research centers


Search results: Found 10

Listing 1 - 10 of 10
Sort by

Article
The role of atmospheric non-thermal plasma in the bacteria inactivation
دور البــلازمــا غـير الحـراريـة فـي تعـطــيل البـكـتــيريـا

Loading...
Loading...
Abstract

Non-thermal atmospheric pressure plasma has emerged as a new promising tool in medicine and biology. In this work, A DBD system was built as a source of atmospheric pressure non-thermal Plasma suitable for clinical and biological applications. E. coli and staphylococcus spp bacteria were exposed to the DBD plasma for a period of time as inactivation (sterilization) process. A series of experiments were achieved under different operating conditions. The results showed that the inactivation, of the two kinds of bacteria, was affected (increasing or decreasing) according to operation conditions because they affects, as expected, the produced plasma properties according to those conditions.

تعد البلازما غير الحرارية من الأدوات الحديثة في الطب والبايولوجي. تم في هذا البحث بناء منظومة تفريغ كهربائي خلال حاجز عازل كمصدر للبلازما اللاحرارية في الضغط الجوي الاعتيادي وهي مناسبة للتطبيقات الطبية والاحيائية. وقد تم تعريض نوعين من البكتيريا لبلازما تفريغ الحاجز العازل كعملية تعطيل (تطهير) للبكتيريا. هذا وقد انجزت سلسلة من التجارب تحت ظروف تشغيلية مختلفة وبينت النتائج ان عملية التطهير, لكلا نوعي البكتيريا, تتأثر ( زيادة او نقصان) تبعا للظروف التشغيلية لانها تؤثر, كما هو متوقع, في خصائص البلازما المنتجة تبعا لتلك الظروف.


Article
Detection of Sak Gene and Expression of Staphylokinase in Different Clinical Isolates of Staphyloccocus spp.
الكشف عن الجين (ساك) والتعبير عن أنزيم ستافيلوكاينيز في عزلات سريرية مختلفة لأنواع من بكتيريا المكورات العنقودية

Authors: Suha Maher Abed سهى ماهر عبد --- Adnan F. Al-Azzawie عدنان فاضل العزاوي
Journal: Tikrit Journal of Pure Science مجلة تكريت للعلوم الصرفة ISSN: 18131662 Year: 2018 Volume: 23 Issue: 1 Pages: 43-47
Publisher: Tikrit University جامعة تكريت

Loading...
Loading...
Abstract

This study had investigated the presence of Staphylokinase (SAK) phenotypically and genetically. A total of 100 Staphylococcus spp. samples were isolated from different clinical cases. Morphological, biochemical tests and for further conformation; Viteck2 technique were adopted to isolate and diagnose the staphylococcal samples. Phenotypic assay tests including hydrolysis of casein and plasma agar were performed to check for the production of Staphylokinase from producing Staphylococcus spp. Out of 100, only 32 isolates had exhibited (SAK) activity whereby 29 of them represented the species S. aureus while 3 belonged to others. All isolates were subjected to Polymerase Chain Reaction (PCR) to determine the possessed sak gene. This investigation certainly had shown that not all isolates of S. aureus has the sak gene, only the lysogenic one has it and that it is not species committed but also other staphylococcus species could have it.

اجريت هذه الدراسة لأجل التحقق من وجود انزيم ستافيلوكاينيزالمحلل مظهريا ووراثيا حيث اشتملت على 100 عزلة لبكتيريا المكورات العنقودية تم جمع العينات من مصادر سريرية مختلفة. وقد اعتمدت الاختبارات المظهرية والكيميائية الحيوية تلاها للتأكيد استخدام تقنية Viteck2 لتشخيص أنواع المكورات المستحصلة. أجريت اختبارات الفحص المظهري التي تضمنت اختبارين هما فحص تحلل كازائين الحليب و فحص تحلل أجار بلازما الدم المسخن للتحقق من إنتاج انزيم ستافيلوكيناز من قبل المكورات العنقودية. ومن أصل 100 عزلة، أظهرت 32 عزلة نشاط (ساك) فقط، كان 29 منها يمثل النوع الذهبي S. aureus بينما 3 منها تنتمي إلى أنواع اخرى. تم إخضاع جميع العزلات إلى تفاعل سلسلة البلمرة المتعدد (PCR) لتحديد ما اذا كانت تمتلك الجين. وقد أثبت هذا البحث بالتأكيد أنه ليس كل عزلات المكورات العنقودية الذهبية لديها الجين (ساكsak )، إلا أنه فقط البكتريا المصابة بالعاثي تمتلك الانزيم المنتقل اليها من خلاله وأنه ليس بالضرورة وجوده بهذا النوع فقط ولكن أيضا الأنواع المكورات العنقودية الأخرى يمكن أن تحتويه


