research centers


Search results: Found 11

Listing 1 - 10 of 11 << page
of 2
>>
Sort by

Article
Genetic Comparative Study of Staphyolococcus aureus& Staphylococcus epidermidis Isolated from Wounds, Burns and Skin Flora
دراسة وراثية مقارنة لبكتريا المكورات العنقودية الذهبية و العنقوديه البشرونيه المعزولة من أخماج الجروح و الحروق و الفلورا الطبيعية

Authors: Hala S. Abdul-Kareem هالة سالم عبد الكريم --- Ali S. Husain علي صالح حسين
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2015 Volume: 56 Issue: 1C Pages: 708-712
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

One hundred specimens from wounds, burns, and skin swabs were collected from patients laying and attended to Balad general hospital. It was found that 50 isolates belong to Staphylococcus spp., 38 isolates were identified as S. aureus and 12 isolates were identified as S. epidermidis according to microscopic, cultural and biochemical testing. The study of seven extracellular enzyme as virulence factors including the enzymes: urease, lipase, DNase, haemolysin, coagulase, β-lactamase, and lecithinase. Reavealed that 100% of S.aureus had the ability to produce these enzymes, while S. epidermidis isolates were unable to produce the enzymes DNase, lipase, coagulase, but they were capable to produce haemolysin, urease, lecithinase, and β-lactamase, the range for production of these factors were 58.33 %,80,%, 10,%, and 45% respectively.Eighteen Staphyolococcus isolates were selected according of their ability for production most of studies virulence enzymes for detection of genes encoding for the enzymes heamolysine (hly) and coagulase (coa) by using of polymerase chain reaction (PCR) technique. The Gene hIy was detected in all isolates and coa was detected in 14 isolates only

جُمعت 100 عينة من أخماج جروح وحروق ومسحات جلدية من مرضى مراجعين وراقدين في مستشفى بلد العام , وبواقع 50مسحة من الجروح و 25 مسحة من الحروق و 25 مسحة من جلد المرضى . وجد ان 50 عزلة تعود لجنس Staphylococcus منها 38 عزلة تم تشخيصها على انها S. aureus و 12 عزلة تعود الى النوع S. epidermidis , شُخصت العزلات أعتماداً على الصفات المظهرية والزرعية والاختبارات الكيموحيوية . بينت دراسة أنتاجية بعض عوامل الفوعة و لسبعة إنزيمات خارج خلوية شملت كل من الإنزيمات : urease, lipase, DNase, haemolysin, Coagulase, β –lactamase, lecithinase أن كل عزلات S.aureus كانت لها القدرة على أنتاج كل تلك العوامل وبنسبة %100 , بينما كانت عزلات S.epidermidis غير منتجة للإنزيمات DNaseو coagulaseو lipase, لكنها أنتجت كل من انزيمات haemolysin,urease,lecithinase,β-lactamase وبنسب انتاج تراوحت %58.33,%80,%10.%45 على التوالي. انتخبت 18 عزلة من عزلات staphylococci اعتمادا على قدرتها في أنتاج أغلب عوامل الفوعة لتقيم وجود الجينات المشفرة للانزيمات , coagulase(coa) (haemolysin(hIy بواسطة تقنية تفاعل البلمرة التضاعفي المتسلسل polymerase chain reaction(PCR) .تبين وجود الجين hIy في جميع العزلات المدروسة ,بينما تواجد الجين coa في 14 عزلة فقط .


Article
Virulence factors genes and phylogenic groups of Escherichia coli isolated from High Vagina and Endo-cervix of Women from Kerbala

Authors: Enaas K .AL-Khalide --- Mohannad Mohsin Ahmed --- Zuhair Hameed Abood
Journal: Karbala Journal of Medicine مجلة كربلاء الطبية ISSN: 19905483 Year: 2015 Volume: 8 Issue: 2 Pages: 2292-2296
Publisher: Kerbala University جامعة كربلاء

