research centers


Search results: Found 41

Listing 1 - 10 of 41 << page
of 5
>>
Sort by

Article
HEPATITIS C VIRUS GENOTYPES IN IRAQ
النمط الوراثي لفايروس التهاب الكبد نمط C في العراق

Author: Mohammad D. Khalid
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2012 Volume: 11 Issue: 2 Pages: 475-480
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

This study included 210 Hepatitis C Virus(HCV) infected patients 150 males and 60 females with an range of 3-50 years, they are 100 patients from thalassemic HCV infected, 100 patients from chronic liver disease HCV infected, and 10 persons from blood donors HCV infected. The study show 94(94%),85(85%),80(80%)from thalassemic and chronic liver disease and blood donors HCV infected carrier the HCV, genotype (4) respectively, and 5(5%), 10(10%). 20(20%) respectively carrier 1b genotype and 1(1%),5(5%)from thalassemic and chronic liver disease HCV infected respectively carrier mixed genotype (1b and 4). While 2(20%) from blood donor HCV infected HCV carrier 1b genotypes.

شملت الدراسة 210 مريضاً بالتهاب الكبد الفايروسي نمط C، 150 ذكوراً و 60 إناثاً والذين تراوحت أعمارهم بين 3-50 سنة، منهم 100 من مرضى الثلاسيميا و 100 من المصابين بالتهاب الكبد المزمن و 10 من متبرعي الدم وجميعهم مصابين بفايروس التهاب الكبد نمط C. وأظهرت الدراسة (94%،85%،80%) على التوالي من مرضى الثلاسيميا والتهاب الكبد المزمن ومتبرعي الدم المصابين بالتهاب الكبد نمط C يحملون النمط الوراثي 4، (5%،10%،20%) على التوالي يحملون النمط الوراثي 1b ،(1%، 5%) على التوالي من مرضى الثلاسيميا والتهاب الكبد المزمن يحملون النمط الوراثي المختلط 1b،4 بينما 20% من متبرعي الدم المصابين بفايروس التهاب الكبد الفايروسي نمط C يحملون النمط الوراثي 1b.

Keywords

HCV --- Genotype --- Iraq


Article
Determination of Toxoplasma gondii lineages of sheep in Wasit, Iraq
تحديد أنساب مقوسة كوندي في الأغنام في واسط، العراق

Author: N.N. A'aiz نعمان ناجي عايز
Journal: Iraqi Journal of Veterinary Sciences المجلة العراقية للعلوم البيطرية ISSN: 16073894 Year: 2016 Volume: 30 Issue: 2 Pages: 23-26
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

Toxoplasma gondii is an intracellular parasite that can cause significant morbidity in human beings and animals. Up to our knowledge no data is known of genetic diversity of T. gondii in sheep in Iraq. This study aim to detect the strains (genotypes) of T. gondii isolates from sheep in Wasit province, east of Iraq. A total of 315 samples (blood 300 and placenta's tissue 15) were collected from aborted ewes, which initially had been examined serologically by LAT, then further tested by RT-PCR through B1 gene amplification to confirm the infection with T. gondii. After that, the positive DNA samples were assayed for genetic characterization depending upon nested PCR- RFLP of SAG2 gene. Out of 315 examined samples, 10 were confirmed positive T. gondii DNA. The genotyping assay of them revealed that 60% (6/10), 30% (3/10) and 10% (1/10) of examined isolates represent the genotypes of II, III and I respectively. The type II appeared as dominant in sheep in Wasit province, Iraq.

مقوسة كوندي هو طفيلي يعيش داخل الخلايا والذي يمكن أن يسبب اصابات مرضية كبيرة في البشر والحيوانات. وحسب معلوماتنا فأنه لا توجد بيانات معروفة حول التنوع الجيني لطفيلي مقوسة كوندي في الأغنام في العراق. لذا فأن الهدف من الدراسة هو للكشف عن السلالات (المورثات) التابعة للطفيلي المعزول من الأغنام في محافظة واسط، شرق العراق. تم جمع 315 عينة (دم 300 و 15 نسيج مشيمة) من النعاج المجهضة، حيث فحصت أولا مصليا بواسطة فحص التلازن لاتكس، ومن ثم فحصت باستخدام تفاعل السلسة المتبلمرة في الوقت الحقيقي من خلال تضخيم الجين B1 لتأكيد الإصابة بطفيلي مقوسة كوندي. بعد ذلك، تم أختيار العينات الموجبة وفحصها لغرض التوصيف الوراثي حسب طريقة PCR-RFLP بالاعتماد على الجين SAG2. ظهر من بين 315 عينة تم فحصها، أن هنالك 10 عينات كانت موجبة لوجود الحمض النووي الخاص بمقوسة كوندي. وكشف فحص التنميط الجيني أن 60٪ (10/6) و 30٪ (10/3) و 10٪ (10/1) من العزلات المفحوصة تمثل الأنماط الوراثية الثاني والثالث والأول على التوالي. ويبدو أن النمط الثاني هو المهيمن في الأغنام في محافظة واسط، العراق.

