research centers


Search results: Found 20

Listing 1 - 10 of 20 << page
of 2
>>
Sort by

Article
ASSOCIATION OF POLYMORPHISMS IN SLC11A1 GENE WITH AUTOIMMUNITY CAUSED BY Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis(MAP) IN CATTLE.
ارتباط تعدد اشكال الجينSLC11A1بالمناعة الذاتية الناتجة من جرثومة Mycobacterium avium subspecies paratyberculosisفي الابقار

Author: Kawther K. J., Fawziah A. A.,Rasha M. O. كوثر كاظم جبر,فوزيه علي عبدالله , رشا منذر عثمان
Journal: Basrah Journal of Veterinary Research. مجلة البصرة للابحاث البيطرية ISSN: Print:18138497 E; 24108456 Year: 2019 Volume: 18 Issue: 1 Pages: 268-282
Publisher: Basrah University جامعة البصرة

Loading...
Loading...
Abstract

Johne's disease is one of the main causes of economic losses in ruminants and a major health hazard in the developed and developing developed countries.In this study, PCR detection of insertion sequences IS900 of MAP in the buffy coat of cows (n = 81), of this 29 (35.8%) cow showed positive results. By Restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP),two single nucleotide polymorphisms (SNPs) of SLC11A1 gene were tested for finding their association with susceptibility to bovine Johens disease in Iraqi cattle. A total of 50 cows were tested, theirresult revealedthat at rs109453173 locus twoelectromorph‘CC’ (374 bp) and ‘CG’ (374, 293 and 81 bp).The rs109915208 locus also showed two electromorph, ‘TT (344bp) and ‘CT’ (344, 215 and 129 bp) . The differences in the electromorph between IS900 positive and negative cows were found to be statistically significant (p = 0.0031). No significant difference in these electromorph at SNP locus rs109915208 between IS900 positive and negative cows. Out of two SNPs from SLC11A1 gene, rs109453173 had a significant association with the susceptibility to Johne's disease. The CC’ electromorph observed at rs109453173 locus showed a significant association with the susceptibility to bovine paratuberculosis in cows. The OR of ‘CC’ in‘IS900 positive versusIS900 negative cattle was7.8750, suggesting that cows having ‘CC’ electromorph were susceptible to Johne's disease compared to ‘CG’ electromorph .

مرض جونزJohne’s هو أحد الأسباب الرئيسية للخسائر الاقتصادية في المجترات ومخاطر صحية كبيرة في العالم النامي والمتقدم.في هذه الدراسة تم استخدام تفاعل البلمرة التسلسلي (PCR)للكشف عن تتابعات الإدراج IS900لجرثومةMycobacterium avium subspecies paratuberculosis في الخلايا البيضاء لواحد وثمانونبقرة,29 (35.8%)منها اظهرت نتائج موجبة. .بواسطة تقنيةPCR-RFLP فحصت اثنين من النيوكليوتيدات متعددة الأشكال (SNPs) للجين SLC11A1لأجل ايجاد ارتباطها مع القابلية للإصابة بمرض Johne’s في الابقار العراقية.اختبرت 50 بقرة ، وبينتالنتائج أن في الموقع rs109453173 اثنين من الاشكال المهاجرةكهربائيا هما( electromorph 'CC' (374) و CG"(374 ، 293 و 81bp) ، كما أظهر الموقع rs109915208 اثنين من الاشكال المهاجرةكهربائيا، ("TT (344bp ) و CT(" 344 و 215 و 129bp).اختلاف الاشكال المهاجرة كهربائيا بين الابقار الموجبة و السالبةلوجود IS900 كان معنويا (p = 0.0031).لايوجد فرق احصائي معنوي بين هذه الاشكال في الموقع. بين الابقار الموجبة و السالبة لوجود IS900 rs109915208 .من أصل اثنين من SNPsللجين SLC11A1 كان ارتباطrs109453173معنويا من الناحيهالإحصائيةمع القابليةللاصايةبمرض Johne’s. اظهر إالشكل الكهربائي المهجرCC الذي تم ملاحظته في موقع rs109453173 وجود ارتباط معنوي مع القابلية للإصابة بمرض Johne’s في الأبقار ، وكان مقدار OR7.875))في الابقار الموجبة IS900 مقابل الابقار 0 السالبة IS900 ، مما يشير إلى أن الأبقار التي لديها electromorph 'CC' لها استعداد للإصابة بمرض Johne’s جونز.