Loading...
Loading...
Abstract

background: Eschrechia coli (E. coli) is the most common colonizing bacteria of the genitaltract however, its status as a cause of genital tract infections is questionable.Aims of the study: To study the virulence and phylogenic groups of E coli strains isolated from high vagina and endo-cervix.Materials and Methods: A total of 100 female patients were enrolled in this study. All patients were attendants of the Gynecology and Obstetrics Teaching Hospital in Kerbala , holy kerbala. Iraq in the period from December 2013 to January 2015. E. coli isolates were identified by standard methods. Molecular diagnosis and characterization for virulence and phylogenic genes were detected by Multiplex PCR. Results and Discussion: Among 65 isolates recovered in this study, the most frequent phylogenic group of E. coli was "B2" which comprised 61.5% (no= 40) followed by "Phylogenic group A" that comprised 33.8% (no= 22). Previous studies have shown that phylogenetic groups B2 and D are virulent because these groups are associated with the presence of several virulence factors. Interestingly, 9 out of 10 isolates from women who their husband using condoms were shown to be of B2 phylogenic group. Frequencies of virulence genes of adhesion Pap, Sfa and Afa, among E.coli isolates were 14, 42 and 5, respectively. In addition, Pap C and Sfa were found in higher rates in phylogenetic group B2 isolates, and this gives more support to the hypothesis that B2 is the pathogenic group. Conclusions: Most of the E. coli isolates were belong to the virulent phylogenic group “B2” and that those isolates harbor several virulence factors. Accordingly, E coli may be considered as a true genital tract pathogen and its colonization entails great risk for vertical transmission to the fetus and fetal membrane.


Article
Some Virulence Factors Genes and Phylogenic Groups of Uropathogenic Escherichia Coli (UPEC) Isolated from Karbala Patients

Authors: Ahmed K. A AL-Ganimi --- Jawad K.T AL-Khafaji
Journal: Karbala Journal of Medicine مجلة كربلاء الطبية ISSN: 19905483 Year: 2016 Volume: 9 Issue: 1 Pages: 2376-2385
Publisher: Kerbala University جامعة كربلاء

Loading...
Loading...
Abstract

background: Uropathogenic Escherichia coli (UPEC) is most important causative agent of urinary tract infection (UTI). This disease is still big health problem among human population in spite of scientific progress.Aims: aims of this study were to investigate the isolates of UPEC in patients with UTI, characterize the virulence factors and phylogenic groups among clinical isolates.Materials and Methods: A total of 150 urine specimens were collected from patients with UTI after establishing the diagnosis via investigation and clinical diagnosis in Al-Hussein Hospital, Gynecology and Obstetrics Hospital, and Children Hospital in Karbala province during the period from November 2013 to April 2014. Thirteen stool samples from apparently healthy individuals as control group were included. All E. coli isolates were identified by standard methods. Molecular diagnosis and characterization for virulence and phylogenic genes were detected by Multiplex PCR technique in medical researches laboratory of medical college at Karbala University.Results and Discussion: This study showed that 56/150 patients (37.3%) had UTI due to UPEC. The isolated UPEC were examined for the presence of the adhesion genes (Papc, Afa and Sfa) and the phylogeny groups’ genes by Multiplex PCR assays. The primers encoding virulence genes were tested against to all the 56 UPEC and 13 stool isolates. It was found that 27(48.21%) urine isolates carried just one virulence factor, of them 16(28.57%) isolates carrying papc, 2(3.57%) isolates carrying afa and 9(16.07%) isolates carrying sfa. No isolates out of 56 had carried all the three genes. However, no virulence factor was found in 24 (42.85%) isolates. Pap gene was found mostly in 7 isolates among patients aged (1-10 years) and (21-30 years); while, the prevalence of sfa gene was found in 7 isolates (50%) among patients aged (31-40 years); however, two isolates have afa gene it was in one isolate in each age group (1-10 years) and (41-50 years). The percentage of phylogenic groups of UPEC isolates belonging to B2 followed by D, A and B1, were 39.28%, 33.92%, 16.07% and 10.71% respectively; while in control group the results were A (53.84%), B2 (23.07%), B1 (15.38%) and D (7.69%).Conclusions: Its̓ concluded that the genes of virulence factors of UPEC isolates in patients with UTI were higher than in healthy persons. Significantly, E. coli strains responsible for UTI were far more likely to be members of phylogenic groups B2 or D than A or B1.


Article
Molecular Detection of virulence factor genes in pseudomonas aeruginosa isolated from human and animals in Diwaniya province
التشخيص الجزيئي لجينات عوامل الضراوة في الزوائف الزنجارية المعزولة من الانسان والحيوان في محافظة الديوانية

Author: Azhar Abdulsada Neamah
Journal: Kufa Journal For Veterinary Medical Sciences مجلة الكوفة للعلوم الطبية البيطرية ISSN: 20779798 Year: 2017 Volume: 8 Issue: 1 Pages: 218-230
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

