research centers


Search results: Found 13

Listing 1 - 10 of 13 << page
of 2
>>
Sort by

Article
Tracking of Ceotaneous Leishmaniasis by Parasitological, Molecular and Biochemical Analysis
تعقب الليشمانيا الجلدية بالاختبارات التحليلية الطفيلية والجزيئية والكيموحيوية

Authors: Thikra Abdullah Mahmood --- Muhsin A. Al-Dhalimi --- Baqur A. Sultan --- Sundus Nsaif AL- Hucheimi
Journal: kufa Journal for Nursing sciences مجلة الكوفة لعلوم التمريض ISSN: 22234055 Year: 2015 Volume: 5 Issue: 1 Pages: 65-74
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

Background: In areas of endemicity without sufficient laboratory infrastructure, identification of Leishmaniaparasites is useful for control and preventive plan and very important since species differentiation is instrumental in selection of optimal therapy and treatment regimens.Aim: The present study was performed to identify the species and strain of Leishmaniaparasiteisolated from different endemic areas .Materials and Methods: In a consecutive series of 126 patients referred for a suspected CL lesion during October 2010 to December 2012 in five Iraqi provinces, direct smear and culture followed by molecular and biochemical analysis were done using nested-PCR and cellulose acetate electrophoresis. Results: Direct smears revealed that 90 (71%) patients gave positive results under light microscope. Out of 126 cases,83(65%) gave positive growth in modified NNN medium and RPMI-1640 with fetal bovine serum followed by sub-culture in drosophila Schniders media. Out of 83 postive growth culture,only 52 specimens were studied by nested - PCR .It was found that 45(86.5%) cases in the generation of a 560 bp DNA and 7(13.4%)patients displayed a fragment of 750 bp, corresponding to L. major and L. tropica, respectively. Cellulose acetate electrophoresis (CAE) was performed by 4 enzyme systems (glucose phosphate isomerase, leucilphosphate, manose phosphate isomerase and 6phosphogluconate dehydrogenase). The results showed that L.major(LV39) isolate were in 20 mass cultivated cultureConclusion: Nested-PCR and cellulose acetate electrophoresis was an ideal method for discrimination of Leishmania. spp. and variants. Both L. major and L. tropica were the causative agents of cutaneous leishmaniasis but L.major was the main species in study area .Recommendations: As a result of the observations made during the whole study period, nested- PCR is very suitable method, which can be used as a basis for future applications. Opening number of research centres situated in the country offer DNA applications for so-called “parasite tracking.” Such an application is probably more relevant for epidemiological purposes than for diagnosis. (e.g., in outbreak investigations or tracking drug-resistant parasite strains). After collection in the field, samples can be simply transferred to such a centre for further analysis. More experimental studies for effective vaccine are developed for leishmaniasis.