Keywords

Toxoplasmosis --- Genotype --- Ovine --- Iraq


Article
Adiagnostic Study Of The Giardia Lamblia Parasite Genotypes, Which Causes Diarrhea Among The Patients In Najaf, Province, By Using The PCR Technique
دراسة تشخيصية للأنـماط الوراثية لطفيلي Giardia lamblia المسبب للإسهال لدى المرضى في محافظة النجف بأستخدام تقنية الـ PCR

Authors: Widad Hashim Yahya --- Jameel Jerri Yousif
Journal: kufa Journal for Nursing sciences مجلة الكوفة لعلوم التمريض ISSN: 22234055 Year: 2013 Volume: 3 Issue: 2 Pages: 7-16
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

Objective: It aims to study the prevalence of the Giardia lamblia parasite and identify genotypes of the parasite in patients with diarrhea in the province of Najaf by using the microscopic examination and the polymerase chain reaction( PCR).Methodology: The Present study was carried out in the Department of Biology - College of Education for Girls - University of Kufa for the period from July 2011 until June 2012. The number of collected samples (100) stool samples from hospitals of Najaf province (Al-Sadr teaching hospital, Al-Hakim general hospital,Al-Zahra for childbirth and children hospital, Manathira general hospital and Al- Sajad general hospital) .The statistical analysis , by using t-test and ANOVA anad calculate the less significant diffirence (L.S.D) at the level 0.05. Results: The results of the extraction (100) Stool Samples by microscopic examination , presence of the gentic material DNA of the G. lamblia Parasite in (41) Samples and by 41% , and results of the examination by PCR by using Triose phosphate isomerase (Tpi) Showed that there are significant differences at the level of probability, p ˂ 0.05. where the highest percentage infection with the genotype (B) compared with the genotype (A), were 61% and 39.1% respectively. The highest rate of infection with the genotype (B) in the semi-liquid samples was 69.3% compared to of liquid samples, which amounted to 67.9%, while the genotype (A) has the highest rate of infection in the liquid samples, which amounted to 32.2% while it was 30.8% in the semi -liquid samples . As the results showed that the percentage of infected male with the genotype (B) is more than it in females, reaching 62.5% and 58.9%, respectively, and type (A) was incidence of females was higher than in males, 41.2% and 37.5% respectively. As the results show the spread of genotype (B) in the urban area is more than it in the rural, the percentage of infection is,72.8% and 66.7% respectively, while type (A )was more prevalent in rural than in the urban, where the percentage of infection is 33.4% and 27.3% respectively. Conclusion: The highest rate of infection with the genotype (B) in the semi-liquid samples compared to of liquid samples, while the genotype (A) has the highest rate of infection in the liquid samples, compared the semi -liquid samples .Recommendation: Further study the relationship between the symptoms and the genotypes of Giardia lamblia.

