research centers


Search results: Found 22

Listing 1 - 10 of 22 << page
of 3
>>
Sort by

Article
Molecular Identification of Aspergillus fumigatus Using ISSR and RAPD Markers
ألتشخيص ألجزيئي لعزلات A.fumigatus بواسطه مؤشرات ال ISSR و الRAPD

Authors: Nawras Kadhim Rassin نورس كاظم رسن --- Neamat J. Al- judy نعمت جميل عبد الباقي --- Batol Imran Dheeb بتول عمران ذيب
Journal: Iraqi Journal of Science المجلة العراقية للعلوم ISSN: 00672904/23121637 Year: 2015 Volume: 56 Issue: 4A Pages: 2788-2797
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

The aim of this stud to isolate and identified of A. fumigatus from different sources and study the genetic diversity among these isolates by using RAPD and ISSR markers.Collected 20 samples from 7samples were isolated A. fumigatusisolates were characterized depending on its morphological, then extracted DNA from its.RAPD markersrandomly bandingwith sitesof genome more than ISSR markers where the primer OPN-07 achieved discriminative power (19.1) and 43 bands, while ISSR6 achieved discriminative power (17.1) with 32 bands.ISSR were more efficiency in specific binding then RAPD, ISSR primers has great a binding to production unique band, when 9 primers from 10 primers, ISSR9 was produce (5) unique bands, while RAPD markers was low ability to production unique bands, 3primers from 9 primers were produced unique bands.The dendrogram of RAPD was reverted than isolates number 5 and 7 had the great genetic diversity 0.33361 while the isolates number 5 and 6 had the lowest genetic similarity 0.98521 in contrast with ISSR markers was show isolates number1 and 2 greats genetic diversity 0.97826whilethe isolates number 5 and 7 had the lowest genetic similarity 0.10253.

هدفت هذا الدراسه الى عزل وتشخيص فطر A. fumigatusمن مصادر مختلف ودراسهالتغايرات الوراثيه بين هذا العزلات بٳستخدام مؤشرات التفاعل العشوائي المتعدد ٳلاشكال لسلسله ٲلدنا RAPD ومؤشرات إعاده ٲلسلسله ٲلبسيطه ISSR تم جمع 20 عينه من A. fumigatus من مصادر مختلفه وتم تشخيصها ٳعتماد على صفات المظهر الخارجي. وتم استخلاص الدنا من جميع العينات ولكن تم اختيار 7 عزلات فقط لاجراء تفاعلات ال RAPDوال ISSRعليها.ٳظهرت مؤشرات ال RAPD بٲنها ذات ارتباط عشوائي بمواقع التركيب الجيني اكثر من مؤشرات ال ‚ISSRحيث ان البادئ OPN-07حقق طاقه تمييزيه بلغت 19.1 وناتج عدد حزم عشوائيه بلغ 43 مقارنه مع البادئ ISSR6 الذي حقق طاقه تمييزيه بلغت 17.1و32 حزم عشوائيه .ٲظهرت بادئات مؤشر الISSR قدره عاليه على ٳنتاج حزم مفرده حيث ان 7 بادئات من اصل 9 اظهرت حزمه منفرد بينما كان البادئ ISSR9 هو الاكثر إنتاج للحزم)5 (حزم منفرده بينما بادئات مؤشر الRAPD كانت ذات قدره اقل على إنتاج الحزم المنفرده حيث انتج 3 بادئات فقط من اصل 9 اظهرت حزم منفرده وكان البادئات OPM-20 ,OPL-05 الاكثر ٳنتاج للحزم المنفرده بعدد 2 وهذا يدل على ان مؤشراتISSR ذات كفاءه اعلى من مؤشرات RAPD في الارتباط اكثر تخصص بمواقع مميزه ,اظهرت المخططاتلشجيريه لتقنيه الRAPD اضهرت ان العزله رقم 5مع عزله رقم 7 هي الاكثر تنوع جينيه بلغت 0.33361 بينما العزله رقم 5 مع عزلة رقم 6 كانت الاقل مسافه جينيه بلغت 10.9852 اما في مايخص تقنية ISSRإضهرت أن العزلة رقم 1 وعزلة رقم 2 هي الاكبر تنوع جيني 0.97826 بينما العزلة رقم 5 و عزله رقم 7 هي الاقل تشابه جيني 0.10253.


Article
PCR Ribotyping for Determining the Diversity of Some Clinical Pseudomonas Aeruginosa Isolates

Authors: Khulod Ibraheem Hassan --- Saman Rafeeq Abdullah --- Khidir Hawrami
Journal: Al-Nahrain Journal of Science مجلة النهرين للعلوم ISSN: (print)26635453,(online)26635461 Year: 2014 Volume: 17 Issue: 2 Pages: 159-164
Publisher: Al-Nahrain University جامعة النهرين

Loading...
Loading...
Abstract

To study the genetic diversity between deferent strains of P. aeruginosa, this study was carried out between August and December 2010 by collecting 165 clinical samples from wounds, burn, ear and urinary tract infection taken from general hospitals of Sulaimani, Erbil and Koya governorates. After identifying P. aeruginos based upon culture methods using the selective media (cetrimide agar) coupled with biochemical tests, Polymerase chain reaction (PCR) method were used for identifying P. aeruginosa using primers targeting 16S rRNA. PCR analysis of 16S-23S internal transcribed spacer primer targeting the interspaced regions between the 16 and 23S rRNA genes (PCR ribotyping) was evaluated for it s effectiveness to differentiate between the isolates, the results show that the clinical isolates of P. aeruginosa belongs to three ribotypes, which were showed in one to three bands in each isolate of P. aeruginosa.

