشخيص اجري باستخدام الطريقة المايكروبايولوجية القياسية و بواسطة التشخيص التجاري، اجري اختبار الحساسية للعزلات للاصناف الرئيسية لمضادات الاساينيتوباكتر بوماني بطريقة الانتشار حول الاقراص. استخدم فحص مناسب للكشف عن انتاج انزيم carbapenemase و metallo-β-lactamase.النتائج: من اصل 26عزلة لبكتريا الاساينيتوباكتر بوماني, 6/26 (23%) عزلة لبكتريا الاساينيتوباكتر بوماني كانت مقاومة لجميع الادوية (مقاومة لكل مضادات الاساينيتوباكتر بوماني المتوفرة في العراق) بينما 1 من اصل 26(4%) مقاومة للعديد من الادوية. الـ(7) عزلات المذكورة اعلاه عزلت من مركز الحروق و كانت جميعها مقاومة للاميبينيم, (6) عزلات من مرضى اخذوا الميروبينيم ضمن العلاج و(1) عزلت من مريض لم ياخذ الميروبينيم لكن دخل للمركز مع مرضى كانوا ياخذون الميروبينيم. كل العزلات اظهرت نتائج موجبة لفحص انتاج ال MBL.الاستنتاجات: يستنتج من هذه الدراسة بان المقاومة لمجموعة كاربابينيم والمتعددة والشاملة ظهرت في عزلات هذه الدراسة وان هذه المقاومة من المحتمل ان تكون مرتبطة باستخدام المضاد الحيوي ميروبينيم واجراءات السيطرة غير الكافية للعدوى خصوصا في مرضى الحروق.


Article
Prevalence of VIM Metallo ß –Lactamase among Clinical Isolates of Klebsiella pneumoniae in Hilla Hospitals

Authors: Eman Mohammad Jarallah --- Fatima Moeen Abbas
Journal: Medical Journal of Babylon مجلة بابل الطبية ISSN: 1812156X 23126760 Year: 2014 Volume: 11 Issue: 4 Pages: 825-835
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

This study investigated the presence of blaVIM in clinical isolates of Klebsiella pneumoniae. During the period from April to August 2011, a total of 801 various clinical samples were collected from different hospitals in Hilla city. Of these,117 isolates were diagnosed as K.pneumoniae . High prevalence of K.pneumoniae isolates were detected in stool samples 38 (27%) followed by sputum 19 (15%). All 117 K.pneumoniae isolates were primarily screened for - lactams resistance, 91 (78%) showed positive results for beta lactams . β- lactam resistance isolates were underwent antimicrobial susceptibility to 26 antibiotics by Kirby-Bauer disk diffusion methods .High resistance rate was recorded for penicillins (carbenicillin and ampicillin) (99%) and (94.5%),respectively .Carbapenem resistance was reported in 17 (18.7%) of K. pneumoniae isolates. Phenotypic detection of metallo β- lactamase by imipenem-EDTA disk identified a proportion of 65% as metallo β-lactamase producers. The presence of blaVIM gene was checked by Polymerase Chain reaction (PCR) and confirmed in 14(82.3%) of isolates.


Article
Detection of blaNDM -Metallo-β-Lactamase Genes in Klebsiella pneumonia Strains Isolated From Burn Patients in Baghdad Hospitals

Authors: Abbas Atyia Hammoudi --- Azhar Noori Hussein --- Mohammed Shamkhi Jebur
Journal: Medical Journal of Babylon مجلة بابل الطبية ISSN: 1812156X 23126760 Year: 2016 Volume: 13 Issue: 4 Pages: 904 -913
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

