research centers


Search results: Found 15

Listing 1 - 10 of 15 << page
of 2
>>
Sort by

Article
DETECTION OF A, A- MUTATIONS OF G6PD GENE ON MOLECULAR LEVEL IN IRAQI POPULATION
الكشف عن طفرات A, A- المصاحبة لأنزيم نازع هيدروجين الكلوكوز-6- فوسفات (G6PD) على المستوى الجزيئي بإستعمال تقنية PCR/RFLP في عينات محلية

Author: Rana A. Al-Temmemy
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2012 Volume: 11 Issue: 2 Pages: 357-368
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The study involved the extraction of deoxyribonucleic acid (DNA) from 71 samples of random G6PD patients and 85 samples apparently healthy individuals from different Iraqi populations respectively, which was then amplified by polymerase chain reaction (PCR) and later subjected to digestion by restriction enzymes (Nla III and Fok I) to create restriction fragment length polymorphism (RFLP) to enable the detection of mutation that caused G6PD deficiency namely A and A-. The results of the current study showed that Iraqis were affected by G6PD deficiency in a percentage 7.2% and showed that the affected cases were attributed to A mutation in 4.2% while 0% was recorded for A- mutation.

تضمنت الدراسة إستخلاص الدنا من 71 عينة مصابة سرسرياً بنقص نازع هيدروجين الكلوكوز-6-فوسفات (G6PD) و 85 حالة من الاصحاء ظاهرياً ثم أخضعت هذه العينات لتفاعل التضاعف التسلسلي ((PCR بعدها تم إستعمال احد الطرق المعتمدة (RFLP) وذلك باستعمال انزيمات قاطعة (Nla III and Fok I ) للكشف عن الطفرتين قيد الدراسة. بينت نتائج الدراسة الحالية إن نسبة الإصابة بمرض نقص نازع هيدروجين الكلوكوز-6-فوسفات في العراق هي 7.2% وان الطفرة نوع A قد تسببت ب 4.2% من مجمل حالات الإصابة في حين لم تسجل أي إصابة بالطفرة من نوع A-.

Keywords

G6pd Detection --- Mutations --- Rflp


Article
Apoptosis and Necrosis Levels in Chemotherapy Treated Chronic Lymphocytic Leukemia Patients
مستوى الاستماتة و التنخر عند مرضى ابيضاض الدم المزمن المقاومين للعلاج الكيميائي

Loading...
Loading...
Abstract

The results showed that CLL patients chemotherapy treatment increase the expression of Bcl2 gene (via measuring the phosphatidylserine -PS level) which increased apoptosis and necrosis percentage. It is also showed that the Necrotic cells (%) were found to be significantly higher in patients samples (1.07 ± 0.03) than in healthy (0.17 ± 0.02) with no significance in viable cells (%) (82.88% in patients and 86.8% in healthy). The apoptotic cells % were found to be significantly higher in patients (15.04 ± 1.03) than healthy (4.40 ± 0.5). On the other hand, late apoptosis % showed no significant results (0.639 % in patients and 0.803 % in healthy).

بينت النتائج أن المعالجة الكيميائية لمرضى ابيضاض الدم المزمن أدت الى زيادة تعبير المورث و ذلك من خلال قياس مستوى الفوسفوتايدل سيرين و الذي أدى الى زيادة نسبة الاستماتة و التنخر. بينت النتائج أيضا أن نسبة التنخر كانت عالية معنويا عند مجموعة المرضى (1.07 ± 0.03) مقارنة مع الاصحاء(0.17 ± 0.02) وعدم وجود فرق معنوي بينهما في حيوية الخلايا 86.8%) و 82.88% على التوالي ) . كما أن نسبة الخلايا المستماتة كانت عالية معنويا ايضا عند المرضى مقارنة (15.04 ± 1.03) مع الاصحاء(4.40 ± 0.5) بينما كانت نسبة الاستماتة المتأخرة غير معنوية بينهما ( 0.803 % و 0.639 % على التوالي ) .