لدراسة التنوع الوراثي لعزلات سريرية من بكتريا الـ P. aeruginosa اجريت هذه الدراسة وذلك بجمع 165 نموذج شملت: الجروح والحروق والتهابات الأذن والمجاري البولية والتي تم أخذها من المستشفيات العامة في ثلاث مناطق من الإقليم وهي كويه، سليمانية و اربيل وذلك للفترة بين شهر آب الى شهر كانون الاول من عام 2010. فبعد تشخيص بكتريا الـ P. aeruginosa اعتمادا على الطرق التقليدية المعتمدة على استخدام الأوساط الزرعية، إذ تم استخدام الوسط الانتخابي (cetrimide agar) مقترنا مع الاختبارات الكيماوية. تم تطبيق التفاعل التسلسلي لانزيم بلمـرة الدنـا ((PCR فـي تشخيـص عـزلات الـP. aeruginosa على مستوى الـ DNA والمعتمدة على الجينات الخاصة بالرايبوسومات وهي الـ 16S rRNA. لإيجاد العلاقة الوراثية بين تلك العزلات تم استخدام نوع أخر من هذه التفاعلات وهي الـ PCR ribotyping) والتي تستخدم فيها بادئات تستهدف جينات الرايبوسامات في المنطقة المحصورة بين16S-23S وذلك لكفائتها في التمييز بين العزلات البكتيرية، إذ تم التوصل إلى وجود اختلاف بين تلك العزلات نتيجة وجود اختلاف في عدد وحجم الحزم المتضاعفة والتي تراوحت بين 1-3 حزم مما يدل على انتماء تلك السلالات الى ثلاثة انواع من الانماط الرايبوسومية (ribotypes) ممايدل على وجود اختلافات وراثية بين تلك العزلات وما يعقبه من اخلاف في التعامل مع كل عزلة.


Article
Genetic Diversity of Kattan Luciobarbus xanthopterus Heckel, 1843 (Pisces: Cyprinidae) in Four Mesopotamean Inland Waters, Iraq
التنوع الجيني لجماعات سمكة القطانLuciobarbus xanthopterus Heckel, 1843 (Pisces: Cyprinidae) في أربع بيئات في بلاد مابين النهرين, العراق

Author: Mustafa S. Faddagh مصطفى سامي الفداغ
Journal: Basrah Journal of Agricultural Sciences مجلة البصرة للعلوم الزراعية ISSN: 18175868 Year: 2016 Volume: 29 Issue: 1 Pages: 25-33E
Publisher: Basrah University جامعة البصرة

Loading...
Loading...
Abstract

Genetic diversity of fish species in Iraqi waters studies are rare, the study design toinvistigate the genetic diversity of Kattan Luciobarbus xanthopterus Heckel, 1843 amongfour ecosystems; Shatt Al-Arab River southern Iraq, Dokan reserviour in Sulaimanyaprovince, Tigris near Kut city and Euphrates near Kerbala’a city. Couple RAPD decamereprimers have been selected. The profiles of RAPD-PCR products on agarose gel revealed22 and 19 bands respectively. The C15 primer amplified seven, seven, one and four bandsand C16 primer created four, eight, two and eight bands respectively. The study concludedthat the L. xanthopterus genetically differentiated while adapting to various environments.whereas population in Tigris near Kut city was the most divers from the others. In thesame time populations from Shatt Al-Arab river and Dokan reserviour were the mostsimilar, while the Euphrates population near Kerbala'a varied from the two later mostsimilar populations. The result of RAPD test revealed that this species acclimated with theecological variation. The study recommoneds not to use each of the four stocks in artificialcrossbreeding in order to conserve the L. xanthopterus genetic diversity.

