research centers


Search results: Found 67

Listing 1 - 10 of 67 << page
of 7
>>
Sort by

Article
Biodiversity and Genetic Relationships to the Species for the genus Gladiolus L. (Iridaceae) Wild Growing in Iraq Using RAPD-PCR Technique
التنوع والعلاقات الوراثية لانواع جنس Gladiolus L. (Iridaceae ) النامية برياً في العراق باستعمال تقنية RAPD – PCR

Loading...
Loading...
Abstract

This study observed the genetic diversity and relationships among 4 species belonging to genus Gladiolus L. , by using the Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique , the study includes extraction of genomic DNA from the dray leaves by using commercial kit . 4 random primers used the produced of many polymorphic bands among the 4 species , it was also possible to fined the DNA fingerprint of all studied species.Through the appearance of a number of bands that were unique to each species.Genetic distances ranged from 0.10 to 0.86, and used cluster analysis were performed to construct dendrogram.Cluster analysis grouped the 4 species Into tow main clusters depending on their ancestor and their morphological and anatomical traits. Depending on the results of this study and other such as anatomical and palynologycal studies we can record a new species in Iraq belonging to genus Gladiolus, it is G. anatolicus.

بينت هذه الدراسة التنوع والعلاقات الوراثية بين 4 انواع تابعة لجنس Gladiolus L. البري باستعمال مؤشرات الدنا DNAفي تقنية التضخيم العشوائي متعدد الاشكال لسلسلة الدنا RAPD، شملت الدراسة استخلاص الدنا المجيني Genomic DNA من الاوراق النباتية الجافة باستعمال عدة استخلاص دنا النباتات ، وتم استعمال 4 بوادئ Primers عشوائية انتجت عدد من الحزم متعددة الاشكال Polymorphic بين الانواع الاربعة المدروسة ، كذلك تم تحديد البصمة الوراثية لجميع الانواع من خلال ظهور عدد من الحزم الفريدة Unique bands ، وتم تحديد البعد الوراثي بين الانواع اذ تراوح بين 0.10 الى 0.86 ، فضلا عن استعمال التحليل العنقودي لبناء شجرة التنوع الوراثي اذ تكوّنت الشجرة من مجموعتين رئيسيتين تعتمد على سلفهم وصفاتهم المظهرية والتشريحية وبالاعتماد على نتائج هذه الدراسة ونتائج دراسات اخرى كالتشريح وحبوب اللقاح تم تسجيل نوع جديد في العراق ضمن هذا الجنس هوBoiss. G.anatolicus .


Article
Genetic Diversity and Relationships Among Species of Iris L. (Iridaceae) Growing Wildly in Iraq by Using RAPD–PCR Technique

Authors: Areej F. AL Rawi --- Mazin N. AL-Ani --- Mohameed M. Jawad
Journal: Engineering and Technology Journal مجلة الهندسة والتكنولوجيا ISSN: 16816900 24120758 Year: 2018 Volume: 36 Issue: 2 Part (C) Pages: 198-205
Publisher: University of Technology الجامعة التكنولوجية

Loading...
Loading...
Abstract

This study shows the diversity and genetic relations among 8 speciesbelong to the genus Iris L. growing wildly in Iraq by using RAPD-PCR technique.This study included Genomic DNA extraction from dry leaves of plants by useing5 random primers that produced several polymorphic bands among the 8 testedspecies, in addition the genetic fingerprint were identified for all species byemergence many of unique bands . The genetic distance between species wasdetermined as it ranged from 0.10 to 0.97, as well as the use of cluster analysis tobuild the genetic diversity tree which formed two main groups based on theirancestors, morphological and anatomical specifications, which depending on theresults of this study and the results of other studies as anatomy and pollen wererecorded a new species in Iraq within this genus is Iris madonna Dykes.

