research centers


Search results: Found 292

Listing 1 - 10 of 292 << page
of 30
>>
Sort by

Article
Quantification of Inha, Inhba, anInhbb genes expression levels in Wister rat testis during Pre- and Post-Pubertal Stages
القياس الكمي لمستويات التعبير عن جينات Inha و Inhba و anInbb في الخصية Wister rat أثناء مراحل ما قبل وبعد مرحلة البلوغ

Loading...
Loading...
Abstract

The present study has been designed to quantitate the mRNA expression level of testicular Inha, Inhba, and Inhbb genes at pre- and post-pubertal stages of male Wister rats. Fifty male Wister rats (25 immature and 25 mature) were used in the present study. At pre-pubertal stage, 5 male rats of 25, 30, 35, 40, and 45 days old, and at post-pubertal stage, 5 male rats of 55, 60, 65, 70, and 75 days old were anasthetized and testis were obtained for molecular study to investigate the expression levels of Inha, Inhba, and Inhbb genes using qRT- PCR. The expression level of Inha gene in testis decreased as the age progress until 40 day period, and then slightly increased at 45 day period. At 55 day period, the expression significantly increased. At 60 and 65 periods, the levels recorded no increase, but 70 and 75 day periods recorded significant increase. The expression level of Inhba gene increased significantly as the age progress at the pre-pubertal stage, where the highest level was recorded at 45 day. At 55, 60, and 65 day periods, the highest expression level has been recorded, thenafter, the levels decreased at 70 and 75 day periods. The expression level of Inhbb gene increased significantly at 30, 35, 40, and 45 day periods of the pre-pubertal stage. At 55 and 60 day periods, no significant difference was recorded compared with 45 day period. At 65 day period, the highest level was recorded, thenafter, the levels decreased at 70 and 75 day periods. It can be concluded that fold changes of Inha, Inhba, and Inhbb genes in testis, correlated with the alterations of inhibins and activins concentrations at different periods of pre- and post-pubertal stages of male Wister rats life.

تم تصميم هذه الدراسة لتقدير مستوى التعبير مرنا من الجينات الخصية Inha ، Inhba ، و Inhbb في مراحل ما قبل وما بعد البلوغ من الفئران Wister الذكور. تم استخدام خمسون ذكورًا من فصيلة الويستر (25 غير ناضجة و 25 ناضجة) في هذه الدراسة. في مرحلة ما قبل البلوغ ، تم تخدير 5 فئران ذكور تتراوح أعمارهم بين 25 و 30 و 35 و 40 و 45 يومًا ، وفي مرحلة ما بعد البلوغ ، تم تخدير 5 فئران ذكور تتراوح أعمارهم بين 55 و 60 و 65 و 70 و 75 يومًا. تم الحصول عليها من أجل الدراسة الجزيئية لاستقصاء مستويات التعبير عن جينات Inha و Inhba و Inhbb باستخدام qRT- PCR. انخفض مستوى التعبير عن جين Inha في الخصية مع تقدم العمر حتى 40 يومًا ، ثم زاد بشكل طفيف في فترة 45 يومًا. في فترة 55 يومًا ، زاد التعبير بشكل كبير. في 60 و 65 الفترات ، لم تسجل المستويات أي زيادة ، ولكن الفترات 70 و 75 يوم سجلت زيادة كبيرة. زاد مستوى التعبير عن جين Inhba بشكل ملحوظ مع تقدم العمر في مرحلة ما قبل البلوغ ، حيث تم تسجيل أعلى مستوى في 45 يومًا. عند 55 و 60 و 65 يومًا ، تم تسجيل أعلى مستويات التعبير ، وبعد ذلك ، انخفضت المستويات عند 70 و 75 يومًا. زاد مستوى التعبير عن الجين Inhbb بشكل كبير في 30 و 35 و 40 و 45 يوما من المرحلة ما قبل البلوغ. في 55 و 60 يوما ، لم يتم تسجيل أي فرق كبير مقارنة مع 45 يوما. عند 65 يومًا ، تم تسجيل أعلى مستوى ، بعد ذلك ، انخفضت المستويات عند 70 و 75 يومًا. يمكن أن نخلص إلى أن التغييرات الطينية لجينات Inha و Inhba و Inhbb في الخصية ، مرتبطة بالتغيرات في تركيزات inhibins و activin في فترات مختلفة من مراحل ما قبل وما بعد البلوغ من حياة فئران ذكور Wister.