ان الدراسات حول التنوع الجیني للاسماك ضمن النوع في المیاه العراقیة قلیلة جدا. لتحدید التنوع الجینيفي اربع انظمة بیئیة هي نهر شط العرب جنوب العراق وخزان Luciobarbus xanthopterus لسمكة القطاندوكان في محافظة السلیمانیة ونهر دجلة بالقرب من مدینة الكوت ونهر الفرات بالقرب من مدینة كربلاء. أختیر بادئینعشریین عشوائیین لأستخدامهما في طر یقة التضخیم العشوائي للذخیرة الجینیة. أن صورة ناتج الطریقة العشوائیة للتفاعلالبولیمیریزي المتسلسل على هلام الأكروز بینت 19 و 22 حزمة على التوالي من البادئین المستخدمین. ضخم باديءأربع وثمان واثنین وثمان حزم في جماعات القطان C سبع وسبع وحزمة واحدة واربع حزم بینما ضخم باديء 16 C15الأربعة على التو الي . استنتجت الدراسة ان سمكة القطان تمایزت جینیا خلال التكیف لبیئات مختلفة في المیاهالداخلیة. واوضحت ان جماعة القطان في نهر دجلة قرب مدینة الكوت هي الأكثر اختلافا عن بقیة الجماعات، بینماكانت الجماعتین من شط العرب وخزان دوكان الأكثر تشابها جینیا، اما الجماعة في نهر الفرات بالقرب من مدینةكربلاء فقد ارتبطت معهما. وقد استنتجت الدراسة ان جماعات سمكة القطان تأقلمت مع التغیرات البیئیة الداخلیة وهيغیر معرضة لخطر التناقص في الجماعات. توصي الدراسة بعدم استخدام المخازین الأربعة في التكثیر الاصطناعيفیما بینها من اجل ان تحتفظ بخواص التنوع الجیني الذي یشكل قاعدة لتحمل وتجاوز التغیرات البیئیة.

Keywords

Fish --- Luciobarbus --- Iraq --- RAPD --- genetic diversity.


Article
Genetic Diversity of Carcass Traits in Three Feather’s Color Types of Native Turkey in Kurdistan Using Random Amplification of Polymorphic DNA
التنوع الوراثي لصفات الذبيحة في ثلاث انواع من الديك الرومي مختلفة لون الريش في كوردستان بأستخدام التضخيم العشوائي متعدد الاشكال

Author: Questan Ali Amin كويستان علي أمين
Journal: iraqi poultry sciences journal مجلة علوم الدواجن العراقية ISSN: 18170927 Year: 2017 Volume: 11 Issue: 1 Pages: 24-33
Publisher: Poultry Science Association جمعية علوم الدواجن

Loading...
Loading...
Abstract

A study was conducted to evaluate the genetic diversity in the three feather’s color types of native turkey for carcass traits and DNA profile using (RAPD) maker. The incoming result showed a significant difference between male and females of body weight, carcass weight, relative weights of breast and gizzard. The results revealed significant difference between three feather’s color of body weight, carcass weight and Thai weight. Furthermore, significant differences for interaction between sex and feathers color were noticed. The Eigenvalues, percentage of the total variance and communalities of the carcass components of the two genetic types (red and black feather) of Kurdish native turkey, two principal components were extracted from with Eigen values of 3.974 for the first principal component (PC1), and 4.597 for the second principal component (PC2). The two principal components account for 66.229% and 76.622% of the total variance. Pearson’s coefficients of correlation between carcass weight and carcass traits for red and black turkey were ranged from 0.819 to 0.308 in red feather turkey and from 0.882 to 0.478 in black feather turkey, respectively. The correlation between carcass weight and all carcass cuts were positive in both genetic groups.The RAPD-PCR technique was applied to generate a DNA fingerprint of 28 individual’s birds of both sexes. Initially, a total of 20 ten-nucleotide arbitrary primers were used, but only5 primers revealed a pattern with scorable amplified bands. From a total number of 174 scored bands 53 and 121 were described as polymorphic and monomorphic respectively. The average number of bands per primer varied from 7 to 16 and with sizes varying from 100 to 1100 bp in size.

أجريت الدراسة لتقييم التنوع الوراثي لصفات الذبيحة لثلاث خطوط وراثية مختلفة الأنواع للديك الرومي المحلي باستخدام RAPD Marker. أشارت النتائج الى تباين معنوي في معدلات وزن الجسم الحي، وزن الذبيحة، والنسب المئوية للصدر والاحشاء الداخلية بين الذكور والاناث. مع تباينات معنوية بين الخطوط الثلاث في معدل وزن الجسم الحي، وزن الذبيحة والوزن النسبي للظهر. فضلاً عن تأثير معنوي للتداخل بين الجنس والخطوط الوراثية الثلاث في القيمة الذاتية، النسبة المئوية للتباين الكلي، ومجموع مكونات الذبيحة في مجموعتين وراثيتين للدجاج التركي المحلي (الأحمر والأسود). بلغت القيمة الذاتية للمكونات التي استخرجت 3.974 للمكون الاول و 4.597 للمكون الثاني. شكلت نسبة المكونين 66.229% و 76.622% من قيمة الاختلاف الكلي. و تراوحت قيمة الارتباط بين مكونات الذبيحة للمجموعتين الوراثيتين بين 0.819 الى 0.308 في المجموعة الوراثية الحمراء، بينما تراوحت قيمة الارتباط في المجموعة الوراثية السوداء بين 0.882 الى 0.478، بالتناوب. و كل الارتباطات للاجزاء الذبيحة للمجموعتين الوراثييتين كانت موجبة. تم تطبيق تقنية تعدد الأشكال العشوائية العشوائية لتوليد بصمة الحامض النووي الرايبوزي منقوص الاوكسجين من 28 فردا من كلا الجنسين. في البداية، تم استخدام ما مجموعه 20 بادء، ولكن فقط 5 بادءات كشفت نمط مع روابط تضخيم. من مجموع عدد 174 فرق سجل 53 و 121 وصفت بأنها متعددة الأشكال و وحيدة الشكل، على التوالي. وتراوح متوسط عدد الروابط بين 7 و 16 مع حجم يتراوح بين 100 و 1100 قاعدة زوجية في الطول.