الهدف: تشخيص الأنواع والسلالات والعتر لمسببات الليشمانيا الجلدية لمختلف المناطق الموبوئة المنهجية: أجريت الدراسة الحالية في خمسة محافظات وغطت سبعة مستشفيات كحقل للدراسة من تشرين الأول/2010 الى كانون الأول/2012، وقد أنجز فحص الترحيل الكهربائي لخلات السليلوز( Cellulose acetate electrophoresis ) في معهد (Walter Reed) للبحوث في الولايات المتحدة الأمريكية. الفحص المجهري المباشر تم بثلاثة طرق(السائل المسحوب من القرحة,خزعة الجلد وقطرات الدم المنسابة أثناء الخزعة) . تضمنت الدراسة زراعة العينات على الوسط الزرعي NNNالمحور و RPMI-1640مع مصل العجل الوليد,يتبع بزراعة العينات على الوسط الزرعي Drosophila Schneider. تعرضت هذه الدراسة للتشخيص الدقيق للطفيلي المسبب لليشمانيا الجلدية بواسطة استخدام الفحوصات الجزيئية والكيماحياتية تطرقت تلك الدراسة إلى Isoenzym profil في(20) عينة من مجموع الحالات المرضية التي أظهرت نتائج موجبة للزرع بواسطة الأوساط الزرعية وتم مقارنتها مع السلالات والعتر المصدرية باستخدام الترحيل الكهربائي لخلات السليلوز (Cellulose acetate electrophoresis)لأربعة أنزيمات (glucose phosphateisomerase,leucilphosphate,manose phosphate isomerase and 6phosphogluconate dehydrogenase) .النتائج :أظهرت نتائج الدراسة ان 90 (71%)من المرضى أعطوا نتائج موجبة عند الفحص تحت المجهر الضوئي. عند زراعة العينات على الأوساط الزرعية فوجد أن 83(65%) من العينات أعطت نتائج موجبةو بينت الدراسة بأن 52(41%) من مجموع الحالات المرضية التي أظهرت نتائج موجبة للزرع بواسطة الاوساط الزرعية درست بواسطة Nested-PCRوبأستخدام نوعين من البادئات لتحديد جنس وسلالة وعترة الطفيلي. أظهرت الدراسة 45(86,5%) من الحالات كانت L.major (560 bp) و7(13,5%) كانت L.tropica (750 bp).Isoenzymprofile في(20) عينة من مجموع الحالات المرضية التي اظهرت نتائج موجبة للزرع بواسطة الأوساط الزرعية تم مقارنتها مع السلالات والعتر المصدرية بأستخدام الترحيل الكهربائي حيث أظهرت النتائج أن L.major(LV39)وجدت في كل الحالات.الاستنتاج:يعتبر ال (nested-PCR و CAE طرق مثلى في تمييز وتشخيص أجناس الليشمانيا وأنواعها .كانت (L.major وL.tropica العوامل المسببة لليشمانيا الجلدية في حين L.major كانت النوع السائد في منطقة الدراسة.التوصيات:1-نتيجة لما تم ملاحظته في فترة الدراسة نوصي باستخدام PCR كأساس للتطبيقات المستقبلية.2 -فتح عدد من المراكز البحثية في القطر لما يسمى بتعقب الطفيلي تستخدم للأغراض الوبائية بالإضافة إلى التشخيص.3 -إجراء دراسات تجريبية للحصول على لقاح.

Keywords

Leishmaniasis --- Nested PCR


Article
Comparison Between the Efficiency of nested PCR Analysis and IgG Avidity Test in Detection Of Acute Toxoplasma gondii Infection in Early Pregnancy in Ramadi city.
مقارنة كفاءة اختباري nested PCRوIgG avidity test في الكشف عن داء المقوسات الكوندية في مرحلة مبكرة من الحمل في مدينة الرمادي

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Primary maternal infection with toxoplasmosis during gestation and its transmission to the fetus continue to be the cause of tragic yet preventable disease in offspring. jective: This study was aimed to Comparison between efficiency of these two methods(nested PCR and IgG avidity test) in detection of acute toxoplasmosis in pregnant women early in the first trimester is of utmost importance in order to offer them early therapy or other interventions to prevent congenital infection of fetuses. Methods: One hundred sixteen blood samples were collected from pregnant women at different ages, and in the first trimester of pregnancy. These women have history of habitual abortion, intrauterine fetal death and congenital anomalies of the fetus. Blood samples were tested for specific anti-Toxoplasma IgG avidity test and detection of B1 gene of T. gondii by nPCR. Results: In this study, it was found out that the rate of Toxoplasmosis by nested PCR 48 cases (41.4%),while by T. IgG avidity test was 76cases(65.5%) (high avidity 54.3% and low avidity11.2%). The detection rate by nested PCR was significantly higher than by T. IgG avidity test. Conclusion: PCR technique is more sensitive and specific than T.IgG avidity tests.