Article
دراسة الظروف المثلى لانتاج إنزيم اللايسوستافين من بكتيريا Staphylococcus sp.YZ14 المعزولة محلياً

Authors: عزيز ياسر العذاري --- غازي منعم عزيز --- ماجد حسين الجيلاوي
Journal: journal of kerbala university مجلة جامعة كربلاء ISSN: 18130410 Year: 2007 Volume: 5 Issue: 4 Pages: 571-582
Publisher: Kerbala University جامعة كربلاء

Loading...
Loading...
Abstract

Staphylococci considered as the main source to produce Lysostaphin enzyme (EC 3.4.99.17). The enzyme is one of the factors that maintain ecological equilibrium between specieses belonging to this bacterial genus ,It has the ability to lyses bacterial cell wall by breaking down peptide bonds that build up the cross bridges in peptidoglycan layer.The ability of 112 isolates of the genus Staphylococcus Spp. were tested to produce lysostaphin enzyme, using solid and submerged culture media in primary and secondary screening ,then the optimal conditions for producing enzyme were determined such as source ofcarbon, nitrogen, phosphorus, concentration and type of salts,pH,tempreture and fermentation time .The isolate Staphylococcus sp.YZ14 was selected for it`s high ability to produce enzyme and some of it’s identificational characteristics were detected .The optimum conditions for lysostaphin production from YZ14 isolate were 6% casien hydrolysate, 0.25%potassium phosphate , 0.5% sodium chloride at initial PH of 7 and after 14 hours of inocubation at 37 C.

تعد بكتريا المكورات العنقودية المصدر الرئيس لانتاج أنزيم اللايسوستافين 73.4.99.1 EC. لان الاخير يعد من العوامل التي تعمل على حفظ التوازن البيئى بين الانواع التابعة لهذا الجنس أذ يمتلك القابلية على تحليل جدرانها الخلويه وذلك بمهاجمة الاصرة الببتيدية الرابطة التي تشكل الجسور العرضيه في طبقه الببتيدوكلايكان . أختبرت قدرة 112 عزلة بكتيرية محلية تعود لجنسSpp. Staphylococcus على انتاج انزيم اللايسوستافين باستخدام الاوساط الصلبة و المزارع المغمورة في مرحلتي الغربله الاولية والثانوية،وثم تحديد الظروف المثلى لانتاج الانزيم منها تحديد المصدر الكربوني و النتروجيني و الفسفور و تعيين نوع و تركيز الملح الامثل و الأس الهيدروجيني و درجة الحرارة و فترة التخمير. أختيرت العزله Staphylococcus sp.YZ14 لكونها الاغزر انتاجا للا نزيم وأجري عدد من الفحوص التشخيصية عليها فكانت مخمرة لبعض السكريات و منتجة لكل من أنزيم محلل الدنا بنوعيه والأسيتوين و الهيمولايسن و الكوأكيوليز المرتبط والحر كما تمتلك القدرة على النمو في مدى حراري (15- 45) ْم ، أما الظروف المثلى لانتاج اللايسوستافين منها فكانت استخدام كل من متحلل الكازين 6% و فوسفات البوتاسيوم 0.25% و كلوريد الصوديوم 0.5%عند رقم هيدروجيني أبتدائي مقداره 7.0 و بعد 14 ساعة من الحضن عند درجة حرارة 37 ْم .