Article
Evaluation of Random Amplified Polymorphic DNA as a Genetic Indicator of Salt Tolerance in Iraqi Wheat
تقييم التضاعف العشوائي متعدد الإشكال لسلسله الدنا للاستدلال على أصناف الحنطة المتحملة للملوحة في العراق

Author: Rawaa Ali Zahid رواء علي زاهد
Journal: Tikrit Journal of Pure Science مجلة تكريت للعلوم الصرفة ISSN: 18131662 Year: 2011 Volume: 16 Issue: 4 Pages: 12-18
Publisher: Tikrit University جامعة تكريت

Loading...
Loading...
Abstract

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) was utilized in order to generate information on polymorphism, genetic relatedness and diversity in two local salt tolerant wheat varieties Dijlah and Furat collected from different locations in Iraq( Latyfia, Twaitha and Hasoa) compared to three local non-salt tolerant varieties Tahdi, Tamose2 and Nakhoa for breeding purposes. Out of the 23 random decamer primers used, 15 primers produced monomorphic and polymorphic amplification patterns. Primers A11 and N16b showed the highest efficiency of 0.069, primer A11also showed the highest discriminatory power of 24.3%. Data obtained were used find the genetic distance and construct the dendogram. There was 26% polymorphism between the studied cultivars. In addition to that we were able to fingerprint seven cultivars.

استخدمت تقنيه التضاعف العشوائي متعدد الاشكال لسلسله الدنا للكشف عن التباينات الوراثيه و التقارب الوراثي و التنوع في صنفين متحملين للملوحه(دجله والفرات) والتي جمعت من مواقع مختلفه من جنوب وجنوب شرق بغداد (اللطيفيه,التويثه والحصوه) وقورنت بثلاثه اصناف محليه غير متحمله للملوحه (تحدي, تموز 2و نخوه ) و ذلك لاغراض التربيه. تم استخدام 23 بادئا عشوائيا مختلفا, 15منها انتجت انماط تكثير متجانسه و متغايره . البادئات 11А,b16N اظهرت اعلى كفاءة تكثير كما وان البادئ 11А أظهر اعلى قوه تمييزيه بلغت 24.3% . المعلومات التي تم الحصول عليها استخدمت لايجاد التباعد الوراثي وتركيب مخطط التحليل التجميعي حيث وجد ان هناك 26% تغاير وراثي بين الاصناف المدروسه كما وتم تحديد البصمه الوراثيه لسبعه اصناف من قبل عده بادئات.


Article
CLUSTER ANALYSIS FOR DIFFERENT GENOTYPES OF PEANUT
التحليل العنقودي لتراكيب وراثية مختلفة من فستق الحقل

Author: Ryad J. Mansour رياض جبار منصور
Journal: IRAQI JOURNAL OF DESERT STUDIES المجلة العراقية لدراسات الصحراء ISSN: 19947801 Year: 2012 Volume: 4 Issue: 2 Pages: 31-35
Publisher: University of Anbar جامعة الانبار

Loading...
Loading...
Abstract

ABSTRACT:A field experiment was carried out at four sites (Al-Anbar ,Al-AshaqiGaloulaa andAl-Kut ) in 2002 to test the performance of 11 genotypes of peanuts (ArachisHypogaea) and accumulated into uniform groups, in addition to estimate the genetic diversity in term of euclidean distancethrough cluster analysis. Pod yield was analyzed based on hierarchical clustering technique after constitute resemblance matrix. The genotypes grouped into six clusters which they formed during teen stages. Each group consisted of two genotypes beyond groupVI which it consisted of one group. The cluster analysis indicated that genotypes Medni and ICGV863 were hadsimilar response because of having minimum Euclidean distance and this may be an indicator of similarity for the genes they carry on. The genotype C92 had the highest Euclidean distance and genetic diversity and this may be a result of difference of its pedigree. The tested genotypes were grouped into two major groups, group (A) included genotypes I, III , VI,while group B included the rest genotypes which had highest yield than A, this may be a result of existing favorable genes govern yield character. The local cultivars can be improved through transporting the yield genes from diverse, superior genotypes.