Keywords

Testis --- Inha gene --- Inhba gene --- Inhbb gene --- Inhibin --- Activin


Article
Molecular feature of lasB gene of Pseudomonas aeruginosa isolated from different clinical sources

Author: Molecular feature of lasB gene of Pseudomonas aeruginosa isolated from different clinical sources
Journal: JOURNAL OF THI-QAR SCIENCE مجلة علوم ذي قار ISSN: 19918690 Year: 2018 Volume: 6 Issue: 4 Pages: 163-166
Publisher: Thi-Qar University جامعة ذي قار

Loading...
Loading...
Abstract

The study was carried out through a period from June to November 2017 from out-patients and in-patients of Al-Hussein Teaching Hospital in Thi-Qar province South of Iraq. A sum of 132 specimens from the hospital facility condition and different clinical samples of various patients were randomly collected and analyzed for diagnosis of Pseudomonas aeruginosa. These clinical specimens were included wound, burn, ear swabs, urine and sputum specimens. Every single specimen was screened to detect of P. aeruginosa by culturing on suitable media, and 36 isolates of P. aeruginosa were distinguished through biochemical tests and using API 20NE system for confirmation the isolates. All P. aeruginosa isolates were tested against nine antimicrobial discs in vitro. They revealed that having different classes and the results demonstrated that variable resistance to the anti-microbial agents. In attempting to the recognizable proof of P. aeruginosa having the DNA, Polymerase chain reaction (PCR) was utilized in light of particular groundwork for 16S rRNA genetic marker. The results demonstrated that PCR has observed to be quick and sensitive and particular for recognizable proof of P. aeruginosa. Furthermore, 16S rRNA was utilized as confirmation feature, while lasB detected as virulence gene also to utilize as pathogenesis quality of the bacteria


Article
DETERMINING THE CELLULASE GENE LOCATION OF SOME PSEUDOMONAS SPECIES ISOLATED FROM SOIL AND STUDYING THE POSSIBILITY TO INCREASE CELLULASE DEGRADATION BY PLASMID DNA AMPLIFICATION TECHNIQUE
تعيين مواقع المورثات المحللة للسليلوز في بعض الأنواع العائدة لجنس Pseudomonas ودراسة إمكانية زيادة قدرة التحلل بإستعمال تقنية تضخيم محتوى الـDNA البلازميدي

Author: Rayan M. Faisal ريان مازن فيصل
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2012 Volume: 11 Issue: 2 Pages: 151-162
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Twenty six cellulose-degrading bacterial isolates were isolated from different soil samples from Nineveh governorate, these isolates were checked for antibiotic resistance towards Tetracycline, Nalidixic acid, Cefalexin, Ampicillin and Chloramphenicol, according to their resistance pattern eight of them were chosen for diagnosis. The study found that all these isolates belonged to Pseudomonas putida. Curing by elevated temperature was carried out to identify the cellulose degradation gene location, curing percentage of some isolates were between (4-31%) which may give a fact that these isolates may carry cellulose genes on their plasmids. On the other hand some isolates failed to be cured probably because their cellulose genes were chromosomal. Plasmid amplification by 150µg/ml chloramphenicol was studied for all isolates that carried plasmid for cellulose degradation, we found that the isolate (19) had the ability to amplify its plasmid content. Certification that cellulase plasmids were amplified was done by comparing the CO2 evolution for the original and the amplified isolate per week.