Article
The Immediate Effect of Crude Miswack Extract against Some Bacterial isolates from Gingivitis
تأثير المباشر لمستخلص السواك الخام ضد بعض عزلات البكتيريا من التهابات اللثة

Author: Hayder Ali Muhammid حيدر علي محمد
Journal: journal of al-qadisiyah for pure science(quarterly) مجلة القادسية للعلوم الصرفة (فصلية). ISSN: 19972490 Year: 2016 Volume: 1 Issue: 21 Pages: 1-7
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

This study included the isolation and identification of some bacterial species which are considered as members of gingivitis in the student of Veterinary Medicine College in the University of Kerbala, Iraq . These include the of Streptococcus spp. was more involved in the third stage 70% percentage and Staphylococcus spp. was more isolated in the second stage 40% percentage by using Blood Agar medium and Manitol Salt agar, respectively. Identification of these bacteria was performed depending on morphological and biochemical crieteria, the study includes also the effect of the aqueous extract of Salvadora persica in the concentrations (20%, 15% and 10%) on the isolated bacteria which showed antimicrobial effects on these species under the study.Biology Classification: QR75-99.5

تضمنت الدراسة عزل وتشخيص بعض الجراثم المتواجدة في التهابات اللثة لدى بعض طلاب كلية الطب البيطري جامعة كربلاء/العراق والتي تـــشمل جـــراثيمspp. Streptococcus والتي كانت اكثر حدوثا في طلاب المرحلة الثالثة بنسبة 70% وجـــراثيم Staphylococcus spp. والتي كانت اكثر نسبة عزل 40% في طلاب المرحلة الثانية علـــى وســـط Blood agar ووسط Manitol Salt agar،على التوالي. وشخــصت باســتخدام الــصفات المظهرية والكيميوحيوية كما تضمنت الدراسة تحديد التأثير المثبط للمستخلص المـائي للسواك بتراكيز (20% و 15% و 10%) والذي اظهر فعالية تثبيطية على الانواع في قيد الدراسة


Article
Detection of Biofilm in Staphylococci isolated from different clinical infections
الكشف عن تكوين الغشاء الحيويBiofilm في بكتريا العنقوديات Staphylococci spp. متعددة المقاومة لمضادات الحياة والمعزولة من أخماج سريرية مختلفة

Author: م.د. ازدهار محمد جاسم
Journal: journal of the college of basic education مجلة كلية التربية الاساسية ISSN: 18157467(print) 27068536(online) Year: 2018 Volume: 24 Issue: 101/ علمي Pages: 54-62
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية

Loading...
Loading...
Abstract

This study aimed to detection of biofilm in multi drug resistant especially to beta –lactam of Staphylococci spp. isolated from different clinical infections ,which includes (burn swab, wound swab, ear swab, urine samples and pharynx swab ) , We obtained 12 isolates of staphylococci spp . six were to be S. aureus , while other six isolates were to be S .epidermidis characterised by laboratory of bacteriology in teaching baquba hospital and the characterised is certain by using vitek 2 compact system .Sensitivity of isolates against 6 antibiotics were performed by using Kerby-Bauer ,The isolates were appeared different resistant to antibiotics , the percentage of resistance of S. aureus isolates to Erythromycin ,clindamycin , Vancomycin , Gentamicin, Chloramphenicol and Ciprofloxacin were to be(66.7% , 50%, 33.3%, 66.7%, 50%, 33.3%)While the resistance to S.epidermidis to same antibiotics were to be (66.7%, 50%, 33.3%,33.3% 50%, 50%)Detection to Biofilm tests of Staphylococci spp. also performed , detect was performed by two methods micro titer plate and congo red agar , the results appeared that 4 isolates of S.aureus (66.7%) were positive results gave black growth and crystal density while 2 isolates (33.3%) were negative , while S.epidermidis isolates 5 isolates were positive and only one isolates was negative .while the microtiter plates 4 isolates of S.aureus were strong producer and 2 isolates were to be medium ,and S.epidermidis 3 isolates were to be strong producer and 3 other were to be medium.