Keywords

CLL --- Apoptosis --- Bcl2 --- Mutations --- PCR


Article
Evaluation of p53 and K-ras Gene Mutations Frequency in Iraqi Women with Ovarian Carcinoma
تقييم تردد الطفرات للجينين p53 و K-ras في النساء العراقيات المصابات بسرطان المبيض

Author: Maisaa Gazi Jumaa
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2014 Volume: 13 Issue: 2-2 Pages: 193-206
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Ovarian cancer represents the fourth most frequent type of cancer among females and is the leading cause of death from gynecological cancer in the western world. More recently, ovarian tumors have been broadly classified into two distinct groups with unique histological, clinical and molecular profiles. Type I tumors in which BRAF and K-ras somatic mutations are relatively common, and type II tumors which display high levels of genomic instability with few common mutations, other than TP53, which is altered in over 90% of the cases. In the present study 58 samples with newly diagnosed ovarian cancer were analyzed for detecting the frequency of p53 and K-ras gene mutations in Iraqi ovarian cancer patients, as well as 15 samples of apparently healthy women used as a control group. The analysis was based on conventional PCR amplification of exons 5 and 7 of the p53 gene and codon 12 of K-ras. For both p53 and K-ras genes, none of healthy control exhibited mutation in those genes. p53 mutations detected in 13(22.4%) of ovarian cancer samples, which was significantly higher in compare with healthy controls (p<0.05). The results showed that out of thirteen mutant ovarian cancer samples, exon-5 mutation was the most frequent and detected in 10 (76.9 %), followed by exon-7 that detected only in 3(23.07%) of cases. Statistically there were no significant differences in mutational rates of p53 gene in patients with age, menopausal state, tumor histological subtypes, and different FIGO stages. K-ras mutation detected in only 3(5.17%) of ovarian cancer samples. There were no significant difference in mutational rates of K-ras gene in patients with age, menopausal state, tumor histological subtypes, and different FIGO stages, but all these three mutant samples with stage I. Out of 58 samples only one patient 1(1.7%) have been identified with mutations in both genes. In conclusion, the present study results show that mutations of the p53 gene are not rare events, and K-ras mutations status is not a prognostic factor in ovarian carcinomas.

يمثل سرطان المبيض رابع نوع من بين السرطانات الأكثر شيوعا التي تصيب الإناث، والسبب الرئيسي للوفاة في العالم تم في الآونة الأخيرة تصنيف أورام المبيض على نطاق واسع إلى مجموعتين متميزتين من النواحي النسيجية والسريرية والجزيئية .النوع الأول الأورام التي تكون فيها الطفرات الجسدية للجينات BRAF وK-ras هي الاكثر شيوعا، والتي قد تكون لها آثار علاجية مهمة. النوع الثاني الأورام التي تظهر مستويات عالية من عدم الاستقرار الجيني مع قليل من الطفرات الشائعة، بالاضافة الى P53، الذي يظهر تغاير في أكثر من 90٪ من الحالات. في هذه الدراسة تم تحليل 58 من سرطان المبيض المشخصة حديثا وذلك للكشف عن البروتين وتواتر الطفرات الجينية للجيني p53 وK-ras في مرضى سرطان المبيض، بالاضافة الى15 عينة من النساء الأصحاء تم استخدامها كمجموعة سيطرة. واستند التحليل على التضخيم باستخدام تقنية تفاعلات السلسلة البوليمريةPCR للاكسونات 5 و 7 من الجين P53 وكودون 12 من K-ras . لم تظهر أيا من عينات السيطرة طفرة في تلك الجينات في حين تم الكشف عن الطفرة في جين p53 في 13(22.4%) من عينات سرطان المبيض، الذي اظهر فروقات معنوية مقارنة مع الاصحاء) p<0.05)). أظهرت النتائج أنه من أصل ثلاثة عشر عينة طافرة، كانت الطفرة في اكسون5 هي الاكثر شيوعا الأكثر شيوعا 10(76.9 %) ثم يليها اكسون7- في 3(23.07%) من الحالات. إحصائيا لا توجد فروقات معنوية عالية في معدلات الطفرة للجين p53 مع عمر المرضى، حالة انقطاع الطمث، انواع الورم النسيجية، ومراحل الورم المختلفة، تم الكشف عن الطفرة في جين K-ras في3(5.17%) من عينات سرطان المبيض، إحصائيا لا توجد فروقات معنوية عالية في معدلات الطفرة للجين K-ras مع عمر المرضى، حالة انقطاع الطمث، انواع الورم النسيجية، والمراحل المختلفة للورم، ولكن كانت العينات الثلاثة الطافرة جميعها ضمن المرحلة الأولى للمرض.من أصل 58 عينة اظهرت عينة واحده فقط طفرة في كلا الجينين. تظهر نتائج الدراسة الحالية أن الطفرات في جينP53 ليست من الأحداث النادرة في أورام المبيض، كما وان الطفرة في جينK-ras قد لا يمكن اعتبارها عاملا في التنبوء والتشخيص لسرطان المبيض.