Keywords

Cattle --- Johnes disease --- PCR-RFLP. --- Cattle --- Johnes disease --- PCR-RFLP --- .


Article
GENOTYPING OF THE ABO BLOOD GROUP SYSTEM IN IRAQ POPULATION USING PCR-RFLP
التنميط الوراثي لمجموعة الدم ABO للمجتمع االعراقي بإستعمال PCR-RFLP

Author: Mohammed I. Nader
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2012 Volume: 11 Issue: 2 Pages: 464-474
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Due to a large number of alleles that could give similar phenotypes but differ in genomic structure. This study study was conducted to determine the ABO genotyping by use PCR-RFLP method. Blood samples withdrawn from 30 unrelated individuals who appear to be healthy. ABO system phenotype grouping was detected by two immunoagglutination tests. Slide and ELISA were done for all samples. Homozygous allele was selected by chosen special family which gives known offspring according to Mendel laws. The DNA was extracted by using two methods, the manual method by using extra gene kit gives relatively high yield concentration (5-10µg/ml) but slightly low purity (0.9-3.3) and the automated BioRobot EZ1 gives slightly lower yield of DNA(4-8 µg/ml) but high purity (1.6–2.2) in comparison with manual method . Two separate segments of ABO gene the glycosyltransferases gene (216pb) in exon 6 and (703pb) in exon 7 were amplified using two sets of specific primers. Restriction digisten of the two amplification PCR productes was used for discrimination of AB and O allells.

هدفت الدراسة الى الكشف الجزيئي لمجموعة الدم ABO ومطابقتها مع الكشوف المختبرية المعتمدة على النمط الظاهري وإيجاد أنسب الظروف لعمل الكشف الجزيئي. توجد العديد من السمات التي تتشابة بالنمط الظاهري لكنها تختلف بالتركيب الوراثي ومن أبرز الأمثلة عليها جين مجموعة الدم ABO. جمعت عينات الدم من 30 شخص بدو من الفحص الظاهري أنهم أصحاء, أستعملت طريقتين للتحري عن النمط الظاهري لفصائل الدم لكل النماذج. الطريقة الاولى التلازن المباشر على الشريحة, الطريقة الثانية هي اليلايزا، إذ تطابقت النتائج لطريقتان علماً ان الطريقتان لم تميزا نوع الاليل. تم إنتخاب أفراد من أبوين معلومين لصنف الدمAB) ) حيث يكون نسل هذه العوائل متجانس الزيجة Homozygous وذلك لقلة صفة التجانس الوراثي في المجتمعات مقارنةً بالطرز الهجين . Heterozygous عزلت المادة الوراثية بطريقتين, الطريقة اليدوية بإستعمال عدة العزل وكانت ذات تركيز عالي نسبياً (10 – 5 ميكروغرام) لكنها بنقاوة دون المثالية (3.3 – 0.9). كانت نقاوة الطريقة الميكانكية بإستعمال جهاز عزل المادة الوراثية الالي (EZI )أفضل (2.2- 1.6) لكنها أقل تركيزاً (8 – 4 ميكروغرام) مقارنهً بالطريقة اليدوية. ضبط تركيز المادة الوراثية مع مايلائم طريقة تفاعل التضاعف التسلسلي (PCR)وأستعملت تسلسلات من بادىء البلمرة( Primers ) مخصصة لمضاعفة قطعتان تمثل جينABO بجميع اليلاته. تم مضاعفة قطعتان من جين ABO, القطعة الاولى في المحور 6 تتضمن النيوكليوتيد 261, والقطعة الثانية في المحور7 والمتضمنة النيوكليوتيد 703(جين ABO يتكون من 7 اكسونات و 6 انترونات) نتجَ من مضاعفة القطعة الاولى 200 زوج قاعدة بينما نتج عن القطعة الثانية 128 زوج قاعدة. فصلت نواتج بإستعمال النيوكليوتيدات 261 و 703 لتميز اليلات مجاميع الدم A,B,O بواسطة أنزيمات التقييد.