Virulent factors are molecules that produced by pathogenic Pseudomonas aeruginosa that enable it to play a great role in causes of the disease , these virulence factors encoding by virulence genes located in the chromosome of Pseudomonas aeruginosa. However, this study was examined four virulence factors genes included (toxA) that encoding to exotoxin A , (exoS) that encoding to exoenzyme S , outer membrane protein (oprL), and outer membrane lipoprotein I (oprI) that encoding surface protein (lipoprotein) by use PCR technique based using specific primers were design in this study.(50) swab samples were collected from human clinical infection samples from Al-Diwanyia hospital, and (30) milk samples were taken from cattle milk that infected by mastitis from different fields in Al-Diwanyia province. The samples were cultured on selective media and then extracted DNA followed by PCR technique to detect the virulence genes. The results were shown a clear difference in isolation of P. areuginosa isolates from human and animal source. Where, in human the percentage of P. areuginosa in wound was (42.8%),in the burn was (70%) , and Otitis media was (68.7%), while, in cattle the percentage of P.aeruginosa in milk was (26.6%); Where percentage of ToxA genes was (100%) in the wound and cow milk; and it was (92.8%) and (81.8%) in burn and Otitis media respectively. while , exoA gene were (66%) , (57.1%), (45.4%) and (75%) while were oprL gene was (50%) ,(50%) , (54.5%) and (50%) , oprI were (66%) ,(42.8%) , (54.5%) and (50%) in Wound , Burn, Otitis media , Cattle milk isolates respectively .In conclusion,use of PCR technique which given high specific and accurate results for detection of virulence factors genes in P.aeruginosa isolates that responsible for cause in disease in human and animals.

جزيئات عوامل الضراوة تنتج بواسطة الزوائف الزنجارية المرضية التي تلعب دورا كبيرا في سبب بعضالامراض ,هذه عوامل الضراوة تشفر بواسطة جينات الضراوة الموجودة في مورثات جرثومة الزوائفالزنجارية . ان هذه الدراسة اختبرت اربعة جينات تتضمن )تي او اكس اي( الذي يشفر لبروتين الاكسوتوكسيناي والمورثة )اي اكس او اس ( الذي يشفر لبروتين )اكسوانزايم اس( , وجين بروتين الغلاف الخارجي ال ) اوبي ال ( , وبروتين الغلاف الخارجي اي ) او بي اي ( بواسطة استخدام تفاعل السلسلة المتعدد طبقا الى استخدامبادئات خاصة صمتت لهذه الدراسة .خمسين عزلة او مسحة جمعت من عزلات اصابات سريرية من مستشفىالديوانية وثلاثين عزلة حليب اخذت من ابقار مصابة بواسطة التهاب الضرع في حقول مختلفة في محافظةالديوانية . هذه العينات زرعت على اوساط زرعيه انتخابية ومن ثم استخلص المادة الوراثية ) الدي ان اي (بواسطة تقنية تفاعل السلسلة المتعدد لتشخيص مورثات الضراوة . النتائج اظهرت اختلاف واضح في عزلاتالزوائف الزنجارية من المصادر البشرية والمصادر الحيوانية حيث في البشر فان نسبة الزوائف الزنجارية في8%( وفي الحروق كانت ) 07 %( اما الاذن الوسطى كانت ) 74.0 %( بينما في الابقار كانت .. الجروح كانت ) 47.7 .%(. حيث كانت نسبة المورثة )تي اكس او اي ( كانت ) 077 %( في الجروح وحليب الابقار وكانت (%8 ( و ) 40.4 %( في الجروح والاذن الوسطى على التوالي . بينما كانت المورثة ) اي اكس او اي ( كانت ..4(18.1 %( و (, )%17(, )% %81.8 ( و ) 01 %( بينما جين ) او بي ار ال ( كانت ) 17 ( , )%10.0( ,)%77(18.1 %( و ) 17 %( في عزلات الجروح والحروق (, )%8..4 ( , )% %17 ( والمورثة ) او بي ار اي ( ) 77 (والاذن الوسطى وحليب الابقار على التوالي . نستنتج ان تقنية تفاعل السلسلة المتعدد اعطى خصوصية عاليةونتائج دقيقة في تشخيص جينات عوامل الضراوة في جرثومة الزوائف الزنجارية المسؤولة عن احداث امراضفي البشر والحيوانات


Article
Genotypic Study of Two Virulence Factors fimH and kpsMTII in Uropathogenic Escherichia coli Isolates from Children Patients with Urinary Tract Infections
دراسة وراثية لأثنين من عوامل الضراوة fimH و kpsMTII لبكتريا ايشريشيا القولون الممرضة للمجاري البولية والمعزولة من الأطفال المصابين بالتهاب المجاري البولية