Keywords

Ovarian tumor --- p53 --- K-ras --- mutations


Article
Molecular Characterization of beta-Thalassemia Mutations in Baghdad
التحديد ألجزيئي للطفرات الوراثيه لبيتا-ثلاسيميا فى بغداد

Author: Waleed Abdelaziz Omer د. وليد عبد العزيز عمر
Journal: IRAQI JOURNALOF COMMUNITY MEDICINE المجلة العراقية لطب المجتمع ISSN: 16845382 Year: 2010 Volume: 23 Issue: 2 Pages: 90-95
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية

Loading...
Loading...
Abstract

Background: There are currently more than 200 known mutations in the beta globin gene that cause thalassemia syndrome in the world and each ethnic population has its own unique and frequency of beta globin mutations. Delineation of the beta-thalassemia mutations in specific community is a prerequisite for implementation of preventive program in that community.Aim of the study is to characterize the spectrum of beta globin gene mutations in Baghdad patients.Patients and methods: thirty one thalassemic patients were included; they were transfusion dependent and they were diagnosed and registered in thalassemia centers in Baghdad. After DNA extraction from venous blood and PCR based DNA amplification, the allele's characterization was achieved by reverse hybridization to specific oligonucleotide probe designed to detect 22 beta-thalassemic mutations.Results: Eleven alleles causing beta-thalassemia in Baghdad were identified, and these alleles with their frequencies were:IVS 2.1 (GA)29.03% , IVS 1.110 (GA)17.74% , cod 44 (-C)14.51%, IVS 2.745 (CG)11.29% , cod 5 (-CT)9.67% , IVS 1.6 (TC)4.83% , IVS 1.5 (GC)3.22% , IVS 1-25 (25 bpDEL)3.22%, cod 8 (-AA)3.22%, cod 39 (CT)1.61% and cod 8/9 (+G)1.61%. Twenty three (74.19%) patients presented as thalassemic patient during the first year of life. Twenty five (80.64%) patients have homozygous alleles.Twenty two (75.86%) families have consanguineous relation between the parents and eleven (37.93%) families have more than one affected individual, Conclusions: 1- Eleven β-globin alleles causing β-thalassemia syndrome in Baghdad were characterized; most of these mutations are of Mediterranean type and few are of Kurdish and Asian Indian types.2- Most of the patients are homozygous, and of severe (βo) Thalassemia, and showed consanguineous relation between their parents.3- The characterization of the most common beta-thalassemia mutations provides a foundation for prenatal genetic counseling that will be part of a thalassemia prevention program in Baghdad.Key words: thalassemia, beta globin genes mutations, Baghdad, oligonucleotide, reverse hybridization