لاساس : العدوى الأولية للأمهات مع داء المقوسات أثناء الحمل وانتقاله إلى الجنين لا تزال قضية مرض يمكن الوقاية منها ومن المأساوية في النسل. الهدف: هدفت هذه الدراسة إلى المقارنة بين كفاءة هاتين الطريقتين (PCR وIgG avidity test) في الكشف عن داء المقوسات الحاد في النساء الحوامل في وقت مبكر من الحمل في الأشهر الثلاثة الأولى أمر في غاية الأهمية من أجل ان تقدم لهم العلاج المبكر أو التدخلات الأخرى لمنع العدوى الخلقية للأجنة. الطرق: تم جمع مائة و ستة عشر عينات دم من النساء الحوامل في أعمار مختلفة، وفي الأشهر الثلاثة الأولى من الحمل. هذه المرأة لديها تاريخ من الإجهاض المعتاد، وفاة الجنين داخل الرحم والتشوهات الخلقية للجنين. تم اختبار عينات الدم لمحددة للكشف عن داء المقوسات الكوندية لل IgG avidity test والكشف عن الجين B1 من المقوسات الغوندية بواسطة nPCR. النتائج: في هذه الدراسة، فقد وجد أن نسبة من داء المقوسات بواسطة PCR n 48 حالة (41.4٪)، في حين كان من 76عينه. IgG avidity test (65.5٪) (54.3٪ عالية ومنخفضة avidity11.2٪) . كان معدل الكشف عن طريق PCR أعلى بكثير من قبل IgG avidity test الاستنتاج: تقنية PCR هي أكثر حساسية وتحديدا من T.IgG avidity test


Article
Genotyping of Cryptosporidium Isolates from Clinical Samples

Author: Thanaa Ismael Jawad
Journal: Medical Journal of Babylon مجلة بابل الطبية ISSN: 1812156X 23126760 Year: 2015 Volume: 12 Issue: 3 Pages: 632-637
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

Cryptosporidium is an intracellular protozoan that infects the gastrointestinal tract of human and other animals. Two main species of this parasite are known to infect human C. hominis and C. parvum with the latter has a zoonotic transmission. This study aimed to genotype the clinical isolates of Cryptosporidium from children with diarrhea.A total of 64 fecal samples were collected from children with diarrhea. Cryptosporidial infection was detected using modified acid fast stain. DNA of the parasite was extracted from oocysts of positive fecal samples and nested PCR method was used for TRAP-C2 gene amplification. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) was applied for genotyping.Four fecal samples from 64 (0.625%) gave positive result for Cryptosporidium. RFLP-PCR suggested that 3 samples of these related to C. parvum and 1 sample of mixed infection with both C. parvum and C. hominis. From these results it can be concluded that most infections in children with cryptosporidiosis are of bovine origin.

Keywords

nested-PCR --- RFLP --- TRAP-C2 --- cryptosporidiosis


Article
Utilization of Molecular and Serological Methods to Investigation Toxoplasma gondii in Healthy Apparently Students in Babylon Province

Author: Hayam Khalis Al-Masoudi
Journal: Medical Journal of Babylon مجلة بابل الطبية ISSN: 1812156X 23126760 Year: 2015 Volume: 12 Issue: 4 Pages: 934 -942
Publisher: Babylon University جامعة بابل

Loading...
Loading...
Abstract

Toxoplasmosis, an infection caused by Toxoplasma gondii, is generally asymptomatic or is associated with mild, non-specific clinical manifestations in immunocompetent patients. The present study consider the first trial in Babylon province to detection of toxoplasmosis among healthy university and secondary students, from February to May 2015, collect 112 blood sample from healthy apparently students. The results of serological test revealed that 57/112 (50.8%) was positive for T. gondii in LAT test, (25%) for university students and (25.8%) for secondary students, there isa significant difference (p≤ 0.05) between male (27.6%) and female (23.2%) in toxoplasmosis infection, where as 21.4% was positive for ELISA in which 13.8% positive for IgG antibodies and 8.0% positive for IgM, while nPCR results showed 19 out of 112(16.9%) was positive to toxoplasmosis. The presence of T. gondii antibodies in the serum regarded as the important criterion for the diagnosis of toxoplasmosis but these methods insufficient to diagnosis, it must be combine with molecular methods such as polymerase chain reaction which detect T. gondii DNA in five or ten parasites are present in blood.