Authors: Zaid N. Abass زيد نصيف عباس --- Khalid A. Habib خالد عبد الرزاق حبيب --- Zahraa A. Abed زهراء عباس عبد
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2014 Volume: 11 Issue: 4 Pages: 1475-1480
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Adhesion (type 1 fimbriae) and host defense avoidance mechanisms (capsule or lipopolysaccharide) have been shown to be prevalent in Escherichia coli isolates associated with urinary tract infections. In this work, 50 uropathogenic Escherichia coli (UPEC) isolated from children with urinary tract infections were genotypically characterized by polymerase chain reaction (PCR) assay. We used two genes; fimH and kpsMTII, both of them previously identified in uropathogenic E.coli (UPEC) isolates. The PCR assay results identified fimH (90.0)% and kpsMTII (72.0)% isolates. In the present study, was also demonstrated that these genes may be included in both or one of them within a single isolate.

جمعت 50 عز لة لاشرشيا القولون من ادرار لاطفال يعانون من التھابات المجاري البولية وقد تم استخدام تقنية سلسلة تفاعل البلمرة مع استخدام باد ئات متخصصة للكشف عن جين الضراوة المشفر لبروتينات عامل الالتصاق (النوع الاول من الاهداب fimH ) وجين الضراوة المشفر لبروتينات المحفظة او الغشاء الدهني متعدد السكر ( kpsMTII) وكا نت نسبة و جود جين عامل الالتصاق 90.0 % بينما نسبة وجود الجين المشفر لبروتين المحفظة. 72.0% و اثبتت الدراسة امتلاك بعض العزلات لاحد الجينين بينما وجد كلا الجينين في عزلات اخرى.


Article
Bacteriological Characterization OF Some Gram Negative Bacteria Isolated From Vaginal Infections
التوصيف البكتريولوجي لبعض اجناس البكتريا السالبة لملون غرام المعزولة من أخماج المهبل في مدينة بعقوبة وضواحيها

Authors: Hadi R Rasheed AL-Taai هادي رحمن رشيد الطائي --- Abass A. Frhan عباس عبود فرحان --- Zwida K. Khadur زويدة كاظم خضير
Journal: Diyala Journal For Pure Science مجلة ديالى للعلوم الصرفة ISSN: 83732222 25189255 Year: 2017 Volume: 13 Issue: 2 - part 3 Pages: 222-241
Publisher: Diyala University جامعة ديالى

Loading...
Loading...
Abstract

This study included collection 410 samples of vaginal swabs from patients woman's in hospitals of Baquba city for the period from 1/9/2015 to 31/12/2015.The results showed that the highest percentage of vaginitis in pregnant woman(65%) than in both nonpregnant and nonfruitl (30%,5%) respectively The results refer that (24%)Escherichia coli, (20%) Proteus mirabilis by using diagnostic phenotypic ,biochemical test and conifirm the diagnosis using VITEC 2 analyser The results of the investigation of some virulence factores showed the isolstes of Escherichia coli and Proteus mirabilis produce of haemolysin with percentage (50%) and(90%) respectively. The results showed that all isolates of Proteus mirabilis were produced urease by(100%),while the results detect that the isolates of Escherichia. coli is not able to produce this enzyme. The results showed that isolates of Proteus mirabilis produced protease by (45%), while Escherichia coli have not ability to produce this enzyme. Results showed that all isolates of Escherichia coli have ability to adhesion surface of epithelial cells of human by(100%),while the isolates Proteus mirabilis showed ability to adhesion by(85%).The minimum inhibitory concentration MIC for 6 antibiotics, that Ampicillin, Amoxicillin ,Amekacin ,Cefotaxime,Gentamycin ,Tetracycllin was determined .The MIC values of these antibiotics ranged between (512-1025≥),(32-1024≥),(4-64),(8-1024),(4-128),(4- 512)µml,respectively. The minimum inhibitory concentration MIC for disinfectant povidone iodine10%, chloroxyzylenol 3%(50,100,200,300,400,500)µ ml,respectively. Results Combination antibiotic Gentamycin and disinfectant povidone iodine10% reduced the ability of isolates for adherence.The results showed averiance as far their resistance to these antibiotics of Escherichia coli and Proteus mirabilis showed highest resistance rate 100% for Ampicillin and Amoxicillin.