Keywords

Iris --- DNA --- RAPD


Article
JESTIMATIONOFEFFICIENTOF RANDOM PRIMERSANDEFFECTOFSALT STRESSON CHLOROPHYLLB CONTENTINSOME BREAD WHEAT CULTIVARS
تقدير كفاءة البادئات العشوائية وتاثير الجهد الملحي على محتوى الكلوروفيلb في بعض انواع الحنطة الخبازية

Authors: W. K. Al – Saadi وليد خالد السعدي --- A. J. Kubba اياد جابر كبه
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2015 Volume: 46 Issue: 4 Pages: 644-651
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis was employed to estimate genetic similarity among six bread wheat Triticum aestivum L. genotypes profile changes in DIJLAH, IPPA99,FURAT, INIA66,URUQ and TAMOOZ 2. Out of 12 random, 9 primers detected polymorphism among all the studied genotypes, produced 8 –21 bands with an average of 14.5 bands per primer. Wheat genotypes were grouped in three main groups, Group 1 was formed by 2 cultivars (DIJLAH and FURAT), group II was formed by three cultivars (INIA66, IPPA99 and URUQ), and group III was formed by a single cultivar (TAMOOZ 2) was the most distant genotype. With three salinity levels the cultivars were distributed on main plots and the treatment were distributed on sub plots according to split – plot design. Using three replication. The cultivars (FURAT,URUQ and DIJLAH) in three salinity levels (0,5,10) EC (Elecetrical Conductivity) was able to prevent toxic levels of Na+, Cl- accumulation. The cultivars (IPPA 99 and INIA 66) In 10 EC water salts build up in the intercellular space, leading to cell dehydration and death. The highest chlorophyll content is recorded by Furat, while Ibaa99 is recorded the lowest chlorophyll content. Salt stress led to decrease chlorophyll b content of leaves from (44.52 to 24.31) spad.

أستخدمـــــت (تقنية التضاعف العشوائي لسلسله الدنا RAPD) لتقدير التشابه الوراثي بين خمسة أصناف من الحنطه الخبازيهTriticumaestivum للأصنافدجله،اباء99، فرات، اينيا66، اوروك وتموز2, باستخدام 12 بادئ أحادي عشوائي، تسعه برايمرات ميزت التغاير او الاختلاف بين الاصناف المدروسة, أعطت 8-21 حزمة بمعدل 14.5 حزمة لكل بادئ. اصناف الحنطة قسمت الى ثلاث مجاميع رئيسيه المجموعه الاولى تضم الاصناف (دجلة وفرات) المجموعة الثانية تضم الاصناف (اينيا66 واوروك واباء 99) والمجموعة الاخيرة تضم الصنف (تموز2فقط) الذي كان بعيدا عن المجاميع السابقة. باستخدام ثلاث مستويات ملحية 10 و5 و0EC,وزعت الاصناف على الالواح الرئيسية بينما وزعت المعاملات على الالواح الثانوية طبقا لتصميم القطع المنشقة,كررت كل معاملة ثلاث مرات. الاصناف (فرات,اوروك ودجلة) وباستخدام جميع المستويات الملحية 10 و5 و0EC كانت قادرة على منع تراكم المستويات السمية من الكلور والصوديوم. اما الاصناف اباء 99 و اينيا 66في المستوى الملحي الثالث 10 EC تراكمت الاملاح في اغشيتها الخلوية مما ادى الى الجفاف ومن ثم الموت,اعلى محتوى كلوروفيل سجل للصنف فرات واقل محتوى للكلوروفيل سجل للصنف اباء 99. جهد الملوحة ادى الى نقصان في مستوى الكلوروفيل b في الاوراق من44.52 الى 24.31وحدة سباد.