الهدف: تهدف الدراسة الحالية تحديد الأنماط الوراثية لطفيلي Giardia lamblia لدى المرضى المصابين بالإسهال في محافظة النجف بتقنية تفاعل السلسلة المتبلمرة ( PCR) .المنهجية أجريت الدراسة الحالية في قسم علوم الحياة - كلية التربية للبنات- جامعة الكوفة للفترة من تموز 2011 ولغاية حزيران 2012وكان عدد العينات التي جمعت (100) عينة براز من مستشفيات محافظة النجف (مستشفى الصدر التعليمي , مستشفى الحكيم العام , مستشفى الزهراء للولادة والأطفال , مستشفى المناذرة العام , مستشفى السجاد) وكان التحليل الإحصائي المستخدم اختبارt-test و ANOVA واستخراج أقل فرق معنوي ((L.S.D عند مستوى أحتمال 0.05. النتائج بينت نتائج استخلاص (100) عينة براز للمرضى التي أظهرها الفحص ألمجهري وجود طفيلي G. lamblia فيها الى احتواء (41) عينة منها على المادة الوراثية DNA للطفيلي وبنسبة 41 % وأوضحت نتائج فحص الـ PCRالتي حللت إحصائيا أن هنالك فروقات معنوية عند مستوى احتمال P˂ 0.05.حيث أن أعلى نسبة إصابة بالنمط الوراثي ( B) مقارنة بالنمط الوراثي ( A) التي بلغت 61% و 39.1% على التوالي .وكانت أعلى نسبة للإصابة بالنمط ( B) في العينات شبه السائلة أذ كانت 69.3% مقارنة بالعينات السائلة التي بلغت 67.9 % , أما النمط الوراثي ( A) فقد كانت أعلى نسبة للإصابة في العينات السائلة التي بلغت 32.2 % في حين كانت في العينات شبه السائلة 30.8 % . كما وبينت النتائج أن نسبة إصابة الذكور بالنمط الوراثي B هي أكثر مما هو عليه في الإناث أذ بلغت 62.5% و 58.9% على التوالي أما النمط A فقد كانت نسبة إصابة الإناث أعلى مما هو عليه في الذكور حيث كانت 41.2% و 37.5% على التوالي . كما وأظهرت النتائج انتشار النمط الوراثي B) ) في المدينة أكثر مما هو عليه في الريف فقد بلغت نسبة الإصابة 72.8% و 66.7% على التوالي , بينما النمط الوراثي (A ) كان أكثر انتشارا في الريف مما هو في المدينة حيث بلغت نسبة الإصابة 33.4 % و 27.3% على التوالي.الاستنتاجات :. كانت أعلى نسبة للإصابة بالنمط ( B) في العينات شبه السائلة مقارنة بالعينات السائلة, أما النمط الوراثي ( A) فقد كانت أعلى نسبة للإصابة في العينات السائلة مقارنة في العينات شبه السائلة .التوصيات : أجراء دراسة مستقبلية عن العلاقة بين أعراض مرض الجيارديا والأنماط الوراثية لطفيلي G.lamblia .


Article
Genotyping of cystic echinococcosis isolates from clinical samples of human and domestic animals
جينوتايب أبواغ الايكانوكوكس والمعزولة من عينات سريرية في الانسان والحيوانات المستانسة

Authors: S.A. Fadhil سامر عباس فاضل --- N.N. A'aiz نعمان ناجي عايز
Journal: Iraqi Journal of Veterinary Sciences المجلة العراقية للعلوم البيطرية ISSN: 16073894 Year: 2016 Volume: 30 Issue: 2 Pages: 33-39
Publisher: Mosul University جامعة الموصل

Loading...
Loading...
Abstract

Cystic hydatid disease is a cosmopolitan important disease in both human and animals. Many strains were investigated in this parasite. The aim of study was to characterize genotype variations of Echinococcus granulosus isolates collected from human and domestic animals in Al-Qadisiyah province/ Iraq based on sequencing of nad1 mitochondrial gene. Eighty hydatid cysts of human (12), sheep (15), cattle (36), and camels (17) were collected from hospital and slaughter house of the province, during October 2014 to June 2015; microscopic examination was made for cysts fluid to determine the fertility. DNAs extraction was done for each sample in addition to purify and concentrate of extracted DNA samples was performed to determine nad1 (400bp) gene used conventional PCR method. Phylogenetic analysis was performed using NCBI-Blast Alignment identification and Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean. Twenty five (10 from human and 5 from each studied animals) samples were chosen due to their fertility and high DNA purity, in which three strains (genotypes) were investigated including sheep strain (G1) 40%, buffalo strain (G3) 48% and camel strain (G6) 12%, where human samples related to G1(20%) and G3(80%); sheep samples related to G1(80%) and G3(20%); cattle samples related to G1(60%), G3 (20%) and G6 (20%); camels samples related to G1(20%), G3(40%) and G6(40%). The dominant strain is a buffalo strain (G3); both of buffalo strain (G3) and sheep strain (G1) represented the actual source of human infection. There is no host specificity of detected genotypes.