تضمنت هذه الدراسة عزل و تشخيص بعض انواع البكتريا السالبة لملون غرام المعزولة من أخماج المهبل من خلال فحص 410 عينة (مسحات مهبلية)من نساء حوامل ,غير حوامل ,عقيمات تروحت أعمارهن من((65-15 سنة في مدينة بعقوبة وضواحيها يعانين من التهاب المهبل للفترة 2015/9/1 لغاية 2015/12/31م. بينت النتائج ارتفاع نسبة الاصابة لدى النساء الحوامل إذ شكلت نسبة 65% بينما نسبة الإصابة لغير الحوامل و العقيمات كانت 30%,5% على التوالي, اخضعت العزلات للفحوصات الكيموحيوية والبكتريولوجية إذ تبين ان بكتريا Escherichia coli 24% تليها Protease mirabilis بنسبة 20%, وتم تأكيد التشخيص باستخدام نظام VITEk2, أوضحت نتائج التحري عن بعض عوامل الضراوة لعزلات Escherichia coliوعزلاتProteus mirabilis ان العزلات منتجة للهيمولايسين بنسبة 65%,90% على التوالي, أما فيما يخص انتاج انزيمي اليورييز و البروتييز فقد إظهرت النتائج قابلية عزلات Proteus mirabilis لأنزيم اليورييز بنسبة%100 و %45لأنزيم البروتييز أما عزلاتEscherichia coli فكانت غير منتجة لكلا الانزيمين, أوضحت الدراسة الحالية على قدرة التصاق عزلات Escherichia coliبالخلايا الطلائية البولية وبنسبة %100 بينما التصاق Proteus mirabilis بنسبة%85. حدد التركيز المثبط الأدنى MIC ل6 من مضادات الحياة وهي Ampicillin Amikacin,Amoxicillin,Cefotaxim,Tetracycline,Gentamycin , , وقد تراوحت هذه القيم من512-≤1024, 32 -≤1024, 8-1024, 4 -128,4 -<64, 4 – <512 مكغم /مل على التوالي. حدد التركيز المثبط الأدنى MIC لكل من اليود الكحولي Povidone Iodine10% والكلوروزايلينول (الديتول3%( وقد تراوحت التراكيز من50 ,100,200,300,400,500مكغم/مل على التوالي. اختبرت حساسية العزلات الجرثومية قيد الدراسة تجاه (13) مضاد حياتي, أظهرت جميع العزلات مقاومة لمضادي Ampicillin وAmoxicillin وبنسيبة 100%,اما بالنسبة للمضادين Gentamycin,Amikacin فقد كانت نسبة المقاومة 12.5%,%16.6, وأن Imipenemهو المضاد الحياتي الأكثر تأثيرا على العزلات قيد الدراسة و بنسبة 100 %. بينت النتائج ان خلط المضاد Gentamycin و المحلول المطهر Povidone Iodine10%يثبط التصاق البكتريا بالخلايا الطلائية.


Article
Epidemiological prevalence of cutaneous Leishmaniasis In immigration people in Al-Qadissyia province
دراسة انتشار داء اللشمانيا الجلدية بين النازحين في محافظة الديوانية وتشخيص طفيلي Leishmania.major باستخدام تقنية بلمرة الحامض النووي PCR

Authors: A. A. Seaad أصيل عبد الرضا سعيد --- S. R. Abdulah صفاء رسن عبد الله --- S. F. Kelef صبا فلاح كليف
Journal: Al-Anbar Journal of Veterinary Sciences مجلة الانبار للعلوم البيطرية ISSN: 19996527 Year: 2017 Volume: 10 Issue: 1 Pages: 77-83
Publisher: University of Fallujah جامعة الفلوجة

Loading...
Loading...
Abstract

This study were conducted an epidemiological survey of prevalence cutaneous leishmaniasis in immigration people in Al-Diwaniyah city center, included shamiaa, Dagharah, Afak Sannia, eastern Hamzah, and al boddier in the period from September 2014 until April 2015 the results showed that the high population density in the province has played a role in the high rate of infected as a result of to population movements and migration of political instability, which recently witnessed diameter and Results showed diagnosed about 62 with percentage (1.58%) from 4007 individual infection cases by leishmania cutaneous. The study included some of the districts of the province where she was the highest in the district of the eastern Hamzah, and Afak by (29, 19.4)% respectively, it was noted that the highest prevalence of cases where it a through monthly January and February 2015 (17.74, 25.81)% respectively recorded infection rate among children under the age of 15at ratio 46.5% while infected rates declined with age progress. For the diagnosis and determine the type of parasite the results showed by PCR technique that 21 out of 62 sample is Leishmania major, with percentage 33.78%