Article
ESTIMATION OF GENETIC VARIATIONS IN DIFFERENT TAXA IN BRASSICACEAE BY RAPD AND ISSR ANALYSIS
تقدير التغايرات الوراثية لمراتب تصنيفية مختلفة من العائلة الصليبية باستخدام تحليل RAPD و ISSR

Author: Huda Jasim M. Al-Tameme هدى جاسم محمد التميمي
Journal: Bulletin of the Iraq Natural History Museum مجلة متحف التاريخ الطبيعي العراقي ISSN: Print ISSN: 10178678, Online ISSN: 23119799 Year: 2018 Volume: 15 Issue: 1 Pages: 1-13
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Twelve species from Brassicaceae family were studied using two different molecular techniques: RAPD and ISSR; both of these techniques were used to detect some molecular markers associated with the genotype identification. RAPD results, from using five random primers, revealed 241 amplified fragments, 62 of them were polymorphic (26%). ISSR results showed that out of seven primers, three (ISSR3, UBC807, UBC811) could not amplify the genomic DNA; other primers revealed 183 amplified fragments, 36 of them were polymorphic (20%). The Similarity evidence and dendrogram for the genetic distances of the incorporation between the two techniques showed that the highest similarity was 0.897 between the varieties red cabbage and red ornamental cabbage, meanwhile the lowest similarity index was between the varieties red radish and Green ornamental cabbage (0.169); thus these RAPD and ISSR markers have the possibility for the identification of species or varieties and the description of genetic variation within the varieties. Furthermore, it could be concluded that the Brassicaceae taxa have a suitable amount of genetic variance and a wide range in the genetic principle of the studied genotypes which can be used for output improvement.Keywords: Brassicaceae, Genetic similarity, ISSR, Polymorphism, RAPD.

درست اثنا عشر نوعاً من العائلة الصليبية باستخدام اثنين من التقنيات الجزيئية المختلفةRAPD وISSR ؛ إذ استخدمت كل من هذه التقنيات للكشف عن بعض الواسمات الجزيئية المرتبطة مع تحديد النمط الجيني اذ اظهرت نتائج تضاعف العشوائي المتعدد الاشكال لسلسلة الدنا RAPD، من استخدام خمسة بادئات عشوائية، تمييز241 حزمة مضخمة، 62 منها كانت متعددة الأشكال (26٪). أظهرت النتائج تكرار التسلسلات البسيطةISSR من أصل سبعة بادئات، ثلاثة (ISSR3، UBC807، UBC811) لم يظهر اي تضخيم للحامض النووي الجيني، وكشفت البادئات الأخرى 183 حزمة مضخمة، 36 منها كانت متعددة الأشكال (20٪) وتبين ان مؤشرات التشابه والمخطط التشجيري للمسافات الوراثية عند الجمع بين الطريقتين أن أعلى التشابه كان 0.897 بين أصناف الملفوف الأحمر والملفوف الزينة الأحمر، بينما ظهر أدنى مؤشر للتشابه بين أنواع الفجل الأحمر والملفوف الزينة الأخضر (0.169)؛ اي ان علامات RAPD وISSR لديها القدرة على تحديد الأنواع / الأصناف وتوصيف الاختلاف الجيني داخل الأصناف أيضا يمكن أن نستنتج أن انواع العائلة الصليبية لها كمية كافية من التنوع الوراثي ومجموعة واسعة في القاعدة الوراثية للتراكيب المستخدمة في الدراسة والتي يمكن استخدامها لتحسين المحاصيل.


Article
Application of the Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers to Analyze the Genetic Variability in Species of the Fungus Alternaria
استخدام مؤشرات التضاعف العشوائي للدنا (RAPD) لتحليل التباين الوراثي لانواع من الفطر Alternaria

Authors: Hadeel A. Omear هديل عبد الهادي عمير --- Akeel H. Al-Assie عقيل حسين العاصي --- Sahi J. Dhahi ساهي جواد ضاحي
Journal: Rafidain journal of science مجلة علوم الرافدين ISSN: 16089391 Year: 2011 Volume: 22 Issue: 1E Pages: 1-16
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