تم عزل 26 عزلة محللة للسليلوز من ترب مختلفة في محافظة نينوى فحصت هذه العزلات تجاه مقاومتها للمُضادات الحيوية التتراسايكلين وحامض النالدكسيك والسيفالكسين والأمبسلين والكلورامفينيكول وإعتماداً على مقاومتها للمُضادات الحيوية أنتخبت ثمأن عزلات لغرض تشخيصها ولوحظ أن جميعها تعود للنوع Pseudomonas putida . أُجري تحييد محتوى الـ DNA البلازميدي لهذه العزلات بإستعمال درجة حرارة °45م كعامل محيد وذلك لغرض الكشف عن مواقع المورثات المحللة للسليلوز إذ تم الحصول على نسب تحييد تراوحت بين (%31-4) لبعض العزلات مما يعتبر مؤشراً على حمل هذه المورثات على جزيئات بلازميدية بينما لم يعطي البعض الاخر نسبة تحييد مما يدل على حملها على الكروموسوم. درست قابلية التضخيم البلازميدي للعزلات التي تحمل مورثات السليلوز بلازميديا بإُستعمال تركيز 150 مايكروغرام/مليلتر من مضاد الكلورامفينيكول ولوحظ أن العزلة ذات الرمز19 كأن لها القدرة على تضخيم محتواها البلازميدي وتم التأكد من أن البلازميدات التي تحمل مورثات تحلل السليلوز هي التي حصل لها التضخيم وليس غيرها من خلال إجراء مقارنة بين العزلة الاصلية والعزلة المضخمة محتواها البلازميدي من حيث كمية الـ CO2المتحرر مقارنة بالزمن.


Article
The Diagnostic and Prognostic Values of NCR1 and NCR3 Genes in Iraqi Breast Cancer Women
أهمية ألجينين (NCR1 و NCR3) في ألكشف عن و ألتنبؤ بتقدم سرطان ألثدي لدى ألمريضات ألعراقيات

Loading...
Loading...
Abstract

Background: The Natural cytotoxicity receptors (NCR1 and NCR3) have been classically de ned as activating receptors delivering potent signals to Natural Killer (NK) cells in order to lyse harmful cells and to produce in ammatory cytokines. Indeed, the elicitation of NK cells effector functions after engagement of NCRs with their ligands on tumor cells without the need for prior antigen recognition is one of the main mechanisms that allow a rapid clearance of tumor cells.Objectives: Evaluation of the diagnostic and/or prognostic values of NCR1 and NCR3 genes in breast cancer Iraqi females patients by initially comparing the expression concentrations of these genes between breast cancer patients and control group, then, comparing the expression levels of these genes with certain clinical features among breast cancer patients (ages of pa- tients, tumor grade, tumor stage and the presence or absence of metastasis).Material and Methods: The NCR1 and NCR3 levels were determined in tissue samples (Formalin Fixed Paraf n Embedded Tissue “FFPE”) derived from 51 Invasive Ductal Carcinoma women and 33 benign breast tumor women (control group) were attended to the Medical City and Al-Yarmouk teaching laboratories / Baghdad – Iraq. The patients’ samples were subjected to total RNA extraction, and then to molecular study by using reverse transcription and quantitative real time PCR at Molecular Oncology Unit in Guy ́s Hospital – Kings College / London – UK.Results: The expression of NCR1 and NCR3 genes were detected in 43 (84.31%) and 41 (80.39%) of breast cancer patients respectively, also, the levels of these genes showed high signi cant increase in breast cancer patients compared to control group. Furthermore, there were a gradual increase in the NCR1 and NCR3 expression concentrations with disease grades and stages progression (signi cant for both genes) in patients with primary breast cancer, moreover, the metastatic breast cancer patients showed signi cant decrease in NCR1 and NCR3 levels compared to primary breast cancer patients. There were no signi cant differences in the levels of NCR1 and NCR3 genes among the age groups of patients.Conclusions: The present study results re ect the potential utility of NCR1 and NCR3 as noninvasive markers for detecting breast cancer even in the earliest cancer stages, also, they suggest the possibility of using these genes as an ef cient molecular signatures for detecting breast cancer disease progression, discrimination between different stages and grades of breast tumors, and its might be of value as a prognostic markers.