Keywords

Abo Blood --- PCR-RFLP --- Genotyping


Article
Analysis of Polymorphism of Melatonin Receptor Type 1A (MTNR1A) Gene, in Iraqi Local Sheep Using PCR-RFLP Technique

Author: Rahawy M. A.1 , AL-Timimi, I. H.2 , Najwa Sh. Ahmad3
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2016 Volume: 15 Issue: 3 Pages: 85-95
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The gene encoding melatonin receptor type 1A (MTNR1A) gene by PCR-RFLP, the aim of the present study of polymorphism MTNR1A gene associated with breeding out of season and correlated with prolactin hormone in Iraqi sheep breed,. Blood samples were randomly collected from 60 ewes from Agriculture Research-Ruminant Researches station breeding station, Baghdad, and genomic DNA was isolated using a Geneius TM Micro gDNA Extraction Kit. A large fragment of exon 2 of MTNR1A gene was amplified by PCR using specific primer pairs and the PCR product was digested with RsaI enzyme which cuts the amplicon to several fragments. There are four cleavage sites (53 bp, 267 bp, 23 bp, 411 bp, 70 bp) for Rsa I within the amplification fragment, Digestion with Rsa1yielded polymorphic fragments of 267 bp when the cleavage site was present (allele R) and a single 290 bp fragment when the cleavage site was (allele r). Three genotypes RR (411 bp/267 bp), Rr (411/290 bp/267 bp) and rr (411 bp/290 bp). Three fragments of 23bp, 53 bp and 70bp were been not related allelic polymorphism .Restricted digestion allowed the determination of two alleles (R, r), Result gene frequencies were 0.40 and 0.60 for the alleles R and r respectively, in local ewes and genotype frequencies of RR (20%), Rr (40%) and rr (40%) in ewes with a significant at (P<0.01), the level of prolactin relation to the genotype differences that the highest hormonal level linked to the RR genotype (234.65±17,48ng/ml), and high significant (P<0.01) with lower values for prolactin hormone that linked to Rr and rr genotype (217. 02 ± 28.12; 182.91 ± 21.35 ng/ml) in local Iraqi ewes and no-significant values between the out and the in season lambing months, however, higher significant variation (P<0.01) of frequencies of R genotype (62.50%) in out-seasonal lambing months than in-seasonal lambing months (37.50%). It was concluded that the alleles frequencies of MTNR1A gene ‘r’ higher than ‘R’ alleles, Analysis of the MTNR1A polymorphism its relationship with prolactin concentration of Moreover show the indirect effect of higher prolactin concentration with genotype RR of the MTNR1A gene polymorphism and can be used a genetic selection marker for spring (out-of-season) breeding in Iraqi local sheep.

Keywords

MTNR1A --- PCR-RFLP --- Polymorphism --- Iraqi sheep.


Article
Determination of Different Species of Animal from their Meats by Using PCR-RFLP Technique of Mitochondria Gene COI

Authors: Asaad Y. Ayied --- Zahra R. Al-Mossawi
Journal: Basrah Journal of Agricultural Sciences مجلة البصرة للعلوم الزراعية ISSN: 18175868 Year: 2017 Volume: 30 Issue: 1 Pages: 59-64
Publisher: Basrah University جامعة البصرة

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted at Dr. Taleb A. Jaayad of Molecular Genetics, Department of Animal Production, College of Agriculture, University of Basrah. Samples of fresh and canned meat of cattle, buffalo, sheep, goats, chicken and turkey were collected randomly from different areas of Basrah province, as well as blood samples of camel. The aim was to determine different animal species from their meat (except camel). DNA was extracted from meat tissue (0.2 gm) and blood by using DNA kit (Invetrogen). DNA purity was estimated by using wavelength (260-280), to be 1.8-2.0 ng. PCR was used to amplify mtco1 gene using a general primer and gave a band of 710 bp for all species used in this study. Different species were determined by using Taq restricted enzyme. Cattle, buffalo, chicken and turkey showed one band of 637 bp. Taq enzyme has recognized sheep and goat, while sheep did not show any band to the fragment 710 bp. However, goat showed a band at 650 bp. Furthermore, camel produced two bands of 303 and 403 bp.