The PCR-based technique of randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) was used to fingerprint and assess the genetic relatedness among nine species of the fungus Alternaria isolated from various crop plants showing the leaf spot disease in Mosul, Iraq. Genomic DNA of each species was extracted at a final concentration of 300 - 400 µg / 2-3 g of wet mycelium , and at a purity of 1.6-1.8. Each DNA sample was amplified with each of 22 primers and the products were resolved electrophoretically on 1.2% agarose gel, stained with ethidium bromide and photographed under UV. One Primer failed to support amplification but the remaining 21 (95.5%) primers produced a total of 112 bands (2-10 per primer) across the nine species. Of these bands, 100 (1-10 per primer ) were polymorphic. The least efficient primer was OP-H01 (1.79%), while the most efficient one weas OP-M05 (8.93 %). Primers OP-C05, OP-E20 and OP-T20 had the lowest (0.1%) discriminatory power while primer OP-M05 had the highest (10 %) power and identified all 9 species through unique patterns of banding. RAPD analysis fingerprinted eight of the nine isolates through marker bands with one or more of the 21 primers. Cluster analysis based on the genetic distances split the nine species into three distinct clusters with no obvious association between the pattern of clustering of the species and their host specificities.

لقد جرى استخدام تقنية RAPD المعتمدة على تفاعل PCR لايجاد البصمة الوراثية والعلاقة الوراثية بين تسعة انواع من الفطر Alternaria المعزولة من نباتات محاصيل مختلفة مصابة بمرض تبقع الاوراق في مدينة الموصل / العراق. وجرى استخلاص الدنا من كل نوع وبتركيز نهائي قدره 400-300 مايكروغرام لكل 3-2غرامات من الغزل الفطري الرطب وبنقاوة 1.8-1.6. وجرت مضاعفة كل عينة من عينات الدنا بواسطة 22 بادئا وفرزت النتائج بالترحيل كهربائيا خلال هلام الاكاروز ذي التركيز 1.2% والمصبغ بالمادة المتألقة بروميد الايثيديوم والتصوير تحت اشعة الــUV. وفيما اخفق احد البوادئ في دعم عملية التضاعف لاي دنا مجيني فقد افلح 21 بادئا اخر في ذلك وانتجت ما مجموعه 112 حزمة دنا ( بمعدل 10-2لكل بادئ) عبر الانواع الفطرية التسعة وكان 100 حزمة من هذه الحزم متباينا ( بمعدل 10-1 لكل بادئ ) وكان اقل البوادئ كفاءة في اسناد التضاعف هو البادئ OP-H01 (بكفاءة 1.79%)، و أكثرها كفاءة (10%) وهو البادئ OP-M05، إذ استطاع ان يميز جميع الانواع التسعة وذلك من خلال الانماط الفريدة من التحزيم في كل نوع. لقد استطاعت تقنية RAPD كذلك تحديد البصمة الوراثية لثمانية انواع من الانواع التسعة المدروسة وذلك من خلال ظهور حزم مؤشرة فريدة حين مضاعفة الدنا من كل نوع من هذه الانواع مع واحد او اكثر من البوادئ الواحد والعشرين أعلاه. كما أن التحليل العنقودي للمسافات الوراثية بين هذه الانواع التسعة قد وضع الانواع في ثلاث مجموعات رئيسة دون ملاحظة وجود علاقة بين توزيع الانواع على هذه العناقيد الثلاثة وتوزيعها على المضائف التي جمعت منها.


Article
Morphological, Biochemical and Molecular Characterization of Ten Rhizobial Bacteria Isolates.
دراسة الصفات المظهرية والكيموحياتية و الوراثية لعشر عزلات من بكتريا الرايزوبيا

Authors: Neamat .J. Al-Judy نعمت جميل الجودي --- Raffal Essmaeil Majeed
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2013 Volume: 54 Issue: 2 Pages: 280-287
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

This study was done in biotechnology laboratories in the national center of organic farming /ministry of agriculture where ten of Rhizobial isolates and strain studied were either local isolate from chickpea root nodules or non- local (Syrian and Turkish) obtained from ICARDA.These isolates were identified and characterized on the basis of colonies morphology and biochemical tests including gram staining, catalase and oxidase tests. The Genetic diversity among the isolates was assessed by RAPD(Randum Amplified Polynorphic DNA)-PCR(Polynerase Chain Reaction) finger printing by using five primers. The RAPD result showed high ability to detect genetic polymorphism in Rhizobia and have the ability to generated unique bands (marker) especially in Shiekhan 3(10)bands Mosle(8)bands isolates that isolated from chickpea plants .