From the period from March to August 2016, 210 swabs were collected from the burn patients hospitalized in different hospitals in Baghdad City: Al-Karama Teaching Hospital, Special Burn Hospital, Central Teaching Laboratories, Child protection Teaching Hospital, Imam Ali Hospital. Out of 210 clinical isolates, 42 (37.5 %) had been shown a single isolated of pathogenic bacteria K. pneumoniae and the others were belonged to other bacteria and mixed growth isolates. Identification of all isolates were carried out depending on macroscopic, microscopic characterizations, conventional biochemical tests and Api 20E system.Metallo-β lactamase (MBL) enzymes were screen by two phenotypic methods(Meropenem-EDTA double disks method and Modified Hodg test). Susceptibility testing were used with The following antibiotic disks:Imipenem,Meropenem,Ceftazidime,Cefotaxime,Pipracillin,Gentamicin,Amikacin andCiprofloxacin.The percentage of resistance isolates were as followed:Imipenem (21.42%),Meropenem (19.04%),Ceftazidime(69.04%), Cefotaxime (85.71%), Pipracillin(85.71%), Gentamicin (26.19%), Amikacin (19.04 %) andCiprofloxacin(59.52%).The percentage of the prevalence of blaNDM-1 and blaNDM-2 genes in K. pneumoniae isolates from burn patients in Baghdad hospitals were as followed:20(100 %) forblaNDM-1 genes and 6 (30 %) for blaNDM-2 genes.


Article
3.DETECTION OF NEW DELHI METALLO-BETA-LACTAMASE-1 (BLANDM-1) IN CARBAPENEM-RESISTANT PSEUDOMONAS AERUGINOSA ISOLATED FROM CLINICAL SAMPLES IN WASIT HOSPITALS

Authors: Zeyad K. Hussein --- Haider S. Kadhim --- Jabbar S. Hassan
Journal: IRAQI JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES المجلة العراقية للعلوم الطبية ISSN: P16816579,E22244719 Year: 2018 Volume: 16 Issue: 3 Pages: 239-246
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

Background:Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) infections are clinical problem, it is a difficult to treat because of high resistant to many antibiotics (Multi-drug resistant) and a high risk of emergence of resistance during therapy. Carbapenems are therapeutic choice against infections caused by Gram-negative bacilli including strains of P. aeruginosa. New Delhi metallo-β-lactamase-1 (blaNDM-1) gene, an acquired class B carbapenemase. Dissemination predominantly involves transfer of the blaNDM-1 gene among promiscuous plasmids and clonal outbreaks. Bacteria with NDM-1 are typically resistant to nearly all antibiotics.Objective:To detect blaNDM-1 in the isolates of P. aeruginosa, which were recovered from various clinical samples from hospitalized patients in Wasit hospitals.Methods: This cross-sectional study involved 200 clinical samples were collected from three major hospitals in Wasit province. Samples were inoculated in Mackonkey and blood agar for primary isolation and then biochemical tests were used to confirm diagnosis of P. aeruginosa. The susceptibility test for 14 types of antibacterial drugs were tested by using disk diffusion method. Chromosomal and plasmid DNA were extracted by using special methods.Results: Out of 36 carbapenems resistant P. aeruginosa (CRPA) isolates, there were 18 isolates (50%) positive for blaNDM-1 gene.Conclusion: Rate of occurrence of blaNDM-1producers is highest among carbapenem-resistant P. aeruginosa isolated from clinical samples in Wasit hospitals. Therefore, its recognizable proof in clinical bacterial diseases will be suspected in any carbapenem resistance P. aeruginosa.Keywords: P. aeruginosa; carbapenems; metallo-β-lactamase; blaNDM-1Citation: Hussein ZK, Kadhim HS, Hassan JS. Detection of New Delhi metallo-beta-lactamase-1 (blaNDM-1) in carbapenem-resistant pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples in Wasit hospitals. Iraqi JMS. 2018; 16(3): 239-246. doi: 10.22578/IJMS.16.3.3


Article
Molecular and Bacteriological Detection of Multi-drug resistant and Metallo- β -Lactamase Producer Acinetobacter baumannii in Ramadi City, West of Iraq
الكشف البكتريولوجي الجزيئي عن المقاومة المتعددة و انزيمات الميتالو بيتا لاكتميز المنتجة من قبل الـ Acinetobacter baumannii في مدينة الرمادي غربي العراق