Article
Molecular and Epidemiological Study of Cryptosporidium spp. in Mid-Euphrates Area
دراسة جزيئية و وبائية Cryptosporidium spp في منطقة الفرات الأوسط

Author: Karar Mohammed Abdul-Sada
Journal: kufa Journal for Nursing sciences مجلة الكوفة لعلوم التمريض ISSN: 22234055 Year: 2015 Volume: 5 Issue: 1 Pages: 102-112
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

Objectives: the aim of present study was to search for Cryptosporidium spp. in our children and tracking different epidemiological effects.Methodology: Random fecal specimens were collected from 467 of children whom attended to hospitals from four Iraqi governorates, modified Ziehl-Neelson staining for all samples, two advanced PCR techniques (Nested PCR and Real Time PCR) were used for all positive samples to detect species. Data was analyzed by use of Yat’s Chi-square test.Results: Among the 467 examined children, Cryptosporidium Oocysts were found to be excreted in 39 (8.35%) of them. Molecular tests showed that C. parvum and C. hominis found in 72.9% and 24.3% of positive samples respectively, two samples (5.1%) explain mixed species infection, whilst one sample (2.7%) don’t reveal any amplification, that may mean species other than of C. parvum or C. hominis.Conclusions: The present study emphasized the public health importance of Cryptosporidium spp in the study area. It seems that zoonotic species (C. parvum) is the most important cause of infection in the region. According to our knowledge, this report is the first that recorded the species of Cryptosporidium in Iraq.Recommendations: Further studies at different areas and age groups are required to investigate the molecular epidemiology of cryptosporidiosis in our community, and also in the animals to evaluate the role of zoonotic transmission in cryptosporidiosis epidemiology.

الهدف: تهدف الدراسة إلى الاستقصاء عن طفيلي .Cryptosporidium spp في الأطفال والتعرف على المؤثرات الوبائية المختلفة . المنهجية: جمعت النماذج البرازية بشكل عشوائي مِنْ 467 مِنْ الأطفالِ الذين راجعوا مستشفيات مِنْ أربع محافظاتِ عراقيةِ، صبغت المسحات البرازية بصبغة Ziehl-Neelsen المحورة، استخدمت اثنتان من تقنياتِ PCR المتقدّمة (Nested PCR and Real Time PCR) للتحري عن الانوعِ في كافة العينات الموجبة. تم تحليل النتائج إحصائيا بطريقة Yat’s Chi-square.النَتائِج: من بين الأطفالِ المَفْحُوصينِ الـ467،َ تبين وجود أكياس البيض لطفيلي Cryptosporidium في براز 39 (8.35 %) منهم. أظهرت الاختبارات الجزيئيةَ بأنّ الانواع Cryptosporidium parvum و Cryptosporidium hominis وَجدا في 72.9 % و24.3 % مِنْ العيناتِ الإيجابيةِ على التوالي، عينتان (5.1 %) تُوضّحانِ عدوى مُخْتَلَطة بكلى النوعين ، بينما عيّنة واحدة فقط (2.7 %) لم تظهر أيّ تضاعف مخبري للحمض النووي، الذي قَدْ يَعْني نوعَ ما آخر عدا C. parvum أَو C. hominis. وقد تم تحليل النتائج إحصائيا باستخدام طريقة الاستنتاجات: أَكّدتْ الدراسةُ الحاليةُ أهميةُ أنواع طفيلي Cryptosporidium spp في منطقةِ الدراسةَ. بالإضافة لذلك يَبْدو بأنّ النوعَ Cryptosporidium parvum المسببُ الأكثر أهميةً للعدوى في المنطقةِ. طبقاً لمعرفتِنا فان هذه الدراسة هي الأولى التي سجّلَت أنواع Cryptosporidium في العراق.التوصيات: الحاجة إلى دراسات إضافية في مناطق أخرى تشمل كل الأعمار للتعرف عل معلومات أكثر عن الوبائية الجزيئية لداء الابواغ الخبيئة في مجتمعنا، كذاك دراسته في الحيوانات لتقييم دورها في وبائيته.


Article
Molecular investigation of the Parasite Entamoeba Spp. among children with diarrhea in Thi Qar Province
التحري الجزيئي لطفيلي المتحولة Entamoeba Spp. بين الاطفال المصابين بالإسهال في محافظة ذي قار

Authors: Fadhil Abbas Manshad أ.د فاضل عباس منشد العبادي --- Manar Kareem Kadhm منار كريم كاظم السعيدي
Journal: Univesity of Thi-Qar Journal مجلة جامعة ذي قار العلمية ISSN: 66291818 Year: 2017 Volume: 12 Issue: 4 Pages: 16-30
Publisher: Thi-Qar University جامعة ذي قار