أجريت ألدراسة ألحالية للكشف عن مستويات ألتعبير للجينين )NCR1 و NCR3( وذلك لتقييم دورهما في ألكشف عن وألتنبؤ بتطور سرطان ألثدي لدى ألنساء ألعراقيات عن طريق مقارنة مستويات تعبيرهما بين مجموعة من ألنساء ألمصابات بسرطان ألثدي ومجموعة من ألنساء ألمصابات بورم ألثدي ألحميد )مجموعة سيطرة(˓ وكذلك عن طريق مقارنة مستويات ألتعبير لهذين ألجينين بين ألنساء ألمصابات بسرطان ألثدي أنفسهن با عتماد على أ خت ف في بعض ألمظاهر ألسريرية )ألمجاميع ألعمرية˓ درجة ألمرض˓ مرحلة ألمرض˓ وجود أو عدم وجود ألسرطان من ألنوع ألمنتشر(. اشتملت ألدراسة على عينات نسيجية تم إستحصالها من 51 مريضة مصابة بسرطان ألثدي )لديهن مراحل مختلفة من مرض سرطان ألثدي( بعد تشخيصها من قبل بعض ألمستشفيات ألعراقية، إضافة إلى عينات نسيجية أخرى ماخوذة من 33 إمرأة مصابة بورم ألثدي ألحميد. تم معاملة ألعينات لغرض إستخ ص ألحمض ألنووي ألريبي ألكلي˓ ثم أجريت ألدراسة ألجزيئية باستخدام تقنية )Quantitative Real Time - PCR( في وحدة علم أ ورام ألجزيئي في مستشفى GUY̛ S / ألكلية ألملكية – لندن/ بريطانيا. أظهرت ألنتائج بأن 43 )%84.31( من ألمريضات كانت نتائجهن إيجابية لجين )NCR1( و 41 )%80.39( من ألمريضات كانت نتائجهم إيجابية لجين )NCR3(˓ كما وأكدت نتائج ألتعبير ألجيني لهذين ألجينين أن هناك زيادة كبيرة في مستويات تعبيرهما لدى مريضات سرطان ألثدي بالمقارنة مع مجموعة ألسيطرة˓ وقد وجد أن هناك زيادة ملحوظة في مستويات ألتعبير للجينين )NCR1 و NCR3( مع تطور حالة )درجة و مرحلة( ألمرض في مريضات سرطان ألثدي غير ألمنتشر. من ألناحية أ خرى˓ أثبتت ألنتائج بأن هناك إنخفاضا كبيرا في مستويات ألتعبير لهذين ألجينين في مريضات سرطان ألثدي ألمنتشر مقارنة با خريات ألمصابات بالنوع غير ألمنتشر. إضافة إلى ذلك فقد أظهرت ألدراسة ألحالية عدم وجود فروقات إحصائية في مستويات ألتعبير للجينين ألمذكورين معألتقدم في ألسن.


Article
Detection of BRCA2 exon 10 genetic variations in Iraqi breast cancer patients
التحري عن التغايرات الجينية في المحور 10 لجين الـ BRCA2 في مرضى سرطان الثدي العراقيين

Loading...
Loading...
Abstract

Breast cancer (BC) is the most prevalent malignancy in women in Western countries currently accounting for one third of all female cancers, and in Iraq rank the first among all cancers. Germline mutations in BRCA2 genes have been demonstrated to increase the risk of developing breast cancer. Conversely, the impact of BRCA mutations on prognosis and survival of breast cancer patients is still debated.Familial aggregation is thought to account for 5–10 % of all BC cases and germline mutations in BRCA1 and BRCA2 account for less of the half of these inherited cases. In Iraq breast cancer represents the principal death-causing malignancy among women, with (44.44 %) of the cases diagnosed before the age of 50 years. In order to study BRCA2 mutation spectra in the Iraqi population, direct sequencing of the entire coding region and intronicsequences flanking the exon was performed. A total of three BRCA2 sequence variants (a, 865A>C, N289H a, 1114 A>C. N372H a, 1153 A>G. K385E)were found. One of them a, 1153 A>G. K385E was novel. In conclusion, this study represents the evaluation of the deleterious and unclassified genetic variants in the BRCA2 gene exon 10 found in Iraqi population harboring of breast cancer.