الملخص: -تمهيد: - تم اكتشاف ما يزيد عن 200 نوع من الطفرات الوراثيه التي تحصل في جين بيتاكلوبين والتي تؤثر على تصنيع سلسلة بيتا كلوبين في عدة مراحل من التصنيع وبالتالي تؤدي الى انماط سريريه متعدده لمرض الثلاسيميا. في كل مجتمع يوجد انتشار لعدد محدد من هذه الطفرات . ان عملية تحديد انواع الطفرات التي تؤدي الى فقر دم البحر المتوسط في مجتمع ما هي المرحله اللازمه الاولى لانشاء برنامج السيطره على المرض. الهدف من الدراسه:- تحديد انواع الطفرات الوراثيه المسببه لمرض فقر دم البحر المتوسط في بغداد.المرضى وطرق العمل: شملت هذه الدراسه 31 مريضا ، وكل مريض مسجل فى مركز الثلاسيميا في محافظة بغداد على انه مصاب بالثلاسيميا الكبرى ويتم له اجراء نقل الدم بشكل متكرر.بعد استخلاص الحامض النووي(الدنا) من الدم الوريدي للمريض، تم اجراء تفاعل البلمره المتسلسل للحامض النووي(الدنا) ، وبعد ذلك تم تحديد نوع الطفره فى الحامض النووي بطريقة التهجين العكسي مع مسبارات خاصه مكونه من عدد من القواعد النتروجينيه مخصصه للكشف عن 22 طفره مسببه للثلاسيميا نوع بيتا.النتائج:- تم تحديد 11 نوع من الطفرات التى تسبب فقر دم البحر المتوسط نوع بيتا في المرضى العراقيين، وهي كما يلي:IVS 2.1 (GA)29.03%, IVS 1.110 (GA)17.74%, cod 44 (-C)14.51%, IVS 2.745 (CG)11.29%, cod 5 (-CT)9.67%, IVS 1.6 (TC)4.83% , IVS 1.5 (GC)3.22%, IVS 1-25 (25 bpDEL)3.22%, cod 8 (-AA)3.22%, cod 39 (CT)1.61% and cod 8/9 (+G)1.61%. وجدت علاقة قرابه بين الوالدين في 22 عائله (75.86%).تم تشخيص المرض في السنه الاولى من العمر في 23 (74.19%) مريضا.خمسة وعشرون(80.64%) مريضا يحملون الليلات متجانسةاحد عشر عائله (37.93 %) يوجد فيها أكثر من مصاب.الاستنتاجات:- ان الاحدى عشرة طفره التي تم تحديدها في هذه الدراسه اظهرت ان الانواع السائده في بغداد هي من انواع البحر المتوسط مع بعض الانواع الكرديه والهنداسيويه.اظهرت الدراسه ان الجزء الاكبر من المرضى يحملون النوع الشديد من الطفرات وان معظمهم يحملون الليلات متجانسه ومن عوائل توجد فيها علاقة قرابه بين الوالدين .ان تحديد الانواع الشائعه من الطفرات في مرضى الثلاسيميا نوع بيتا سيسهم في ايجاد قاعده اساسيه للاستشارات الوراثيه والتشخيص قبل الولاده والتي تشكل جزءا اساسيا من برنامج السيطره على المرض.


Article
Prevalence of HPV Genotype in Cervical Cells Among Iraqi Patients with Abnormal Pap Smears.

Author: Mohammed I. Mezaal , Nada A.S. Alwan , Ismail H. Aziz , Maad M. Shalal
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2017 Volume: 16 Issue: 2 Pages: 19-27
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Cervical cancer is a leading cause of malignant related mortality among women specifically in developing countries. Research evidence has shown that Human Papilloma virus (HPV) is one of the most common sexually transmitted infections and the cause of the vast majority of cervical cancer cases. This study was designed to determine the prevalence of molecular 16 and 18 genotypes of HPV among Iraqi patients with abnormal Pap smear findings by utilizing endpoint real time PCR for qualitative detection.The study included 90 Pap smear specimens belonging to women complaining from gynecological problems and another ten specimens obtained from apparently healthy women. Samples were collected from two major Oncology hospitals in Baghdad during the period from April, 2015 to April, 2016. Total DNA (genomic, mitochondrial, and viral) isolated from the Pap smear samples for molecular studies was examined utilizing genomic DNA purification kits of Qiagen ( QIAamp DNA Mini Kit /Germany).Pap smear cytological examination revealed that lesions in the forms of ASCUS, LSIL, HSIL and Squamous Carcinoma were observed in 23.3. 22, 20 and 3.3% respectively. The molecular detection method (Real Time PCR) showed that 16 and 18 genotypes were demonstrated in 23% of patients with HPV infections. An effective method has been used for detection of HPV genotypes yielding higher sensitivity by using global diagnostics kit.


Article
Detection of five substitution TPO mutations in Polycystic Ovary Syndrome (PCOS) and thyroid hormones disturbance patients
تحديد خمسة طفرات TPO إستبدالية في مرضى متلازمة تعددالاكياس المبيضية واختلال هرمونات الدرقية