داء الأكياس العدرية هو مرض مهم واسع الأنتشار في كلا من الأنسان والحيوان؛ هنالك عدة عتر درست في هذا الطفيلي؛ الدراسة الحالية هدفت الى تمييز الاختلاف الجيني لعزلات طفيلي المشوكات الحبيبية التي جمعت من الأنسان والحيوانات المستأنسة في محافظة القادسية/ العراق؛ بالأعتماد على تسلسل جين nad1 الموجود في المايتوكوندريا. تم جمع ثمانون كيس عدري من الأنسان (12) والأغنام (15) و الأبقار (36) والجمال (17)؛ حيث جمعت من مستشفى ومجزرة المدينة خلال الفترة من تشرين الأول 2014 لغاية حزيران 2015؛ أجري الفحص المجهري على سائل الأكياس لتحديد خصوبتها وأستخلص الحمض النووي من العينات وتم قياس نقاوة وتركيز الحمض النووي المستخلص. أستخدمت طريقة تفاعل السلسلة المتبلمرة العادية لتحديد الأصابة حسب الجين nad1 (400 زوج قاعدي) ثم أجري التحليل الجيني الوراثي بأستخدام موقع المركز العالمي للمعلومات التقنية الأحيائية وتحديد المحاذاة وطريقة زوج المجموعة الغير مرجح مع المتوسط الحسابي. أختيرت خمسة وعشرون عينة حسب خصوبتها ونقاوة الحمض النووي فيها (10 من الأنسان و5 من كل من الحيوانات المدروسة الأخرى) حيث وجدت ثلاثة عتر (سلالات) شملت عترة الأغنام ((G1 بنسبة 40% و عترة الجاموس (G3) بنسبة 48% وعترة الجمال ((G6 بنسبة 12%؛ وسجلت عترتي الجاموس والأغنام نسبة 80% و 20% حسب التوالي من عينات الأنسان في حين سجلت عكس النسبة بالنسبة للعترتين في الأغنام, و ظهرت في الأبقار ثلاثة عتر وهي عتر الأغنام والجاموس والجمال بنسب 60% و 20% و 20% على التوالي, أما عينات الجمال فكانت نسبة 20% منها تعود الى عترة الأغنام و 40% الى كل من عترتي الجاموس والجمال. إن عترة الجاموس G3 تمثل العترة السائدة, وإن المصدر الحقيقي لأصابة الأنسان هو كل من عترتي الجاموس والأغنام حيث لاتوجد خصوصية الأصابة للمضيف بالنسبة للعتر الموجودة.

Keywords

Echinococcus --- Hydatid cyst --- Genotype --- Iraq


Article
Effect of MDR1 Gene Expression Related with C1236T Polymorphism in Iraqi Acute Myeloid Leukemia patients
تأثير تعبير جين المقاومة المتعددة MDR1 وعلاقته مع تعدد طرز الموقع C1236T في مرضى ابيضاض الدم النخاعي الحاد العراقيون

Author: Abdul Hussein M. AL-Faisal 1 Kifah Jabbar Alyaqubi 2
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2014 Volume: 13 Issue: 2-2 Pages: 253-265
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Single nucleotide polymorphism (SNP) in multidrug resistance gene1 (MDR1) could alter the gene expression level and may have effect role in responses to drug therapy and diseases susceptibility. The aim of the present study is to investigate allele frequency in Iraqi healthy and acute myeloid leukemia (AML) patients to detect the susceptibility of C1236T genotype carrier to develop AML. Also the study aimed to correlate the expression level of MDR1 mRNA with MDR1 C1236T polymorphism in newly diagnosed AML patients to predict clinical outcomes at initial diagnosis. The results showed there was a significant difference in genotype and allele frequency with heterozygous CT in AML while appeared significant with CC wild type in healthy control. Both AML and control showed non-significant in allele frequency. In regard with gene expression the healthy control showed significantly high level of MDR1 mRNAs expression in CC genotype at position 1236 compared with CT and TT. Whereas MDR1 heterozygous 1236CT genotype was showed highly significant difference in MDR1 mRNA expression among AML patients. According to the clinical outcome status MDR1 C1236T genotype showed statistically high significant differences with low level of CC genotype compared to CT/TT genotype at initial diagnosis in NR patients, while CR group was showed non-significantly with MDR1 C1236T polymorphism. In conclusion healthy Iraq populations have predominantly CC genotype and appeared a protective genotype, while MDR1 1236CT/TT genotype were indicated affected genotype and associated with poor prognosis in de novo AML patients, while CC appeared good prognosis.