تضمنت هذه الدراسة إجراء مسح وبائي لحالات الإصابة باللشمانيا الجلدية بين النازحين في كل من مركز مدينة الديوانية، والشامية, والدغارة, وعفك, والسنية, والحمزة الشرقي, والشافعية وال بدير وللمدة من أيلول 2014 ولغاية نيسان 2015. حيث سجلت هذه الدراسة تشخيص 21 عزلة من اصل 62 عينة من اللشمانيا الجلدية من طفيليmajor Leishmanial ان ارتفاع الكثافة السكانية في المحافظة قد لعب دورا هام في ارتفاع نسبة الإصابات باللشمانيا الجلدية نتيجة لحركة تنقل السكان وهجرتهم لعدم الاستقرار السياسي الذي شهده القطر مؤخرا وأظهرت النتائج تشخيص حوالي 62 إصابة باللشمانيا الجلديةcutaneous leishmaniasis وبنسبة 1.58% من مجموع النازحين 4007 فرد وشملت الدراسة بعض أقضية المحافظة حيث كانت اعلى نسبة إصابة في قضاء الحمزة الشرقي وعفك حيث بلغت (29, 19.4)% على التوالي وسجلت اعلى نسبة للإصابة مرتفع خلال شهري كانون الثاني وشباط 2015 (17.74, 25.81)% على التوالي وكانت نسبة الإصابة بين الأطفال دون سن 15 من العمر هي الأعلى حيث بلغت 46.5% في حين انخفضت نسب الإصابة مع تقدم العمر، ومن خلال استخدام تقنيةPCR باستخدام عوامل الضراوة LPG1 وUDP بينت النتائج ان 21 عينة من اصل 62 عينة هيLeishmania major وبنسبة 87 .33%


Article
Detiction of some Virulence Factors for Staphylococcus aureus Isolated from Conjunctivitis in Numan Teaching Hospital .
التحري عن بعض عوامل الضراوة لبكتريا Staphylococcus aureus المعزولة من إصابات ملتحمة العين في مستشفى النعمان التعليمي

Authors: Laith m. najeb ليث مصلح نجيب --- Othman S.muter عثمان صابر مطر
Journal: Journal of university of Anbar for Pure science مجلة جامعة الانبار للعلوم الصرفة ISSN: ISSN: 19918941 Year: 2018 Volume: 12 Issue: 1 Pages: 1-9
Publisher: University of Anbar جامعة الانبار

Loading...
Loading...
Abstract

The study included the collection of a sample of 80 patients reviewers for consulting eyes in Numan Teaching Hospital, the injured eye infections in patients ages ranged from (70-5) for males and females, Results showed the first examination that the 68 samples by 85 % been positive bacterial growth either samples of 12 that was negative bacterial growth accounted for 15%. the results showed the sovereignty of staphylococcus aureus by 32.05 %. varied in sensitivity assay results over the isolates under study used antibiotics response as isolates showed resistance to anti Pencillin G, Ampicillin 100% each, while the resistance to antibiotics Amoxicillin by 72% and 60% Erthromycin. While the anti Tetracycline antibiotics more influence on these isolates as percentage of their sensitivity to the anti 100%. has been investigating the viability of resistant bacteria to produce some virulence factors as it was found that all isolates were resistant to more than three antibiotics or above have the ability to produce Haemolysin enzyme, Urease enzyme, Siderophores, Gelatinase enzyme, Lipase enzyme, Capsule , β-Lactamase enzyme Production and Biofilm. While they are not able to produce the Protease enzyme.

تضمنت الدراسة 80 عينة سريرية من المرضى المراجعون لاستشارية العيون في مستشفى النعمان التعليمي المصابين بالتهاب ملتحمة العين Conjunctivitis للاعمار ما بين (70-5) سنة للذكور والاناث بينت نتائج الفحص الاولي ان 68 عينه وبنسبة 85 % كانت موجبة للنمو البكتيري اما العينات ال 12 التي كانت سالبة للنمو البكتيري شكلت نسبة 15 % .اظهرت النتائج سيادة المكورات العنقودية الذهبية staphylococcus aureus بنسبة 32.05 %.تباينت نتائج فحص الحساسية في مدى استجابة العزلات قيد الدراسة للمضادات المستعملة اذ اظهرت العزلات مقاومة لمضاد Pencillin G , Ampicillin بنسبة 100% لكل منهما, بينما كانت المقاومة لمضادات Amoxicillin بنسبة 72 % و Erthromycin بنسبة 60% .وفيما كان مضاد Tetracycline اكثر المضادات تاثيرا على هذه العزلات اذ بلغت نسبة حساسيتها لهذا المضاد 100%.تم التحري عن قابلية البكتريا المقاومةعلى انتاج بعض عوامل الضراوة اذ وجد ان جميع العزلات المقاومة لأكثر من ثلاث مضادات فما فوق لها القدرة على انتاج ،انزيم الهيمولايسن ،انزيم اليوريز ،السايدروفور ،انزيم الجيلاتينيز ،انزيم اللايبيز ,المحفظة، ،انزيمات البيتالاكتاميز والغشاء الحيوي. في حين كانت غير قادرة على انتاج انزيم البروتيز .