سرطان الثدي من اكثر السرطانات شيوعا بين النساء في دول العالم الغربي, ويمثل ثلث انواع السرطانات التي تصيب النساء في العالم. في العراق يحتل سرطان الثدي الصداره بين انواع السرطانات. وتظهر التغايرات الجينيه الموروثه في BRCA2 احتماليه كبيره للتعرض الى سرطان الثدي بالاضافه لذلك فان دور التغايرات الجينيه فيBRCA في تشخيص سرطان الثدي وتاثيره في معدل الوفيات في المرضى مازال قيد البحث والدراسة. حيث يشكل سرطان الثدي نسبه 5-10% بين السرطانات الموروثه ضمن العوائل, ومن ضمن هذا تشكل التغايرات في BRCA1/2 نسبه اقل من النصف ، ويعتبر في العراق سبب مهم من اسباب الوفيات بين النساء حيث ان معظم الحالات في هذه الدراسه ظهرت قبل عمر ال 50 عاما وهذا يشكل نسبه (44.44%) من الحالات. ولدراسة هذه التغايرات في هذا الجين بين المرضى العراقيين تم استخدام بادئات خاصه تضمن لنا تغطيه المنطقه بالكامل في تفاعل البلمره التسلسلي ليتسنى لنا بعدها دراسه تتابعات القواعد النتروجينيه لكل حاله ومقارنتها مع التسلسل المصدر ضمن برامج خاصه وبالتالي تحديد التغايرات ومواقعها, وواحدة من هذه التغايرات التي تم تحديدها لم تسجل مسبقا عالميا. وبالنتيجه فان الهدف من هذه الدراسه التحري عن التغايرات الوراثيه الخطره وغير المصنفه مسبقا في جين الـ BRCA2 المنطقه المشفره 10 بين مرضى سرطان الثدي في المجتمع العراقي.


Article
Gene frequencies of ABO and rhesus blood groups in Sabians (Mandaeans), Iraq
دراسة توزيع مجاميع الدم ABO ومعامل الـRh لعينة عشوائية من طائفة الصابئة المندائيين

Authors: Noor J.Ali نور جالي علي --- Maisam B. N. Alkhamesi ميسم بلاسم نعيم الخميسي --- Asmaa M. Salih أسماء محمد صالح --- Alia E. M. Alubadi عالية عصام محمود العبيدي
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2014 Volume: 11 Issue: 2 عدد خاص بالمؤتمر النسوي الثاني Pages: 1035-1042
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The present study aimed to determine the frequency of ABO and Rh blood group antigens among Sabians (Mandaeans) population. This paper document the frequency of ABO and Rh blood groups among the Sabians (Mandaeans) population of Iraq.There is no data available on the ABO/Rh (D) frequencies in the Sabians (Mandaeans) population. Total 341 samples analyzed; phenotype O blood type has the highest frequency 49.9%, followed by A 28.7%, and B 13.8% whereas the lowest prevalent blood group was AB 7.6%. The overall phenotypic frequencies of ABO blood groups were O>A>B>AB. The allelic frequencies of O, A, and B alleles were 0.687, 0.2 and 0.1122 respectively. Rhesus study showed that with a percentage of 96.2% Rh (D) positive is by far the most prevalent, while Rh (d) negative is present only in 3.8% of the total population. The Sabians (Mandaeans) ethnic group showed the same distribution of ABO and Rh blood groups with others ethnic groups in Iraqi population.