هدفت الدراسة الحالية الى التحري عن تكوين الغشاء الحيوي Biofilm في عزلات من بكتريا المكورات العنقودية Staphylococci المتعددة المقاومة لمضادات الحياة ولاسيما البيتا لاكتام والمعزولة من مصادر سريرية مختلفة شملت (مسحات الحروق، مسحات الجروح مسحات الأُذن، عينات إدرار ومسحات البلعوم)، تمَّ الحصول على 12 عزلة 6 منها كانت عائدة لبكتريا S.aureus والـ6 الاخرى عائدة لبكتريا S.epidermidis مشخصة مختبريا" وتم تأكيد التشخيص بأستخدام جهاز Vitek 2 compact system في مختبر البكتريولوجي في مستشفى بعقوبة التعليمي .أُجري إختبار الحساسية لستة من مضادات الحياة بإستعمال طريقة Kerby- Bauer, أظهرت العزلات مقاومتها لمضادات الحياة بشكل متفاوت , وبلغت نسبة مقاومة عزلات S.aureus للمضاداتErythromycin وClindamycin وVancomycin و Gentamicin و Chloramphenicol و Ciprofloxacin (66.7%و50%و 33.3%و 66.7%و 50%و 33.3%)على التوالي . بينما بلغت نسبة مقاومة عزلات S.epidermidis لنفس المضادات (66.7%و50%و 33.3%و 33.3%و 50%و 50%) على التوالي.كما أُجري التحري عن تكوين العزلات البكتيرية للغشاء الحيوي بأعتباره عامل ضراوة مهما" في أحداث المرض ,تم الكشف بطريقتين وهي طريقة صفيحة المعايرة الدقيقةMicro Titer plate وطريقة وسط أحمر الكونغو Congo red agar , اظهرت النتائج ان 4 عزلات وبنسبة 66.7% من بكتريا S.aureus أعطت نتيجة موجبة اذ كان نمو المستعمرات باللون الاسود وذا كثافة بلورية وعزلتين كانتا سالبتين اذ بقي نموهما باللون الوردي وبنسبة 33.3% اما عزلات بكتريا S.epidermidis فكانت 5 عزلات منتجة للغشاء الحيوي وعزلة واحدة كانت سالبة لهذا الاختبار، أما بطريقة صفيحة المعايرة الدقيقة فاعطت 4 عزلات من بكتريا S.aureus انتاجية عالية وعزلتان انتاجيتهما متوسطة اما عزلات بكتريا S.epidermidis فكانت 3 عزلات انتاجيتها عالية و3 عزلات انتاجيتها متوسطة .


Article
An Identification of Staphylococcus spp. by PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) Analysis of dnaJ Gene and ApoI Enzyme
تشخيص الأنواع التابعة للمكورات العنقودية بوساطة تقنية PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism Analysis باستخدام الجين dnaJ والانزيم القاطع Apo

Author: Aws Ibrahim Sulaiman أوس ابراهيم سليما ن
Journal: Diyala Journal For Pure Science مجلة ديالى للعلوم الصرفة ISSN: 83732222 25189255 Year: 2019 Volume: 15 Issue: 04 Pages: 64-73
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

Genetic methods based on Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) are widely used for microbial species determination, in this study, PCR-RFLP technique was used to target the intragenic between 16S and 23S rDNA (dnaJ gene) for rapid detection and identification of twenty Staphylococcus species isolates. The RFLP analysis of the dnaJ gene and the digestive enzyme ApoI was designed for a rapid and accurate identification of the selected genome. In this assay, the conserved intragenic region between 16S and 23S fragments subsequently digestion of the amplicon with restriction enzymes. Therefore, dnaJ gene with digestive enzyme ApoI were studied to differentiate Staphylococcus genus. The results confirmed that S. epidermidis, S. hominis, and S. lugdunensis had 3 bands and S. aureus 4 bands. However, the restriction enzyme not fail but there are no restrict site in there amplified genome segment for S. haemolyticus, S. xylosus and S. auricularis. Our study found that a restriction enzyme ApoI does not benefit in classifying the species of the genus Staphylococcus spp.

تم دراسة الجين dnaJ مع الانزيم القاطع ApoI في تفريق الانواع التابعة لجنس Staphylococcus spp. بتقنية PCR-RFLP وجد ان الانواع Staph. epidermidis و Staph. hominis و Staph. lugdunensis يمتلكون 3 حزم، بينماStaph. aureus 4 حزم، ام ا بقية الانواع المتمثلة ب Staph. auricularis و Staph. haemolyticus و Staph. xylosus فقد فشل الانزيم القاطع ApoI بفصلهم الى حزم، تبين من دراستنا ان الانزيم القاطع لا يفيد في تصنيف الأنواعالتابعة لجنس المكورات العنقودية