Article
Detection of hemolysin virulence factor gene of Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) isolated from feces of infected sheep by using Polymerase Chain Reaction Technique
تشخيص جين عامل الفوعة الهيمولايسين لبكتيريا الايشيريشيا القولونية النزفية المعزولة من براز الاغنام المصابة باستخدام تقنية تفاعل سلسلة البلمرة

Author: Saba Aboud Ali صبا عبود علي
Journal: Al-Qadisiyah Journal of Veterinary Medicine Sciences مجلة القادسية لعلوم الطب البيطري ISSN: 18185746 23134429 Year: 2015 Volume: 14 Issue: 1 Pages: 127-131
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) are the most important recently emerged group of food-borne pathogens. It can cause severe gastrointestinal disease, including fatal infections, and is being detected more frequently worldwide. In this study the Polymerase chain reaction technique (PCR) were used for detection of hemolysin toxin gene (hlyA) as virulence factor producing by Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) isolated from diarrheic sheep. The PCR primers for hlyA gene were designed according to a program from NCBI-Genbank published sequence (Genbank code: X94129.1). Fifty fecal samples were collected from sheep suffering from diarrhea, (32) isolates (64%) of Escherichia coli were detected and diagnosed by routine laboratory tests. The results were shown only (13) positive isolates in PCR technique for detection of hemolysin toxin gene at (40.62%) which present as Enterohemorrhagic Escherichia coli out of (32) E. coli. In conclusion, hemolysin toxin gene (hlyA) is important virulence factor of Enterohemorrhagic Escherichia coli infected sheep and using PCR was appeared very sensitive and highly specific assay serve as suitable molecular diagnostic tool for detection Enterohemorrhagic Escherichia coli producing hemolysin toxin.

تعد بكتيريا الايشيريشيا القولونية النزفية المعوية (EHEC) في الوقت الحاضر من اهم المجاميع البكتيرية الممرضة التي تنقل بواسطة الاغذية, وتكون سببا لأمراض الجهاز الهضمي الحادة وقد تكون سببا للوفاة, وتم تشخيصها بكثرة في جميع انحاء العالم. في هذه الدراسة استخدمنا تقنية تفاعل سلسلة البلمرة للكشف عن وجود جين ذيفان الهيمولايسين (hlyA) كعامل ضراوة ينتج من قبل بكتيريا (EHEC) المعزولة من حالات اسهال من الاغنام. تم تصميم البادئات لجين (hlyA) حسب برنامج من قبل بنك الجينات NCBI (Genbank code: X94129.1). جمعت (50) عينة من اغنام تعاني من حالات اسهال , وجدت (32) عزلة من بكتيريا الايشيريشيا القولونية (64%) وتم تشخيصها بطرق التشخيص الروتينية بالمختبر. اظهرت نتائج فحص تفاعل سلسلة البلمرة وجود (13) عزلة موجبة حاوية على جين ذيفان الهيمولايسين بنسبة (40.62%) من مجموع (32) عزلة من بكتيريا الايشيريشيا القولونية النزفية المعوية (EHEC). استنتجت الدراسة ان الجين المسؤول عن انتاج ذيفان الهيمولايسين هو عامل ضراوة مهم لبكتيريا الايشيريشيا القولونية النزفية المعوية EHEC)) التي تصيب الاغنام وان فحص تقنية تفاعل سلسلة البلمرة هو فحص حساس وذو خصوصية عالية لتشخيص بكتيريا الايشيريشيا المعوية (EHEC) الفارزة لذيفان الهيمولايسين.