Loading...
Loading...
Abstract

Polycystic ovary syndrome (PCOS (is a complex disorder which reflects variable clinical symptoms. There is considerable heterogeneity of symptoms and signs among women with PCOS, and for an individual, these may change over time. The genetic base of PCOS is not clear and no concrete genetic correlation was built with PCOS. The current study showed the presence of multiple peripheral small cysts 5-9 mm also there was an increase in ovarian volume 3.7-3.9 cm and change in ovarian dimensions with the ovary being more spherical. 20.8% of the PCOS patients included in this study found to have hyperthyroidism. Thethyroid stimulating hormone-TSH level was significantly higher 17.34±5.12μIU/ml in 4 POCS patients with thyroid hormones disturbance than the level in POCS patients without thyroid disturbance or healthy control group )2.19 ±0.47 and 2.33±0.44 μIU/ml respectively(. On the other hand, the rest of POCS patients with thyroid hormones disturbance 7 Patients showed lower significance levels of triiodothyronine-T3 and thyroxine-T4 (0.96±0.029 and 51.33± 10.96 n.mol/L respectively) than other groups. At the molecular analysis five substitution thyroid peroxidase genes -TPO mutations were detected in 5 patients with PCOS and thyroid hormones disturbances. Three of them were detected in exon 8 and two in exon 9. The missense substation mutations detected in this study involve one transition of T to C (c.904T>C) and 4 transversion of C to G, C to A and G to C (c.904T>C, c.1280C>G, c.1265C>A, c.1617G>C and c.1603G>C respectively).

متلازمة تعدد الاكياس المبيضية خلل معقد له إنعكاسات واعراض طبية متنوعة وهناك إختلاف واضح في هذه الاعراض والعلامات بين النساءالمصابات بهذه المتلازمة يمتد حتى على مستوى الفرد اذ تتغير هذه الاعراض مع مرورالوقت . الاساس الوراثي لمتلازمة تعددالاكياس المبيضة غيرواضح ولم تبنى أيةعلاقة وراثية مع هذه المتلازمة . توضح الدراسة الحالية وجود أكياس صغيرة متعددة محيطي 5 -9 ملم وزيادة من حجم المبايض3.7 -3.9 سم وتغيرات في أبعاد المبايض بحيث تصبح أكثر كروية . أن 20.8% من مرضى متلازمة تعدد الاكياس المبيضية المشمولين بالدراسة لديهم تضخم في الغدة الدرقية وكان مستوى هرمون TSH مرتفع معنوياً 17.34±5.12 مايكرووحدة دولية/مل في أربعة مرضى من هولاء اكثرمما لدى المصابات بالمتلازمة دون خلل في الـهرمونات الدرقية أومجموعةالسيطرة 2.19± 0.47،±2.33±0.44 مايكرووحدة دولية/مل على التوالي. في مقابل ذلك فأن ماتبقى من المرضى المصابات بالمتلازمة وإختلال هرمونات الدرقية 7 مرضى اظهرن انخفاض معنوي في مستوى T4,T3 0.29 ±0.96 و 51.33 ± 10.96 نانومول/ لترعلى التوالي مقارنة ببقيةالمجاميع . أماعلى المستوى الجزيئي تم تحديد خمسة طفرات TPO إستبدالية في خمسة مرضى من المصابات بالمتلازمة وإختلال هرمونات الدرقية . ثلاثة من هذه الطفرات سجلت في المحورالثامن وأثنان في المحورالتاسع للجين . أشتملت طفرات الاستبدال هذه على استبدال مكافيء واحدلـلثايمين بالسايتوسين (c.904T>C) وأربعة طفرات أستبدال غيرمكافيء للسايتوسين بالجوانين أو السايتوسين بالادنين أوالجوانين بالسايتوسينC.904T>C, c.1280>G, c.1265C>A, c.1617G>C) و c.1603G>C على التوالي( .


Article
MOLECULAR GENETIC STUDY ON BETA-THALASSEMIA MAJOR IN SOME IRAQI PATIENTS
دراسة وراثية جزيئية لبعض مرضى الثلاسيميا الكبرى في العراق

Author: آمنة نعمة الثويني
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2010 Volume: 9 Issue: 1 Pages: 115-123
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The objective of this project was to establish the molecular genetics of β-thalassemi in the Iraq. Genomic DNA was isolated from the blood of 75 patients who were diagnosed clinically and hematologically as β-thalassemia major and from 20 blood samples of apparently healthy individuals as control, all these samples was collected from Baghdad thalassemic center at Ibn-Al-Baladi pediatrics hospital. Polymerase chain reaction (PCR) was used for amplification of 4 regions in β-globin gene. The data show that IVS-1 nt 110 mutations are the most common in the population. Codon 39 mutation was also found with relatively high incidence. One of the subjects had a compound mutation which included IVS-1 nt 110 and CD8 mutations. Eighteen of the β-thalassemia major patients showed none of the four common mutations.