تهدف الدراسة الحالية الى معرفة توزيع مجاميع الدم ABO ومعامل الـRh لعينة عشوائية للمجموعة العرقيةِ المندائية الصابئية و توثق الدراسة الحالية توزيع مجاميع الدم ABO ومعامل الـRh لعينة عشوائية للمجموعة العرقيةِ المندائية الصابئية في بغداد و الإستفادة منها في دراسة وراثة العشائر. حيث أن ليس هناك دراسات وراثية (بيانات) متوفرة حول الطائفة المندائية الصابئية وتم تحديد مجاميع الدم لـ341 فرد.أظهرت النتائج أعلى تكرار مظهري كان ضمن مجموعة مجموعة الـ O حيث كان تردد المظهري يساوي 49.9% هي الأكثر شيوعا بين مجاميع الدم في مجتمع الدراسة ويليه ومجموعة الـ A كانت 28.7% وومجموعة الـ B 13.8ومن ثم مجموعة الـ AB كانت الأقل تكرارا تساوي 7.6%. وكان التردد المظهري العام لمجاميع الدم ABO كَانت O > A > B > AB . فكان التردد الأليلي للأليلات ا لـ O , A , B كَانتْ 0.687, 0.2 و0.1122 على التوالي.وأظهرت الدراسة أن تردد معامل الريصي الموجب 96.2% والسالب كان 3.8%. أظهرت هذه الدراسة بأن المجموعة العرقية الصابئية المندائية مشابهين في التردد الأليلي لمجاميع الدم ABO ومعامل الـRh .


Article
Cloning of Copper resistance gene (copA) that Presence in Novel Genomic Island of Acinetobacter baumannii A92
كلونه جين النحاس المتواجد في الجزيرة الوراثية الفريده المتواجدة في بكتريا Acinetobacter baumannii A92

Authors: Suhad Saad سهاد سعد محمود --- Alice k. Melconian اليس كريكور اغوب --- Ali H.Ad'hiah علي حسين دحيه --- kumar Rajakumar كومار راجا كومار
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2014 Volume: 55 Issue: 2Supplement Pages: 722-728
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

This study was aimed to detect weather copA gene(copper resistance gene ) presence in A.baumannii A92 genome(AbaR genomic islands). The full genomic sequence of A.baumannii A92 not published in NCBI genome similarity was detected between two strains so the sequence of A.baumanniiIS-116(Genebank-AMGF0100000.1 ) was used to design the primers that were used for amplify of copA gene of A.baumannii A92. Two primers contain two sites for restriction enzymes (KpnI,XohI) and PWSK29 vector were used in the cloning, double digestion has been performed for vector and gene. Then the re-ligation was completed to form recombinant molecule,after that, transformation have been performed for the recombinant molecule by using chemical competent E.coli DH5α. Finally ,the transformant cells were incubated for 16-18hr at 37°C, the white positive colony that contain recombinant vector was appeared . After that, the success of cloning was confirmed by using colony PCR method for white colony by using copA-F with M13-R(universal primer) primers ,the results of colony PCR confirmed the presence of insert gene by appearing of inserted band.

اجريت الدراسه للكشف عن تواجد جين مقاومه عنصر النحاس في موروث (جينوم) بكتريا Acinetobacter baumannii A92 .بسبب عدم تواجد التتابعات الكاملة لجينومA92 A.baumannii في موقع NCBI لذلك تم الاعتماد على تتابعات بكتريا A.baumanniiIS-116 Gene bank-AMGF0100000.1 )) حيث وجد تشابه بين تتابعات المادة الوراثية للعزلتين لتصميم البادئات التي استخدمت في تضخيم الجين .حيث تم تصنيع بادئين يحتويان على موقعين للأنزيمات القاطعة (KpnI,XohI) وكذلك تم استخدام الناقل PWSK29 كناقل استنسال ،بعد اكمال عمليه الهضم للجين المراد استنساله وناقل الكلونه تم اجراء تفاعل الربط بين الجين والناقل لتكوين الجزيئه الهجينه ثم بعد ذالك تم ادخال الجزيئة الهجينة الى خلايا بكتريا E.coli DH5α المؤهلة بواسطه عمليه التحول (transformation ) واخيرا تم حضن الخلايا البكتريه المتحولة لمده 16-18 ساعه في 37 م وبعد انتهاء مده الحضن تم الحصول على خلايا بيضاء اللون الحاملة للجزيئة الهجينة .للتأكد من نجاح عمليه الاستنسال وتواجد الجزيئة الهجينة ، تم استخدام تضاعف السلسة للخلايا باستخدام بادئcop-R والبادئ العام M13-R(universal primer) وقد بينت نتائج التفاعل لل colony-PCR على الجل وجود الجين المحشور من خلال ظهور حزمه ( 2484 زوج قاعدي) الجين المحشور.