المستخلص:نفذت تجربة حقلية في أربعة مواقع هي الأنبار وجلولاء والأسحاقي والكوت في الموسم 2002لأختباراداءاحد عشر تركيبا من فستق الحقل (ArachisHypogaea ) وتجميعها في مجاميع متجانسة وتقدير درجة التباعد بينها بصيغة مسافات Euclidean باستخدام التحليل العنقودي Cluster Analysis . تم تحليل بيانات حاصل القرنات باستخدام طريقة التجميع الهرمي ( hierarchical ) بعد ان تم تقدير درجة التشابه عن طريق إنشاء مصفوفة Proximities . أشارت نتائج التحليل العنقودي الى تجمع التراكيب الوراثية في ست مجاميع تشكلت خلال عشر مراحل. تكونت كل مجموعة من تركيبين وراثيين باستثناء المجموعة السادسة التي تكونت من تركيب واحد فقط. دلت نتائج التحليل العنقودي ان التركيبين Medni و ICGV863 كانا الأكثر تشابها لامتلاكهما اقل مسافة Euclideanوهذا يشير الى تشابه الجينات التي تسيطر على صفة حاصل القرنات, في حين حصلت اعلى مسافة Euclidean للتركيب C92 والتي تدل على البعد الوراثي لهذا التركيبب ربما بسبب اختلاف اصله الوراثي . توزعت التراكيب المدروسة الى مجموعتين رئيسيتين ,ضمت المجموعة الأولى ( A) تراكيب المجاميع I وIII و VI في حين ضمت المجموعة الثانية ( B) بقية المجاميع والتي تميزت بمعدل حاصل اعلى من المجموعة A وهذا مؤشر عن وجود جينات مفضلة مسؤلة عن صفة الحاصل في تراكيب المجموعة B يمكن الاستفادة من انعزالاتها.يمكن استخدام التراكيب المتباعدة وراثيا لتحسين الأصناف المحلية وذلك بنقل جينات الحاصل المتفوقة بإحدى طرائق التربية لأن التباعد الوراثي سيضمن عدم تشابه الجينات بين التراكيب المختبرة.


Article
Genetic Variation of Sinorhizobium meliloti Isolates Differing in Their Ability to Drought Tolerance
الاختلافات الوراثية بين عزلات Sinorhizobium meliloti في قابليتها على تحمل الجفاف

Loading...
Loading...
Abstract

Soil bacteria Sinorhizobium meliloti had enormous agricultural value, due to their ability in fixing nitrogen symbiotically with an important forage crop legume- alfalfa. The aim of this study (i) isolate indigenous S. meliloti from different field sites in Iraq, (ii) evaluate the isolates tolerance to induce drought using polyethylene glycol-6000, (iii) assessing genetic diversity and genetic relationships among isolates of natural population with drought tolerant abilities. Drought tolerance study revealed vast variations between Sinorhizobium isolates, the highest tolerant isolates to drought were twelve from total thirty 40%, tolerated from -3 up to -4 Mpa (mega pascal), while the drought sensitive isolates tolerated upto – 1.5 Mpa, except isolate Bs58 which tolerated upto -1 Mpa water potential. The growth declined with the increase of drought stress. Cluster analysis based on RAPD-PCR showed significant differences among S. meliloti isolates, and the results gave almost identical grouping of isolates in regards to drought experiment. Among indigenous isolates two divergent groups could be determined, the first major group included drought tolerant isolates and the second major group comprised all drought moderate and sensitive isolates with 40% similarity between the two major groups.

بكتريا التربة Sinorhizobium meliloti لها اهمية كبيرة في الزراعة وذلك لقابليتها على تثبيت النتروجين تعايشيا مع نبات الجت البقولي. الهدف من الدراسة :1) الحصول على عزلات من Sinorhizobium من مناطق مختلفة من العراق 2) تقييم تحمل العزلات للجفاف المستحث بواسطة البولي اثيلين كلايكول6000 ,3) تحديد التغايرات والعلاقات الوراثية بين العزلات بناءا على قابليتها لتحمل الجفاف. ان دراسة تحمل الجفاف بينت وجود تغايرات كثيرة بين عزلات Sinorhizobium وبلغت العزلات المتحملة اثنى عشر من مجموع ثلاثين عزلة 40% حيث تحملت من -3 الى -4 ميغاباسكال بينما العزلات الحساسة للجفاف تحملت 1 , 5ميغاباسكال باستثناء العزلة Bs 58 تحملت لغاية -1 ميغاباسكال جهد مائي. النمو انخفض بزيادة الجفاف كما ان تحليل شجرة العلاقة بين العزلات بناءا على نتائج التضخيم العشوائي للدنا بجهاز البلمرة الحراري اظهرت وجود اختلافات واضحة بين عزلات Sinorhizobium meliloti وهذه النتائج جاءت متوافقة مع نتائج تجربة تحمل الجفاف حيث قسمت العزلات الى مجموعتين رئيسية الاولى ضمت جميع العزلات المتحملة للجفاف والثانية ضمت العزلات الحساسة والمتوسطة التحمل للجفاف وبنسبة تشابهه بلغت 40%بين المجموعتين.


Article
Genetic Diversity Assessment of Some Citrus Species Cultivated in Iraq Based on RAPD Molecular Marker.
الوراثية تقييم التنوع من بعض أنواع الحمضيات المزروعة في العراق بناء على RAPD الجزيئية ماركر.