ان تعدد طرز النيوكليوتيدة المفردة SNP في جين المقاومة المتعددة MDR1 قد يؤدي الى تغيير تعبير الجين MDR1 مما له تأثير على الاستجابة للعلاج الكيميائي وعلى حساسية المرض. أن هدف هذه الدراسة هو تحديد تكرار اليلات الجين في مرضى ابيضاض الدم النخاعي الحاد العراقيون ولمعرفة حساسية الطراز الوراثي للموقع C1236T وعلاقته بالإصابة بالمرض. كما هدفت الدراسة الى ايجاد العلاقة بين مستوى تعبير جين المقاومة المتعددة و طرزه الوراثية في المرضى المشخصين حديثا للاستفادة منها في التشخيص والتوقع الطبي للمرض. بينت الدراسة بوجود اختلاف معنوي في المظاهر الوراثية و تكرار الاليلات مع الزيجة المغايرة للطراز الوراثي MDR1 C1236CT في المرضى مقارنة مع معنويه في الطراز الوراثي MDR1 C1236CC في الاصحاء. كما بينت النتائج بأن كلا المرضى والاصحاء بينوا عدم معنوية تكرار الاليلات. بينما كان تعبير الجين MDR1 معنوي عالي في طرازه الوراثي MDR1 C1236CC مقارنة مع طرزه الوراثية MDR1 C1236CTوMDR1 C1236TT عند الاصحاء بينما كان المظهر الوراثي مغاير الزيجةMDR1 C1236CT عالي المعنوية عند المرضى. واستنادا للتوقع الطبي للمرض فأن الطراز الوراثي MDR1 C1236CT كان مختلف معنويا وعاليا مع انخفاض الطرز الوراثية MDR1 C1236CC و MDR1 C1236CCTT عند التشخيص الاول للمرض. بينما كانت مجموعة ذات تعدد طرز وراثية غير معنوي. وكخلاصة فأن تكرار الطراز الوراثي MDR1 C1236CC شائع لدى الاصحاء العراقيون ويبدو انه مرتبط مع الحماية بينما تمثل الطرز MDR1 C1236CTTT الطرز المتأثرة والتي ترتبط مع تشخيص ضعيف للمرض مقارنة مع الطرازMDR1 C1236CC الذي يمثل طراز جيد لتشخيص المرض.

Keywords

C1236T --- MDR1 --- AML --- Genotype --- SNP --- Iraq.


Article
Association Between Polycystic Ovary Syndrome and Genetic Polymorphisms of CYP 17 Gene in Iraqi Women

Author: Marwa B. Mohammed1, Salwa J. AL-Awadi2, Mahfoodha A. Omran3
Journal: Iraqi Journal of Biotechnology المجلة العراقية للتقانات الحياتية ISSN: 18154794 Year: 2015 Volume: 14 Issue: 2 Pages: 99-110
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Polycystic ovary syndrome (PCOS), whose genetic basis is not completely well understood, it is the most common endocrine disorder in women in their reproductive years. Blood samples were collected from two groups. The first group included 61 females with PCOS and the second group included 30 normal females to detect the presence of mutation in the CYP17 gene. The two groups were genotyped and a comparison was done between them. The results showed a significant difference (p<0.05) in FSH levels in patients and normal females and there is no significant difference in the levels of Testosterone, prolactin and LH. Moreover, it showed a significant difference (p<0.05) in the levels of HDL in both patients and normal females and no significant difference in the levels of (LDL, VLDL, Triglyceride and cholesterol). Two comparisons for genotype were done: one between age and genotype and the second between BMI and genotype for each group. The results showed two types of genotype, which were a TT wild type and a heterozygote TC mutant type. Furthermore, the results showed a significant difference (p<0.05) in genotype TT and TC in the group of age less than 25 years old and no significant difference in these genotypes in age groups (25-35) and those with more than 35 years old. It is concluded from this study that this single nucleotide polymorphism in the CYP 17 gene was not associated with PCOS in Iraqi women.

Keywords

PCOS --- BMI --- CYP17 --- SNP --- RFLP --- genotype.