Article
The Diagnostic and Prognostic Values of FOXP3 Gene in Iraqi Breast Cancer Women
أهمية ألجين FOXP3 في ألكشف عن و ألتنبؤ بتقدم سرطان ألثدي لدى ألمريضات ألعراقيات

Loading...
Loading...
Abstract

Background: The transcription factor forkhead-box protein P3 (FOXP3) have been identi ed to counteract the anti-tumor im- mune responses during tumor progression. In addition, by expressing FOXP3, tumor cells may evade effector T-cell responses, resulting in a survival bene t of the tumor.Objectives: Evaluation of the diagnostic and/or prognostic values of FOXP3 gene in breast cancer Iraqi female patients by initially comparing the expression concentrations of this gene between breast cancer patients and control group, then, compar- ing the expression levels of FOXP3 with certain clinical features among breast cancer patients (ages of patients, tumor grade, tumor stage and the presence or absence of metastasis).Material and Methods: The Foxp3 levels were determined in tissue samples (Formalin Fixed Paraf n Embedded Tissue “FFPE”) derived from 51 Invasive Ductal Carcinoma women and 33 benign breast tumor women (control group) were at- tended to the Medical City and Al-Yarmouk teaching laboratories / Baghdad – Iraq. The patients’ samples were subjected to total RNA extraction, and then to molecular study by using reverse transcription and quantitative real time PCR at Molecular Oncology Unit in Guy ́s Hospital – Kings College / London – UK.Results: The FOXP3 gene expression was detected in 45 (88.23%) of breast cancer patients, also, the expression levels of this gene showed high signi cant increase in breast cancer patients compared to control group. Furthermore, there were a gradual increase in the FOXP3 expression concentrations with disease grades (highly signi cant) and stages (signi cant) progres- sion in patients with primary breast cancer, moreover, the metastatic breast cancer patients showed high signi cant increase in FOXP3 levels compared to primary breast cancer patients. There were no signi cant differences in the levels of FOXP3 among the age groups of patients.Conclusions: The present study results re ect the potential utility of FOXP3 as noninvasive marker for detecting breast cancer even in the earliest cancer stages, also, they suggest that possibility of using this gene as an ef cient molecular signature for detecting breast cancer disease progression, discrimination between different stages and grades of breast tumors, and it might be of value as a prognostic marker.

أجريت ألدراسة ألحالية للكشف عن مستويات ألتعبير للجين )FOXP3( وذلك لتقييم دوره في ألكشف عن وألتنبؤ بتطور سرطان ألثدي لدى ألنساء ألعراقيات عن طريق مقارنة مستويات تعبيره بين مجموعة من ألنساء ألمصابات بسرطان ألثدي ومجموعة من ألنساء ألمصابات بورم ألثدي ألحميد )مجموعة سيطرة(˓ وكذلك عن طريق مقارنة مستويات ألتعبير لهذا ألجين بين ألنساء ألمصابات بسرطان ألثدي أنفسهن با عتماد على أ خت ف في بعض ألمظاهر ألسريرية )ألمجاميع ألعمرية˓ درجة ألمرض˓ مرحلة ألمرض˓ وجود أو عدم وجود ألسرطان من ألنوع ألمنتشر(. إشتملت ألدراسة على عينات نسيجية تم إستحصالها من 51 مريضة مصابة بسرطان ألثدي )لديهن مراحل مختلفة من مرض سرطان ألثدي( بعد تشخيصها من قبل بعض ألمستشفيات ألعراقية، إضافة إلى عينات نسيجية أخرى ماخوذة من 33 إمرأة مصابة بورم ألثدي ألحميد. تم معاملة ألعينات لغرض إستخ ص ألحمض ألنووي ألريبي ألكلي˓ ثم أجريت ألدراسة ألجزيئية باستخدام تقنية )Quantitative Real Time - PCR( في وحدة علم أ ورام ألجزيئي في مستشفى GUY̛ S / ألكلية ألملكية – لندن/ بريطانيا. أظهرت نتائج ألتعبير للجين )FOXP3( بأن هناك 45 مريضة )%88.23( من ألمريضات ألمصابات بسرطان ألثدي كانت نتائجهن إيجابية لهذا ألجين˓ كما وأكدت ألنتائج بأن هناك إرتفاعا كبيرا في مستويات تعبيره لدى مريضات سرطان ألثدي بالمقارنة مع مجموعة ألسيطرة. وقد وجد أن هناك زيادة ملحوظة في مستويات ألتعبير للجين )FOXP3( مع تطور حالة )درجة و مرحلة( ألمرض في مريضات سرطان ألثدي غير ألمنتشر. من ألناحية أ خرى˓ أثبتت ألنتائج بأن هناك إرتفاعا كبيرا في مستويات ألتعبير لهذا ألجين في مريضات سرطان ألثدي ألمنتشر مقارنة با خريات ألمصابات بالنوع غير ألمنتشر. إضافة إلى ذلك فقد أظهرت ألدراسة ألحالية عدم وجودفروقات إحصائية في مستويات ألتعبير لهذا ألجين مع ألتقدم في ألسن.