Keywords

Animal --- species --- meat --- mt CO1 --- PCR-RFLP.


Article
Detection of genotypes for Giardia lamblia in Iraqi patients feces by using PCR-RFLP techniques based on GDH gene characterization
التحري عن الطرز الوراثية لطفيلي Giardia lamblia في براز المرضى العراقيين بوساطة تقنية PCR-RFLP واستنادا الى خصائص جين GDH

Loading...
Loading...
Abstract

This study was carried out during the period from March 2016 to January 2017 to detect of genotypes and subgenotypes of Giardia lamblia in human feces by PCR-Restriction fragment length polymorphism based on the detection of glutamate dehydrogenase gene and study the corralation between genotype and prescence of symptoms , a total of 101 stool samples were taken from patients(male and female), aged(2-72) years, who suffering from acute or persistent diarrhea and examined by microscope and molecular techniques , the gdh gene was amplified from 19 cases only by a conventional PCR assay by using a specific oligonucleotide sequence for coding region by gdh gene at size 432bp and typed by RFLP analysis, the results showed the total infection with Giardia lamblia was 84(83.1%) according to the results of microscopic examination, of the 19 positive samples, 2(1.98%) were infected with genotype AI , 3(2.97%) genotype AII , 5(4.95%) genotype BIII and 9(8.91%) infected with genotype BIV, with significance differences between the genotype and precence of symptoms

اجريت هذه الدراسة خلال المدة الواقعة بين اذار 2016 الى كانون الثاني 2017 كان الهدف منها التحري عن الطرز الوراثية لطفيلي Giardia lamblia في البراز البشري بوساطة تقنية تقييد اطوال القطع متعددة الاشكال PCR-RFLP وذلك من خلال الكشف عن جين gdh ، تم خلال هذه المدة جمع 101 عينة براز من مرضى يشكون من اسهال حاد واعراض الإصابة بداء الجيارديات و من عدد من عمال المطاعم وصالونات الحلاقة والفنادق بأعتبارهم مصدر للعدوى بالطفيليات، تم تضخيم جين gdh من 19عينة بوساطة تقنية PCR التقليدية وتم تنميطها جينيا بوساطة تقنية RFLP PCR-وذلك من خلال ادخال نوعين من الانزيمات القاطعة، من مجموع 19 عينة موجبة لفحص PCR وجد %)1.98)2 مصابين بالطراز الوراثي AI ،3(2.97%) مصابين بالطراز الوراثي AII ، 5(4.95%) مصابين بالطراز الوراثي BIII و 9(8.91%) مصابين بالطراز الوراثي BIV ، لاتوجد فروقات حقيقية بين نسبة الإصابة والعمر، الجنس،المهنة، التباين الفصلي،والمنطقة الجغرافية.

Keywords

Giardia lamblia --- GDH gene --- PCR-RFLP


Article
FACTOR II PROTHROMBIN (G20210A) MUTATION AMONG HEALTHY INDIVIDUALS IN ERBIL / IRAQ
عامل الثاني البروثرومبين (G20210A ) طفرات الجينية بين الافراد الاصحاء في اربيل / العراق

Authors: JALADET M.S. JUBRAEL جلادت محمدصالح جبرائيل --- SALAR S. HUSSAIN سالار حسين --- FARIDA, F. A. NERWEYI فريده فايق نيرويي
Journal: Duhok Medical Journal مجلة دهوك الطبية ISSN: ISSN: 20717334 (online)/ ISSN: 20717326 (Print) Year: 2013 Volume: 7 Issue: 2 Pages: 9-15
Publisher: University of Dohuk جامعة دهوك