Article
Detection, purification and characterization of a bacteriocin produced by Bacillus subtilis NK16 exhibits a significant antimicrobial activity against clinical Staphylococcus spp
كشف و تنقية وتوصيف البكتريوسن المنتج من عزلة Bacillus subtilis NK16 والذي اظهر فعالية ضد عزلات Staphylococcus spp المرضية

Authors: Fouad Najm Abd فؤاد نجم عبد --- Khalid Jaber Kadhum Luti خالد جابر كاظم
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2017 Volume: 14 Issue: 3 Pages: 524-538
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Bacteriocin is an important antimicrobial peptide that can be used in industrial and medical fields due to its characteristics of antibacterial, food preservation and anticancer activities. Fifty isolates of Bacillus sp were collected from different soil samples which were already recognized via morphological and biochemical identification process. The isolates were screened for bacteriocin production effective against Staphylococcus spp in order to select the highest producing isolate. The isolate NK16 showed the maximum bacteriocin production (80 AU/ml) which was further characterized as Bacillus subtilis NK 16 through using API identification system (API 20E and API 50CHB). Then, next step was to detect the optimal conditions for maximum bacteriocin production which were found to be brain-heart infusion broth as the best production medium with pH 6, 30oCand 2% inoculum size. Bacteriocin was partially purified by precipitation with ammonium sulphate and then separation with sephadex G-150 gel filtration. The specific activity of the resulted partial purified bacteriocin was increased to 853.33 AU/mg with 38 fold purification and 24% yield. The study of bacteriocin characterization revealed that the activity of bacteriocin was stable after 10 min at 20, 30, 40oC whereas 50% of the bacteriocin activity was lost after exposure to 50oC and decreased to approximately 20 AU/ml at 60,70 and 80 Co. In addition, bacteriocin activity showed stability at pH 6 and 7 for 30 min while it was decreased by approximately 50% at pH 5 and 8, and completely inhibited at pH 4 and 9. On the other hand, the investigation of mode of action showed that bacteriocin has a bactericidal activity. Antimicrobial activity tests of the partial purified bacteriocin displayed a significant activity against most clinical Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis isolates, whereas it was less effective against Staphylococcus saprophyticus isolates.

يعد البكتريوسن مضاد بكتيري ببتيدي مهم يستخدم في العديد من المجالات الصناعية والطبية بسبب خواصة المضادة للبكتريا, فضلا عن فعاليته المضادة للسرطان. تم جمع خمسون عزله من بكتريا Bacillus sp من عينات مختلفة من التربة والتي تم التحقق منھا من خلال تشخيص ودراسة بعض الصفات الظاهرية وألفحوصات الكيموحيوية. تم اختبار قدرةعزلات بكتريا Bacillus sp على انتاج البكتريوسين ومن ثم اختيار العزلة الاكثر انتاجا حيث اظهرت العزلة NK16اعلى انتاج للبكتريوسين بمقدار 80 وحدة /مل. استخدمت تقنية API identification systemباستخدامAPI 20E وAPI 50CHB من اجل تشخيص هذه العزله على مستوى النوع حيث تبين انها تعود لبكترياBacillus subtilis . الخطوة التالية كانت لتحديد الظروف المثلى لاعلى انتاج من البكتريوسين ووجد ان الوسط السائل نقيع القلب والدماغ كانافضل وسط للانتاج مع رقم هيدروجني (pH) , درجة حراره 30 م وحجم اللقاح % 2. تمت نقية البكتريوسين جزئيا بعدة خطوات اشتملت الترسيب بكبريت اتالامونيوم بنسبة اشباع % 80 ومن ثم الفصل بالترشيح الهلامي بواسطة عمودSephadex G-150 . اظهرت النتائج ان فعالية البكتريوسن قد ارتفعت الى 853.33 وحده/ملغم مع عدد مرات تنقيه 38 مره وبحصيله مقدارها %24. بينت نتائج التوصيف ان البكتريوسين احتفظ بفعاليته ولمدة 10 دقائق في درجة حراره 20 و 30 و 40 م بينما فقدت %50 من فعالية البكتريوسين نتيجة التعرض لدرجة حرارة 50 م وانخفضت الفعاليه الى 20 وحدة/مل عند درجة حرارة 60 و 70 و 80 م. بالاضافة لىذلك, احتفظ البكتريوسين بكامل فعاليته عند الرقم الهيدروجيني 6 و 7 لمدة 30 دقيقة واختفت كليا عند الرقم الهيدروجيني 4 و 9. من جهة اخرى اظهرت النتائج ان البكتريوسين كان ذو تأثير قاتل للبكتريا. تم اختبار فعالية البكتريوسين المنقى جزئيا كمضاد بكتيري وقد اظهرت النتائج ان البكتريوسين كان اكثر فعالية ضد معظم بكتريا S. aureusو S. epidermidis المرضية, بينما كان اقل تاثيرا ضد عزلات S. saprophyticus.