Authors: Mushtak T. S. Al- Ouqaili مشتاق طالب صالح --- Ahmed Sa’doun Jal’oot احمد سعدون جلعوط --- Amin Suleiman Badawy امين سليمان بدوي
Journal: Al- Anbar Medical Journal مجلة الأنبار الطبية ISSN: PISSN: 27066207 / EISSN: 26643154 Year: 2016 Volume: 13 Issue: 1 Pages: 1-13
Publisher: University of Anbar جامعة الانبار

Loading...
Loading...
Abstract

Background: One leading factor responsible for resistance in Acinetobacter baumannii, is the production of carbapenamases like metallo-β-lactamases (MBLs), which hydrolyze a variety of β-lactams including penicillin, cephalosporins and carbapenems. This study aims to evaluate phenotypic method against genotypic, PCR as gold standard test among carbapenem resistant A. baumannii for identifying MBL producers.Patients and Methods: One hundred and eighty-eight of 213 patients were culture positive (88.26%). Forty-four Acinetobacter baumannii clinical isolates were chosen for this study. Phenotypic expression of MBL was detected by IPM-EDTA-disk synergy test and presence of blaIMP-1 and blaIMP was detected by PCR for all metallo- β -lactamase producing Acinetobacter baumannii.Results: Forty-one (93.2%) isolates of Acinetobacter baumannii (out of 44 isolates) were found to be MBL producers by IPM-EDTA-disk synergy test. Thirty-five (80%) Acinetobacter baumannii of 44 presumptive MBL producer isolates (with isolates were negative for MBL producer in phenotypic method used as control) were positive for bla IMP-1 gene by PCR, while twelve (27.3%) Acinetobacter baumannii out of 44 presumptive MBL producer isolates (with isolates were negative for MBL producer in phenotypic method used as control) were positive for blaIMP gene by PCR. The coexistence of blaIMP-1 with blaIMP genes in present study 25% (11/44) of cases.Conclusion: Most isolates of Acinetobacter baumannii were found to be metallo beta-lactamase (MBL) producers using IPM-EDTA-disk synergy test. Further, isolates of A. baumannii have been produced MBL gene (bla IMP-1). It seems to be the major mechanism of resistance among Iraqi nosocomial isolates of A. baumannii.

الخلفية : احد العوامل المهمة والمسؤولة عن المقاومة عند بكتريا Acinetobacter baumannii هو إنتاج انزيمات carbapenamase خاصة انزيمات metallo-β-lactamases (MBLs) التي تحلل انواع مختلفة من β-lactams منها البنسلينات والسيفالوسبورينات والكاربيبنمات. الهدف : تهدف هذه الدراسة إلى تقييم الخواص الشكلية(المظهرية) مقابل الخواص الوراثية، باستخدام تقنية تفاعل الكوثرة (PCR) كاختبار اساسي لبكتريا A. baumannii المقاومة للكاربيبنم من اجل تشخيص انتاج انزيمات Metallo-β-lactamases (MBLs). المواد وطرق العمل : وضَّحت نتائج زرع 213 مريض ،أن نسبة الإصابة الفعلية بالخمج عند المرضى 188مريضاً (88,3%). وقد تم إختيار44عزلة من بكتريا Acinetobacter baumannii لإجراء الدراسة الحالية. تم الكشف عن الخواص المظهرية للعزلات المنتجة لأنزيمات الميتالو بيتا لاكتميز قيد الدراسة بواسطة اختبار التآزر المزدوج بين IPM-EDTA،في حين استخدمت تقنية PCR لتضخيم جينات blaIMP-1 and blaIMP للكشف الجيني عن الانزيمات المذكورة اعلاه.النتائج : أظهرت نتائج الاختبار التأكيدي لإنتاج انزيمات الميتالو-بيتا-لاكتميز ان احدى واربعين عزلة من اصل اربع واربعين (93.2%) من عزلات Acinetobacter baumannii كانت منتجة لأنزيمات الميتالو-بيتا-لاكتميز بواسطة اختبار التآزر المزدوج بين IPM-EDTA ، في حين كانت العزلات الثلاثة المتبقية غير منتجة للأنزيمات المذكورة أعلاه. استهدفت الدراسة الحالية الكشف عن الجينات المشفرة لمقاومة مضاد الـ carbapenem باستخدام تقنية تفاعل الكوثرة (PCR) لتضخيم الجينات ( blaIMP-1 و blaIMP)، اذ كانت 35 عزلة من أصل 44 (80%) من بكتريا Acinetobacter baumannii المنتجة ابتدائياً لأنزيمات الميتالو-بيتا-لاكتميز موجبة لجين blaIMP-1 ،في حين كانت اثنتا عشرة عزلة من أصل اربع واربعين (27.3%) من العزلات أعلاه موجبة للجين blaIMP. كما بينت نتائج الدراسة الحالية ان نسبة 25% (11 من أصل 44) من عزلات بكتريا Acinetobacter baumannii امتلكت نوعين من آليات المقاومة (blaIMP + blaIMP-1) لمضاد carbapenem.الاستنتاج: استنتجت الدراسة الحالية إن أغلب عزلات بكتريا Acinetobacter baumannii كانت منتجة لأنزيمات الميتالو-بيتا-لاكتميز بواسطة اختبار التآزر المزدوج بين IPM-EDTA. كذلك أثبتت الدراسة الحالية ان أغلب عزلات بكتريا Acinetobacter baumannii المنتجة لأنزيمات الميتالو-بيتا-لاكتميز امتلكت جين blaIMP-1 ، ويمثل الجين أعلاه الميكانيكية الرئيسية للمقاومة بين عزلات Acinetobacter baumannii المنتشرة في المستشفيات العراقية.