Loading...
Loading...
Abstract

The purpose of the current study is the genetic diagnosis of the genus Entamoeba Using PCR technology and identify some of the species that infect humans using Nested PCR by 18S rRNA gene responsible for this genus discrimination. The current study included 300 Sample microscopically examined for a period for October 2015 to Septembre 2016 - turned out the presence total infection rate for Entamoba complex 26.86%. Eighty samples of microscopically positive were examined moleculary and affirmed the presence 35% of Entamoba spp. When Nested PCR examination was used to determine the species (Species Specific) the infection rate 39.29% appeared to Entamoeba histolytica and 39.29% for Entamoeba. The results of this study refer that the Nested PCR technique was efficiency in distinguishing and identifying species of the parasite with high accuracy and reliability, high-speed compared to microscopic examination is able to distinguish the species of Entamoeba and The high sensitivity of molecular ways help to reach the true prevalence of this genus and We can use these molecular methods in epidemiological studies.

إن الغرض من الدراسة الحالية هو التشخيص الجيني لجنس المتحولة Entamoeba spp. باستعمال تقنية PCR والتعرف على بعض الانواع التي تصيب الانسان باستعمال Nested PCR بواسطة الجين 18S rRNAالمسؤول عن تمييز هذا الجنس وانواعه وتضمنت الدراسة الحالية فحص 300 عينة مجهريا ً للمدة من شهر تشرين الثاني 2015 لغاية شهر ايلول 2016 فتبين وجود نسبة إصابة كلية بلغت 26.86 % وعندما اجري الفحص الجزيئي ثبُت وجود نسبة اصابه 35 % Entamoba spp، وعندما اجري فحصNested PCR لتحديد الانواع ظهر وجود نسبة إصابة % 39.29 Entamoeba histolytica و % 39.29 Entamoeba dispar تُشير نتائج هذه الدراسة الى كفاءة تقنية Nested PCR بتمييز وتحديد انواع الطفيلي بدقة عالية ومصداقية وسرعة عالية بالمقارنة بالفحص المجهري غير القادر على تمييز انواع جنس المتحولة وتساعد الحساسية العالية للطرق الجزيئية للوصول بشكل صحيح للانتشار الحقيقي لأنواع هذا الجنس ويمكن من استعمال هذه الطرق الجزيئية في الدراسات الوبائية


Article
Prevalence Rate of Isolated Cryptosporidium Spp. of Broiler Chicken in Al-Qadisiyah Province
معدل انتشارداء الابواغ الخبيئه المعزولة من افراخ دجاج اللحم في محافظة القادسية

Authors: Tahseen. A. AL- Saeedi تحسين عبود صويحي --- Najlaa O. H. AL- Jubury نجلاء عبيس هلول
Journal: AL-Qadisiyah Journal For Agriculture Sciences مجلة القادسية للعلوم الزراعية ISSN: Online ISSN: 26181479 Print ISSN: 20775822 Year: 2018 Volume: 8 Issue: 2 Pages: 101-106
Publisher: Al-Qadisiyah University جامعة القادسية

Loading...
Loading...
Abstract

This study has been carried out to determined the prevalence rate of cryptosporidiosis in broiler flocks. 150 fecal samples from 30 broiler flocks (5 samples for each flock) in different areas of AL-Qadisiyah province were used. They were collected starting of January till November 2016 with two age groups of chickens, (10-15 and 30-35) days old. Samples were examined with Modified Ziel -Neelsen stain to detect the positive samples by microscopic examination. After that, a nested-PCR technique was performed on 60 samples. Results of microscopic examination showed that total infection rate of Cryptosporidium was 29.33% . The highest rates of infection were recorded in 10-15 days group and during spring season, infection rates reached were 35.71% and 34.28% respectively. The lowest rates were observed in 30-35 days group and during summer season were 23.75% and 20% respectively. No significant differences within percentage in both two age group or among percentage in seasons at level (P < 0.05) were recorded. According to Nested Polymerase Chain Reaction test, the results showed that overall percentage of infection is 20%. The highest rate of observed infection is 23.33% in 10-15 days aged group, while the lowest rate of infection is (16.67 %) in the other age. No significant differences was observed between percentage in ages. On the other hand, result of comparing nested-PCR test with microscopic examination shows that there are no significant differences between the percentage of both tests.In conclusion, cryptosporidiosis is widespread in broiler flocks in AL-Qadisiyah province, but there is no significant impact found concerning the relationship between infection rates and age of chickens or seasons of the year.