Authors: Iqbal Harbi Mohammed Al-Zaidi اقبال الزبيدي --- SalwaJaberAbdulah Al-Awadi سلوى جابر --- Ali.Saeed.Atiyah.AL-Janabi علي سعيد الجنابي
Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2016 Issue: Special Second International Scientific Conference for the Life Sciences Pages: 23-30
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

Genotyping of six Citrus accessions was carried out using RAPD marker .The genetic variability among the six Citrus accessions was estimated using six decamer RAPD primers. Five primers generated reproducible and easily storable RAPD profiles with a number of amplified DNA fragments ranging from nine to 12 ,the primer OPA – 17 was negative results . The total number of amplicons detected was 50, including unique bands reached seven polymorphism were 34,this represents a level of polymorphism of 68.33% and an average number of 6.8 polymorphic bands per primer. a maximum numbers of amplicons was amplified with primer OPA-18 reached 12 while the minimum number of fragments was amplified with primers OPA-12 and OPN-16 reached 9 respectively. The highest number of polymorphic bands reached 8 were obtained with primer OPN-16 and OPA-01respectively, while the highest number of monomorphic bands reached 3 was obtained with primer OPA-12 and OPS-147 with percentage reached 33.33% and 30 respectively. RAPD markers detected genetic distance and similarity , a maximum genetic distance value was observed between sour orange (SO) and sweet orange (OR) reached 0.578 with less similarity value reached 42%, a minimum genetic distance value was observed between sweet orange (OR) and mandarin (MA) reached 0.316 with high similarity value reached 69% . The similarity matrices were employed in the cluster analysis to generate a dendrogram using the UPGMA method. The cluster tree analysis showed that the citrus species were broadly divided into two main groups A and B. A group including two species were troyercitronge (TC) and sour orange (SO) with genetic similarity reached 56%. B group was divided into two sub-cluster B1 and B2 with genetic similarity reached 51%. The first sub-cluster (B1) including only citrone(CI) species but the second sub-cluster (B2) divided into two groups( B2A and B2B),the first group (B2A) included sweet orange (OR) and mandarin (MA) with high genetic similarity reached 69%, and second group (B2B) included volkamer lemon (VL) species only.

أجريت التنميط الجيني لستة انضمام الحمضيات خارج باستخدام علامة RAPD قدرت. والتباين الوراثي بين الانضمامات الحمضيات ستة باستخدام ستة الاشعال RAPD decamer. ولدت خمسة الاشعال الشخصية RAPD استنساخه وللتخزين بسهولة مع عدد من شظايا تضخيم الحمض النووي التي تتراوح بين تسعة إلى 12، وقانون التلوث النفطي التمهيدي - كان 17 نتائج سلبية. وكان العدد الإجمالي للamplicons الكشف عن 50، بما في ذلك وصلت عصابات فريدة كانت سبعة التعدد 34، وهذا يمثل مستوى من تعدد الأشكال من 68.33٪ ومتوسط ​​عدد 6.8 عصابات متعددة الأشكال في التمهيدي. وقد تضخمت أعداد أقصاها amplicons مع التمهيدي الذي تم التوصل إليه OPA 18 12 في حين تم تضخيم العدد الأدنى من شظايا مع الاشعال OPA-12 و OPN-16 وصلت 9 على التوالي. تم الحصول عليها بلغ أعلى عدد من عصابات متعددة الأشكال 8 مع التمهيدي OPN-16 وقانون التلوث النفطي، 01respectively، في حين بلغ أعلى عدد من العصابات monomorphic تم الحصول عليها 3 مع التمهيدي OPA-12 و OPS-147 بنسبة وصلت 33.33٪ و 30 على التوالي. علامات RAPD الكشف عن المسافة الوراثية والتشابه، لوحظ أقصى قيمة المسافة الجينية بين البرتقال الحامض (SO) والبرتقال الحلو (أو) قد بلغ 0.578 مع أقل قيمة التشابه صلت إلى 42٪، لوحظ الحد الأدنى قيمة المسافة الجينية بين البرتقال الحلو (أو) واليوسفي (MA) بلغ 0.316 مع قيمة تشابه عالية وصلت 69٪. تم توظيف المصفوفات التشابه في التحليل العنقودي لتوليد dendrogram باستخدام طريقة UPGMA. أظهر تحليل شجرة الكتلة التي الأنواع الحمضيات وتنقسم إلى مجموعتين رئيسيتين ألف وباء وكانت مجموعة من بينهم اثنان من الأنواع troyercitronge (TC) والبرتقال الحامض (SO) مع التشابه الجيني وصلت 56٪. تم تقسيم المجموعة (ب) إلى قسمين B1 مجموعة فرعية وB2 مع التشابه الجيني وصلت 51٪. أول المجموعة الفرعية (B1) بما في ذلك citrone فقط (CI) الأنواع ولكن المجموعة الفرعية الثانية (B2) وتنقسم الى مجموعتين (B2A وB2B)، ضمت المجموعة الأولى (B2A) البرتقال الحلو (أو) واليوسفي (MA ) مع التشابه الجيني عالية وصلت 69٪، وشملت المجموعة الثانية (B2B) volkamer الليمون (VL) أنواع فقط.