Loading...
Loading...
Abstract

ABSTRACTBackground and Objectives The factor II (Prothrombin) is the precursor of thrombin.Factor II G20210A mutation is one of the genetic risk factors for thrombosis and it is associated with elevated prothrombin levels. The goal of this study was to study the frequency of the Factor II mutation in healthy individuals in Erbil-Iraq.Methods A total of 100 healthy individuals attending the premarital screening center in Erbil city were recruited. Factor II gene polymorphism was investigated in all of them by the polymerase chain reaction (PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP).Results Factor ll prothrombin (G20210A) mutation was documented heterozygous state in 2 subjects (2%).Conclusions The prevalence of Prothrombin G20210A mutation differs in different countries and ethnic groups, being highest in Caucasians, especially those in the Southern Europe and in the Eastern Mediterranean; its frequency in Erbil appears slightly lower than these reports and than that from Duhok, probably implying limited role in pathogenesis of venousthrombosis in the former province.

خلفية واهداف البحث: إن العامل الثاني (البروثرومبين) هو مقدمة للثرومبين. عامل الثاني طفرة G20210A هي واحدة من عوامل الجينية الخطرة لتجلط الدم و أنه يرتبط مع مستويات مرتفعة البروثرومبين . هدف هذه الدراسةِ كانت دراسة ترددَ تغيرِالطفرة العامل الثاني في الأفراد الأصحاء في أربيل/ العراق.طرق البحث: جمع عينة من مائة (100) الأفراد الأصحاء الذين حضروا مركز الفحص قبل الزواج في مدينة أربيل. عامل الثاني تعدد الأشكال الجيني تُحرّى في كُلّ منهم بسلسلة تفاعل البلمرة ( PCR ) و تقييد جزء طول تعدد الأشكال (RFLP).النتائج: عامل الثاني لطفرة البروثرومبين ( G20210A ) وقد تم توثيق حالة heterozygous في 2 المواضيع (2٪).الاستنتاجات: إنتشارطفرة البروثرومبينِ G20210A يَختلفُ في البلدانِ المختلفةِ والمجموعات العرقيةِ، ويَكُونَ أعلى في Caucasians، خصوصاً أولئك في جنوب أوروبا وفي شرقي البحر الأبيض المتوسطِ؛ تردده في أربيل يَبْدو أوطأ قليلاً مِنْ التقاريرِ سجلت في دهوك، هذا يَدْلُّ على الدورِ المحدودِ من المحتمل في النشوء المرضي مِنْ تخثّرِ وريديِ في المحافظةِ السابقةِ.


Article
INVESTIGATION OF FECUNDITY FecB GENE IN IRAQI AWASSI EWES
التحري عن جين الخصب FecB في نعاج العواسي العراقي

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to investigate the multiple aspects of mutant fertile gene and their effects in reproductive performance of Iraqi Awassi ewes. A total of 82 Iraqi Awassi (2-3 years) old with an average live body weight 45 kg were obtained from two locations (First , College of Agriculture , second , Agricultural Research Station / Ministry of Agriculture) in Abu-Ghraib , (30 km) south – west of Baghdad, were used in this study from August 2009 to August 2010. Investigation was carried out for multiple fertility gene (FecB) using the (PCR-RFLP) technique. Blood samples (5 ml/ewe) were drawn from the juglar vein using vacutainer tubes with anticoagulant material (ACD). Genomic DNA was extracted from whole blood for each sample using (Wizard genomic DNA purification Kit). The concentration and the purity of extracted DNA were measured with Spectrophotometry. Gel concentration (0.8%) was used for the purpose of electrophoresis. Specific parts of mutant region were isolated and amplified using (polymerase chain reaction) and specific (DNA markers) technique. For the purpose of natural point mutation diagnosis in the resulting PCR product is through the digestion of (FecB) gene (190 bp), by using restriction enzymes (Ava II). The results of the study showed that: Awassi ewes studied with (++) genotype revealed the absence of fertility genes (FecB). Twining percentage found in some Awassi ewes were not related to this gene and may be are related to other fertility genes or to other factors such as nutrition. No significant differences were observed in the birth weight or body weight at 90 days postpartum.