Article
Molecular Identification of StaphylococcussppIsolatedfrom Clinical samples
عزل وتشخيص المكورات السريريه باستخدام الاوساط الزرعيه والجزيئيه (دراسه مقارنه)

Author: TaghreedKhudhur Mohammad تغريد خضر محمد
Journal: Jornal of Biotechnology Research Center مجلة مركز بحوث التقنيات الاحيائية ISSN: 18151140 Year: 2018 Volume: 12 Issue: 1 Pages: 14-24
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

The analysis of 16S rRNA gene sequences has been the technique generally used to study and confirm the identification andtaxonomy of staphylococci. However, bacterial species cannot always be distinguished from each other using cultural methods. Thus,clinicalsamples were collected from 190 cases only 31 positive for staphylococcal infections withUrinary Tract Infection, Wounds, Burns, Otitis media, diarrhea infections, were applied for microbiological analysis which include: cultures onManitol salt agar and HiCrome UTI Agar medium all the isolates gave positive golden yellowand identify as Staphylococcusspp. DNA was extracted fromStaphylococcussppand the 16srRNA gene were amplified by using specific primer, then sequencing of nucleic acid of genes was performed by machine is AB13730XL, Applied Biosystem, Macro gen company,the DNA sequencing results of flank sense of 16srRNA gene from 31strains of Staphylococcuswas confirm the identification into species level: Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidisAnd Staphylococcus sciuri.Analysis of the sequences appeared that there two substitution(Transversion, Transition) in the Staphylococcusaureusstrains with Sequence IDLC090540.1 location at Range of nucleotide from 4 to 636, 100% compatibility with NCBI while no substitution appeared in the Staphylococcus haemolyticusstrains which have thesequence IDLN998078.1, 99% compatibility with NCBIalso the sequence ID KR812401.1 which related to the strain Staphylococcussciuri not appeared any substitution after sequencing analysis.Types of substitution detected in partial16srRNA gene inStaphylococcus epidermidisstrains 13 Transversion and 5 transition substitutionlocation at range of nucleotide from 6 to 1026 have the Sequence IDKF575160.1 compared with data obtained from Gene Bank, these finding lead to conclusion,our assay allows rapid and confirm the detection to avoid possibility of misidentification of Staphylococcus species based on cultural analysis, the study aimed to propose the partial sequencing of the gene as an alternative molecular tool for the analysis of Staphylococcus species and for decreasing thepossibility of misidentification. New submission of local Iraqi Staphylococcus clinical isolated during the current study show successfully record of four isolate Staphylococcus sciuri,Staphylococcus epidermidis,Staphylococcus aureus andStaphylococcus haemolyticuswith GenBank accession number: KY938530.1,KY938529.1,,KY938528.1, and GenBank: KY938527.1respectivelly.