Article
Phenotype and Genotype of Virulence Factors in Escherichia Coli Isolated from Different Clinical Samples
النمط الظاهري والتركيب الوراثي لبكتريا E-coli القولونية المعزولة من عينات سريرية مختلفة النمط

Authors: Nihad Khalawe Tektook نهاد خلاوي تكتوك --- Mohammed Flayyih Tareef محمد فليح طريف --- EptissamYounan Pirko ابتسام يونان بيركو
Journal: Al-Nisour Journal for Medical Sciences مجلة النسور للعلوم الطبية ISSN: 26640562 26640554 Year: 2019 Volume: 1 Issue: 2 Pages: 241-249
Publisher: Al-Nisour University College كلية النسور الجامعة

Loading...
Loading...
Abstract

Escherichia coli is the principal causative agent of most infection of bacterial origin, and extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) is responsible for 80% of infections of urinary tract in human bieng. The aim of this work was to study the distribution of some virulence factors of Escherichia coli in different type of human samples. This study was carried out in Baghdad city-Iraq from January to June 2019, included 70 clinical samples (Blood, Urine and Wound samples) with positive culture for E. coli. Each sample was managed bacteriologically to isolate causative bacteria as mentioned in standard systems of bacteriology Lab. The DNA was extracted from all E. coli isolates for detection of fim H and Kpc gens (important virulence factors of bacteria) by PCR and for determination resistance antibiotics these isolates. The present study showed that the highest rate of E coli isolates (78.57%) was from urine samples of patients with UTI and the lowest percentage was from blood samples (8.57%). The study show highest percentage of E coli isolates (95.43%) was positive for adhesion factors, followed by 91.43% was positive for biofilm formation, 70% was capsule producer, while 21.43% of E coli isolates was multidrug resistance (MDL) (p: < 0.05). The study revealed that 95.71% of E coli isolates was resistant for cefotaxime, 94.29% was resistant to aztroneom while 2.86% was resistant to amikacin. The study revealed that 95.71% of E coli isolates was with adhesion factors and 70% of E coli isolates capsule producer as phenotypic virulence factor while 95.71% of E coli isolates was positive for Fim H gene and 4.29% was positive for Kpc gene (as genotype virulence factors).Conclusions: nearly quarter of E coli isolated was multidrug resistant and fim H virulence gene was the most gene detected in those isolates

الإيشريشا القولونيه هي احد العوامل المرضية و كمسبب رئيسي لمعظم حالات العدوى البكتيرية ، حيث تعتبر هذه البكتريا نوع (extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC ) المسؤولة عن 80 ٪ من التهابات المسالك البولية , لذا هدفت الدراسة الحالية لدراسة المظهرية و الجنينية لعوامل ضراوة البكتريا المعزوله من عينات سريرية مختلفة .وقد أجريت هذه الدراسة في مدينة بغداد - العراق في الفترة من يناير إلى يونيو 2019 ، وشملت 70 عينة سريرية (عينات دم وبول ومسحات الجروح ) وقد زرعت البكتريا وشخصت بطرق كلاسيكية وحديثة وقد استخلص الحامض النووي, و كشف عن جينات الضراوه fim H و Kpc باستخدام (PCR ) . أظهرت الدراسة الحالية أن أعلى نسبة لعزلات البكتريا (78.57 ٪) كانت من عينات البول لمرضى التهاب المسالك البولية وأدنى نسبة كانت من عينات الدم (8.57 ٪). أظهرت الدراسة أن أعلى نسبة من عزلات E coli (95.43٪) كانت إيجابية بالنسبة لعوامل الالتصاق ، تليها 91.43٪ كانت إيجابية لتكوين الغشاء الحيوي ، 70٪ كانت منتجة للكبسولة ، بينما كان 21.43٪ من عزلات E coli مقاومة متعددة الأدوية (MDL) (p : <0.05). كشفت الدراسة أن 95.71٪ من عزلات E coli كانت مقاومة للسيفوتاكسيم ، 94.29٪ كانت مقاومة للأزترونوم بينما 2.86٪ كانت مقاومة للأميكاسين. و أن 95.71٪ من عزلات E coli لها قابليىة التصاق وأن 70٪ منها كانت منتجة للكبسولة كعامل ضراوة النمط الظاهري بينما كان 95.71٪ منها كانت إيجابية لجين Fim H و 4.29٪ كانت إيجابية لجين Kpc وقد استننج ان ما يقارب ربع العزلات كانت متعددة المقاومًة للأدوية المتعددة وكان جين الـ H fim هو أكثر الجينات المكتشفة في تلك العزلات.

Listing 1 - 10 of 11 << page
of 2
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (11)


Language

English (7)

Arabic (3)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2019 (1)

2018 (1)

2017 (3)

2016 (1)

2015 (3)

More...