research centers


Search results: Found 1

Listing 1 - 1 of 1
Sort by

Article
Detection of Pseudomonas aeruginosa in Clinical Samples Using PCR Targeting ETA and gyrB Genes
الكشف عن السلالات المرضية لبكتريا Pseudomonas aeruginosa باستهداف جيني الضراوة ETA و gyrB

Authors: Khulod Ibraheem Hassan خلود ابراهيم حسن --- Saman Rafeeq Abdullah سامان رفيق عبدالله
Journal: Baghdad Science Journal مجلة بغداد للعلوم ISSN: 20788665 24117986 Year: 2018 Volume: 15 Issue: 4 Pages: 401-405
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Pseudomonas aeruginosa has variety of virulence factors that contribute to its pathogenicity. Therefore, rapid detection with high accuracy and specificity is very important in the control of this pathogenic bacterium. To evaluate the accuracy and specificity of Polymerase Chain Reaction (PCR) assay, ETA and gyrB genes were targeted to detect pathogenic strains of P. aeruginosa. Seventy swab samples were taken from patients with infected wounds and burns in two hospitals in Erbil and Koya cities in Iraq. The isolates were traditionally identified using phenotypic methods, and DNA was extracted from the positive samples, to apply PCR using the species specific primers targeting ETA, the gene encoding for exotoxin A, and gyrB gene. The results of this study indicate that 100% of P. aeruginosa isolates harbored the gyrB gene, whereas 74% of these isolates harbored ETA gene. However, the specificity of PCR for detection of P. aeruginosa based on the both genes was 100%, since no amplified product obtained using DNA extracted from other bacterial species. Hence by considering the importance of rapid detection of this bacterium due to the presence of problems in biochemical methods, PCR targeting multiple virulence genes is suggested in identification of pathogenic strains of P. aeruginosa isolated from some infections which should speed diagnosis of an antimicrobial therapy.

تمتلك بكتريا Pseudomonas aeruginosa مجموعة متنوعة من عوامل الضراوة التي قد تساهم في قدرتها المرضية، لذلك فإن الكشف السريع بدقة عالية يلعب دورا حاسما في السيطرة على هذه البكتيريا المسببة للأمراض. ان الهدف من هذه الدراسة هو تقييم دقة تقانة تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) ، باستهداف جيني ETA و gyrB ، وذلك للكشف عن السلالات المرضيه لبكتريا P. aeruginosa. وولتحقيق ذلك ، تم أخذ 70 مسحة من المرضى المصابين بالجروح الملتهبة، والحروق من مستشفيين في مدينتي أربيل وكويا في العراق . شخصت العزلات باستخدام الطريقة التقليديه المعتمدة على الصفات المظهريه والصفات الكيموحية، بعدها استخدمت الطرق الجزيئيه في التشخيص بعد استخلاص الحمض النووي من العينات الموجبة للصفات السابقة، وذلك لتطبيق تفاعل اتفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) باستخدام البادئات النوعية المحددة للنوع والتي تستهدف الجين ETA والجين الـ gyrB . اظهرت نتائج هذه الدراسة إلى وجودحزمة تمثل القطعة المتضاعفة من الجينgyrB في جميع العينات المدروسة في حين تم الكشف عن وجود الجين ETA في 74% من العينات عند تطبيق تفاعلاتPCR . إلا أن تخصص ال PCR وباستهداف كلا الجينين لتشخيص بكتريا P. aeruginosa كانت 100٪ وذلك بسبب عدم الحصول على اي قطعه متضاعفة باستخدام DNA المستخرج من أنواع بكتيرية أخرى ، لذلك و لاهميه الكشف السريع عن هذه البكتيريا بسبب وجود مشاكل في الطرق التقليديه البطيئة تعد تقنيةPCR التي تكشف عن اكثر من جين ضروريه جدا في تشخيص السلالات المرضية من P. aeruginosa والتي تساهم بدورها في تحديد المضاد البكتري الفعال لتلك البكتريا.

Listing 1 - 1 of 1
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (1)


Language

English (1)


Year
From To Submit

2018 (1)