research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
ERIC-PCR Typing, RAPD-PCR Fingerprinting and Quorum Sensing Gene Analysis of Pseudomonas aeruginosa Isolated from Different Clinical Sources

Authors: Ruqaia S. Sallman --- Suzan S. Hussein --- Munim R. Ali
Journal: Al-Mustansiriyah Journal of Science مجلة علوم المستنصرية ISSN: 1814635X Year: 2018 Volume: 29 Issue: 2 Pages: 50-62
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية

Loading...
Loading...
Abstract

Recently, Pseudomonas aeruginosa infections proportions have increased significantly. Molecular typing and virulence analysis are good techniques, which can lead us to know P. aeruginosa infections. P. aeruginosa isolates were identified by using housekeeping gene (16S rDNA gene) via PCR technique for accurate identification. The highest percent 41.26% of P. aeruginosa bacteria was found in the burn infections followed by 28.57% in wound swabs, 17.46% in ear discharge and lowest percentage were obtained from sputum samples. All isolates classified into six groups (A-F) according to classes of antibiotics. Of the 63 bacterial isolates, 100% were resistant to carbencillin, whereas 31.74% were resistant to ticarcillin and all isolates susceptible to imipenem. In addition all of clinical isolates indicated multidrug resistant (MDR) patterns, the highest rate of MDR was observed with pattern C these isolates were able to resist (9-12) antibiotics. All isolates were typed genotypically by using two methods of amplification, ERIC and RAPD-PCR. The results of the ERIC-PCR typing of P. aeruginosa bacteria that 96.82% showed amplification bands ERIC-PCR also revealed 17 groups of genotypes (A-R) and 4 unique isolates. The results of RAPD-PCR fingerprint revealed 12 groups of genotypes (A-M) of 40–90% similarity according to coefficient values and 4 unique isolates, except 7.93% were untypeble. QS genes (lasI, lasR, rhlI, rhlR), screen showed all isolates 100% were positive for one or more QS genes, in the other hand 82.53% carrying lasI, lasR, rhlI, and rhlR, while the 15.87% carrying lasI, rhlI, and rhlR and 1.58% carrying lasI, lasR, and rhlR genes. ERIC genotyping significantly correlated resistance patterns but not with virulence control QS genes. RAPD genotyping significantly correlated with source of infection, resistance patterns and virulence control QS genes. These results can help initial diagnosis MDR P. aeruginosa outbreaks associated with specific genotyping patterns.

ازدادت في الآونة الأخيرة عدوى الزائفة الزنجاريه ((Pseudomonas aeruginosa بشكل ملحوظ لذلك جاءت هذه الدراسة ,حيث أجري التنميط الجزيئي وتحليل عوامل الضراوة التي تعتبر تقنيات جيده ومتطورة يمكن ان تقودنا لمعرفة عدوى P. aeruginosa , تم تشخيص عزلات P. aeruginosa باستخدام جين 16S rDNA عن طريق استخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) للتشخيص الدقيق, حيث وجد أعلى نسبة إصابة من P. aeruginosa 41.26% والتي تم العثور عليها في الالتهابات الحروق تليها %28.57 من مسحات الجروح , 17.46% من خراج الاذن وأقل نسبة إصابة تم الحصول عليها من عينات البلغم. اعتمادا على نتائج فحص الحساسية جميع العزلات تم تصنيفها الى ست مجموعات (A-F) وفقا لفئات المضادات الحيوية , من بين 63 عزلة , %100 كانت مقاومة Carbenicillin , في حين أن 31.74% كانت مقاومة Ticarcillin وجميع العزلات حساسة Imipenem , وبالإضافة إلى ذلك ، جميع العزلات السريرية أشارت إلى أنماط المقاومة المتعددة (MDR)، وقد لوحظ أن أعلى معدل للمقاومة المتعددة هو النمط C حيث كانت هذه العزلات قادرة على مقاومة (12-9) من المضادات الحيوية. من جانب أخر تم تنميط جميع العزلات جينيا باستخدام طريقتين مختلفتين ERIC-PCR و RABD-PCR, حيث أظهرت النتائج بتقنية ERIC-PCR للعزلات السريرية من P. aeruginosa أن 96.82% أظهرت ناتج للتنميط, كما كشفت عن17 مجموعة من التراكيب الوراثية (A - R) و 4 عزلات فردية (B, C, F, R) , أضافة الى ذلك فأن نتائج التنميط بطريقة RAPD-PCR كشفت عن 12 مجموعة من التراكيب الوراثية (A - M) من 40-90٪ كنسبة تشابه وفقا لقيم coefficient values و 4 عزلات فرديه (A، C، D، H)، أضافة الى ذلك 7.93% لم تظهر نتائج للتنميط, في هذه الدراسة أيضا تم التحري عن جينات تحسس الزحام (QS genes) حيث أظهرت النتائج 100% موجبة لجين واحد أو أكثر, كما بينت النتائج 82.53% حاملة للجينات الاربعة ( lasI, lasR, rhlI, rhlR) بينما 15.87% حاملة لثلاث جينات (lasI, rhlI, rhlR) في حين 1.58% حاملة لهذه جينات (lasI, lasR, rhlR). ERIC-PCR أظهر ارتباطا كبيرا مع أنماط المقاومة ولكن ليس مع عوامل الضراوة المسيطر عليها من قبل جينات تحسس الزحام ((QS genes, في حين RAPD-PCR يرتبط بشكل كبير مع مصدر العدوى وأنماط المقاومة و أيضا مع عوامل الضراوة المسيطر عليها من قبل جينات تحسس الزحام(QS genes) . هذه النتائج يمكن أن تساعد التشخيص الأولي لتفشي P. aeruginosa المتعددة المقاومة المرتبطة بأنماط جينيه محددة.

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

English (1)


Year
From To Submit

2018 (1)