تمت الدراسة الحالية في مختبرات التقانات الإحيائية في المركز الوطني للزراعة العضوية التابع لوزارة الزراعة حيث تضمنت دراسة عشر عزلات و سلالات من بكتريا الرايزوبيا ، تضمنت عزلات محلية عزلت من العقد الجذرية لنبات الحمص والباقلاء أو غير محلية ذات مصدر سوري أو تركي تم الحصول عليها من منظمه ايكاردا. شخصت العزلات بالاعتماد على المظهر الخارجي والفحوصات الكيموحياتيه عن طريق صبغة كرام و فحصي الأوكسيديز والكاتاليز.درست التغايرات الوراثية للبكتريا على اساس تقنيه ال RAPD-PCR باستخدام خمسه بادئات حيث اظهرت هذه التقنية قدره عاليه للتحري عن التباين الوراثي في الرايزوبيا وقدره البادئات على إظهار حزم مميزه للعزلة وكانت أكثر العزلات التي ظهرت فيها هذه الحزم هي شيخان 3 (10)حزم وموصل (8) حزم والتي عزلت من نباتات الحمص.

Keywords

Rhizobium --- molecular --- RAPD-PCR --- Biochemical


Article
Assessment of Genetic Effects of Bacterial Cells After Exposure to Mobile Phone Radiation Using RAPD Technique
تقييم التأثيرات الوراثية للخلايا البكتيرية بعد التعرض لأشعة الهاتف النقال باستخدام تقنية RAPD

Author: Ibraheem A. Latif, Adnan F. AL-Azawy, Akeel H. AL-Assie
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2013 Volume: 12 Issue: 2 Pages: 63-74
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Abstract: In this study the random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique was used to evaluate the genetic effects of the DNA of Escherichia coli and Staphylococcus aureus bacteria after exposed to various durations (15, 30, and 45 min) of radiofrequency (RF) radiation used in cellular phone communications at a frequency of 900 MHz compared with control (unexposed). Genomic DNA were obtained from all bacterial cells, then amplified individually by RAPD technique with fourteen different 10-mer arbitrary primers. Change in the genome revealed by RAPD technique included variation in band intensity; loss of normal bands and appearance of new bands compared with control. The results display that exposition to various durations of mobile phone radiation induced great changes in RAPD profiles of genomic DNA of bacterial cells compared with control and genomic DNA of E. coli bacteria was more affected than S. aureus. In addition, the results demonstrated that RAPD technique is useful for detection of alterations in the DNA produced by mobile phone radiation.

الخلاصــة:في هذه الدراسة استخدمت تقنيـــة التضاعف العشوائي المتعدد الأشكال لسلســــة الدنا (RAPD) لتقييم التأثيرات الوراثيــــة للحامض النـــووي DNA) )لبكتريا الإشيريشيا القولونية والبكتيريا العنقودية الذهبية بعد التعرض لفترات مختلفة (15، 30، 45 دقيــقة) من الموجات الراديوية المستخدمة في اتصالات الهاتف النقال عند التردد 900 ميغاهيرتز مقارنة مع السيطرة (غير المعرضة). تم الحصول على الجينوم من جميع الخلايا البكتيرية، ضخم باستعمال تقنية RAPD مع واحد وعشرين بادءة عشرية القواعد اعتباطية التعاقب. تضمنت التغيرات في الجنيوم والتي أظهرتها تقنية RAPD التغير في كثافة الحزمة أو فقدان حزم طبيعية وظهور حزم جديدة مقارنة مع السيطرة. اظهرت النتائج ان التعرض لفترات مختلفة لأشعة الهاتف المحمول سبب تغيرات كبيرة في انماط ال RAPD للخلايا البكتيرية مقارنة مع السيطرة وان جينوم بكتيريا الإشيريشيا القولونية كان أكثر تأثرا من البكتيريا العنقودية الذهبية. بالإضافة إلى أن النتائج أثبتت أن تقنية RAPD مفيدة للكشف عن التغيرات في الحامض النووي الديوكسي رايبوزي الناتجة عن إشعاع الهاتف النقال.