اجريت هذه الدراسة بهدف التحري عن تعدد المظاهر الوراثية لجين الخصب وتأثيره في بعض مظاهر الاداء التناسلي لدى النعاج العواسي العراقي. استخدمت 82 نعجة عواسي تراوحت اعمارها من 2-3 سنوات وبمعدل وزن جسم حي 45 كغم. تم الحصول عليها من موقعين (الاول كلية الزراعة/ جامعة بغداد والثاني محطة البحوث الزراعية/وزارة الزراعة) الواقعة في منطقة ابو غريب (30 كم) جنوب غربي بغداد للمدة من اب 2009 الى اب 2010. تم التحري عن تعدد المظاهر الوراثية لجين الخصب (FecB) باستخدام تقنية PCR-RFLP. تم سحب عينة دم (5 مل/نعجة) من الوريد الوداجي في انابيب مفرغة من الهواء تحتوي على مادة مانعة للتخثر (ACD). استخلصت المادة الوراثية الدنا (DNA) من الدم الكامل لكل عينة دم باستخدام عدة (Wizard Genomic DNA purification). تركيز ونقاوة المادة الوراثية (DNA) تم قياسها باستخدام جهاز مطياف الاشعة البنفسجية (Spectrophotometry) مع استخدام تركيز هلام (8%) لغرض الترحيل الكهربائي (Electrophorsis). تم عزل ومضاعفة اجزاء محددة من المنطقة المشفرة للمادة الوراثية الدنا (DNA) باستخدام تقنية انزيم بلمرة الدنا المتسلسل (Polymerase chain reaction) وبادئات متخصصة (DNA Markers). ولغرض تشخيص الطفرات الطبيعية النقطية في نواتج التكثير التي تم الحصول عليها من خلال هضم جين (FecB) لازواج القواعد (190bp) على التوالي باستخدام انزيمات التقييد وهي (Ava 11). اوضحت نتائج الدراسة ان نعاج العواسي التي تحمل التركيب الوراثي (++) لا تحمل جين الخصب (FecB). نسبة التوائم التي وجدت لدى بعض نعاج العواسي ليس سببها الجينات المدروسة وربما يكون السبب جينات خصب اخرى او عوامل اخرى مثل التغذية. لم تلاحظ فروقات معنوية في الوزن عند الولادة وعند عمر 90 يوماً بعد الولادة.


Article
DETERMINATION OF INSULIN GENE INSG POLYMORPHISMS AND THEIR RELATIONSHIP WITH SOME PRODUCTIVE TRAITS IN BOTH SEXES OF HYBRID BROILER ROSS308
تحديد الطرز الوراثية لجين هرمون الانسولين وعلاقته مع بعض الصفات الانتاجية في الجنسين لهجين فروج اللحم 308 Ross

Authors: H. J. Mohamed حنين جاسم محمد --- E. H. Alanbari ايمان حسن الأنباري
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2017 Volume: 48 Issue: 6 Pages: 1381-1389
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

To determine the polymorphisms of Insulin gene INSg and its relationship with some productive traits such as rate of initial and weekly body weight, average weekly body gain, live body weight, carcass weight, dressing %, cuts weight and weight for abdominal fat on broiler in both sexes for Ross 308 hybrid, 200 one – day old chicks, reared on closed system tagged and weighted initially and weekly for 35 days, polymorphisms for Insulin gene were determined by using MSPI restriction enzyme and PCR-RFLP technique. Results showed two genotypes were detected only for INSg differ highly significantly P<0.01 between them and on its effect on studied treats was differ significantly P≤ 0.05 for male in both genotypes also Male in heterozygous and homozygous genotype was differ on weekly body weight that caused effect on weekly body weight gain also when compared with female in each genotype. Male with TC genotype effect P<0.05 on carcass weight ,breast weight , leg weight and wing weight compared with female with same genotype, while male with TT genotype effect P<0.05 on live body weight and leg weight wing weight also when compared with female in the same genotype. That means it’s very important to use methods of molecular technique to be used as easy tool on selection programs on parent of commercial flock to select male for rearing to be guaranty reaching suitable weight and gens weight and cuts weight for hybrid.