هدف الدراسة الحالية معرفة نسبة الاصابة لداء الخبيئات في حقول دجاج اللحم. جمعت 150 عينة لبراز دجاج من 30 حقل (5 عينة لكل حقل) من مناطق مختلفة في محافظة القادسية خلال الفترة الممتدة من شهر كانون الثاني الى نهاية شهر تشرين الثاني 2016 وكان عمر الدجاج في تلك الحقول بعمري (10-15 و30-35) يوم. كل العينات فحصت باستخدام المجهر الضوئي بعد التصبيغ بصبغة زيل نلسن المحورة لتحديد العينات الموجبة. بعد ذلك اختبرت 60 عينة بتفاعل السلسلة المتبلمرة المتداخل - nested) .(PCRنتائج الفحص المجهري اظهرت بأن معدل الاصابة الكلية لداء الخبيئات كان 29.33% وكانت اعلى نسب للإصابة (35.71) (34.28) بعمر 10-15 يوم وموسم الربيع على التوالي بينما كانت اقل نسبة للإصابة (23.75) (20) بعمر 30-35 يوم وموسم الصيف على التوالي. ولم يكن هناك فروق معنوية بمستوى (P <0.05) عند المقارنة بين عمري ومواسم التجربة نتائج الفحص الجزيئي اظهرت بأن معدل الاصابة الكلية كانت بنسبة 20% ولم يكن هناك فروق معنوية بمستوى (P <0.05) عند المقارنة بين عمري التجربة حيث كانت اعلى نسب الاصابة (23.33) بعمر 10-15 يوم بينما كانت اقل نسبة اصابة (16.67) بعمر 30-35 يوم. من جهة اخرى اظهرت نتائج التجربة بين الفحصين (الفحص المجهري، تفاعل السلسلة المتبلمرة المتداخل) عدم وجود فروق معنوية بين نسب الاصابة لكلا الفحصين.نستنتج من خلال نتائج هذه الدراسة ان الاصابة بداء الخبيئات واسعة الانتشار في حقول محافظة القادسية غير ان ليس لعمر الدجاج او مواسم السنة تأثير معنوي على نسبة الاصابة.


Article
DETECTION OF B1 GENE OF TOXOPLASMA GONDII IN BLOOD OF PREGNANT AND ABORTIVE WOMEN INFECTED WITH THIS PARASITE
التحري عن الجينB1 في دم النساء الحوامل والمجهضات المصابات بطفيلي المقوسات الكونديه

Loading...
Loading...
Abstract

Background: Primary maternal infection with toxoplasmosis during gestation and its transmission to the fetus continue to be the cause of tragic yet preventable disease in offspring.Objective: This study was aimed to investigate the utility of nested PCR (nPCR) technique for detection recent infection with Toxoplasma gondii in blood of pregnant and abortive women.Methods: One hundred twenty women were included in this study with a history of single or repeated abortion and thirty women with normal pregnancy were used as a control. Blood samples were tested for specific anti-Toxoplasma IgM and IgG antibodies by an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and detection of B1 gene of T. gondii by nPCR. Results: The results indicated that 43.33% of abortive women were exposed positive for anti-Toxoplasma antibodies, 4.16% of them had IgM, 25.83% had IgG, and 13.33% had both IgM and IgG, and 56.55% had no antibodies. Subsequently, nested PCR analysis was used to detecting T. gondii DNA in blood of abortive women. It was found that 15.83%of abortive women exposed positive result for B1 gene of T. gondii, those abortive women involved 10.52% of them with IgM, 31.57%with IgG, and 26.31% with both IgM and IgG, and 31.57% of them had none anti-Toxoplasma antibodies.Conclusion: It can be concluded that nPCR assay in blood has advantage in detection of recent and active toxoplasmosis.Key Words: Toxoplasma gondii, nested PCR, toxoplasmosis.