استخدم تتابع الجين الرايبوسومي كتقنيه لتأكيد تشخيص وتصنيف المكورات لأن العزلات البكتيريه لانستطيع تمييزها عن بعضها باستخدام الطرق المزرعيه لذلك هدفت الدراسه الحاليه الى تشخيص الأنواع التابعه للمكورات السريريه باستخدام الطرق المزرعيه والجزيئيه ولتحقيق الهدف تم جمع 190 عزله بكتيريه أظهرت النتائج ان 31 فقط منها تابعه لجنس المكورات تم عزلها من أخماج السيل البولي، التهاب الاذن الوسطى، الحروق، الجروح، والاسهال، اخضعت العزلات للتحليل الكيموحيوي المتضمن زرعها على وسط أكار ملح المانيتول و الكروم أكار أظهرت جميع العزلات اللون الأصفر الذهبي ممايعني انها تابعه لأنواع جنس المكورات، عزل الدنا المجيني من المكورات ومضاعفته باستخدام باديء متخصص وعمل تسلسل للحامض النووي للجينات وأظهرت نتائج تسلسل الحامض النووي انه تم تأكيد تشخيص من بين 31 عزله من المكورات هنالك 21 عزله تابعه للمكورات العنقويه الذهبيه و 8 عزلات تابعه للمكورات العنقوديه الحاله للدم و عزله واحده تابعه للمكورات العنقوديه البشرويه وعزله تابعه للمكورات العنقوديه السنجابيه بعد اجراء تحليل تسلسل الحامض النووي تبين ان هنالك 16 موقع استبدال في الجين 16 الرايبوسومي من خلال تحليلنا تبين ان هنالك امكانيه لعمل فحص سريع و أكيد للتعرف على انواع المكورات العنقوديه لتجنب امكانيه الخطأ في التشخيص بالاعتماد على الفحوصات المزرعيه لذلك نقترح باستخدام تحليل الحامض النووي كوسيله جزيئيه لتشخيص المكورات العنقوديه وهذا يقلل امكانية الوقوع في الخطأ أثناء التشخيص.سجلت اربع عزلات محليه للمكورات في المركز العالمي لمعلومات التقنيه الحيويه المعزوله خلال الدراسه للعزلات المكورات العنقودية سسيوري، المكورات العنقودية البشروية، المكورات العنقودية الذهبية والمكورات العنقودية المحلله للدم واللتي تم اعطائها رقم وصول لبنك لجينات العالميه:KY938530.1 ,KY938529.1,,KY938528.1, KY938527.1 بالتتابع.


Article
MOLECULAR DETECTION OF erm(A), mef(A) IN Staphylococcus spp AND Streptococcus spp RESISTANT TO MACROLIDE FROM DIFFERENT CLINICAL INFECTIONS
الكشف الجزيئي للجين erm(A) وmef(A) فيStaphylococcus spp. وStreptococcus spp المقاومة لمضادات المايكرولايد والمعزولة من مصادر سريرية مختلفة

Author: Hadi R. Rasheed Al-Taai هادي رحمن رشيد الطائي
Journal: Diyala Journal of Agricultural Sciences مجلة ديالى للعلوم الزراعية ISSN: 20739524 Year: 2017 Volume: 9 Issue: 3 Special Pages: 1-15
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

Isolates Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus saprophyticus, Staphylococcus albus, Streptococcus Pyogenes and Streptococcus agalactiae isolated from different clinical infections were activated. Results of susceptibility test showed that Staphylococcus aureus have resistance to antibiotics of erythromycin, azithromycin and clindomycin with percentage 45%, 45% 25% respectively, while Staphylococcus epidermidis resistant to erythromycin, azithromycin and clindomycin with ratio 66.6%, 44%, 22.2%, respectively. The resistance of erythromycin and azithromycin by Streptococcus pyogenes reached 25% and 37.5% respectively, whereas all isolates sensitive to clindomycin. The outcome disclosed that the values of minimum inhibitory concentrations of erythromycin ranged between 32 - ≥ 64 µg/ mL for all isolates. The results outcomes to 13(65%) isolates of Staphylococcus aureus produced Staphylokinase, 6(66.6%) isolates of Staphylococcus epidermidis able to produce the same enzyme. The results proved that 3(37.5%) isolates of Streptococcus pyogenes able to produce Streptokinase enzyme, but Streptococcus agalactiae could not produce streptokinase. The PCR-based assay, gene was detected in erm (A) gene was detected in 33.3% isolate of Staphylococcus spp. and 50% of Streptococcus spp, whereas mef (A) was detected in 46.6 % isolates of Staphylococcus spp. and 50% of Streptococcus spp .These findings demonstrated the variable phenotypic expression when compared to genotypic detection .