لتحديد التراكيب الوراثية لجين هرمون الأنسولين INSg ودراسة علاقته مع بعض الصفات الانتاجية التي شملت معدل الوزن الابتدائي والاسبوعي ومعدل الزيادة الوزنية الاسبوعية والوزن الحي والذبيحة ونسبة التصافي واوزان القطعيات ودهن البطن للجنسين في هجين فروج اللحم Ross308، 200 فرخ عمر يوم واحد ربيت بنظام مغلق رقمت ووزنت ابتدائيا اسبوعيا حتى 5 اسابيع، حددت التراكيب الوراثية لجين هرمون الانسولين باستخدام الانزيم القاطع MSPI وتقانة ال PCR-RFLP. اظهرت النتائج وجود تركيبين وراثيين فقط لجين هرمون الانسولين تباينت فيما بينها بشكل عالي المعنوية p<0.01 واختلفت في تأثيرها على الصفات المدروسة بشكل معنوي P<0.05 كانت لصالح الذكور في التركيب السائد النقي TT والهجين TC الذين اظهرا ارتفاعا في معدل وزن الجسم الاسبوعي الذي اثر بدوره على الزيادة الوزنية الاسبوعية مقارنة بالاناث في كل تركيب وراثي، كما اظهرت الذكور تفوق معنوي P<0.05 في الافراد الهجينة لصفات وزن الذبيحة ووزن الصدر والافخاذ والاجنحة مقارنة مع الاناث لنفس التركيب فيما سجلت الذكور للتركيب السائد ارتفاعا معنويا في صفة الوزن الحي ووزن الافخاذ والاجنحة مقارنتا بالاناث الحاملة للتركيب الوراثي نفسه مما يعني ضرورة الاستفادة من طرق التقانات الجزيئية واعتبارها اداة سهلة تنفع لاجراء برامج الانتخاب المبكر لعزل الذكور وتربيتها لضمان الوصول لاوزان وزيادات وزنية مع اوزان قطعيات مرتفعة لهجين التربية.


Article
An Identification of Staphylococcus spp. by PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) Analysis of dnaJ Gene and ApoI Enzyme
تشخيص الأنواع التابعة للمكورات العنقودية بوساطة تقنية PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism Analysis باستخدام الجين dnaJ والانزيم القاطع Apo

Author: Aws Ibrahim Sulaiman أوس ابراهيم سليما ن
Journal: Diyala Journal For Pure Science مجلة ديالى للعلوم الصرفة ISSN: 83732222 25189255 Year: 2019 Volume: 15 Issue: 04 Pages: 64-73
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

Genetic methods based on Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) are widely used for microbial species determination, in this study, PCR-RFLP technique was used to target the intragenic between 16S and 23S rDNA (dnaJ gene) for rapid detection and identification of twenty Staphylococcus species isolates. The RFLP analysis of the dnaJ gene and the digestive enzyme ApoI was designed for a rapid and accurate identification of the selected genome. In this assay, the conserved intragenic region between 16S and 23S fragments subsequently digestion of the amplicon with restriction enzymes. Therefore, dnaJ gene with digestive enzyme ApoI were studied to differentiate Staphylococcus genus. The results confirmed that S. epidermidis, S. hominis, and S. lugdunensis had 3 bands and S. aureus 4 bands. However, the restriction enzyme not fail but there are no restrict site in there amplified genome segment for S. haemolyticus, S. xylosus and S. auricularis. Our study found that a restriction enzyme ApoI does not benefit in classifying the species of the genus Staphylococcus spp.