Article
Molecular Identification of Aspergillus fumigatus Using ISSR and RAPD Markers
ألتشخيص ألجزيئي لعزلات A.fumigatus بواسطه مؤشرات ال ISSR و الRAPD

Authors: Nawras Kadhim Rassin نورس كاظم رسن --- Neamat J. Al- judy نعمت جميل عبد الباقي --- Batol Imran Dheeb بتول عمران ذيب
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2015 Volume: 56 Issue: 4A Pages: 2788-2797
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of this stud to isolate and identified of A. fumigatus from different sources and study the genetic diversity among these isolates by using RAPD and ISSR markers.Collected 20 samples from 7samples were isolated A. fumigatusisolates were characterized depending on its morphological, then extracted DNA from its.RAPD markersrandomly bandingwith sitesof genome more than ISSR markers where the primer OPN-07 achieved discriminative power (19.1) and 43 bands, while ISSR6 achieved discriminative power (17.1) with 32 bands.ISSR were more efficiency in specific binding then RAPD, ISSR primers has great a binding to production unique band, when 9 primers from 10 primers, ISSR9 was produce (5) unique bands, while RAPD markers was low ability to production unique bands, 3primers from 9 primers were produced unique bands.The dendrogram of RAPD was reverted than isolates number 5 and 7 had the great genetic diversity 0.33361 while the isolates number 5 and 6 had the lowest genetic similarity 0.98521 in contrast with ISSR markers was show isolates number1 and 2 greats genetic diversity 0.97826whilethe isolates number 5 and 7 had the lowest genetic similarity 0.10253.

هدفت هذا الدراسه الى عزل وتشخيص فطر A. fumigatusمن مصادر مختلف ودراسهالتغايرات الوراثيه بين هذا العزلات بٳستخدام مؤشرات التفاعل العشوائي المتعدد ٳلاشكال لسلسله ٲلدنا RAPD ومؤشرات إعاده ٲلسلسله ٲلبسيطه ISSR تم جمع 20 عينه من A. fumigatus من مصادر مختلفه وتم تشخيصها ٳعتماد على صفات المظهر الخارجي. وتم استخلاص الدنا من جميع العينات ولكن تم اختيار 7 عزلات فقط لاجراء تفاعلات ال RAPDوال ISSRعليها.ٳظهرت مؤشرات ال RAPD بٲنها ذات ارتباط عشوائي بمواقع التركيب الجيني اكثر من مؤشرات ال ‚ISSRحيث ان البادئ OPN-07حقق طاقه تمييزيه بلغت 19.1 وناتج عدد حزم عشوائيه بلغ 43 مقارنه مع البادئ ISSR6 الذي حقق طاقه تمييزيه بلغت 17.1و32 حزم عشوائيه .ٲظهرت بادئات مؤشر الISSR قدره عاليه على ٳنتاج حزم مفرده حيث ان 7 بادئات من اصل 9 اظهرت حزمه منفرد بينما كان البادئ ISSR9 هو الاكثر إنتاج للحزم)5 (حزم منفرده بينما بادئات مؤشر الRAPD كانت ذات قدره اقل على إنتاج الحزم المنفرده حيث انتج 3 بادئات فقط من اصل 9 اظهرت حزم منفرده وكان البادئات OPM-20 ,OPL-05 الاكثر ٳنتاج للحزم المنفرده بعدد 2 وهذا يدل على ان مؤشراتISSR ذات كفاءه اعلى من مؤشرات RAPD في الارتباط اكثر تخصص بمواقع مميزه ,اظهرت المخططاتلشجيريه لتقنيه الRAPD اضهرت ان العزله رقم 5مع عزله رقم 7 هي الاكثر تنوع جينيه بلغت 0.33361 بينما العزله رقم 5 مع عزلة رقم 6 كانت الاقل مسافه جينيه بلغت 10.9852 اما في مايخص تقنية ISSRإضهرت أن العزلة رقم 1 وعزلة رقم 2 هي الاكبر تنوع جيني 0.97826 بينما العزلة رقم 5 و عزله رقم 7 هي الاقل تشابه جيني 0.10253.