Article
Hepatitis G virus infection and genotypes in Iraqi thalassemia patients

Authors: Maryam S. Ibrahim --- Arwa H. Al.Hamdani --- Ashnaj.faeq
Journal: Iraq Joural of Hematology المجلة العراقية لامراض الدم ISSN: 20728069/25432702 Year: 2015 Volume: 4 Issue: 1 Pages: 67-81
Publisher: Al-Mustansyriah University الجامعة المستنصرية

Loading...
Loading...
Abstract

Background: HGV infects patients at risk for parenteral exposure and chronic bloodtransfusion, such as those with β- thalassemia major.Objectives: This study was designed to investigate the prevalence of HGV infection inthalassemia patient and furthermore to sequence and analyze phylogentic of HGV.Materials and methods: A prospective study conducted between Feb. to May, 2014. A totalof 154 Beta thalassemia patients (87 male; 67 female), from Alkarama teaching hospital andIbn AL-baladi hospital maternity &children's hospital; aged 18-50 years , who receivedregular blood transfusions were included in the study. All patients were screened forAntibody against E2 glycoprotein of HGV (Anti-E2 Ab) by using ELISA to detect thepresence of HGV infection. While Detection of HGV genomes was done by RT-PCR.Results: One hundred fifty four thalassemia patients (87 male, 67 female) of 18-50 yearswere involved in this study. Using the ELISA method, Anti-HGV was detected in 16 patientsout of 154 (10.4%) with peak prevalence age group was between 20-24 years. Reversetranscription - polymerase chain reaction (RT-PCR) showed HGV-cDNA was detected in 28(18.2%) only. The peak age prevalence of HGV infection was under 20 years; however, therewere no significant differences in prevalence among two sexes or number of bloodtransfusion. The results of genotyping in 12 randomly selected patients showed presence ofgenotype 2 and genotype 5 with percentage of 91.7% and 8.3% respectively.Conclusion: the prevalence rate of HGV RNA in β-thalassemia major patients is 18.2%,while the prevalence rate of anti-HGV (past infection) is 10.4%. No one of thalassemiapatients had HGV RNA and anti-HGV simultaneously. The Gene sequence analysis of PCRproducts identified HGV genotypes 2 and 5 with percentage of 91.7% and 8.3% respectively


Article
Genotype Distribution of Angiotensin I- Converting Enzyme in Iraqi Arab Population
توزيع التغايرات الاليلية لجين الانزيم المحول للانجيوتينسين للعراقيين العرب

Loading...
Loading...
Abstract

The angiotensin-converting enzyme (ACE) gene in humans has an insertion-deletion (I/D) polymorphic which producethree allelic variants: II, ID & DD that associated with population relativity and relation with many geneticdisease. The polymorphisms of ACE gene were investigated using polymerase chain reaction. The results showed a highfrequency of the DD allele among the Iraqi Arab populations (50%), which is similar to those obtained from previousstudies for Arab populations. More ever the distribution of ACE genotype among male and female (n= 100, 53male & 47female) showed DD: 47.17%, II: 22.6% & ID: 30.19% in the male group and DD: 40.43%, II: 17.02% & ID42.55:%in the female group. Significant association of hypertension & diabetic with D allele of the ACE gene has been in IraqiArab population.

يحتوي جين الانزيم المحول للانجيوتينسين (ACE) في الانسان على نوعين من التغايرات الوراثية: الادراج والحذف (I/D) مما ينتج ثلاث انواع من الطرز الجينية:(II, ID & DD) والتي لها علاقة باصول المجتمعات وارتباطها ببعض الامراض الوراثية مثل ارتفاع ضغط الدم والسكر. في هذه الدراسة تم التحري عن التغايرات الوراثية لجين (ACE) باستعمال تقنية التفاعل المتسلسل لانزيم بلمرة الـ DNA (PCR) واظهرت النتائج انتشار الطرز الاليلي (DD) اذ وجد بنسبة 50% بين العراقين العرب وهي نتيجة مشابه لبقية الدراسات التي اجريت على الشعوب العربية. كما كشفت الدراسة عن التوزيع الاليلي في الذكور والاناث حيث كانت: (DD:47.17%, II:22.6% & ID:30.19%) للرجال و(DD:40.43%, II:17.02%& ID42.55:%) للنساء. كما اظهرت الدراسة وجود ارتباط معنوي بين شكل التغاير الاليلي DD ووجود الامراض الوراثية ( ارتفاع ضغط الدم والسكر ) في العراقين العرب.