تم دراسة الجين dnaJ مع الانزيم القاطع ApoI في تفريق الانواع التابعة لجنس Staphylococcus spp. بتقنية PCR-RFLP وجد ان الانواع Staph. epidermidis و Staph. hominis و Staph. lugdunensis يمتلكون 3 حزم، بينماStaph. aureus 4 حزم، ام ا بقية الانواع المتمثلة ب Staph. auricularis و Staph. haemolyticus و Staph. xylosus فقد فشل الانزيم القاطع ApoI بفصلهم الى حزم، تبين من دراستنا ان الانزيم القاطع لا يفيد في تصنيف الأنواعالتابعة لجنس المكورات العنقودية


Article
Molecular Identification of Giardia duodenalis Parasite Isolates from Human by Polymerase Chain Reaction – Restriction Fragment Length Polymorphism Technique (PCR-RFLP) in Baghdad Province

Authors: Tural Yelderim Bakir --- Abdullah Mustafa Qader
Journal: Diyala Journal For Pure Science مجلة ديالى للعلوم الصرفة ISSN: 83732222 25189255 Year: 2011 Volume: 7 Issue: 4 Pages: 54-66
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

The present study was designed to determine the genotypes of Giardia duodenalis isolatesfrom human by using polymerase chain reaction – restriction fragment length polymorphismtechnique (PCR-RFLP) technique, by amplification of glutamate dehydrogenase (gdh) gene toprovide information about the genetic diversity and their epidemiological and clinicalcharacteristics in Baghdad province. Thirty isolates from children (1-12 years old) wereprocessed for (PCR-RFLP). Data corresponding to demographic, social and environmentalvariables and presence or absence of symptoms were collected. The glutamate dehydrogenase(gdh) gene was amplified by using specific primers (GDHiF and GDHiR), the PCRamplification was observed in 17/30 (56.6%) of the fecal samples, among these 5/17 (29.4%)samples belonged to genotype A and 12/17 (70.5%) samples belonged to genotype B. Geneticsubgenotypes identified from human fecal samples revealed that, 5/17 (29.4%) weresubgenotype AΙΙ, 9/17 (52.9%) subgenotype BΙΙΙ, and 3/17 (17.6%) subgenotype BΙV.Genotype B was detected in children with severe symptomatic giardiasis and many of themhad diarrhea while, subgenotype AΙΙ was detected in children with mild symptomaticgiardiasis and without diarrhoea.

خصصت الدراسة لتحديد البنية الوراثية لل Giardia duodenalis المعزولة عن البشر بأستخدام ردة فعل سلسلة البوليمرات المحددة بتقنية تعدد طول البوليمرات (PCR-RELP) عن طريق توسيع الجين الموروث لخميرة الجلوتيمات (gdh) لتجهيز معلومات حول التنوع الوراثي وخصائصهم الوبائية والسريرية في منطقة بغداد . وقد عزل 30 من الاطفال تتراوح اعمارهم بين 1 - 12 سنة PCR-RELP). جمعت حقائق مطابقة للديمغرافية وللتنوعات الاجتماعية والبيئية وحضور وغياب الاشارات .اطنبت الجينات الوراثيةلخميرة الجلوتيمات (gdh)بأستخدام بطانات معينة (GDHIFAND GDHIR). لوحظ زيادة ال (PCR) في 1730 (56,6%) في A وعينات 1217 (70,5%) العائدة للطراز الجيني B .عرف الطراز الجيني الثانوي في عينات برازية بشرية اظهرت بأن 175 (29,4%)كانت طراز جيني ثانوي ,917 (52,9%) طراز جيني ثانوي .BII 317 (17,6%) طراز جيني BIV استكشف الطراز الجيني B عند الاطفال مع SYMPTOMATIC JIARDIASIS عنيفة وعدة منهم كان لديهم اسهال بينما اكتشف الطراز الجيني AII عند الاطفال مع SYMPTOMATIC JIARDIASIS معتدل وبدون اسهال

Listing 1 - 10 of 20 << page
of 2
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (20)


Language

English (16)

Arabic (2)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2019 (3)

2017 (5)

2016 (6)

2015 (1)

2014 (1)

More...