research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
Molecular identification and sequencing of Pseudomonas aeruginosa virulence genes among different isolates in Al-Diwaneyah hospital
التحديد الجزيئي وتتابع جين ضراوة Pseudomonas aeruginosa لعزلات مختلفة في مستشفى الديوانية

Author: L.J. Shaebth ليلى جاسم شعيبث
Journal: Iraqi Journal of Veterinary Sciences المجلة العراقية للعلوم البيطرية ISSN: 16073894 Year: 2018 Volume: 32 Issue: 2 Pages: 183-188
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

Pseudomonas (P.) aeruginosa possesses a variety of the virulence factors that may contribute to its pathogenicity, such as exotoxin A (toxA) and exoenzyme S (ExoS). The principal aim of this study was to find out the rapid method for identification of P. aeruginosa and to detect the toxA, exoS and 16SrRNA genes by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique. Other aim on the other hand, the DNA sequencing was performed for phylogenetic tree analysis of 16SrRNA gene in local pathogenic P. aeruginosa isolates in comparison with NCBI-Genbank global P. aeruginosa isolates and finally submission of the present isolates in NCBI-Genbank database. According to the detection of the 16S rRNA gene, the study revealed that 29 (58%) and 32 (64%) of P. aeruginosa out of 50 swabs obtained from each wound and burn areas were positive. whereas in addition, the result of this study showed that the toxA gene was detected in 77% of P. aeruginosa isolated from the wound and 51% of P. aeruginosa isolated from the burn. whereas, the exoS gene was detected in 69% of P. aeruginosa isolated from the wound and 49% P. aeruginosa isolated from the burn. BLAST analysis showed that the 16S rRNA gene shared more than 99% homology with the sequences of P. aeruginosa. Furthermore, the phylogenetic tree analysis of the 16S rRNA gene indicated that (PA-IQw and PA-IQb) the 16S rRNA gene shared higher homology with other four P. aeruginosa isolates available in the GenBank. The homology of the nucleotides was between 99.9% and 100%.

تمتلك Pseudomonas aeruginosa العديد من عوامل الضراوة التي قد تساهم في امراضيتها مثلexotoxin A (toxA) و exoenzyme S (exoS). الهدف الأساس للدراسة الحالية هو ايجاد الطريقة السريعة لتشخيص هذه الجرثومة وتحديد جينات toxA و exoS و 16SrRNA باستخدام تفاعل سلسلة البلمرة. كما تهدف الدراسة أيضا الى تحديد تتابع الـ DNA للشجرة الوراثية لجين 16SrRNA في العزلات المحلية لجرثومة Pseudomonas aeruginosa المرضية بالمقارنة مع بنك الجينات الدولي NCBI وادراجها في قاعدة بيانات البنك بوصفها عزلة محلية عراقية. اعتمادا على تحديد جين 16SrRNA، بينت الدراسة أن 29 عزلة (58%) و 32 عزلة (64%) من أصل 50 عينة أخذت من مواقع الجروح والحروق كانت ايجابية كما بينت الدراسة أن الجين toxA قد تم تعيينه في 77% من عزلات الجروح و 51% من عزلات الحروق بينما تم تعيين الجين exoS في 69% من عزلات الجروح و 49% من عزلات الحروق. أظهر تحليل BLAST أن الجين 16SrRNA يطابق بنسبة 99% ذلك الموجود في جرثومة Pseudomonas aeruginosa. علاوة على ذلك أن تحليل الشجرة الوراثية للجين 16SrRNA بأن PA-IQw و PA-IQb أظهر تطابقا مع العزلات الأربعة من Pseudomonas aeruginosa المثبتة في بنك الجينات، إذ كانت نسبة التطابق بين 99-100%.

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

English (1)


Year
From To Submit

2018 (1)