Article
Stability Parameters For Yield and Some of It's Components in Upland Cotton (Gossypium hirsutum L.)
معلمات الاستقرارية للحاصل وبعض مكوناته في القطن الابلند (Gossypium hirsutum L.)

Loading...
Loading...
Abstract

Genotypes of upland cotton IK8, S29, S118, Coker 310, Curds 26, Condor, Deer 22 and Aleppo 33 were planted in the farm guidance for the development of cotton cultivation in Sharqat, the elimination of the Agriculture Department of Salah al-Din during the growing seasons 2013 and 2014 at the distances cultivation between plants 15, 20, 25 and 30 cm between plants (their combinations represent eight different environments) by using a randomized complete design with three replications, in order to evaluate it's stability for characters: number of days to first boll opening, plant height, number fruiting branches, number bolls per plant, boll weight and seed cotton yield per plant. Combined analysis of variance results showed that the mean square of each of the environments, genotypes and that related to the interaction genotypes x environments was significant for all characters expected number bolls per plant seed cotton yield per plant was not significant. The variations related to the environments was much greater than those of each of the genotypes and interaction for all characters. The broad sense heritability appeared high for number of days to first boll opening and number of fruiting branches per plant, moderate for plant height and low for the rest of characters. Results of stability parameters showed that genotype S29 was high stable for four characters (number of days to first boll opening, number of fruiting branches per plant, number of bolls per plant and seed cotton yield per plant), and showed a high response in good environments only for number of bolls per plant and boll weight, followed by the genotype Ik378 which showed high stability for three characters (number of fruiting branches, number of bolls per plant and boll weight) and its response was high seed cotton yield only in good environments, and these findings offer the possibility to benefit from genotypes of high stability in future breeding programs by hybridization to create new varieties characterized by good productivity and quality characters and stable in a wide range of environmental changes, in addition to the possibility of extend grow at a wide range of environmental conditions.

زرعت التراكيب الوراثية من القطن الابلند IK8 وS29 وS118 وكوكر 310 وكورد 26 وكوندور ودير 22 وحلب 33 في المزرعة الإرشادية لتطوير زراعة القطن في قضاء الشرقاط التابعة لمديرية زراعة صلاح الدين خلال الموسمين الزراعيين 2013 و2014 عند مسافات زراعة بين النباتات 15 و20 و25 و30 سم (توافيقها تمثل ثمانية بيئآت مختلفة) باستخدام تصميم القطاعات العشوائية الكاملة بثلاثة مكررات، بهدف تقييم استقراريتها لصفات عدد الايام حتى تفتح اول جوزة وارتفاع النبات وعدد الأفرع الثمرية/نبات وعدد الجوز المتفتح/نبات ومتوسط وزن الجوزة وحاصل القطن الزهر بالنبات. اظهرت نتائج تحليل التباين التجميعي ان متوسط مربعات كل من البيئات والتراكيب الوراثية وذلك العائد لتداخل التراكيب الوراثية x البيئات كان معنوياً للصفات جميعها عدا صفتي عدد الجوز المتفتح/نبات وحاصل القطن الزهر/نبات فهي غير معنوية للتراكيب الوراثية، وكانت الاختلافات العائدة إلى البيئات اكبر كثيراً من تلك العائدة لكل من التراكيب الوراثية والتداخل للصفات جميعها. ظهر التوريث بالمعنى الواسع عالياَ لصفتي عدد الايام لتفتح اول جوزة وعدد الافرع الثمرية بالنبات ومتوسطاَ لارتفاع النبات وواطئاً لبقية الصفات. بينت نتائج معلمات الاستقرارية ان التركيب الوراثي S29 كان عالي الاستقرارية لاربعة صفات (عدد الايام لتفتح اول جوزة وعدد الافرع الثمرية بالنبات وعدد الجوز بالنبات وحاصل القطن الزهر بالنبات)، واظهر استجابة عالية فقط في البيئآت الجيدة لصفتي عدد الجوز بالنبات ومتوسط وزن الجوزة، تلاه التركيب Ik378 الذي ابدى استقرارية عالية لثلاث صفات (عدد الافرع الثمرية وعدد الجوز بالنبات ومتوسط وزن الجوزة) واستجابة عالية لحاصل القطن الزهر فقط في البيئآت الجيدة، وهذه النتائج تتيح امكانية الاستفادة من التراكيب عالية الاستقرارية في برامج التربية بالتهجين المستقبلية لايجاد اصناف جديدة تتميز بمواصفات انتاجية ونوعية جيدة وثابتة في مدى واسع من التغيرات البيئية، اضافة الى امكانية التوسع بزراعتها عند مدى واسع من الظروف البيئية.