Article
Detection of genetic diversity for number of Iraqi maize cultivars (Zea mays L.) by using the RAPD-PCR technique
الكشف عن التنوع الوراثي لعدد من أَصناف الذرة الصفراء العراقية باستخدام تقنية RAPD-PCR

Loading...
Loading...
Abstract

Abstract:In this study six varieties of maize (Zea mays L.) used which where Z. mays saccharata (Z1), Z. mays indurate (Z2), Z. mays indentata (Z3), Z. mays everta (Z4), Z. mays tunicate (Z5) and Z. mays amylacea (Z6), and (10) RAPD primers for detection of the genetic variation among the DNA of these varieties and determine the genetic relationship among them and also determine the genetic fingerprint. the mount of DNA was between (65-90) microgram for each (1) gram of the leaves of these varieties after isolation the genomic DNA by (CTAB) method with purity range between (1.5-1.85) and interfering (PCR) reactions and then electrophoresis on agarose gel.The results of RAPD reactions showed that the primer (OPW-09) didn't show amplified results while nine primers appear (277) band, (120) bands are monomorphic and the percent (43.32%), (157) bands polymorphic and at percent (56.67%). The results of genetic diversity appeared the RAPD is the least value of the genetic diversity was (0.21349) between the varieties (Z2, Z5) and the highest value was (0.56484) between (Z1, Z5). according to genetic analysis for the results, the dendogram divided in to three major groups, the first major group include (Z1), and the second group (Z6) only while the third major group was divided in to three minor groups. The first minor group contained (Z4) and the second group (Z3) while the third group includes (Z2, Z5).

إستُخدِمَت في هذه الدراسة ستة أصناف من الذرة الصفراء وهي (الحلوة 1Z ، الصيوانية 2Z ، المنغوزة 3Z ، الشامية 4 Z ، المغلفة 5Z والطحينية 6Z) ، و10 بوادئ لمؤشر RAPD للكشف عن التنوع الوراثي بين DNA الاصناف المدروسة وتحديد العلاقة الوراثية بينها كذلك تحديد البصمة الوراثية لهذه الاصناف. تم الحصول على كمية DNA)) تراوحت بين (65-90) مايكروغرام لكل غرام واحد من أوراق الأصناف المدروسة بعد عزل DNA)) بطريقة (CTAB) , وبنقاوة تراوحت بين (1.5-1.85) وأجريت تفاعلات (PCR) ورُحِلت العينات على هلام الاكاروز.أوضحت نتائج تفاعلات (RAPD) ان البادئ (OPW-09) لم يُظهِر اي نتائج تضاعف ، بينما أظهرت 9 بوادئ 277 حزمة ، (120) حزمة منها متماثلة وبنسبة مئوية (43.32%) و(157) حزمة متباينة وبنسبة مئوية (56.67%) , وأظهرت نتائج البعد الوراثي لتفاعلات (RAPD) أن أقل قيمة للبعد الوراثي كانت (0.21749) بين الصنفين (صيوانية Z2 ومغلفة Z5) , وأعلى قيمة كانت (0.56484) بين الصنفين (حلوة Z1 ومغلفة Z5) ، وحسب التحليل الوراثي للنتائج رُسِمت شجرة القرابة الوراثية للأصناف المدروسة وقُسِمت الى ثلاث مجاميع رئيسية ، ضمت المجموعة الأولى الصنف حلوة (Z1) فقط ، والمجموعة الثانية الصنف طحينية (Z6) فقط ، بينما إنقسمت المجموعة الثالثة الى ثلاث مجاميع ثانوية ، ضمت الأولى الصنف شامية (Z4) ، والثانية الصنف منغوزة (Z3) ، بينما ضمت المجموعة الثالثة الصنفين (صيوانية Z2 ومغلفة Z5).