أجريت هذه الدراسه على مدى عام من بداية تشرين الثاني 2006 ولغاية تشرين الأول 2007، تم فيه جمع 75عينة دم لمرضى الثلاسيميا-بيتا من مستشفى ابن البلدي في بغداد و20 عينه لأشخاص أصحاء كمجموعة سيطره. أستعملت تقنية PCR لتعيين الأنماط الجزيئية لمرض البيتا ثلاسيميا في العراق لذلك تم أستخلاص وتنقية الصبغة الوراثية DNA من المرضى المصابين بفقر دم البحر الأبيض المتوسط الشديد للبحث عن وجود الطفرات الآتية 9/8CD، CD، 39CD، 110-IVS1. وجد أن الطفرة IVS1-110 هي الأكثر شيوعاً بين المصابين للبيتا ثلاسيميا بنسبة 36%. كما أن الطفرهCodon 39 موجودة ولكن بنسبة أقل من الطفرة الأولى (حوالي 25.3%). كما تم تشخيص وجود طفرتين في صبغة الهيموغلوبين IVS1-110 and CD8 لأحد المصابين. لم نتمكن من تعيين نوع الطفرات في ثمانية عشر شخصاً من المرضى. كما تم تشخيص الطفرتان CD8 و CD8/9 لأول مرة في العراق ضمن عينات الدم لمرضى الثلاسيميا التي تمت دراستها.


Article
Two novel missense mutations in exon 9 of TPO gene in Polycystic Ovary Syndrome patients with hypothyroidism
أثنان من الطفرات الوراثية الخاطئة الجديدة في جين الـ TPO عند مريضات متلازمة المبيض متعدد الاكياس اللواتي يعانين من قصور الدرقية

Loading...
Loading...
Abstract

This study was reflected on the relationship between the polycystic ovary syndrome (PCOS) and the genetic alternations in TPO gene. Fifty infertile Iraqi women with PCOS and 20 healthy women were included in this study, Blood samples were collected from the Infertility center of AL-Yarmok Teaching Hospital in Baghdad, during the period from November, 2010 to May, 2011. The age of infertile and fertile women was ranged from 16 to 45 years. The results of hormonal assay were as follows: There is significant (P ≤0.05) decrease in E2 and FSH levels in PCOS women and fertile women, There is significant (P ≤0.05) increase in LH levels in PCOS women and fertile women. There is no significant differences in Testosterone levels and the ratio of LH/FSH was ≥1.5. The molecular study was focused on the 18% of PCOS women with hypothyroidism. By sequencing for 27 samples; two novel different mutations were identified in the reading frame of the TPO gene in transcript variant of exon 9: c.1471delC (deletion C in codon 460) and c.1481delC (deletion C in codon 464). The percentage of mutations c.1481delC and c.1471delC recorded 55% and 44% of PCOS with hypothyroidism; respectively.

أجريت هذه الدراسة بهدف التعرف على العلاقة ما بين متلازمة المبيض متعدد الاكياس واعتلالات الغده الدرقية. شملت الدراسة خمسين امرأة عراقية عقيمة مصابة بمتلازمة المبيض متعدد الاكياس وعشرون امرأه سليمة الخصوبة كمجموعة سيطرة تراوحت اعمارهن بين 16 الى 45 سنة, جمعت عينات الدم من مركز العقم/ مستشفى اليرموك التعليمي في بغداد خلال الفترة من تشرين الثاني 2010 لغاية نيسان من 2011. سحبت عينات الدم لغرض الدراسات الهرمونية والجزيئية. تشير النتائج التي تم الحصول عليها للهرمونات الى مايلي : لوحظ وجود أنخفاض معنوي (P ≤ 0.05) في تركيز هرمون الاستراديول (E2)والهرمون المنبه للجريب (FSH) عند النساء المصابات بمتلازمة المبيض متعدد الاكياس, ارتفاع معنوي (P ≤ 0.05) في تركيز الهرمون اللوتيني (LH)عند النساء المصابات بمتلازمة المبيض متعدد الاكياس, عدم وجود فروق معنوية(P ≤ 0.05) في تركيز هرمون التيستوستيرون (T), النسبة بين الهرمون اللوتيني (LH) الى والهرمون المنبه للجريب(FSH) كانت >1.5, كذلك هناك ارتفاع معنوي (P < 0.05) في تركيز هرمون ثلاثي يودوثيريونين (T3), الثايروكسين(T4) والهرمون المنبه للدرقية (TSH )عند النساء المصابات بمتلازمة المبيض متعدد الاكياس اللواتي يعانين من قصور الغدة الدرقية. ركزت الدراسة الجزيئية على 18% من النساء المصابات بمتلازمة المبيض متعدد الاكياس اللواتي يعانين من قصور في الغدة الدرقية عن طريق متابعة تسلسل القواعد النتروجينية في 27عينه لللاكسون9 للجين TPO. تم الحصول على طفرتين وراثيتين جديدة في المناطق المشفرة للجين TPO في الاكسون 9 وهي: الاولى c.1471delC أدت الى حذف القاعدة النتروجينية السايتوسين للكودون في الموقع 460 والثانية كانت c.1481delC أدت الى حذف القاعدة النايتروجينية السايتوسين للكودون في الموقع 464. وكانت النسبة المئوية للطفرات c.1471delC, c.1481delC كالأتي 55%و 44% على التوالي عند النساء المصابات بمتلازمة المبيض متعدد الاكياس اللواتي يعانين من قصور في الغدة الدرقية.


