research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
USING THE BURIED HERBICIDE METHOD TO CONDUCT GENOME WIDE ASSOCIATION MAPPING FOR ROOT DEPTH IN RICE*
استخدام طريقة دفن مبيد الأعشاب لرسم الخارطة الوراثية لصفة عمق الجذور في الرز

Authors: Z. K. Kadhum زينب كريم كاظم --- A. H. Price آدم برايس --- D. Robinson ديفد ربنسون
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2014 Volume: 45 Issue: 8 - special issue Pages: 940-955
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Rice (Oryza sativa L.) is one of the main staple foods of the world. With the increase of population and the deficit of irrigation water, the increase in rice production that is predicted will be dependent on areas prone to drought. Root depth is important for plant growth and survival during drought because of its role in facilitating water uptake from deep soil layers. By advances in genomics, the plant root systems can be linked to quantitative trait locus (QTLs) information to achieve a most beneficial design of root system architecture. There is a demand to develop and validate techniques that permit estimation of the root system. Therefore, a buried herbicide method at depth 30 cm was used in this study to assess root trait in a total of 325 rice cultivars, allowing high resolution genetic mapping. Using efficient mixed model statistical analysis for genome wide association, four associations were detected two on chromosome 1 and one on each of chromosome 4 and 6. Positional candidate genes underneath QTLs were examined bioinformatically and through the literature revealing several interesting genes which may offer potential for developing drought resistant rice cultivars. Therefore, developing a cost effective high-throughput system that can measure traits related to drought avoidance on a large number of plants would aid genetic studies in breeding and gene identification.

يعد محصول الرز (Oryza sativa L.) واحد من اهم المحاصيل الغذائية في العالم. نظرا لزيادة عدد السكان وشحة المياه في العالم لاسيما في المناطق الزراعيه المائلة للجفاف اصبح من الضروري النظر في تطوير زيادة انتاج المحاصيل الزراعيه في هذه المناطق. يلعب عمق الجذور دور مهم في امتصاص الماء من طبقات التربة العميقة وادامة نمو النبات خلال فترات الجفاف. بالنظر للتقدم العلمي في مجال الوراثه اصبح بالإمكان ربط الصفات الظاهرية للنظام الجذري الى الصفات الكمية (QTLs) من اجل تطوير كفائة النظام الجذري في امتصاص الماء. لذلك اصبح من الضروري تطوير تقنيات تسمح بتقيم الصفات الظاهريه للنظام الجذري. احدى التقنيات التي استخدمت في هذه الدراسة هي طريقة دفن مبيد الاعشاب Diuron على عمق 30 سم لتقييم عمق الجذور ل325 صنف من الرز ثم تحليل البيانات احصائيا باستخدام efficient mixed model analyses. كشفت نتائج التحليل عن اربع مواقع للصفات الكمية لها علاقة بصفة عمق الجذور اثنان على كروموسوم 1 وواحد على كل من كروموسوم 4 و6. فضلا عن ذلك, فقد تم تحديد واختبار الجينات المرشحة تحت هذه المواقع التي يعتقد لها دور مهم جدا لصفة عمق الجذور في محصول الرز من خلال الابحاث العلمية المنشورة. لذلك ايجاد طريقة اقتصادية قليلة الكلفة, سهلة, يتم فيها تقييم اعداد كبيره من اصناف الرز وربط الصفات الظاهرية مع الصفات الكمية تعد من الاهداف المهمة لمربي النبات في مجال مقاومة الجفاف.


Article
Identification of quantitative trait loci for root depth in the riceBala x Azucena F6 mapping population using the buried herbicide method
تحديد الصفات الكمية ورسم الخارطة الوراثية لصفة عمق الجذور في الرز الى F6recombinantinbredlineناتج من التضريب بين BalaXAzucena باستخدام طريقة دفن مبيد الاعشاب

Authors: ZaniabAl-Shugeairy زينب كريم كاظم --- Adam H Price آدم برايس --- David Robinson ديفد ربنسون
Journal: Euphrates Journal of Agriculture Science مجلة الفرات للعلوم الزراعية ISSN: 38752072 Year: 2016 Volume: 8 Issue: 4 Pages: 11-22
Publisher: Al-kasim University جامعة القاسم الخضراء

Loading...
Loading...
Abstract

Root depth is important for plant growth and survival during drought because of its role in water uptake from deep soil layers. The burying TRIK herbicide method has been applied to screen root depth in 138 recombinantinbredlines derived from crossing betweentwo subspecies IndicaBala and JaponicaAzucena. Analysis of mapping population revealed two putative QTLs on chromosome 6 near marker RZ682 and one on chromosome 7 near marker RG351 and two significant QTLs near marker G1010b and G1073 for root depth on chromosome 8. Positional candidate genes underneath QTLs were examined bioinformatically and through the literature revealing several interesting genes which may offer potential for developing drought resistant rice cultivars.

تم في هذه الدراسة استخدام طريقة دفن مبيد الاعشاب لتقيم recombinant inbred lineF6138 لصفة عمق الجذور ناتجة من التضريب بين Balla x Azucena. كشفت نتائج التحليل الوراثي عن عدة مواقع معنوية للصفات الكمية , اثنان على كرومسوم رقم 8 قرب ماركر b1010G و1073G وموقع واحد على كروموسوم رفم 6 قرب ماركر682RZ وموقع واحد على كروموسوم 7 قرب ماركر 351RG. كذلك تم تحديد الجينات المرشحة لتلك المواقع التي ربما لها اهمية كبيرة في عملية استنباط اصناف من الرز مقاومة للجفاف.

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

English (2)


Year
From To Submit

2016 (1)

2014 (1)