Article
Association of Genetic Polymorphisms in a Sample of Iraqi Patients with Type2 Diabetes Mellitus

Author: Ruaa H. Abdul Ridha, Nuha J. Kandala
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2016 Volume: 15 Issue: 3 Pages: 78-84
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Type 2 Diabetes (T2D) is a progressive condition that is characterized by high blood sugar (hyperglycemia)‚ with T2D the body either resist the effect of insulin or does not produce enough insulin. In order to underline the role of the genes involved in this study‚ we investigate ‚using PCR-RFLP for CTLA-4 gene ‚ PCR-RFLP and sequencing for VDR gene. Polymorphisms of two single nucleotide polymorphisms (SNPs) belonging to both genes in 60 T2D patients and 30 healthy control from Iraqi population. The present local study demonstrated that VDR FoK-I‚ FF genotype (P = 0.04) and F‚f alleles (P=0.07) frequencies were significantly associated while VDR Bsm-I was significantly non-associated. CTLA-4 -1722(T>C) and +49 (A>G) shows non-significant association. These result suggest the involvement of VDR gene in the genetic susceptibility to T2D. Interestingly FoK-I‚ contributes to increasing the risk to the disease in our population. However‚ Further studies are require to confirmed this finding.


Article
Detection of luxS Gene in Serratia marcescens and rpoS Gene in Enterobacter cloacae Isolates Using PCR Reaction

Authors: Zeyad A. Shabeeb --- Muthana B. Farhan --- Naba'a A. Muhammed
Journal: Al-Nahrain Journal of Science مجلة النهرين للعلوم ISSN: (print)26635453,(online)26635461 Year: 2018 Volume: 21 Issue: 1 Pages: 115-120
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

luxS and rpoS genes were involved in the regulation of some biological processes, which interfere with virulence of Serratia marcescens and Enterobacter cloacae bacterial species sequentially. luxS have an important activity in Quorum Sensing (QS) processes, but rpoS interfere with tolerance and resistance processes toward stress conditions correlating with its virulence. The study aimed to detect rpoS presence in E. cloacae and luxS gene presence in S. marcescens separately isolated from 16 leukaemia patients (4 of S. marcescens and 12 of E. cloacae), who characterised with bacteraemia by using primers designed for this purpose by using PCR technique. The results showed that all of the bacterial isolates of S. marcescens contain luxS gene, while no one of E. cloacae isolates show positive results for rpoS gene. The study concluded that S. marcescens has high virulence as a result of luxS presence, which controls Quorum sensing and prodigiosin formation and affecting host immunity. Moreover, the negative results of rpoS gene can be explained according to two possibilities: the gene can be found in the isolates with a copy differ from the registered sequences of the rpoS gene, or the gene did not present in those isolates with presence of alternatives offset its activities

Listing 1 - 10 of 292 << page
of 30
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (292)


Language

English (218)

Arabic (40)

Arabic and English (32)


Year
From To Submit

2019 (32)

2018 (44)

2017 (51)

2016 (55)

2015 (34)

More...