Article
Possibility of transmission the character of antibiotics resistance and heavy metals by conjugation genetic process in klebsiella pneumonia
إمكانیة إنتقال صفة مقاومة المضادات الحیویة والمعادن الثقیلة بعملیة الإقتران الوراثي في بكتریا Klebsiella pneumonia

Authors: إیمان عباس علي الزنكنة --- ھادي رحمن رشید الطائي --- عباس عبود فرحان الدلیمي
Journal: Diyala Journal For Pure Science مجلة ديالى للعلوم الصرفة ISSN: 83732222 25189255 Year: 2014 Volume: 10 Issue: 3 - part 1 Pages: 77-94
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

The total 22 isolate of K. pneumoniae which isolated from different infected cases has been active through their growth on the Brain Heart Infusion Broth Media, and then the processes of detection for bacterial producing to the Beta lactamase was done.19 isolate (86.4%) showed ability to produce β-Lactamase enzyme , also have the ability to produce the Extendended spectrum β-Lactamase enzyme by using Disc Approximation , where was 9 isolates (40.9%), testing has been its ability to produce enzymes Metalloβ-Lactamase and using the Imp-EDTA combination disc as managed 12 isolates (54.5%) production of the enzyme.All isolates showed pattern of multiple drug resistance towards 16 anti biotics , as were all isolates (100%) were resistance to antibiotics Ampicillin , Carbencillin , and Pipracillin, while most of the isolates were sensitive to Imipenem and chloramphenicol, and varied resistance ratio for the rest of antibiotics.Detection tolerate of bacteria to different concentrations of heavy metals and that their growing them on media containing different concentrations (3, 1.5, 0.03, 0.03 and 1.5) mmol. of metals (copper, cobalt, mercury, silver, and zinc) respectively where the highest concentration tolerance the bacteria to copper(3) mmol. , and the lowest concentration tolerance to metallic mercury and silver (0.01) In the current study was conducted the bacterial conjugation for a group of bacterial isolates that have shown high resistance to antibiotics and heavy metals as well as the production of enzymes β-Lactamase with the standard strain E.coliMM294, and the Isolates were unable to achieve the conjugation in the liquid media or solid agar by Seldeen method, while 18 isolates which contain plasmids were able to achieve conjugation (100%) on solid agar by Miller method where depended on heavy growth and direct contact between the donor and recipient strains .The current study found by investigation the plasmid profile for conjugated cells that the most of the plasmids had transferred from donor strain which represent by the isolates under study to standard strain , where 15 trans conjugated isolates (83.3%) from 18 isolate can produce β-Lactamase enzyme , while 9 trans conjugated isolate (50%) can produce extended spectrum β-Lactamase enzyme , and 10 trans conjugated isolate 55.6)%) can produce Metallo β-Lactamase enzyme , in addition to the multi drug resistance and the heavy metal tolerance were transferred to the trans conjugated cells , a condition implying that they are plasmid mediated.

