research centers


Search results: Found 2

Listing 1 - 2 of 2
Sort by

Article
INVESTIGATION OF PHYLOGENIC RELATIONSHIP AMONG ESCHERICHIA COLI ISOLATED FROM CLINICAL AND SUBCLINICAL MASTITIS IN DIFFERENT ANIMALS IN BASRAH PROVINCE

Authors: Ibrahim H. Madhloom --- Rasha M. Othman
Journal: Basrah Journal of Veterinary Research. مجلة البصرة للابحاث البيطرية ISSN: Print:18138497 E; 24108456 Year: 2017 Volume: 16 Issue: 2 Pages: 193-209
Publisher: Basrah University جامعة البصرة

Loading...
Loading...
Abstract

E.colican be assigned to one of the four main phylogenetic groups A, B1, B2and D, which can be divided into seven and then into subgroups: A0, A1, B1, B22, B23,D1, and D2, in addition group B1can be divided into subgroups B11 and B12, usingmultiplex PCR according to the presence/absence or combinationof the three phylogenygenetic markers chuA, yjaA and DNA fragment TspE4.C2.In the currentstudy atotal of30E. coli isolates were obtained from clinical and subclinical samples from mastitis incows, sheeps and goats by standard bacteriological methods. Results found that the mostisolates of E. coli belong to the phylogeny groups A and B1. Group Aincluded (14isolates, 46.7%) belonged to subgroup A0 about (6 isolates, 20.0%), and (8 isolates,26.7%) to A1 subgroup. On the other hand results showed group B1 composed (14isolates, 46.7%). Group B1 can be also classified into subgroups B11 included (8 isolates,26.7%) and B12 about (6 isolates, 20.0%). In addition our results showed (1 isolate,3.3%), assigned to B2 belonged to subgroup B23 and (1 isolate, 3.3%), fitted in Dbelonged to subgroup D1. No isolates were found to belong to subgroups B22 and D2.Phylogeny pedigree was done according to the data recovered previously. This studyexplains that the distributions of E. coli isolates in phylogenetic groups (A, B1, B2 andD) varied depending on the climatic zone and environmental factors such as dietary,climatic conditions and geographic.


Article
A COMPARATIVE STUDY OF SOME VIRULENCE FACTORS AND PHYLOGENETIC CHARACTRIZATION OF Escherichia.coli ISOLATES CAUSING URINARY TRACT INFECTION AND THE COMMENSAL GUT MICROBIOTA
دراسة مقارنة انتشار بعض عوامل الضراوة.وتوصيف النشوء.الجيني لمسببات القولون الممرضةزالمسبب لعدوى المسالك البولية ومكروبات.الأمعاء المتعايشة

Author: Ahmed &et al. احمد وآخرون
Journal: Iraqi Journal of Agricultural Science مجلة العلوم الزراعية العراقية ISSN: 00750530/24100862 Year: 2019 Volume: 50 Issue: 4 Pages: 1193-1198
Publisher: Baghdad University جامعة بغداد

Loading...
Loading...
Abstract

Variety of virulence factors are involved in the pathogenicity of Escherichia coli isolates, the common cause of the urinary tract infections.(UTIs). This study was aimed.to determine some virulence factors.involved in the pathogenicity.and the phylogenetic.grouping of uropathogenic E. coli isolates.from UTIs in compare.with isolates.from gut.microbiota (fecal flora) In.this study ,E coli isolates were collected from samples .urine (n = 25), fecal samples (n = 25) samples of the same patients with UTI, and from fecal samples (n= 5 as control )of patients without UTI. The detection of phylogenetic grouping and some virulence genes among the all isolates were confirmed by PCR technique. The results.showed that.phylogenetic groups B2,B1(36%) and D (28%) were predominated.among uropathogenic E.coli in comparison with group A (8%) ,whereas in .commensal isolates.groups B1(36%), B2(32%) ,D (28%) were.more prevalent in compare.with group A (4%).The prevalence.of cnf1 and fimH .genes were higher in.UPEC in comparsion with.commensal isolates. However, the.prevalence of kpsMT II gene.was similar among.both groups, while hlyA gene was.higher in fecal.isolates. According to this results., microbiota may considered the main source of UPEC bacteria.

تشارك مجموعة.متنوعةزمن عوامل الضراوةزفي القدرة الإمراضية للإشريكية القولونية، والذي يعتبرالسبب الشائع للالتهابات.المسالك البوليةز(UTI). تهدف هذه الدراسةزإلى تحديد بعض عوامل الضراوةزالمتضمنة في الإمراضيةزوالتجمع النشوئي لعزلات الإشريكية القولونيةزالمسببة لالتهاب المسالك البوليه من.عدوى المسالك.البولية مقارنة مع العزلات من الميكروبات المعوية (النبيت الطبيعي للبراز) في هذه.الدراسة، تم جمع عزلة E. coli من الادرار (n = 25)، البراز (n = 25) عينات من نفس المرضى الذين يعانون من عدوى المسالك البولية، ومن عينات البراز (n = 5)للسيطرة من المرضى الذين لا يعانون من عدوى المسالك البولية. تم التأكيد على الكشف عن التجمع النشوئي و بعض مورثات الضراوة .بين جميع العزلات.بواسطة تقنية PCR. أوضحت النتائج أن مجموعات التوالد B2 و (36%)B1 و(28%) D كانت سائدة بين الإشريكية القولونيةزالمسببة لالتهاب المسالك البوليه بالمقارنة مع المجموعة A (8%)، بينما في مجموعات العزلات المتعايشةB1 (36%), B2 (32%) ، وكانت (28%) D أكثر انتشارا مقارنة مع.المجموعة%) A (4، وكان انتشار جينات cnf1 و fimH أعلى في الإشريكية القولونيةزالمسببة لالتهاب المسالك البوليه مقارنة مع العزلات المتعايشة. ومع ذلك ، كان انتشار المورث kpsMT II متشابهًا بين.المجموعتين ، في حين كان المورث hlyA أعلى في.العزلات البرازية. واعتمادا على هذه النتائج، قد تعتبرزمايكروبات الامعاء المتعايشه المصدر الرئيسي للبكتيريا الإشريكية القولونيةزالمسببة لالتهاب المسالك البوليه.

Listing 1 - 2 of 2
Sort by
Narrow your search

Resource type

article (2)


Language

English (2)


Year
From To Submit

2019 (1)

2017 (1)