خلفية الدراسة: ان الاصابه الاوليه للام بداء المقوسات الكونديه خلال فترة الحمل وانتقال الاصابه الى الجنين لا يزال السبب الفاجع لمرض بالامكان تجنبه في الذريه الناتجه. خلفية الدراسة: تهدف هذه الدراسه الى التقصي عن مدى فاعلية استخدام طريقة التفاعل التسلسلي البلمري ذو النوع المتداخل (nested PCR)في كشف الاصابات الحديثه بالمقوسات الكونديه في دم النساء الحوامل والمجهضات.طريقة العمل: تضمنت الدراسه 120 أمرأه ذات تاريخ اجهاض مفرد او متكرر و30 أمرأه ذات حمل طبيعي كسيطره. أختبرت عينات الدم للكشف عن الاجسام المضاده IgM ,IgG بطريقة فحص الاليزاELISA كما تم الكشف عن الجينB1 الخاص بطفيلي المقوسات الكونديه بأستخدام فحص التفاعل التسلسلي البلمري نوع المجموعه المتداخله(nPCR) .النتائـج: تشير النتائج الى أن 43,33% من النساء المجهضات أظهرن نتيجه موجبه للاجسام المضاده للمقوسات الكونديه , 4,16% منهن يحملن الضد IgM, 25,83% يحملن الضد IgG, 13,33% يحملن كلا الضدين IgM, IgG معا و56,55% لا يحملن اجسام مضاده للمقوسات الكونديه. وعلى غرار ذلك استخدم فحص nPCR للكشف عن دنا (DNA) المقوسات الكونديه في دم النساء المجهضات وقد تبين من النتائج أن 15,83% من النساء المجهضات أظهرن نتيجه موجبه لوجود الجين. B1لقد كان 10,52% من النساء الموجبات لفحص nPCR يحملن الضد , IgM 31,57% منهن يحملن الضد IgG,26,31% منهن يحملن كلا الضدين IgM, IgG بينما 31,57% منهن لا يحملن اجسام مضاده. الاستنتتاج: يمكننا الاستنتاج بأن فحص nPCR في دم المرضى اظهر اهميه في الكشف عن الاصابه الحديثه او الفعاله بداء المقوسات الكونديه. مفتاح الكلمات: المقوسات الكونديه, التفاعل التسلسلي البلمري, داء المقوسات الكونديه.


Article
The Rate of Pulmonary Mycotic Infections with Coccidioidomycosis in An Najaf Province
معدل الاصابات الفطرية الرئوية بمرض الفطار الكرواني في محافظة النجف

Author: Raed Ali Hussein Shabaa رائد علي حسين
Journal: Al-Kufa University Journal for Biology مجلة جامعة الكوفة لعلوم الحياة ISSN: 20738854 23116544 Year: 2015 Volume: 7 Issue: 1 Pages: 8-18
Publisher: University of Kufa جامعة الكوفة

Loading...
Loading...
Abstract

This study was aimed to evaluate the rate of infections with Coccidioidomycosis in An Najaf province and to demonstrate the importance of molecular diagnoses methods.Ninety three respiratory specimens were obtained from patients with Coccidioidomycosis seen at Al-Sader Teaching Hospital and AL-Hakim general hospital in Al-Najaf, Iraq between January 2014 and June 2014. clinical isolates were examined for Coccidioides immitis and C. posadasii and inoculated onto sabouraud dextrose agar plates. Nested PCR was used to confirm the diagnosis by screening for the presence of proline-rich antigen (PRA) which is a protein located in the spherule cell wall of C. immitis and C. posadasii. Twenty one clinical isolates determined to be Coccidioides spp. by microscopic examination from a total of 93 respiratory specimens, which were coexamined by general fungal culture. Nested PCR results showed a product of 526 bp was obtained from 23 of the 93 strains tested after the first PCR, whereas an expected 342 bp nested PCR product was detected by agarose electrophoresis from 25 strains tested.