نُشطت 22 عزلة لبكتريا K.pneumoniae المعزولة سابقا من أصابات مرضية مختلفة (ألتهابات مجاري بولية , حروق , جروح , قشع) وذلك بتنميتها على وسط Brain Heart Infusion Broth ثم أجريت عملية الكشف عن إنتاج البكتريا لأنزيمات البيتالاكتاميز β-Lactamase .أظهرت نتائج هذه الدراسة ان 19 عزلة (86.4%) لهاالقابلية على إنتاج أنزيمات البيتا لاكتاميز، و كان 9 عزلات لها القابلية على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز الواسعة الطيف و بنسبة (40.9%) ,وكانت 12 عزلة (54.5%) قادرة على انتاج انزيمات البيتالاكتاميز المعدنية.اختبرت حساسية العزلات نمط المقاومة المتعددة تجاه 16 مضاداً حيوياً، وكانت جميع العزلات وبنسبة 100% مقاومة لمضادات الامبسيلين، و الكاربنسيلين، والببراسيلين، في حين كانت معظم العزلات حساسة لمضادي الاميبينيم والكلورامفينيكول، وتفاوتت نسبة المقاومة لباقي المضادات .تم تحديد تحمل البكتريا لتراكيز مختلفة من المعادن الثقيلة وذلك بتنميتها على أوساط تحتوي على تراكيز مختلفة ( 3 ، 1.5 ، 0.03 ، 0.03 و 1.5 ) ملي مول من معادن (النحاس، الكوبلت، الزئبق، الفضة، والزنك) على التوالي حيث كان أعلى تركيز تحملته البكتريا لمعدن النحاس (3) ملي مول، وأقل تركيز تحملته كان لمعدني الزئبق والفضة (0.01) ملي مول.تم إجراء عملية الأقتران البكتيري Conjugation لمجموعة من العزلات التي أبدت مقاومة عالية للمضادات الحيوية والمعادن الثقيلة فضلاً عن إنتاجها لأنزيمات البيتا لاكتاميز مع السلالة القياسية E.coliMM294 ولم تستطع العزلات تحقيق الأقتران في الوسط السائل والوسط الصلب ، بينما أستطاعت جميع العزلات الحاوية على بلازميدات والبالغة 18 عزلة تحقيق الأقتران بنسبة 100% على الوسط الصلب تم التحري عن المحتوى البلازميدي للخلايا الأقترانية ووجد أن اغلب البلازميدات كانت قد أنتقلت من السلالة الواهبة الى السلالة المستقبلة وقد أستطاعت 15 عزلة إقترانية (83.3%) من 18 عزلة إقترانية من إنتاج أنزيم البيتا لاكتاميز، وأستطاعت 9 عزلات إقترانية (50%) من إنتاج أنزيمات البيتا لاكتاميز الواسعة الطيف، وتمكنت 10 عزلات إقترانية 55.6)%) من إنتاج أنزيمات البيتالاكتاميزالمعدنية، فضلاً عن ذلك قد أنتقلت مقاومة مشتركة لاكثر من مضاد حيوي ومعدن ثقيل للخلايا الاقترانية مما يدل على ان هذه الصفات محمولة بلازميديا.

Listing 1 - 6 of 6
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (6)


Language

English (4)

Arabic (2)


Year
From To Submit

2018 (1)

2016 (2)

2014 (2)

2013 (1)