Article
Molecular Study of Insulin Resistance and Polycystic Ovary Syndrome
دراسة جزيئية للترابط ما بين مقاومة الأنسولين ومتلازمة المبايض متعددة الأكياس في نساء بغداد

Author: Mohammad Ibraheem Mezeal Mohammed Ibrahim Nader Ismail Hussein Aziz
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2014 Volume: 13 Issue: 2-2 Pages: 273-283
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

This study explores on the relationship between the polycystic ovary syndrome (PCOS) and insulin resistance which caused by variation in the 5-prime flanking region of the insulin gene, a variable number of tandem repeat (VNTR) regulates transcription of the gene.The study includes 50 Iraqi women with polycystic ovary syndrome (PCOS) and 25 healthy women, Blood samples were collected from the the Medical City hospital, Kamal al-Samarrai Hospital and private medical laboratories (in Baghdad), during the period from November, 2011 to May, 2012. The age of infertile and fertile women was ranged from 16 to 45 years.The molecular study was focused on the 42% of PCOS women with insulin resistance. By sequencing for 50 samples, one separate segment (INS-VNTR) containing nucleotide 360 of insulin gene was amplified by using specific primer..The result of sequencing refers to a number of mutations found in women with PCOS (substitution = 69.86% , deletion =10.95% and insertion =19.17% ) . Some of mutations were repeated in a number of patients with the same type and locations. The results showed 9.52% of patients having deletion in adenine in 388 position (TAC/ T_C) , 9.52% of patients having deletion in adenine in 681 position (CCA/ CC_) , 9.52% of patients having insertion adenine in 638 position (GCT/ GACT) , 9.52% of patients having Missense mutation in 447 position (GAG/ AAG) , 9.52% of patients having Missense mutation in 84 position (CAG/ AAG) and 9.52% of patients having silent mutation in 88 position (GGG/ GGT).The results showed 14.28% of patients having Missense mutation in 455 position (GGG/ AGG) , 14.28% of patients having Missense mutation in 434 position (CCA/ TCA) and 14.28% of patients having silent mutation in 639 position (CGG / CGT) .The results showed 19.04% of patients having insertion in thymine in 94 position (CTG/ CTTG). Also compound mutations have been detected among most of PCOS with insulin resistance.