هدفت هذه الدراسة لتقييم معدل الاصابات الرئوية بمرض الفطار الكرواني في محافظة النجف و لأظهار اهمية الطرق الجزيئية في تشخيصه.تم الحصول على مائة و ثلاث و اربعين عينة من المرضى المصابين بالفطار الكرواني في مستشفى الصدر التعليمي و مستشفى الحكيم العام في مدينة النجف للفترة ما بين كانون الثاني و حزيران 2014 . فحصت العينات السريرية للبحث عن الفطرين Coccidioides immitis و C. posadasii و لقحت على وسط السابرود دكستروز اكار. اجري اختبار Nested PCR لتاكيد التشخيص من خلال البحث عن بروتين proline-rich antigen (PRA) و هو البرو تين الموجود في جدران الخلايا الكروية لكلا الفطرين اعلاه. حددت احدى و عشرين عزلة من اصل 143 على انها Coccidioides spp. بالفحص المجهري و الزرعي. أظهرت نتائج Nested PCR وجود ناتج البلمرة ذو الطول 526 زوج قاعدي في 23 من مجموع العزلات البالغ 143 بعد مرحلة التضاعف الاولى في حين تم الحصول على ناتج البلمرة ذو الحجم 342 زوج قاعدي في 25 عزلة من مرحلة التضاعف الثانية لاختبار Nested PCR.


Article
Direct Amplification of B1 gene of Toxoplasma gondii DNA using Nested Polymerase Chain Reaction Following Microwave Treatment for Whole Blood Samples
التظخيم المباشر لجين B1 في المادة الوراثية لطفيلي المقوسات الكوندية بأستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل متبوعا بالمعالجة الحرارية بواسطة المايكرويف لعينات الدم

Loading...
Loading...
Abstract

Infection with Toxoplasma gondii is a cause of fetal death since T. gondii can be transmitted to the fetus through the placenta (transplacental) from an infected mother or at vaginal delivery. Blood obtained from women and sheep to confirm their infection with toxoplasmosis by using Enzyme Linked Immunosorbant Assay test (ELISA) to ditective positive specific anti-Toxoplasma (IgM, IgG and IgM, or IgG) antibodies. This study used two methodes to extract DNA (the first one was a standard extraction commercial method (CM-PCR) of genomic DNA using a commercial kit (Promega, USA), and the second one was the direct heat DNA extraction using microwave oven (MW-PCR) for whole blood samples obtained from infected women and sheep. Then nested Polymerase Chain Reaction (n PCR) were used to amplify Toxoplasma B1 gene to detect T. gondii DNA in whole blood samples. The results indecated using of microwave treatment instead of commercial kit to extract DNA is low cost and short time,and complement serology for clinical studies and diagnostic purposes of toxoplasmosis.

أن الأصابة بطفيلي داء المقوسات الكوندية من الأسباب التي تؤدي الى موت الجنين أذ ان الطفيلي له القدرة على الأنتقال منالأم الحامل الى جنينها عن طريق المشيمة والتسبب بلأجهاض أو أنتقال الطفيلي أثناء الولادة. تم سحب عينات الدم من نساء وأغنامأكدت أصابتهم بداء المقوسات الكوندية بأستخدام الفحص المناعي الأليزا وذلك عن طريق تشخيص وجود الأجسام المناعية نوع( (IgM, IgG/IgM, IgG . الهدف من الدراسة هو استخدام طريقتين لأستخلاص المادة الوراثية من عينات دم النساء والأغنامالمؤكد مسبقا اصابتها بطفيلي داء القوسات الكوندية )الأولى هي الطريقة اللأعتيادية بأستخدام عدة تجارية نوع (Promega)الأمريكي أما الطريقة الثانية هي أستخدام الفرن الحراري )المايكرويف(، من ثم استخدام تفاعل البلمرة المتسلسل نوع المجموعةالمتداخلة لتضخيم الجين (B1) الخاص بطفيلي المقوسات الكوندية لنفس عينات الدم لتشخيص وجود الأصابة بداء المقوساتالكوندية. أكدت النتائج ان بلأمكان استخدام الفرن الحراري المايكرويف بدل العدة التجارية لأستخلاص المادة الوراثية من عيناتالدم، وبهذا يمكننا استخلاص المادة الوراثية بوقت قصير وبتكلفة قليلة جدا مقارنة بالعدة التجارية المكلفة ومكملا لنتائج الفحوصاتالمناعية لغرض دراسة وتشخيص داء المقوسات الكوندية.

Listing 1 - 10 of 13 << page
of 2
>>
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (13)


Language

English (8)

Arabic (1)

Arabic and English (1)


Year
From To Submit

2019 (1)

2018 (1)

2017 (1)

2016 (1)

2015 (6)

More...