Article
Genetic Variations of Echinococcus granulosus Isolated from Sheep and Cows by Using Fingerprint DNA Method in Iraq

Authors: Farhan A. Risan --- Salwa S.Muhsin --- Zaman A.A. Ibrahim
Journal: Iraqi Journal of Pharmaceutical Sciences المجلة العراقية للعلوم الصيدلانية ISSN: 16833597 Year: 2009 Volume: 18 Issue: 2 Pages: 61-67
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The fingerprinting DNA method which depends on the unique pattern in this study was employed to detect the hydatid cyst of Echinococcus granulosus and to determine the genetic variation among their strains in different intermediate hosts (cows and sheep). The unique pattern represents the number of amplified bands and their molecular weights with specialized sequences to one sample which different from the other samples. Five hydatitd cysts samples from cows and sheep were collected, genetic analysis for isolated DNA was done using PCR technique and Random Amplified Polymorphic DNA reaction(RAPD) depending on (4) random primers, and the results showed: 1-Ability of OPF-13 primer to find fingerprinting for DNA of hydatid cysts collected from cows with (3) unique patterns and from sheep with (5) unique patterns.2- Ability of OPF-06 primer to found (4) unique patterns for cows and (2) unique patterns for sheep. 3-Ability of OPF-19 primer to find fingerprinting for DNA of hydatid cysts collected from cows (5) unique patterns and (4) unique patterns for sheep.4-OPF-16 was unable to find the finger prints of DNA isolated from cows and sheep

ان طريقة البصمة الوراثية Fingerprinting DNA التي تعتمد على النسق المتميزUnique pattern قد استخدمت في هذه الدراسة لتشخيص طفيلي الأكياس ألعدريه ومعرفة الاختلافات الوراثية في مضائفه الوسطية المختلفة "الأغنام والأبقار" . أذ يمثل النسق المتميز عدد الحزم الناتجة مع أوزانها الجزيئية الخاصة وألتتابع ألخاص بالعينة والتي تميزها عن بقية العينات قيد الدراسة والتي كانت تشتمل على خمسة عينات لكل من الأكياس العدريه ألمعزوله من الأغنام والأبقار . وبعد تحليل العينات باستخدام تقانة الـ RAPD بالاعتماد على 4 بادئات عشوائية. أظهرت النتائج ما يلي – ١- تم إيجاد بصمة وراثية للعينات الخمسة لدنا الأكياس العدريه المعزولة من الأغنام والأبقار باستخدام البادئOPF-6 وبتنسيق متميزunique pattern للعينات جميعا.٢- قدرة البادئ OPF -13 على التوصل إلى إيجاد بصمة وراثية لدنا عينات الأكياس العدريه المعزولة من الأغنام وبتنسيق متميز بعدد خمسة انساق و(۳) أنساق للأبقار.۳- قدرة البادئ OPF -19 على إيجاد بصمة وراثية لدنا عينات الأكياس العدريه المعزولة من المضائف الوسطية الأبقار وبنسق متميز بعدد (٥) و (٤) أنساق للأغنام.٤- عدم قدرة البادئ OPF -16 على إيجاد بصمة وراثية لدنا عينات الأكياس العدريه المعزولة من المضائف الوسطية ( الأغنام والأبقار) المستخدمة في الدراسة.

Listing 1 - 10 of 67 << page
of 7
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (67)


Language

English (42)

Arabic (15)

Arabic and English (9)


Year
From To Submit

2019 (1)

2018 (11)

2017 (8)

2016 (12)

2015 (11)

More...