نشطت العزلات البكتيرية Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis، Staphylococcus saprophyticus ,Staphylococcus albus،Streptococcus pyogenes ، Streptococcus agalactiae والمعزولة من مصادر سريرية مختلفة. اظهرت نتائج فحص الحساسية ان Staphylococcus aureus قد قاومت مضاداتerythromycin وazithromycin وClindomycin بنسب 45% و 45% و 25% على التوالي، بينما كانت مقاومة Staphylococcus epidermidis لنفس المضادات بنسب 66.6% و44% و22.2% على التوالي. مقاومة المضادين erythromycin ، azithromycin من قبل Streptococcus pyogenes وصلت الى 25%، 37.5% بينما جميع العزلات حساسة لـ Clindomycin ونسبة 100%. اوضحت النتائج ان التركيز المثبط الادنىMIC لـerythromycin كان32 - ≥ 64 مكغم مل-1. ان 13 (65 %) من عزلات Staphylococcus aureus منتجة لانزيم Staphylokinase وان 6 (66 %) Staphylococcus epidermidis منتجة لنفس الانزيم. بينت النتائج ان 3 (37%) Streptococcus pyogenes انتجت انزيم Streptokinaseولكن Streptococcus agalactiaeلم تستطع انتاج الانزيم. نتائج تقنية PCR كشفت تواجد الجين (erm (A في 33.3% من عزلات Staphylococcus spp و 50% من عزلات Streptococcus spp. بينما بينت النتائج تواجد جين mef (A) في 46.6% من عزلات Staphylococcus spp و 50% من عزلات Streptococcus spp. بينت النتائج هناك تنوع في النمط المظهري مقارنة بالنمط الوراثي.


Article
The Effect of Partial Replacement of Rice Husk Instead of Corn and Nourishment with Probiotic and Enzymes Combination on Intestine Bacterial Population in Juvenile Common Carp(cyprinus carpio L). 1. The Effect on Staphylococcus spp. and Escherichia coli
تأثير الاحلال الجزئي لسحالة الرز بدلا من الذرة الصفراء والتدعيم بخليط المعزز الحيوي والانزيمات التجارية في مجتمع بكتريا الامعاء لصغار اسماك الكارب الشائع (Cyprinus carpio L.)1. التأثير في بكتريا Staphylococcus spp. و Escherichia coli

Loading...
Loading...
Abstract

This study was conducted to determine the effect of partial substitution of rice husk instead of corn (25% and 50%) and reinforcement with probiotics on bacterial population in common carp larvae stomach. The results showed that the replacement of rice husk induced reduction in the population of Staphylococcus spp. which recorded 5 ×103 , 0.6 ×103 bacteria of both percentages of replacement 25% and 50% respectively . Regarding the effect on Escherichia coli , the replacement treatments induced reduction in bacterial population which recorded 4 × 104, 10 ×104 bacteria and the treatment of reinforcement with probiotic which recorded 1 × 104, 10 × 104 bacteria respectively. The results also showed that the effect of replacement in tested bacterial population was decreased as the percentage of replacement increased from 25% to 50% for Staphylococcus spp. which recorded 5 ×103 and 0.6 × 103 bacteria while Escherichia coli population was increased which recorded 4×104 to 6×10 4 bacteria respectively .

نفذت هذه الدراسة لتحديد اثر الاحلال الجزئي لسحالة الرز محل الذرة الصفراء بنسبتي احلال 25% و 50% والتدعيم بالمعزز الحيوي في سكان بكتيريا Staphlococcus spp. و Escherichiacoliفي امعاء صغار الكارب الشائع Cyprinus Carpio L ، اظهرت النتائج أنخفاضاً في مجتمع بكتريا Staphylococcus اذ سجلت كثافة عددية مقدارها 5×103 بكتريا و 0.6×103 بكتريا لنسبتي الاحلال 25% و 50% على التوالي ، اما مجتمع بكتريا Escherichia coli فاحدثت معاملتا الاحلال خفضا للمجتمع وبلغ 4×104 و 10× 104 ومعاملتا اضافة خليط المعزز سجلت 1×104 و 10×104 كما واظهرت نتائج تأثير نسبتي الاحلال في مجتمع البكتريا المدروسة ان زيادة نسبة الاحلال من 25% الى 50% احدثت أنخفاضاً في مجتمع بكتريا Staphylococcus spp. اذ سجلت 5×103 و 0.6×103 لكلا نسبتي الاحلال على التوالي في حين ازداد مجتمع البكتريا Escherichia coli بزيادة نسبة الاحلال اذ سجل 4×104 و 6×104 على التوالي

Listing 1 - 10 of 10
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (10)


Language

English (7)

Arabic (3)


Year
From To Submit

2019 (1)

2018 (3)

2017 (3)

2016 (1)

2015 (1)

More...