Article
GENOTYPE VERSUS PHENOTYPE TO DETERMINE THE DEFINITIVE IDENTIFICATION OF THE GENERA CHLORELLA BEIJERINCK, 1890 (CHLORELLACEAE) AND COELASTRELLA CHODAT, 1922 (SCENDESMACEAE)
النمط الوراثي مقابل النمط المظهري لتحديد التشخيص النهائي للجنسين Chlorella Beijerinck, 1890 (Chlorellaceae) و Coelastrella Chodat, 1922(Scendesmaceae)

Authors: Ali M. Najem علي مؤيد نجم --- Ghusoon A. Abdulhasan غصون علي عبد الحسن --- Ibrahim J. Abed إبراهيم جابر عبد
Journal: Bulletin of the Iraq Natural History Museum مجلة متحف التاريخ الطبيعي العراقي ISSN: Print ISSN: 10178678, Online ISSN: 23119799 Year: 2018 Volume: 15 Issue: 1 Pages: 101-111
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Conventional identification of three coccoid green algae isolates was attempted to characterize the studied algae morphologically under compound microscope, which demonstrated confusional phenomenal convergence; all were classified microscopically as the green alga Chlorella vulgaris Beijerinck, 1890. Phylogenetic studies were conducted to settle the argument about the phenotype by studying the genotype. Genotype the promising field in advance classification by using 18S rRNA and compared to GenBank database using to search the related sequences. The determined sequences showed high a similarity to the strains registered in GenBank. Phylogenetic tree of ITS within 18S RNA were analyzed: the phylogram separated into two clusters, the first cluster included C1-ITS-Iraq and C2-ITS-Iraq and put with Coelastrella Chodat, 1922 which was well supported in bootstrap tests (86-100%), while the second cluster included C3-ITS-Iraq and put with C. sorokiniana Shihira and Krauss, 1965, which have bootstrap value 100% with the mentioned species. however, in this study, the green alga Colestrella was identified as new record genus in Iraqi freshwater belonged to the order Sphaeropleales.

اجريت محاوله للتشخيص التقليدي لثلاث عزلات من الطحالب الخضراء الكروية الدقيقة والتي شملت وصف الطحالب المدروسة شكليا تحت المجهر الضوئي المركب والذي أظهر التقارب الهائل فيما بينها، وقد شُخصت جميعها على أساس انها الطحلب الأخضرBeijerinck, 1890 vulgaris .Chlorella أجريت دراسات للتطور الوراثي لتفسير الحجة حول النمط المظهري من خلال دراسة النمط الوراثي والذي يمثل الحقل الواعد في التصنيف باستخدام 18S rRNA ومقارنتها مع قاعدة بيانات بنك الجينات باستخدام البحث في التسلسلات ذات الصلة، اذ أظهرت التسلسلات المحددة تشابهاً عالياً مع السلالات المسجلة في بنك الجينات. جرى تحليل الشجرة التطورية لمنطقة ITS ضمن 18S rRNA؛ وقسم المخطط التطوري إلى مجموعتين، ضمّت المجموعة الأولى العينات C1-ITS-Iraq و C2-ITS-Iraq وتم تشخيصها مع جنس Chodat, 1922 Coelastrella و التي تم دعمها بشكل جيد في اختبارات bootstrap (86-100٪) في حين ضمت المجموعة الثانية عينة C3-ITS-Iraq وضعت مع النوع Shihira and Krauss, 1965 Chlorella sorokiniana وبقيمة bootstrap 100% مع النوع المذكور، علما ان الطحلب Coelastrella قد سُجّل في هذه الدراسة كجنس جديد في المياه العذبة العراقية والعائد الى رتبة .Sphaeropleales

Listing 1 - 10 of 41 << page
of 5
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (41)


Language

English (20)

Arabic (12)

Arabic and English (7)


Year
From To Submit

2019 (4)

2018 (5)

2017 (4)

2016 (7)

2015 (8)

More...