Article
Evaluated Several Genotypes Postings Wheat Bread (Triticum aestivum L.) Studying some Physiological Traits under The Influence of Salt Water
تقيم عدة تراكيب وراثية مدخلة من حنطة الخبز Triticum aestivum L. بدراسة بعض الصفات الفسلجية تحت تأثير الري بالماء المالح

Authors: Jassim M. A. AL-Joburi جاسم محمد عزيز الجبوري --- Hadeel A. Hatam Al-karkhi هديل عبدالله حاتم الكرخي --- Nawroz A. Tahir نوروز عبدالرزاق طاهر
Journal: Tikrit Journal for Agricultural Sciences مجلة تكريت للعلوم الزراعية ISSN: 18131646 Year: 2017 Volume: 17 Issue: وقائع المؤتمر العلمي السادس للعلوم الزراعية Pages: 560-578
Publisher: Tikrit University جامعة تكريت

Loading...
Loading...
Abstract

The experiment was conducted through winter season (2014-2015) in field of Agriculture administration /Kirkuk governate to estimate the genetic diversity for (17) genotypes of bread wheat Triticum aestivum L. under irrigation of two kinds, normal and salt water to estimate of genetic diversity were, the seeds of the genotypes were planted to evaluate the tolerance interaction between them, using RCBD design with three replicates at 19/11/2014. morphological traits were measured at tilleing and spike formation stage. The results showed that the (Atli ) genotype was surpassed in leaf area (1313.13 cm2), last duration of leaf area (46611.82 cm2/dur .time ), relative growth rate (0.007 mg/g / day ), photosynthesis net (0.00007 mg/cm2/ day ), flag leaf area (58.32 cm2), chlorophyll content (SPAD 44.41) , wet weight (27.24 gm/plant ) , relative water content (77.18 %), membrane utility (59.44%), The genotype (Lutfi bey ) was surpassed in dry weight (8.52 gm/plant ), relative growth rate (0.007 mgm/gm/day) , net photosynthesis (0.00008 mgm/cm2 /day), wet weight (26.07 gm/plant), membrane utility (60.08%), while other traits showed least differences unless plant height trait which showed no significant differences between studied genotypes . The results also showed that the increasing of salt level caused significant decreasing in all traits.

نفذت التجربة خلال الموسم الشتوي (2015-2014 ) في مشتل مديرية الزراعة/محافظة كركوك لتقيم (17) تركيب وراثي من حنطة الخبزTriticum aestivum L. تحت الري بمياه أعتيادية , ومياه مالحة ،زرعت بذورها في سنادين وفق تصميم القطاعات العشوائية الكاملة RCBD في تجربة عاملية بثلاثة مكررات , وتمت الزراعة في 19/11/2014 وعند بلوغ مرحلة التفرعات ومرحلة طرد السنابل تم قياس عدد من الصفات الفسلجية . أظهرت النتائج أنّ التركيب الوراثيAtli تفوق في صفة المساحة الورقية 1313.13) سم2) ومدة بقاء أقصى مساحة ورقية (46611.82 سم2.مدة القياس-1) ومعدل النمو النسبي0.007) ملغم.غم-1.يوم-1) ومساحة ورقة العلم 58.32) سم2) ومحتوى الكلوروفيل(44.41 SPAD) والوزن الطري 27.24)غم.نبات-1) ومحتوى الماء النسبي 77.18)%) , كما لوحظ تفوق التركيب الوراثيLutfi bey في صفة الوزن الجاف 8.52) غم.نبات-1) ومعدل النمو النسبي0.007) ملغم.غم-1.يوم-1) وصافي البناء الضوئي (0.00008 ملغم.سم2-.يوم1-) وثباتية الأغشية %60.08)) , كما بينت النتائج أنّ زيادة الملوحة قد سببت أنخفاضاً معنويآ في جميع صفات التراكيب الوراثية , أمَّا بالنسبة لتاثير التداخل بين التراكيب الوراثية ونوعية مياه الري فكان معنوياً في صفات المساحة الورقية ومدة بقاء اقصى مساحة ورقية والوزن الجاف للنبات ومعدل النمو النسبي .


Article
Estimate of The Genetic Diversity for Many Genotypes of Bread Wheat (Triticum aestivum L.) Depending on Productivity Traits under Salanity of The Water Effect
تقدير البعد الوراثي لعدة تراكيب وراثية من حنطة الخبز Triticum aestivum L. بالاعتماد على صفات الحاصل تحت تأثير الماء المالح

Authors: Hadeel. A. Hatam Al-karkhi هديل عبدالله حاتم الكرخي --- Jassim M. A. AL-Joburi جاسم محمد عزيز الجبوري --- Nawroz A. Tahir نوروز عبدالرزاق طاهر
Journal: Tikrit Journal for Agricultural Sciences مجلة تكريت للعلوم الزراعية ISSN: 18131646 Year: 2017 Volume: 17 Issue: وقائع المؤتمر العلمي السادس للعلوم الزراعية Pages: 612-629
Publisher: Tikrit University جامعة تكريت