أجريت هذه الدراسة بهدف التعرف على العلاقة مابين متلازمة المبيض متعدد الأكياس ومقاومة الأنسولين الذي سببه التغاير في الطرف ( 5) لمورث الأنسولين والتي تعرف بالتكرارات المترادفة متباينة العدد(VNTR) التي تعمل على تنظيم عملية استنساخ الموروث .شملت الدراسة (50) أمرآه عراقية مصابة بمتلازمة المبيض متعدد الأكياس و( 25) امرأة سليمة كمجموعة سيطرة تراوحت أعمارهن مابين 15 – 45 سنة , جمعت عينات الدم من النساء السليمات والمريضات من مستشفى مدينة الطب , مستشفى كمال السامرائي والمختبرات الطبية الخاصة ( في بغداد ) خلال الفترة مابين شهر تشرين الثاني لعام 2011 ولغاية شهر أيار للعام 2012 . الدراسة الجزيئية ركزت على 42% من النساء المصابات متلازمة المبيض متعدد الأكياس اللواتي يعانين من مقاومة في الأنسولين عن طريق متابعة تسلسل القواعد النتروجينية في 50 عينة .استخدمت تسلسلات من باديء البلمرة مخصصة لمضاعفة التكرارات المترادفة متباينة العدد لمورث الانسولينINS-VNTR) ) والمتضمنة 360 نيوكليوتيدة التي تم تضخيمها بواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل(PCR) . ان نتائج متابعة تسلسل القواعد النتروجينية تشير الى وجود عدد من الطفرات الوراثية في النساء المصابات بمتلازمة المبيض متعدد الأكياس ( الاستبدال = 69,86% , الحذف = 10,95 % و الغرس = 19,17 % ). تكررت بعض الطفرات في عدد من المرضى بنفس الموقع وبالنوع نفسه . حيث ان النتائج أشارت إلى ان 9,52 % من المرضى يمتلكون حذف في الأدنين بالموقع 388 (TAC/ T_C) , و ان 9,52 % من المرضى يمتلكون حذف في الأدنين بالموقع 681 (CCA/ CC_) , كما ان 9,52 % من المرضى يمتلكون غرس ( حشر) الأدنين بالموقع 681(GCT/ GACT) و ان 9,52 % من المرضى يمتلكون طفرة تؤدي إلى استبدال حامض أميني بحامض أميني أخر مختلف بالموقع 447 (GAG/ AAG) , ان 9,52 % من المرضى يمتلكون طفرة تؤدي إلى استبدال حامض أميني بحامض أميني أخر مختلف بالموقع 84 (CAG/ AAG) و ان 9,52 % من المرضى يمتلكون طفرة صامته بالموقع 88 (GGG/ GGT) . أشارت النتائج إلى ان 14,28% من المرضى يمتلكون طفرة تؤدي إلى استبدال حامض أميني بحامض أميني أخر مختلف بالموقع 455 (GGG/ AGG) , وان 14,28% من المرضى يمتلكون طفرة تؤدي إلى استبدال حامض أميني بحامض أميني أخر مختلف بالموقع 434 (CCA/ TCA) وان ان 14,28 % من المرضى يمتلكون طفرة صامته بالموقع 639(CGG / CGT) . اشارت النتائج الى ان 19,04% من المرضى يمتلكون غرس ( حشر) الثايمين بالموقع 94 (CTG/ CTTG) .كذلك فأن اغلب الحالات التي سجلت وجد بأنها تحمل طفرات وراثية متعددة في النساء المصابات بمتلازمة المبايض متعددة الاكياس مع مقاومة الانسولين.


Article
Association of Exon 9 FGFR3Mutations and Cancer Grads in Patientswith Bladder Cancer

Author: Abdul Hussein M. AL-Faisal and Sabah Bresam
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2016 Volume: 15 Issue: 2 Pages: 109-118
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Bladder cancer is the ninth most common cancer diagnosis worldwide, with more than 330,000 new cases each year and more than 130,000 deaths per year, with an estimated male:female ratio of 3.8:1.0. According to the most recent Iraqi cancer record (Iraqi cancer registry, 2010), bladder carcinoma is currently ranks sixth among the commonest ten cancers. Previous studies indicated that genetic alterations were involved in bladder cancer. To detect genetic alteration in exon 9 of FGFR3 gene, 50 patients with different grads of bladder cancer who admitted to Ghazi AL-Hariri Hospital in Baghdad and 25 healthy persons aged between 30 to 86 years were included in this study. DNA was extracted from blood samples from patients and healthy control. PCR was conducted using special primers. Mutations of exon 9 of the FGFR3 gene were screened by sequencing and the patients sequencing results were compared with human reference FGFR3 gene sequence (NCBI Reference Sequence: NG_012632.1). Among 50 patients included in this study, 30 (37%) patients were with mutations detected in exon 9 which include novel g.16026 del G and g.16024 sub G>C mutations. The more frequent mutation was g.16026 del G (22, 70%) followed by g.16024 sub G>C mutation (8, 30%). Moreover, the results showed that three patients were with compound mutations (with both exon 9 mutations). Exon 9 mutations (g.16024 sub G to C and g.16026 del G) showed an association with cancer initiation and metastasis since they detected in grad I and II.

Listing 1 - 10 of 15 << page
of 2
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (15)


Language

English (12)

Arabic and English (2)

Arabic (1)


Year
From To Submit

2017 (2)

2016 (2)

2015 (2)

2014 (4)

2013 (1)

More...