Loading...
Loading...
Abstract

The experiment was conducted through winter season (2014-2015) in field of Agriculture administration /Kirkuk governate to estimate the genetic diversity for (17) genotypes of bread wheat Triticum aestivum L. under irrigation of two kinds, normal and salt water. to estimate of genetic diversity were, the seeds of the genotypes were planted to evaluate the tolerance interaction between them, using RCBD design with three replicates at 19/11/2014 . Seventeen morphological traits were measured at tillering and spike formation stage. The results showed that the (Atli) genotype was surpassed in biological yield (35.56 gm/plant), The genotype (Lutfi bey ) was surpassed in grain number rate (413.16 grain /plant ) , number of active tilleres (6.33 branch), active tillering ratio (73.83%), biological yield (35.49 gm/plant) and grain yield (10.75gm/plant), while other traits showed least differences unless plant height trait which showed no significant differences between studied genotypes. The results also showed that the increasing of salt level caused significant decreasing in all traits. The interaction was significant in most physiological traits unless plant height of these traits which were the interaction was no significant . The cluster analysis depending on the data of morphological traits showed for normal water and salt water which showed that the genotypes were clustered to three main groups, for normal water included the first group genotypes (TURKMEN, BEREKET, Atli, ZENGIRCI, Tosun, Lutfi bey, Bayrakler, KARAHAN, UZUNUALUA, DEMIR and PEHLIVAN ) . While the second main group included Seval genotype lonely . The third main group included the genotypes (Adana99, Kenan bey, Gerek, Sham6 and Gihan99). At irrigated with salt water, the first main group included the genotypes (Atli, ZENGIRCI, Bayrakler and UZUNUALUA), while the second main group included the genotypes ( Sham6, Gerek, Kenan bey, BEREKET, Seval, Adana99 and TURKMEN ) . The main third group included (Gihan99, KARAHAN, Lutfi bey, PAHLIVAN, Tosun and DEMIR ) genotypes . all the same had against these study diacritics good of genetic diversity .

نفذت التجربة خلال الموسم الشتوي (2015-2014 ) في مشتل مديرية الزراعة/محافظة كركوك لتقدير البعد الوراثي لـ (17) تركيب وراثي من حنطة الخبزTriticum aestivum L. تحت الري بمياه أعتيادية , ومياه مالحة لتقييم تحمل ستة عشر من التراكيب الوراثية المدخلة وصنف شام 6 المعتمد في الزراعة للملوحة والتداخل بينهما وفقا لتصميم القطاعات العشوائية الكاملة RCBD بثلاث مكررات , وتمت الزراعة في 19/11/2014 وتم قياس صفات الحاصل , وأُستخدمت في هذه الدراسة طريقة التوصيف المورفولوجي لتقدير البعد الوراثي . أظهرت النتائج أنّ التركيب الوراثيAtli تفوق في صفة الحاصل البايولوجي35.56) غم.نبات-1) , كما لوحظ تفوق التركيب الوراثيLutfi bey في صفة معدل عدد الحبوب ( 413.16 حبة.نبات-1) وعدد الإشطاء الفعّالة 6.33) فرع) ونسبة الأشطاء الفعّالة 73.83)%) والحاصل البايولوجي 35.49) غم.نبات1-) وحاصل الحبوب(10.75 غم.نبات1-) ولم تظهر صفة أرتفاع النبات فروقاً معنوية بين التراكيب الوراثية المدروسة , كما بينت النتائج أنّ زيادة الملوحة قد سببت أنخفاضاً معنويآ في جميع الصفات , أمَّا بالنسبة للتداخل فكان معنوياً في أغلب الصفات المدروسة وتفوق التركيب الوراثي Lutfi bey في صفات الحاصل ومكوناتة تحت الري بالمياه الاعتيادية والمالحة عدا صفة أرتفاع النبات إذ لم يكن التداخل فيها معنوياً . أُجري التحليل العنقودي بالأعتماد على بيانات الصفات المدروسة لمعاملة الري بالماء الأعتيادي والماء المالح اللذين أظهرا تقسيم التراكيب الوراثية إلى ثلاث مجاميع رئيسة ففي الري بالماء الأعتيادي تضمنت المجموعة الرئيسية الأولى التراكيب الوراثية TURKMEN و BEREKETوAtli وZENGIRCI وTosun و Lutfi bey وBayrakler وKARAHAN وUZUNUALUA وDEMIR و PEHLIVAN , أمَّا المجموعة الرئيسة الثانية فشملت التركيب الوراثي Seval بمفرده لتميزه بجميع الصفات المورفولوجية , مما يدل على البعد الوراثي لهذا التركيب الوراثي . بينما شملت المجموعة الرئيسة الثالثة التراكيب الوراثية Adana99وKenan bey وGerek وشام6 وجيهان 99, أمَّا عند الري بالماء المالح فتضمنت المجموعة الرئيسة الأولى الوراثيةAtli وZENGIRCI و Bayrakler وUZUNUALUA وشملت المجموعة الرئيسة الثانية التراكيب الوراثية شام6 و Gerek وKenan bey وBEREKET و Sevalو Adana99 وTURKMEN , أمَّا المجموعة الرئيسية الثالثة فقد شملت جيهان99 و KARAHAN و Lutfi bey و PAHLIVANو Tosun وDEMIR , وعلى الرغم من ذلك فقد عكست هذه الدراسة نسبة جيدة من التنوع الوراثي .

Listing 1 - 10 of 22 << page
of 3
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (22)


Language

English (13)

Arabic (6)

Arabic and English (2)


Year
From To Submit

2018 (4)

2017 (4)

2016 (3)

2015 (3)

2014 (4)

More...